RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540240.1

C16orf62-212, Transcript of UPF0505 protein C16orf62, humanhuman

TSL 3

Gene C16orf62, Length 633 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf62-212ENST00000540240 PPM1LQ5SGD2 360 aa8.49□□□□□ -1.05
C16orf62-212ENST00000540240 LIN9Q5TKA1 542 aa8.49□□□□□ -1.05
C16orf62-212ENST00000540240 SLC27A1Q6PCB7 646 aa8.49□□□□□ -1.05
C16orf62-212ENST00000540240 ZNF574Q6ZN55 896 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
C16orf62-212ENST00000540240 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa8.49□□□□□ -1.05
C16orf62-212ENST00000540240 RUFY3Q7L099 469 aa8.49□□□□□ -1.05
C16orf62-212ENST00000540240 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
C16orf62-212ENST00000540240 WFDC3Q8IUB2 231 aa8.49□□□□□ -1.05
C16orf62-212ENST00000540240 CCNJLQ8IV13 435 aa8.49□□□□□ -1.05
C16orf62-212ENST00000540240 PJA1Q8NG27 643 aa8.49□□□□□ -1.05
C16orf62-212ENST00000540240 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
C16orf62-212ENST00000540240 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
C16orf62-212ENST00000540240 RMDN1Q96DB5 314 aa8.49□□□□□ -1.05
C16orf62-212ENST00000540240 TCF12Q99081 682 aa8.49□□□□□ -1.05
C16orf62-212ENST00000540240 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
C16orf62-212ENST00000540240 LXNQ9BS40 222 aa8.49□□□□□ -1.05
C16orf62-212ENST00000540240 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
C16orf62-212ENST00000540240 BCO2Q9BYV7 579 aa8.49□□□□□ -1.05
C16orf62-212ENST00000540240 GPR62Q9BZJ7 368 aa8.49□□□□□ -1.05
C16orf62-212ENST00000540240 CLEC4MQ9H2X3 399 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
C16orf62-212ENST00000540240 ACSS3Q9H6R3 686 aa8.49□□□□□ -1.05
C16orf62-212ENST00000540240 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
C16orf62-212ENST00000540240 ANKEF1Q9NU02 776 aa8.49□□□□□ -1.05
C16orf62-212ENST00000540240 MIOSQ9NXC5 875 aa8.49□□□□□ -1.05
C16orf62-212ENST00000540240 CDH7Q9ULB5 785 aa8.49□□□□□ -1.05
C16orf62-212ENST00000540240 NUMBLQ9Y6R0 609 aa8.49□□□□□ -1.05
C16orf62-212ENST00000540240 C2orf16Q68DN1 1984 aa8.49□□□□□ -1.05
C16orf62-212ENST00000540240 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP8.49□□□□□ -1.05
C16orf62-212ENST00000540240 WDFY4Q6ZS81 3184 aa8.48□□□□□ -1.05
C16orf62-212ENST00000540240 A0A1B0GUA9 196 aa8.48□□□□□ -1.05
C16orf62-212ENST00000540240 KANSL1LA0AUZ9 987 aa8.48□□□□□ -1.05
C16orf62-212ENST00000540240 LAMTOR5O43504 91 aa8.48□□□□□ -1.05
C16orf62-212ENST00000540240 SLC37A4O43826 429 aa8.48□□□□□ -1.05
C16orf62-212ENST00000540240 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
C16orf62-212ENST00000540240 LYPLA2O95372 231 aa8.48□□□□□ -1.05
C16orf62-212ENST00000540240 POU2F2P09086 479 aa8.48□□□□□ -1.05
C16orf62-212ENST00000540240 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
C16orf62-212ENST00000540240 GPC5P78333 572 aa8.48□□□□□ -1.05
C16orf62-212ENST00000540240 MAP7Q14244 749 aa8.48□□□□□ -1.05
C16orf62-212ENST00000540240 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
C16orf62-212ENST00000540240 NPY5RQ15761 445 aa8.48□□□□□ -1.05
C16orf62-212ENST00000540240 SLC44A4Q53GD3 710 aa8.48□□□□□ -1.05
C16orf62-212ENST00000540240 NCAPH2Q6IBW4 605 aa8.48□□□□□ -1.05
C16orf62-212ENST00000540240 SEZ6L2Q6UXD5 910 aa8.48□□□□□ -1.05
C16orf62-212ENST00000540240 TPH2Q8IWU9 490 aa8.48□□□□□ -1.05
C16orf62-212ENST00000540240 DYDC2Q96IM9 177 aa8.48□□□□□ -1.05
C16orf62-212ENST00000540240 CPB2Q96IY4 423 aa8.48□□□□□ -1.05
C16orf62-212ENST00000540240 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
C16orf62-212ENST00000540240 PHF20Q9BVI0 1012 aa8.48□□□□□ -1.05
