RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533557.5

BBS1-222, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 1, human

TSL 2

Gene BBS1, Length 1,043 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS1-222	ENST00000533557	MCL1	Q07820	350 aa		13.17	□□□□□ -0.3
BBS1-222	ENST00000533557	PSMD2	Q13200	908 aa		13.17	□□□□□ -0.3
BBS1-222	ENST00000533557	NOLC1	Q14978	699 aa	Known RBP eCLIP	13.17	□□□□□ -0.3
BBS1-222	ENST00000533557	FBXO43	Q4G163	708 aa		13.17	□□□□□ -0.3
BBS1-222	ENST00000533557	USP39	Q53GS9	565 aa	Known RBP	13.17	□□□□□ -0.3
BBS1-222	ENST00000533557	C2orf27A	Q580R0	203 aa		13.17	□□□□□ -0.3
BBS1-222	ENST00000533557	RINT1	Q6NUQ1	792 aa		13.17	□□□□□ -0.3
BBS1-222	ENST00000533557	C1orf186	Q6ZWK4	172 aa		13.17	□□□□□ -0.3
BBS1-222	ENST00000533557	ARMCX6	Q7L4S7	300 aa		13.17	□□□□□ -0.3
BBS1-222	ENST00000533557	TMEFF1	Q8IYR6	380 aa		13.17	□□□□□ -0.3
BBS1-222	ENST00000533557	CCDC33	Q8N5R6	958 aa		13.17	□□□□□ -0.3
BBS1-222	ENST00000533557	TMEM161B	Q8NDZ6	487 aa		13.17	□□□□□ -0.3
BBS1-222	ENST00000533557	NSUN7	Q8NE18	718 aa	Known RBP	13.17	□□□□□ -0.3
BBS1-222	ENST00000533557	TSTD1	Q8NFU3	115 aa		13.17	□□□□□ -0.3
BBS1-222	ENST00000533557	OR2I1P	Q8NGU4	316 aa		13.17	□□□□□ -0.3
BBS1-222	ENST00000533557	LRRC15	Q8TF66	581 aa		13.17	□□□□□ -0.3
BBS1-222	ENST00000533557	CD101	Q93033	1021 aa		13.17	□□□□□ -0.3
BBS1-222	ENST00000533557	NTPCR	Q9BSD7	190 aa	Known RBP	13.17	□□□□□ -0.3
BBS1-222	ENST00000533557	DDX19A	Q9NUU7	478 aa	Known RBP	13.17	□□□□□ -0.3
BBS1-222	ENST00000533557	DAXX	Q9UER7	740 aa	Predicted RBP	13.17	□□□□□ -0.3
BBS1-222	ENST00000533557	EVL	Q9UI08	416 aa	Predicted RBP	13.17	□□□□□ -0.3
BBS1-222	ENST00000533557	PTPRD	P23468	1912 aa		13.17	□□□□□ -0.3
BBS1-222	ENST00000533557	ATXN2	Q99700	1313 aa	Known RBP	13.16	□□□□□ -0.3
BBS1-222	ENST00000533557	BPTF	Q12830	3046 aa		13.16	□□□□□ -0.3
BBS1-222	ENST00000533557	PP2D1	A8MPX8	630 aa		13.16	□□□□□ -0.3
BBS1-222	ENST00000533557	ADRB2	P07550	413 aa		13.16	□□□□□ -0.3
BBS1-222	ENST00000533557	OR52Z1	P0C646	297 aa		13.16	□□□□□ -0.3
BBS1-222	ENST00000533557	CYP3A5	P20815	502 aa		13.16	□□□□□ -0.3
BBS1-222	ENST00000533557	CDC25A	P30304	524 aa		13.16	□□□□□ -0.3
BBS1-222	ENST00000533557	AVPR1A	P37288	418 aa		13.16	□□□□□ -0.3
BBS1-222	ENST00000533557	OPRD1	P41143	372 aa		13.16	□□□□□ -0.3
