RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550044.1

CS-217, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 546 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-217ENST00000550044 PPM1JQ5JR12 505 aa10.4□□□□□ -0.74
CS-217ENST00000550044 SCARA3Q6AZY7 606 aa10.4□□□□□ -0.74
CS-217ENST00000550044 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP10.4□□□□□ -0.74
CS-217ENST00000550044 PPFIBP1Q86W92 1011 aa10.4□□□□□ -0.74
CS-217ENST00000550044 CBWD2Q8IUF1 395 aa10.4□□□□□ -0.74
CS-217ENST00000550044 SLC44A3Q8N4M1 653 aa10.4□□□□□ -0.74
CS-217ENST00000550044 BEST2Q8NFU1 509 aa10.4□□□□□ -0.74
CS-217ENST00000550044 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP10.4□□□□□ -0.74
CS-217ENST00000550044 CCDC34Q96HJ3 373 aa10.4□□□□□ -0.74
CS-217ENST00000550044 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP10.4□□□□□ -0.74
CS-217ENST00000550044 RXFP1Q9HBX9 757 aa10.4□□□□□ -0.74
CS-217ENST00000550044 PDE11AQ9HCR9 933 aa10.4□□□□□ -0.74
CS-217ENST00000550044 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa10.4□□□□□ -0.74
CS-217ENST00000550044 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP10.4□□□□□ -0.74
CS-217ENST00000550044 DPP3Q9NY33 737 aa10.4□□□□□ -0.74
CS-217ENST00000550044 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP10.4□□□□□ -0.74
CS-217ENST00000550044 FRYQ5TBA9 3013 aa10.39□□□□□ -0.75
CS-217ENST00000550044 ZNF233A6NK53 670 aa10.39□□□□□ -0.75
CS-217ENST00000550044 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP10.39□□□□□ -0.75
CS-217ENST00000550044 ADAM12O43184 909 aa10.39□□□□□ -0.75
CS-217ENST00000550044 LAMTOR5O43504 91 aa10.39□□□□□ -0.75
CS-217ENST00000550044 RHOBTB3O94955 611 aa10.39□□□□□ -0.75
CS-217ENST00000550044 IGHA1P01876 353 aa10.39□□□□□ -0.75
CS-217ENST00000550044 ADH1AP07327 375 aa10.39□□□□□ -0.75
CS-217ENST00000550044 FGFR3P22607 806 aa10.39□□□□□ -0.75
CS-217ENST00000550044 LRPAP1P30533 357 aa10.39□□□□□ -0.75
CS-217ENST00000550044 CLCN4P51793 760 aa10.39□□□□□ -0.75
CS-217ENST00000550044 SH3BP2P78314 561 aa10.39□□□□□ -0.75
CS-217ENST00000550044 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP10.39□□□□□ -0.75
CS-217ENST00000550044 DMWDQ09019 674 aa10.39□□□□□ -0.75
CS-217ENST00000550044 NNTQ13423 1086 aa10.39□□□□□ -0.75
CS-217ENST00000550044 KCNB1Q14721 858 aa10.39□□□□□ -0.75
CS-217ENST00000550044 PSMD5Q16401 504 aa10.39□□□□□ -0.75
CS-217ENST00000550044 C9orf57Q5W0N0 161 aa10.39□□□□□ -0.75
CS-217ENST00000550044 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP10.39□□□□□ -0.75
CS-217ENST00000550044 ISM2Q6H9L7 571 aa10.39□□□□□ -0.75
CS-217ENST00000550044 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP10.39□□□□□ -0.75
CS-217ENST00000550044 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa10.39□□□□□ -0.75
CS-217ENST00000550044 HS2ST1Q7LGA3 356 aa10.39□□□□□ -0.75
CS-217ENST00000550044 BRSK2Q8IWQ3 736 aa10.39□□□□□ -0.75
CS-217ENST00000550044 EFCAB13Q8IY85 973 aa10.39□□□□□ -0.75
CS-217ENST00000550044 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP10.39□□□□□ -0.75
CS-217ENST00000550044 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP10.39□□□□□ -0.75
CS-217ENST00000550044 ATRIPQ8WXE1 791 aa10.39□□□□□ -0.75
CS-217ENST00000550044 PIK3R5Q8WYR1 880 aa10.39□□□□□ -0.75
CS-217ENST00000550044 TIGD1Q96MW7 591 aa10.39□□□□□ -0.75
CS-217ENST00000550044 MYADMQ96S97 322 aa10.39□□□□□ -0.75
CS-217ENST00000550044 TSPAN18Q96SJ8 248 aa10.39□□□□□ -0.75