C16orf62-212ENST00000540240 APOL6Q9BWW8 343 aa8.48□□□□□ -1.05
C16orf62-212ENST00000540240 C1GALT1Q9NS00 363 aa8.48□□□□□ -1.05
C16orf62-212ENST00000540240 DLL3Q9NYJ7 618 aa8.48□□□□□ -1.05
C16orf62-212ENST00000540240 RGL1Q9NZL6 768 aa8.48□□□□□ -1.05
C16orf62-212ENST00000540240 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
C16orf62-212ENST00000540240 PARP2Q9UGN5 583 aa8.48□□□□□ -1.05
C16orf62-212ENST00000540240 HES2Q9Y543 173 aa8.48□□□□□ -1.05
C16orf62-212ENST00000540240 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa8.48□□□□□ -1.05
C16orf62-212ENST00000540240 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
C16orf62-212ENST00000540240 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa8.47□□□□□ -1.05
C16orf62-212ENST00000540240 SLITRK3O94933 977 aa8.47□□□□□ -1.05
C16orf62-212ENST00000540240 MYBP10242 640 aa8.47□□□□□ -1.05
C16orf62-212ENST00000540240 JUNBP17275 347 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
C16orf62-212ENST00000540240 ARL2P36404 184 aa8.47□□□□□ -1.05
C16orf62-212ENST00000540240 MBTD1Q05BQ5 628 aa8.47□□□□□ -1.05
C16orf62-212ENST00000540240 TUSC3Q13454 348 aa8.47□□□□□ -1.05
C16orf62-212ENST00000540240 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
C16orf62-212ENST00000540240 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
C16orf62-212ENST00000540240 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
C16orf62-212ENST00000540240 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
C16orf62-212ENST00000540240 GLYCTKQ8IVS8 523 aa8.47□□□□□ -1.05
C16orf62-212ENST00000540240 SUMF1Q8NBK3 374 aa8.47□□□□□ -1.05
C16orf62-212ENST00000540240 AGBL5Q8NDL9 886 aa8.47□□□□□ -1.05
C16orf62-212ENST00000540240 GSTCDQ8NEC7 633 aa8.47□□□□□ -1.05
C16orf62-212ENST00000540240 ATRIPQ8WXE1 791 aa8.47□□□□□ -1.05
C16orf62-212ENST00000540240 WASF1Q92558 559 aa8.47□□□□□ -1.05
C16orf62-212ENST00000540240 HAS1Q92839 578 aa8.47□□□□□ -1.05
C16orf62-212ENST00000540240 TTPALQ9BTX7 342 aa8.47□□□□□ -1.05
C16orf62-212ENST00000540240 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
C16orf62-212ENST00000540240 TM6SF1Q9BZW5 370 aa8.47□□□□□ -1.05
C16orf62-212ENST00000540240 LIN7BQ9HAP6 207 aa8.47□□□□□ -1.05
C16orf62-212ENST00000540240 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa8.47□□□□□ -1.05
C16orf62-212ENST00000540240 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
C16orf62-212ENST00000540240 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
C16orf62-212ENST00000540240 NCDNQ9UBB6 729 aa8.47□□□□□ -1.05
C16orf62-212ENST00000540240 FBXW11Q9UKB1 542 aa8.47□□□□□ -1.05
C16orf62-212ENST00000540240 KCNH3Q9ULD8 1083 aa8.47□□□□□ -1.05
C16orf62-212ENST00000540240 PCDHA12Q9UN75 941 aa8.47□□□□□ -1.05
C16orf62-212ENST00000540240 AP4E1Q9UPM8 1137 aa8.47□□□□□ -1.05
C16orf62-212ENST00000540240 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa8.47□□□□□ -1.05
C16orf62-212ENST00000540240 MED19A0JLT2 244 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
C16orf62-212ENST00000540240 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa8.46□□□□□ -1.06
C16orf62-212ENST00000540240 N4BP3O15049 544 aa8.46□□□□□ -1.06
C16orf62-212ENST00000540240 TBC1D4O60343 1298 aa8.46□□□□□ -1.06
C16orf62-212ENST00000540240 FAM13AO94988 1023 aa8.46□□□□□ -1.06
C16orf62-212ENST00000540240 NPTXRO95502 500 aa8.46□□□□□ -1.06
C16orf62-212ENST00000540240 THP07101 528 aa8.46□□□□□ -1.06
C16orf62-212ENST00000540240 AKAP5P24588 427 aa8.46□□□□□ -1.06
C16orf62-212ENST00000540240 ASPAP45381 313 aa8.46□□□□□ -1.06
C16orf62-212ENST00000540240 ARHGAP8P85298 464 aa8.46□□□□□ -1.06
C16orf62-212ENST00000540240 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.6 ms