BBS1-222	ENST00000533557	TUFM	P49411	452 aa	Known RBP	13.16	□□□□□ -0.3
BBS1-222	ENST00000533557	SEC13	P55735	322 aa		13.16	□□□□□ -0.3
BBS1-222	ENST00000533557	ZXDB	P98169	803 aa		13.16	□□□□□ -0.3
BBS1-222	ENST00000533557	GUCY1B3	Q02153	619 aa		13.16	□□□□□ -0.3
BBS1-222	ENST00000533557	ST3GAL1	Q11201	340 aa		13.16	□□□□□ -0.3
BBS1-222	ENST00000533557	SCAP	Q12770	1279 aa		13.16	□□□□□ -0.3
BBS1-222	ENST00000533557	NBR1	Q14596	966 aa		13.16	□□□□□ -0.3
BBS1-222	ENST00000533557	ENOX2	Q16206	610 aa	Known RBP	13.16	□□□□□ -0.3
BBS1-222	ENST00000533557	ME3	Q16798	604 aa		13.16	□□□□□ -0.3
BBS1-222	ENST00000533557	EML3	Q32P44	896 aa		13.16	□□□□□ -0.3
BBS1-222	ENST00000533557	ZC2HC1C	Q53FD0	456 aa	Predicted RBP	13.16	□□□□□ -0.3
BBS1-222	ENST00000533557	ARMCX5	Q6P1M9	558 aa		13.16	□□□□□ -0.3
BBS1-222	ENST00000533557	RAB44	Q7Z6P3	723 aa	Predicted RBP	13.16	□□□□□ -0.3
BBS1-222	ENST00000533557	MON1A	Q86VX9	555 aa		13.16	□□□□□ -0.3
BBS1-222	ENST00000533557	CNOT6L	Q96LI5	555 aa	Known RBP	13.16	□□□□□ -0.3
BBS1-222	ENST00000533557	PLEKHA5	Q9HAU0	1116 aa		13.16	□□□□□ -0.3
BBS1-222	ENST00000533557	BRMS1	Q9HCU9	246 aa		13.16	□□□□□ -0.3
BBS1-222	ENST00000533557	UBQLN1	Q9UMX0	589 aa	Known RBP	13.16	□□□□□ -0.3
BBS1-222	ENST00000533557	PI4KA	P42356	2102 aa		13.16	□□□□□ -0.3
BBS1-222	ENST00000533557	ASH1L	Q9NR48	2969 aa	Known RBP	13.16	□□□□□ -0.3
BBS1-222	ENST00000533557	KIAA1549L	Q6ZVL6	1849 aa		13.16	□□□□□ -0.3
BBS1-222	ENST00000533557	ACACA	Q13085	2346 aa		13.15	□□□□□ -0.3
BBS1-222	ENST00000533557	PIR	O00625	290 aa		13.15	□□□□□ -0.3
BBS1-222	ENST00000533557	REC8	O95072	547 aa		13.15	□□□□□ -0.3
BBS1-222	ENST00000533557	CYP11A1	P05108	521 aa		13.15	□□□□□ -0.3
BBS1-222	ENST00000533557	CLTA	P09496	248 aa		13.15	□□□□□ -0.3
BBS1-222	ENST00000533557	MAPT	P10636	758 aa	Known RBP	13.15	□□□□□ -0.3
BBS1-222	ENST00000533557	MUT	P22033	750 aa		13.15	□□□□□ -0.3
BBS1-222	ENST00000533557	P2RY2	P41231	377 aa		13.15	□□□□□ -0.3
BBS1-222	ENST00000533557	RAD51AP2	Q09MP3	1159 aa		13.15	□□□□□ -0.3
BBS1-222	ENST00000533557	BFSP1	Q12934	665 aa		13.15	□□□□□ -0.3
BBS1-222	ENST00000533557	MTF1	Q14872	753 aa		13.15	□□□□□ -0.3
BBS1-222	ENST00000533557	PDGFRL	Q15198	375 aa		13.15	□□□□□ -0.3
BBS1-222	ENST00000533557	ZNF77	Q15935	545 aa		13.15	□□□□□ -0.3
BBS1-222	ENST00000533557	IL17A	Q16552	155 aa		13.15	□□□□□ -0.3
