RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000543190.5

LTBR-211, Transcript of lymphotoxin beta receptor, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene LTBR, Length 785 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBR-211ENST00000543190 CSH1P0DML2 217 aa20.07■□□□□ 0.8
LTBR-211ENST00000543190 CSH2P0DML3 217 aa20.07■□□□□ 0.8
LTBR-211ENST00000543190 STAT6P42226 847 aa20.07■□□□□ 0.8
LTBR-211ENST00000543190 E2F4Q16254 413 aa20.07■□□□□ 0.8
LTBR-211ENST00000543190 DCLK2Q8N568 766 aa20.07■□□□□ 0.8
LTBR-211ENST00000543190 LINC00301Q8NCQ3 95 aa20.07■□□□□ 0.8
LTBR-211ENST00000543190 GCNAQ96QF7 691 aa20.07■□□□□ 0.8
LTBR-211ENST00000543190 PANK4Q9NVE7 773 aa20.07■□□□□ 0.8
LTBR-211ENST00000543190 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
LTBR-211ENST00000543190 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
LTBR-211ENST00000543190 L1RE1Q9UN81 338 aa20.07■□□□□ 0.8
LTBR-211ENST00000543190 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
LTBR-211ENST00000543190 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa20.06■□□□□ 0.8
LTBR-211ENST00000543190 HUS1O60921 280 aa20.06■□□□□ 0.8
LTBR-211ENST00000543190 ITGB3P05106 788 aa20.06■□□□□ 0.8
LTBR-211ENST00000543190 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
LTBR-211ENST00000543190 LHX1P48742 406 aa20.06■□□□□ 0.8
LTBR-211ENST00000543190 ARHGAP8P85298 464 aa20.06■□□□□ 0.8
LTBR-211ENST00000543190 SURF1Q15526 300 aa20.06■□□□□ 0.8
LTBR-211ENST00000543190 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa20.06■□□□□ 0.8
LTBR-211ENST00000543190 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
LTBR-211ENST00000543190 FAM173BQ6P4H8 233 aa20.06■□□□□ 0.8
LTBR-211ENST00000543190 TSSK4Q6SA08 328 aa20.06■□□□□ 0.8
LTBR-211ENST00000543190 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa20.06■□□□□ 0.8
LTBR-211ENST00000543190 GPD1LQ8N335 351 aa20.06■□□□□ 0.8
LTBR-211ENST00000543190 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa20.06■□□□□ 0.8
LTBR-211ENST00000543190 NCDNQ9UBB6 729 aa20.06■□□□□ 0.8
LTBR-211ENST00000543190 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
LTBR-211ENST00000543190 SIX4Q9UIU6 781 aa20.06■□□□□ 0.8
LTBR-211ENST00000543190 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa20.06■□□□□ 0.8
LTBR-211ENST00000543190 ATG2BQ96BY7 2078 aa20.06■□□□□ 0.8
LTBR-211ENST00000543190 EML5Q05BV3 1969 aa20.05■□□□□ 0.8
LTBR-211ENST00000543190 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa20.05■□□□□ 0.8
LTBR-211ENST00000543190 K7ESF4 209 aa20.05■□□□□ 0.8
LTBR-211ENST00000543190 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP20.05■□□□□ 0.8
LTBR-211ENST00000543190 STX6O43752 255 aa20.05■□□□□ 0.8
LTBR-211ENST00000543190 NOL4O94818 638 aa20.05■□□□□ 0.8
LTBR-211ENST00000543190 FAM163BP0C2L3 166 aa20.05■□□□□ 0.8
LTBR-211ENST00000543190 MAGEA11P43364 429 aa20.05■□□□□ 0.8
LTBR-211ENST00000543190 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
LTBR-211ENST00000543190 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
LTBR-211ENST00000543190 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
LTBR-211ENST00000543190 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
LTBR-211ENST00000543190 LAIR1Q6GTX8 287 aa20.05■□□□□ 0.8
LTBR-211ENST00000543190 TXNDC11Q6PKC3 985 aa20.05■□□□□ 0.8
LTBR-211ENST00000543190 MON1AQ86VX9 555 aa20.05■□□□□ 0.8
LTBR-211ENST00000543190 CCDC65Q8IXS2 484 aa20.05■□□□□ 0.8
