RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545825.1

CCDC189-211, Transcript of coiled-coil domain containing 189, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CCDC189, Length 1,046 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC189-211ENST00000545825 FAM171BQ6P995 826 aa24.07■■□□□ 1.44
CCDC189-211ENST00000545825 TMC8Q8IU68 726 aa24.07■■□□□ 1.44
CCDC189-211ENST00000545825 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP24.07■■□□□ 1.44
CCDC189-211ENST00000545825 PSMG2Q969U7 264 aa24.07■■□□□ 1.44
CCDC189-211ENST00000545825 NXPE3Q969Y0 559 aa24.07■■□□□ 1.44
CCDC189-211ENST00000545825 PI4K2AQ9BTU6 479 aa24.07■■□□□ 1.44
CCDC189-211ENST00000545825 ABCB6Q9NP58 842 aa24.07■■□□□ 1.44
CCDC189-211ENST00000545825 CRTAC1Q9NQ79 661 aa24.07■■□□□ 1.44
CCDC189-211ENST00000545825 CDH9Q9ULB4 789 aa24.07■■□□□ 1.44
CCDC189-211ENST00000545825 ASB3Q9Y575 518 aa24.07■■□□□ 1.44
CCDC189-211ENST00000545825 PRR33A8MZF0 331 aa24.06■■□□□ 1.44
CCDC189-211ENST00000545825 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
CCDC189-211ENST00000545825 MOSPD3O75425 235 aa24.06■■□□□ 1.44
CCDC189-211ENST00000545825 HLA-DRAP01903 254 aa24.06■■□□□ 1.44
CCDC189-211ENST00000545825 PDGFRBP09619 1106 aa24.06■■□□□ 1.44
CCDC189-211ENST00000545825 MYL4P12829 197 aa24.06■■□□□ 1.44
CCDC189-211ENST00000545825 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP24.06■■□□□ 1.44
CCDC189-211ENST00000545825 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP24.06■■□□□ 1.44
CCDC189-211ENST00000545825 LPIN3Q9BQK8 851 aa24.06■■□□□ 1.44
CCDC189-211ENST00000545825 SNX25Q9H3E2 840 aa24.06■■□□□ 1.44
CCDC189-211ENST00000545825 SMYD3Q9H7B4 428 aa24.06■■□□□ 1.44
CCDC189-211ENST00000545825 GDE1Q9NZC3 331 aa24.06■■□□□ 1.44
CCDC189-211ENST00000545825 KIAA1468Q9P260 1216 aa24.06■■□□□ 1.44
CCDC189-211ENST00000545825 NUMBLQ9Y6R0 609 aa24.06■■□□□ 1.44
CCDC189-211ENST00000545825 MYO10Q9HD67 2058 aa24.06■■□□□ 1.44
CCDC189-211ENST00000545825 ASS1P00966 412 aaKnown RBP24.05■■□□□ 1.44
CCDC189-211ENST00000545825 PIK3CAP42336 1068 aa24.05■■□□□ 1.44
CCDC189-211ENST00000545825 CFAP221Q4G0U5 840 aa24.05■■□□□ 1.44
CCDC189-211ENST00000545825 KLHL10Q6JEL2 608 aa24.05■■□□□ 1.44
CCDC189-211ENST00000545825 PARM1Q6UWI2 310 aa24.05■■□□□ 1.44
CCDC189-211ENST00000545825 ITIH5Q86UX2 942 aa24.05■■□□□ 1.44
CCDC189-211ENST00000545825 SLC44A3Q8N4M1 653 aa24.05■■□□□ 1.44
CCDC189-211ENST00000545825 OR6B3Q8NGW1 331 aa24.05■■□□□ 1.44
CCDC189-211ENST00000545825 TAS1R2Q8TE23 839 aa24.05■■□□□ 1.44
CCDC189-211ENST00000545825 TAF4BQ92750 862 aa24.05■■□□□ 1.44
CCDC189-211ENST00000545825 FGF14Q92915 247 aa24.05■■□□□ 1.44
CCDC189-211ENST00000545825 MCRS1Q96EZ8 462 aa24.05■■□□□ 1.44
CCDC189-211ENST00000545825 ASIC4Q96FT7 647 aa24.05■■□□□ 1.44
CCDC189-211ENST00000545825 MMRN2Q9H8L6 949 aa24.05■■□□□ 1.44
CCDC189-211ENST00000545825 TMEM8AQ9HCN3 771 aa24.05■■□□□ 1.44
CCDC189-211ENST00000545825 TECTAO75443 2155 aa24.04■■□□□ 1.44
CCDC189-211ENST00000545825 TMEM221A6NGB7 291 aa24.04■■□□□ 1.44
CCDC189-211ENST00000545825 M0R296 226 aa24.04■■□□□ 1.44
CCDC189-211ENST00000545825 CLSTN1O94985 981 aa24.04■■□□□ 1.44
CCDC189-211ENST00000545825 GJA1P17302 382 aa24.04■■□□□ 1.44
CCDC189-211ENST00000545825 CYP2F1P24903 491 aa24.04■■□□□ 1.44
CCDC189-211ENST00000545825 GTF2H1P32780 548 aa24.04■■□□□ 1.44
CCDC189-211ENST00000545825 CDH8P55286 799 aa24.04■■□□□ 1.44
CCDC189-211ENST00000545825 VEPH1Q14D04 833 aa24.04■■□□□ 1.44
CCDC189-211ENST00000545825 TTI2Q6NXR4 508 aa24.04■■□□□ 1.44