BBS1-222	ENST00000533557	EMC10	Q5UCC4	262 aa		13.15	□□□□□ -0.3
BBS1-222	ENST00000533557	SPATA1	Q5VX52	437 aa		13.15	□□□□□ -0.3
BBS1-222	ENST00000533557	C9orf57	Q5W0N0	161 aa		13.15	□□□□□ -0.3
BBS1-222	ENST00000533557	SCARA3	Q6AZY7	606 aa		13.15	□□□□□ -0.3
BBS1-222	ENST00000533557	ERMN	Q8TAM6	284 aa		13.15	□□□□□ -0.3
BBS1-222	ENST00000533557	OSCP1	Q8WVF1	389 aa		13.15	□□□□□ -0.3
BBS1-222	ENST00000533557	WASF1	Q92558	559 aa		13.15	□□□□□ -0.3
BBS1-222	ENST00000533557	CAMK1G	Q96NX5	476 aa		13.15	□□□□□ -0.3
BBS1-222	ENST00000533557	ZDHHC4	Q9NPG8	344 aa		13.15	□□□□□ -0.3
BBS1-222	ENST00000533557	DUS2	Q9NX74	493 aa	Known RBP	13.15	□□□□□ -0.3
BBS1-222	ENST00000533557	RBM19	Q9Y4C8	960 aa	Known RBP	13.15	□□□□□ -0.3
BBS1-222	ENST00000533557	DENND4C	Q5VZ89	1909 aa		13.14	□□□□□ -0.31
BBS1-222	ENST00000533557	ANO9	A1A5B4	782 aa		13.14	□□□□□ -0.31
BBS1-222	ENST00000533557	CYSRT1	A8MQ03	144 aa		13.14	□□□□□ -0.31
BBS1-222	ENST00000533557	UPK3BL1	B0FP48	263 aa		13.14	□□□□□ -0.31
BBS1-222	ENST00000533557	UPK3BL2	E5RIL1	263 aa		13.14	□□□□□ -0.31
BBS1-222	ENST00000533557	CLDN3	O15551	220 aa		13.14	□□□□□ -0.31
BBS1-222	ENST00000533557	CD59	P13987	128 aa		13.14	□□□□□ -0.31
BBS1-222	ENST00000533557	ITPKA	P23677	461 aa		13.14	□□□□□ -0.31
BBS1-222	ENST00000533557	ZNF268	Q14587	947 aa	Predicted RBP	13.14	□□□□□ -0.31
BBS1-222	ENST00000533557	VEPH1	Q14D04	833 aa		13.14	□□□□□ -0.31
BBS1-222	ENST00000533557	CRY1	Q16526	586 aa		13.14	□□□□□ -0.31
BBS1-222	ENST00000533557	CCDC142	Q17RM4	750 aa		13.14	□□□□□ -0.31
BBS1-222	ENST00000533557	MAP7D1	Q3KQU3	841 aa		13.14	□□□□□ -0.31
BBS1-222	ENST00000533557	WSCD1	Q658N2	575 aa		13.14	□□□□□ -0.31
BBS1-222	ENST00000533557	JADE1	Q6IE81	842 aa		13.14	□□□□□ -0.31
BBS1-222	ENST00000533557	CC2D1A	Q6P1N0	951 aa	Predicted RBP	13.14	□□□□□ -0.31
BBS1-222	ENST00000533557	TTC30A	Q86WT1	665 aa		13.14	□□□□□ -0.31
BBS1-222	ENST00000533557	EFCAB13	Q8IY85	973 aa		13.14	□□□□□ -0.31
BBS1-222	ENST00000533557	DEFB119	Q8N690	84 aa		13.14	□□□□□ -0.31
BBS1-222	ENST00000533557	TTC16	Q8NEE8	873 aa		13.14	□□□□□ -0.31
BBS1-222	ENST00000533557	ACD	Q96AP0	544 aa		13.14	□□□□□ -0.31
BBS1-222	ENST00000533557	GCNA	Q96QF7	691 aa		13.14	□□□□□ -0.31
BBS1-222	ENST00000533557	MMTAG2	Q9BU76	263 aa	Known RBP	13.14	□□□□□ -0.31

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