RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550734.5

CS-221, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 5

Gene CS, Length 747 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-221ENST00000550734 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP12.42□□□□□ -0.42
CS-221ENST00000550734 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP12.42□□□□□ -0.42
CS-221ENST00000550734 CMA1P23946 247 aa12.42□□□□□ -0.42
CS-221ENST00000550734 PMLP29590 882 aa12.42□□□□□ -0.42
CS-221ENST00000550734 PNPLA4P41247 253 aa12.42□□□□□ -0.42
CS-221ENST00000550734 ASIC1P78348 528 aa12.42□□□□□ -0.42
CS-221ENST00000550734 SHC2P98077 582 aa12.42□□□□□ -0.42
CS-221ENST00000550734 CCINQ13939 588 aa12.42□□□□□ -0.42
CS-221ENST00000550734 TXNDC11Q6PKC3 985 aa12.42□□□□□ -0.42
CS-221ENST00000550734 Q6ZS52 159 aa12.42□□□□□ -0.42
CS-221ENST00000550734 UNC13DQ70J99 1090 aa12.42□□□□□ -0.42
CS-221ENST00000550734 WDR5BQ86VZ2 330 aa12.42□□□□□ -0.42
CS-221ENST00000550734 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP12.42□□□□□ -0.42
CS-221ENST00000550734 EFCAB13Q8IY85 973 aa12.42□□□□□ -0.42
CS-221ENST00000550734 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP12.42□□□□□ -0.42
CS-221ENST00000550734 CXorf38Q8TB03 319 aa12.42□□□□□ -0.42
CS-221ENST00000550734 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP12.42□□□□□ -0.42
CS-221ENST00000550734 LOXL4Q96JB6 756 aa12.42□□□□□ -0.42
CS-221ENST00000550734 CHAMP1Q96JM3 812 aa12.42□□□□□ -0.42
CS-221ENST00000550734 CBWD1Q9BRT8 395 aa12.42□□□□□ -0.42
CS-221ENST00000550734 FAM213AQ9BRX8 229 aa12.42□□□□□ -0.42
CS-221ENST00000550734 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP12.42□□□□□ -0.42
CS-221ENST00000550734 C2orf42Q9NWW7 574 aa12.42□□□□□ -0.42
CS-221ENST00000550734 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP12.42□□□□□ -0.42
CS-221ENST00000550734 FAM208BQ5VWN6 2430 aa12.42□□□□□ -0.42
CS-221ENST00000550734 SDK1Q7Z5N4 2213 aa12.42□□□□□ -0.42
CS-221ENST00000550734 UBE4BO95155 1302 aa12.41□□□□□ -0.42
CS-221ENST00000550734 ZZEF1O43149 2961 aa12.41□□□□□ -0.42
CS-221ENST00000550734 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa12.41□□□□□ -0.42
CS-221ENST00000550734 SLC38A8A6NNN8 435 aa12.41□□□□□ -0.42
CS-221ENST00000550734 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa12.41□□□□□ -0.42
CS-221ENST00000550734 SLFN14P0C7P3 912 aa12.41□□□□□ -0.42
CS-221ENST00000550734 CPB1P15086 417 aa12.41□□□□□ -0.42
CS-221ENST00000550734 WEE1P30291 646 aa12.41□□□□□ -0.42
CS-221ENST00000550734 CTHP32929 405 aa12.41□□□□□ -0.42
CS-221ENST00000550734 SOX9P48436 509 aa12.41□□□□□ -0.42
CS-221ENST00000550734 TAF6P49848 677 aa12.41□□□□□ -0.42
CS-221ENST00000550734 SMARCB1Q12824 385 aa12.41□□□□□ -0.42
CS-221ENST00000550734 PLD1Q13393 1074 aa12.41□□□□□ -0.42
CS-221ENST00000550734 SURF1Q15526 300 aa12.41□□□□□ -0.42
CS-221ENST00000550734 BMT2Q1RMZ1 405 aa12.41□□□□□ -0.42
CS-221ENST00000550734 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP12.41□□□□□ -0.42
CS-221ENST00000550734 FAM26FQ5R3K3 315 aa12.41□□□□□ -0.42
CS-221ENST00000550734 CENPPQ6IPU0 288 aa12.41□□□□□ -0.42
CS-221ENST00000550734 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP12.41□□□□□ -0.42
CS-221ENST00000550734 YAF2Q8IY57 180 aa12.41□□□□□ -0.42
CS-221ENST00000550734 GPD1LQ8N335 351 aa12.41□□□□□ -0.42
CS-221ENST00000550734 GLIS3Q8NEA6 775 aa12.41□□□□□ -0.42
CS-221ENST00000550734 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa12.41□□□□□ -0.42