CCDC189-211ENST00000545825 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP24.04■■□□□ 1.44
CCDC189-211ENST00000545825 TRIML1Q8N9V2 468 aa24.04■■□□□ 1.44
CCDC189-211ENST00000545825 SHKBP1Q8TBC3 707 aa24.04■■□□□ 1.44
CCDC189-211ENST00000545825 FAM200AQ8TCP9 573 aa24.04■■□□□ 1.44
CCDC189-211ENST00000545825 NELFBQ8WX92 580 aa24.04■■□□□ 1.44
CCDC189-211ENST00000545825 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP24.04■■□□□ 1.44
CCDC189-211ENST00000545825 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP24.04■■□□□ 1.44
CCDC189-211ENST00000545825 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP24.04■■□□□ 1.44
CCDC189-211ENST00000545825 SDCBP2Q9H190 292 aa24.04■■□□□ 1.44
CCDC189-211ENST00000545825 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP24.04■■□□□ 1.44
CCDC189-211ENST00000545825 LMBRD1Q9NUN5 540 aa24.04■■□□□ 1.44
CCDC189-211ENST00000545825 DUSP12Q9UNI6 340 aa24.04■■□□□ 1.44
CCDC189-211ENST00000545825 RAP1GAPP47736 663 aa24.03■■□□□ 1.44
CCDC189-211ENST00000545825 GPR15P49685 360 aa24.03■■□□□ 1.44
CCDC189-211ENST00000545825 KRT39Q6A163 491 aa24.03■■□□□ 1.44
CCDC189-211ENST00000545825 SPOPLQ6IQ16 392 aa24.03■■□□□ 1.44
CCDC189-211ENST00000545825 FOXR2Q6PJQ5 311 aa24.03■■□□□ 1.44
CCDC189-211ENST00000545825 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa24.03■■□□□ 1.44
CCDC189-211ENST00000545825 HFE2Q6ZVN8 426 aa24.03■■□□□ 1.44
CCDC189-211ENST00000545825 MTSS1LQ765P7 747 aa24.03■■□□□ 1.44
CCDC189-211ENST00000545825 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa24.03■■□□□ 1.44
CCDC189-211ENST00000545825 GPR152Q8TDT2 470 aa24.03■■□□□ 1.44
CCDC189-211ENST00000545825 GIPC2Q8TF65 315 aa24.03■■□□□ 1.44
CCDC189-211ENST00000545825 MYLPFQ96A32 169 aa24.03■■□□□ 1.44
CCDC189-211ENST00000545825 DPEP3Q9H4B8 488 aa24.03■■□□□ 1.44
CCDC189-211ENST00000545825 CLSTN2Q9H4D0 955 aa24.03■■□□□ 1.44
CCDC189-211ENST00000545825 CTNND2Q9UQB3 1225 aa24.03■■□□□ 1.44
CCDC189-211ENST00000545825 A0A1W2PRU2 124 aa24.02■■□□□ 1.44
CCDC189-211ENST00000545825 NARSO43776 548 aaKnown RBP24.02■■□□□ 1.44
CCDC189-211ENST00000545825 TEAD2Q15562 447 aa24.02■■□□□ 1.44
CCDC189-211ENST00000545825 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP24.02■■□□□ 1.44
CCDC189-211ENST00000545825 C4orf50Q6ZRC1 276 aa24.02■■□□□ 1.44
CCDC189-211ENST00000545825 GAREM2Q75VX8 874 aa24.02■■□□□ 1.44
CCDC189-211ENST00000545825 PCED1BQ96HM7 432 aa24.02■■□□□ 1.44
CCDC189-211ENST00000545825 ZSWIM3Q96MP5 696 aa24.02■■□□□ 1.44
CCDC189-211ENST00000545825 CEP63Q96MT8 703 aa24.02■■□□□ 1.44
CCDC189-211ENST00000545825 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP24.02■■□□□ 1.44
CCDC189-211ENST00000545825 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP24.02■■□□□ 1.44
CCDC189-211ENST00000545825 A8MXQ7 604 aa24.01■■□□□ 1.43
CCDC189-211ENST00000545825 STX10O60499 249 aa24.01■■□□□ 1.43
CCDC189-211ENST00000545825 LRRN2O75325 713 aa24.01■■□□□ 1.43
CCDC189-211ENST00000545825 P4HA1P13674 534 aa24.01■■□□□ 1.43
CCDC189-211ENST00000545825 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP24.01■■□□□ 1.43
CCDC189-211ENST00000545825 MAGEA11P43364 429 aa24.01■■□□□ 1.43
CCDC189-211ENST00000545825 ASPAP45381 313 aa24.01■■□□□ 1.43
CCDC189-211ENST00000545825 MXI1P50539 228 aa24.01■■□□□ 1.43
CCDC189-211ENST00000545825 NOP14P78316 857 aaKnown RBP24.01■■□□□ 1.43
CCDC189-211ENST00000545825 DDR2Q16832 855 aa24.01■■□□□ 1.43
CCDC189-211ENST00000545825 MDH1BQ5I0G3 518 aa24.01■■□□□ 1.43
CCDC189-211ENST00000545825 SDHAF4Q5VUM1 108 aa24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.6 ms