RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548092.5

TRAFD1-204, Transcript of TRAF-type zinc finger domain containing 1, humanhuman

TSL 3

Gene TRAFD1, Length 584 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAFD1-204ENST00000548092 CACNB3P54284 484 aa4.87□□□□□ -1.63
TRAFD1-204ENST00000548092 NUCB1Q02818 461 aa4.87□□□□□ -1.63
TRAFD1-204ENST00000548092 TAP1Q03518 808 aa4.87□□□□□ -1.63
TRAFD1-204ENST00000548092 SIGLEC14Q08ET2 396 aa4.87□□□□□ -1.63
TRAFD1-204ENST00000548092 ZNF460Q14592 562 aa4.87□□□□□ -1.63
TRAFD1-204ENST00000548092 GRM7Q14831 915 aa4.87□□□□□ -1.63
TRAFD1-204ENST00000548092 ATP2B3Q16720 1220 aa4.87□□□□□ -1.63
TRAFD1-204ENST00000548092 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
TRAFD1-204ENST00000548092 MIGA2Q7L4E1 593 aa4.87□□□□□ -1.63
TRAFD1-204ENST00000548092 COPS6Q7L5N1 327 aa4.87□□□□□ -1.63
TRAFD1-204ENST00000548092 FAM83AQ86UY5 434 aa4.87□□□□□ -1.63
TRAFD1-204ENST00000548092 CREBRFQ8IUR6 639 aa4.87□□□□□ -1.63
TRAFD1-204ENST00000548092 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa4.87□□□□□ -1.63
TRAFD1-204ENST00000548092 C1orf210Q8IVY1 113 aa4.87□□□□□ -1.63
TRAFD1-204ENST00000548092 TMEM199Q8N511 208 aa4.87□□□□□ -1.63
TRAFD1-204ENST00000548092 GDPD5Q8WTR4 605 aa4.87□□□□□ -1.63
TRAFD1-204ENST00000548092 TMEM176AQ96HP8 235 aa4.87□□□□□ -1.63
TRAFD1-204ENST00000548092 ISCA1Q9BUE6 129 aa4.87□□□□□ -1.63
TRAFD1-204ENST00000548092 BOCQ9BWV1 1114 aa4.87□□□□□ -1.63
TRAFD1-204ENST00000548092 OSBPL2Q9H1P3 480 aa4.87□□□□□ -1.63
TRAFD1-204ENST00000548092 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
TRAFD1-204ENST00000548092 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
TRAFD1-204ENST00000548092 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa4.87□□□□□ -1.63
TRAFD1-204ENST00000548092 PHIPQ8WWQ0 1821 aa4.87□□□□□ -1.63
TRAFD1-204ENST00000548092 AKAP13Q12802 2813 aa4.87□□□□□ -1.63
TRAFD1-204ENST00000548092 RELNP78509 3460 aa4.87□□□□□ -1.63
TRAFD1-204ENST00000548092 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa4.86□□□□□ -1.63
TRAFD1-204ENST00000548092 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
TRAFD1-204ENST00000548092 MBD3O95983 291 aa4.86□□□□□ -1.63
TRAFD1-204ENST00000548092 ANXA1P04083 346 aa4.86□□□□□ -1.63
TRAFD1-204ENST00000548092 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
TRAFD1-204ENST00000548092 MAPK4P31152 587 aa4.86□□□□□ -1.63
TRAFD1-204ENST00000548092 KIF11P52732 1056 aa4.86□□□□□ -1.63
TRAFD1-204ENST00000548092 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
TRAFD1-204ENST00000548092 RABEP1Q15276 862 aa4.86□□□□□ -1.63
TRAFD1-204ENST00000548092 CCDC152Q4G0S7 254 aa4.86□□□□□ -1.63
TRAFD1-204ENST00000548092 ANO1Q5XXA6 986 aa4.86□□□□□ -1.63
TRAFD1-204ENST00000548092 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa4.86□□□□□ -1.63
TRAFD1-204ENST00000548092 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
TRAFD1-204ENST00000548092 MCM10Q7L590 875 aa4.86□□□□□ -1.63
TRAFD1-204ENST00000548092 GPR142Q7Z601 462 aa4.86□□□□□ -1.63
TRAFD1-204ENST00000548092 CCDC146Q8IYE0 955 aa4.86□□□□□ -1.63
TRAFD1-204ENST00000548092 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
TRAFD1-204ENST00000548092 GPT2Q8TD30 523 aa4.86□□□□□ -1.63
TRAFD1-204ENST00000548092 CALML6Q8TD86 181 aa4.86□□□□□ -1.63
TRAFD1-204ENST00000548092 DDX19BQ9UMR2 479 aa4.86□□□□□ -1.63
TRAFD1-204ENST00000548092 TNNQ9UQP3 1299 aa4.86□□□□□ -1.63
TRAFD1-204ENST00000548092 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