CS-221ENST00000550734 SPATA18Q8TC71 538 aa12.41□□□□□ -0.42
CS-221ENST00000550734 LRRC3BQ96PB8 259 aa12.41□□□□□ -0.42
CS-221ENST00000550734 MKNK1Q9BUB5 465 aa12.41□□□□□ -0.42
CS-221ENST00000550734 DNAJC25Q9H1X3 360 aa12.41□□□□□ -0.42
CS-221ENST00000550734 KIAA1586Q9HCI6 787 aa12.41□□□□□ -0.42
CS-221ENST00000550734 OBP2AQ9NY56 170 aa12.41□□□□□ -0.42
CS-221ENST00000550734 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP12.41□□□□□ -0.42
CS-221ENST00000550734 USP25Q9UHP3 1055 aa12.41□□□□□ -0.42
CS-221ENST00000550734 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa12.41□□□□□ -0.42
CS-221ENST00000550734 YIPF1Q9Y548 306 aa12.41□□□□□ -0.42
CS-221ENST00000550734 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa12.4□□□□□ -0.42
CS-221ENST00000550734 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa12.4□□□□□ -0.42
CS-221ENST00000550734 A0A1W2PRU2 124 aa12.4□□□□□ -0.42
CS-221ENST00000550734 KPNA7A9QM74 516 aa12.4□□□□□ -0.42
CS-221ENST00000550734 MYL1P05976 194 aa12.4□□□□□ -0.42
CS-221ENST00000550734 ZNF806P0C7X5 589 aa12.4□□□□□ -0.42
CS-221ENST00000550734 RAP1GAPP47736 663 aa12.4□□□□□ -0.42
CS-221ENST00000550734 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP12.4□□□□□ -0.42
CS-221ENST00000550734 WNT7BP56706 349 aa12.4□□□□□ -0.42
CS-221ENST00000550734 SV2CQ496J9 727 aa12.4□□□□□ -0.42
CS-221ENST00000550734 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa12.4□□□□□ -0.42
CS-221ENST00000550734 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP12.4□□□□□ -0.42
CS-221ENST00000550734 IL31Q6EBC2 164 aa12.4□□□□□ -0.42
CS-221ENST00000550734 ARMCX5Q6P1M9 558 aa12.4□□□□□ -0.42
CS-221ENST00000550734 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP12.4□□□□□ -0.42
CS-221ENST00000550734 C12orf56Q8IXR9 622 aa12.4□□□□□ -0.42
CS-221ENST00000550734 LRRC52Q8N7C0 313 aa12.4□□□□□ -0.42
CS-221ENST00000550734 C1orf127Q8N9H9 656 aa12.4□□□□□ -0.42
CS-221ENST00000550734 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa12.4□□□□□ -0.42
CS-221ENST00000550734 TMEM174Q8WUU8 243 aa12.4□□□□□ -0.42
CS-221ENST00000550734 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP12.4□□□□□ -0.42
CS-221ENST00000550734 SCFD1Q8WVM8 642 aa12.4□□□□□ -0.42
CS-221ENST00000550734 HPS3Q969F9 1004 aa12.4□□□□□ -0.42
CS-221ENST00000550734 SAAL1Q96ER3 474 aa12.4□□□□□ -0.42
CS-221ENST00000550734 ZNF560Q96MR9 790 aa12.4□□□□□ -0.42
CS-221ENST00000550734 CRISPLD1Q9H336 500 aa12.4□□□□□ -0.42
CS-221ENST00000550734 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa12.4□□□□□ -0.42
CS-221ENST00000550734 GDAP2Q9NXN4 497 aa12.4□□□□□ -0.42
CS-221ENST00000550734 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP12.4□□□□□ -0.42
CS-221ENST00000550734 HPSEQ9Y251 543 aa12.4□□□□□ -0.42
CS-221ENST00000550734 ASB3Q9Y575 518 aa12.4□□□□□ -0.42
CS-221ENST00000550734 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP12.4□□□□□ -0.42
CS-221ENST00000550734 BAHCC1Q9P281 2608 aa12.39□□□□□ -0.43
CS-221ENST00000550734 MTMR11A4FU01 709 aa12.39□□□□□ -0.43
CS-221ENST00000550734 ZNF233A6NK53 670 aa12.39□□□□□ -0.43
CS-221ENST00000550734 CYB561D2O14569 222 aa12.39□□□□□ -0.43
CS-221ENST00000550734 TGFB1I1O43294 461 aa12.39□□□□□ -0.43
CS-221ENST00000550734 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP12.39□□□□□ -0.43
CS-221ENST00000550734 HOXC13P31276 330 aa12.39□□□□□ -0.43
CS-221ENST00000550734 EPHB3P54753 998 aa12.39□□□□□ -0.43
CS-221ENST00000550734 KRT85P78386 507 aa12.39□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.8 ms