LTBR-211ENST00000543190 KIAA1958Q8N8K9 716 aa20.05■□□□□ 0.8
LTBR-211ENST00000543190 HINFPQ9BQA5 517 aa20.05■□□□□ 0.8
LTBR-211ENST00000543190 CBWD1Q9BRT8 395 aa20.05■□□□□ 0.8
LTBR-211ENST00000543190 KIAA1586Q9HCI6 787 aa20.05■□□□□ 0.8
LTBR-211ENST00000543190 TMLHEQ9NVH6 421 aa20.05■□□□□ 0.8
LTBR-211ENST00000543190 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
LTBR-211ENST00000543190 GTSE1Q9NYZ3 720 aa20.05■□□□□ 0.8
LTBR-211ENST00000543190 AGAP1Q9UPQ3 857 aa20.05■□□□□ 0.8
LTBR-211ENST00000543190 MYO16Q9Y6X6 1858 aa20.05■□□□□ 0.8
LTBR-211ENST00000543190 SLC38A8A6NNN8 435 aa20.04■□□□□ 0.8
LTBR-211ENST00000543190 TCF3P15923 654 aa20.04■□□□□ 0.8
LTBR-211ENST00000543190 PCSK1P29120 753 aa20.04■□□□□ 0.8
LTBR-211ENST00000543190 RBP5P82980 135 aa20.04■□□□□ 0.8
LTBR-211ENST00000543190 CYP4F8P98187 520 aa20.04■□□□□ 0.8
LTBR-211ENST00000543190 MYL7Q01449 175 aa20.04■□□□□ 0.8
LTBR-211ENST00000543190 LMNB2Q03252 620 aa20.04■□□□□ 0.8
LTBR-211ENST00000543190 TAF12Q16514 161 aa20.04■□□□□ 0.8
LTBR-211ENST00000543190 FAM171BQ6P995 826 aa20.04■□□□□ 0.8
LTBR-211ENST00000543190 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
LTBR-211ENST00000543190 SYCP3Q8IZU3 236 aa20.04■□□□□ 0.8
LTBR-211ENST00000543190 FAM200AQ8TCP9 573 aa20.04■□□□□ 0.8
LTBR-211ENST00000543190 SAAL1Q96ER3 474 aa20.04■□□□□ 0.8
LTBR-211ENST00000543190 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa20.04■□□□□ 0.8
LTBR-211ENST00000543190 TRIM9Q9C026 710 aa20.04■□□□□ 0.8
LTBR-211ENST00000543190 PDE11AQ9HCR9 933 aa20.04■□□□□ 0.8
LTBR-211ENST00000543190 TDP1Q9NUW8 608 aa20.04■□□□□ 0.8
LTBR-211ENST00000543190 INTS13Q9NVM9 706 aa20.04■□□□□ 0.8
LTBR-211ENST00000543190 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
LTBR-211ENST00000543190 TBC1D7Q9P0N9 293 aa20.04■□□□□ 0.8
LTBR-211ENST00000543190 SDK1Q7Z5N4 2213 aa20.03■□□□□ 0.8
LTBR-211ENST00000543190 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP20.03■□□□□ 0.8
LTBR-211ENST00000543190 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
LTBR-211ENST00000543190 IDEP14735 1019 aa20.03■□□□□ 0.8
LTBR-211ENST00000543190 PFKLP17858 780 aa20.03■□□□□ 0.8
LTBR-211ENST00000543190 AVPR1AP37288 418 aa20.03■□□□□ 0.8
LTBR-211ENST00000543190 SATB1Q01826 763 aa20.03■□□□□ 0.8
LTBR-211ENST00000543190 EHHADHQ08426 723 aa20.03■□□□□ 0.8
LTBR-211ENST00000543190 TMEM196Q5HYL7 178 aa20.03■□□□□ 0.8
LTBR-211ENST00000543190 DGLUCYQ7Z3D6 616 aa20.03■□□□□ 0.8
LTBR-211ENST00000543190 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa20.03■□□□□ 0.8
LTBR-211ENST00000543190 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP20.03■□□□□ 0.8
LTBR-211ENST00000543190 BACH2Q9BYV9 841 aa20.03■□□□□ 0.8
LTBR-211ENST00000543190 ACACBO00763 2458 aa20.03■□□□□ 0.8
LTBR-211ENST00000543190 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP20.02■□□□□ 0.8
LTBR-211ENST00000543190 YEATS4O95619 227 aa20.02■□□□□ 0.8
LTBR-211ENST00000543190 RETP07949 1114 aa20.02■□□□□ 0.8
LTBR-211ENST00000543190 HOXD13P35453 343 aa20.02■□□□□ 0.8
LTBR-211ENST00000543190 SOX9P48436 509 aa20.02■□□□□ 0.8
LTBR-211ENST00000543190 AMPD3Q01432 767 aa20.02■□□□□ 0.8
LTBR-211ENST00000543190 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.8
LTBR-211ENST00000543190 MYO1EQ12965 1108 aa20.02■□□□□ 0.8
LTBR-211ENST00000543190 SOWAHAQ2M3V2 549 aa20.02■□□□□ 0.8
LTBR-211ENST00000543190 LONP2Q86WA8 852 aa20.02■□□□□ 0.8
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