TRAFD1-204ENST00000548092 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP4.86□□□□□ -1.63
TRAFD1-204ENST00000548092 ZHX2Q9Y6X8 837 aa4.86□□□□□ -1.63
TRAFD1-204ENST00000548092 TNKSO95271 1327 aa4.86□□□□□ -1.63
TRAFD1-204ENST00000548092 C2CD3Q4AC94 2353 aa4.86□□□□□ -1.63
TRAFD1-204ENST00000548092 SPEF2Q9C093 1822 aa4.86□□□□□ -1.63
TRAFD1-204ENST00000548092 PTPDC1A2A3K4 754 aa4.85□□□□□ -1.63
TRAFD1-204ENST00000548092 TRIM75PA6NK02 468 aa4.85□□□□□ -1.63
TRAFD1-204ENST00000548092 SEPT4O43236 478 aa4.85□□□□□ -1.63
TRAFD1-204ENST00000548092 SUV39H1O43463 412 aa4.85□□□□□ -1.63
TRAFD1-204ENST00000548092 SLC26A4O43511 780 aa4.85□□□□□ -1.63
TRAFD1-204ENST00000548092 NARSO43776 548 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
TRAFD1-204ENST00000548092 MAFO75444 373 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
TRAFD1-204ENST00000548092 PRLP01236 227 aa4.85□□□□□ -1.63
TRAFD1-204ENST00000548092 FGBP02675 491 aa4.85□□□□□ -1.63
TRAFD1-204ENST00000548092 IL1R1P14778 569 aa4.85□□□□□ -1.63
TRAFD1-204ENST00000548092 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
TRAFD1-204ENST00000548092 CYP2C19P33261 490 aa4.85□□□□□ -1.63
TRAFD1-204ENST00000548092 ADCY7P51828 1080 aa4.85□□□□□ -1.63
TRAFD1-204ENST00000548092 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
TRAFD1-204ENST00000548092 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
TRAFD1-204ENST00000548092 SLC6A3Q01959 620 aa4.85□□□□□ -1.63
TRAFD1-204ENST00000548092 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
TRAFD1-204ENST00000548092 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
TRAFD1-204ENST00000548092 FAM47AQ5JRC9 791 aa4.85□□□□□ -1.63
TRAFD1-204ENST00000548092 FKBP1CQ5VVH2 108 aa4.85□□□□□ -1.63
TRAFD1-204ENST00000548092 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
TRAFD1-204ENST00000548092 SCYL3Q8IZE3 742 aa4.85□□□□□ -1.63
TRAFD1-204ENST00000548092 FAM184AQ8NB25 1140 aa4.85□□□□□ -1.63
TRAFD1-204ENST00000548092 SHCBP1Q8NEM2 672 aa4.85□□□□□ -1.63
TRAFD1-204ENST00000548092 RUNDC1Q96C34 613 aa4.85□□□□□ -1.63
TRAFD1-204ENST00000548092 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
TRAFD1-204ENST00000548092 FOXB1Q99853 325 aa4.85□□□□□ -1.63
TRAFD1-204ENST00000548092 PORCNQ9H237 461 aa4.85□□□□□ -1.63
TRAFD1-204ENST00000548092 TXNRD2Q9NNW7 524 aa4.85□□□□□ -1.63
TRAFD1-204ENST00000548092 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa4.85□□□□□ -1.63
TRAFD1-204ENST00000548092 MIS18AQ9NYP9 233 aa4.85□□□□□ -1.63
TRAFD1-204ENST00000548092 OGFRQ9NZT2 677 aa4.85□□□□□ -1.63
TRAFD1-204ENST00000548092 KIF3AQ9Y496 699 aa4.85□□□□□ -1.63
TRAFD1-204ENST00000548092 IL16Q14005 1332 aa4.85□□□□□ -1.63
TRAFD1-204ENST00000548092 TAF4O00268 1085 aa4.84□□□□□ -1.63
TRAFD1-204ENST00000548092 TULP2O00295 520 aa4.84□□□□□ -1.63
TRAFD1-204ENST00000548092 OPA1O60313 960 aa4.84□□□□□ -1.63
TRAFD1-204ENST00000548092 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
TRAFD1-204ENST00000548092 LMNAP02545 664 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
TRAFD1-204ENST00000548092 APPP05067 770 aa4.84□□□□□ -1.63
TRAFD1-204ENST00000548092 HOXC6P09630 235 aa4.84□□□□□ -1.63
TRAFD1-204ENST00000548092 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
TRAFD1-204ENST00000548092 IGFALSP35858 605 aa4.84□□□□□ -1.63
TRAFD1-204ENST00000548092 ADAM8P78325 824 aa4.84□□□□□ -1.63
TRAFD1-204ENST00000548092 PTH1RQ03431 593 aa4.84□□□□□ -1.63
TRAFD1-204ENST00000548092 RIN1Q13671 783 aa4.84□□□□□ -1.63
TRAFD1-204ENST00000548092 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.2 ms