CS-217ENST00000550044 CLSTN3Q9BQT9 956 aa10.39□□□□□ -0.75
CS-217ENST00000550044 PARD6AQ9NPB6 346 aa10.39□□□□□ -0.75
CS-217ENST00000550044 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP10.39□□□□□ -0.75
CS-217ENST00000550044 FNIP2Q9P278 1114 aa10.39□□□□□ -0.75
CS-217ENST00000550044 DERAQ9Y315 318 aa10.39□□□□□ -0.75
CS-217ENST00000550044 C2CD2Q9Y426 696 aa10.39□□□□□ -0.75
CS-217ENST00000550044 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa10.39□□□□□ -0.75
CS-217ENST00000550044 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP10.39□□□□□ -0.75
CS-217ENST00000550044 CITO14578 2027 aa10.39□□□□□ -0.75
CS-217ENST00000550044 CEP295Q9C0D2 2601 aa10.38□□□□□ -0.75
CS-217ENST00000550044 CLUHO75153 1309 aa10.38□□□□□ -0.75
CS-217ENST00000550044 UBE4BO95155 1302 aa10.38□□□□□ -0.75
CS-217ENST00000550044 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa10.38□□□□□ -0.75
CS-217ENST00000550044 PIRO00625 290 aa10.38□□□□□ -0.75
CS-217ENST00000550044 TGM5O43548 720 aa10.38□□□□□ -0.75
CS-217ENST00000550044 EXOC3O60645 756 aa10.38□□□□□ -0.75
CS-217ENST00000550044 OR1D2P34982 312 aa10.38□□□□□ -0.75
CS-217ENST00000550044 ARPP19P56211 112 aa10.38□□□□□ -0.75
CS-217ENST00000550044 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP10.38□□□□□ -0.75
CS-217ENST00000550044 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP10.38□□□□□ -0.75
CS-217ENST00000550044 ZNF528Q3MIS6 628 aa10.38□□□□□ -0.75
CS-217ENST00000550044 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP10.38□□□□□ -0.75
CS-217ENST00000550044 DSTYKQ6XUX3 929 aa10.38□□□□□ -0.75
CS-217ENST00000550044 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa10.38□□□□□ -0.75
CS-217ENST00000550044 XXYLT1Q8NBI6 393 aa10.38□□□□□ -0.75
CS-217ENST00000550044 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP10.38□□□□□ -0.75
CS-217ENST00000550044 SMARCE1Q969G3 411 aa10.38□□□□□ -0.75
CS-217ENST00000550044 CCDC127Q96BQ5 260 aa10.38□□□□□ -0.75
CS-217ENST00000550044 SUSD3Q96L08 255 aa10.38□□□□□ -0.75
CS-217ENST00000550044 KCTD10Q9H3F6 313 aa10.38□□□□□ -0.75
CS-217ENST00000550044 KIAA1586Q9HCI6 787 aa10.38□□□□□ -0.75
CS-217ENST00000550044 MAN1C1Q9NR34 630 aa10.38□□□□□ -0.75
CS-217ENST00000550044 EPS15L1Q9UBC2 864 aa10.38□□□□□ -0.75
CS-217ENST00000550044 AGAP1Q9UPQ3 857 aa10.38□□□□□ -0.75
CS-217ENST00000550044 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa10.38□□□□□ -0.75
CS-217ENST00000550044 FASNP49327 2511 aaKnown RBP10.38□□□□□ -0.75
CS-217ENST00000550044 ASPMQ8IZT6 3477 aa10.38□□□□□ -0.75
CS-217ENST00000550044 ANO9A1A5B4 782 aa10.37□□□□□ -0.75
CS-217ENST00000550044 PDXKO00764 312 aa10.37□□□□□ -0.75
CS-217ENST00000550044 SYN3O14994 580 aa10.37□□□□□ -0.75
CS-217ENST00000550044 AP1G2O75843 785 aa10.37□□□□□ -0.75
CS-217ENST00000550044 SMC2O95347 1197 aa10.37□□□□□ -0.75
CS-217ENST00000550044 ADH1CP00326 375 aa10.37□□□□□ -0.75
CS-217ENST00000550044 GLUD1P00367 558 aa10.37□□□□□ -0.75
CS-217ENST00000550044 ITGB3P05106 788 aa10.37□□□□□ -0.75
CS-217ENST00000550044 KRT19P08727 400 aa10.37□□□□□ -0.75
CS-217ENST00000550044 DLATP10515 647 aaKnown RBP10.37□□□□□ -0.75
CS-217ENST00000550044 TGM1P22735 817 aa10.37□□□□□ -0.75
CS-217ENST00000550044 WDR4P57081 412 aaKnown RBP10.37□□□□□ -0.75
CS-217ENST00000550044 LILRA4P59901 499 aa10.37□□□□□ -0.75
CS-217ENST00000550044 UBE2HP62256 183 aa10.37□□□□□ -0.75
CS-217ENST00000550044 ACAP1Q15027 740 aa10.37□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.3 ms