RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531461.5

ACER3-211, Transcript of alkaline ceramidase 3, humanhuman

TSL 2

Gene ACER3, Length 1,292 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACER3-211ENST00000531461 NLRP12P59046 1061 aa25.83■■□□□ 1.73
ACER3-211ENST00000531461 LMNB2Q03252 620 aa25.83■■□□□ 1.73
ACER3-211ENST00000531461 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa25.83■■□□□ 1.73
ACER3-211ENST00000531461 LAIR1Q6GTX8 287 aa25.83■■□□□ 1.73
ACER3-211ENST00000531461 SYCP3Q8IZU3 236 aa25.83■■□□□ 1.73
ACER3-211ENST00000531461 SAAL1Q96ER3 474 aa25.83■■□□□ 1.73
ACER3-211ENST00000531461 FAM83CQ9BQN1 747 aa25.83■■□□□ 1.73
ACER3-211ENST00000531461 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP25.83■■□□□ 1.73
ACER3-211ENST00000531461 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP25.83■■□□□ 1.73
ACER3-211ENST00000531461 L1RE1Q9UN81 338 aa25.83■■□□□ 1.73
ACER3-211ENST00000531461 AGAP1Q9UPQ3 857 aa25.83■■□□□ 1.73
ACER3-211ENST00000531461 K7ESF4 209 aa25.82■■□□□ 1.72
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ACER3-211ENST00000531461 IDEP14735 1019 aa25.82■■□□□ 1.72
ACER3-211ENST00000531461 USP28Q96RU2 1077 aa25.82■■□□□ 1.72
ACER3-211ENST00000531461 PKMYT1Q99640 499 aa25.82■■□□□ 1.72
ACER3-211ENST00000531461 KIF9Q9HAQ2 790 aa25.82■■□□□ 1.72
ACER3-211ENST00000531461 PANK4Q9NVE7 773 aa25.82■■□□□ 1.72
ACER3-211ENST00000531461 A0A087X0B3 334 aa25.81■■□□□ 1.72
ACER3-211ENST00000531461 MED19A0JLT2 244 aaPredicted RBP25.81■■□□□ 1.72
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ACER3-211ENST00000531461 MYL7Q01449 175 aa25.81■■□□□ 1.72
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ACER3-211ENST00000531461 PON2Q15165 354 aa25.81■■□□□ 1.72
ACER3-211ENST00000531461 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP25.81■■□□□ 1.72
ACER3-211ENST00000531461 Q6ZS52 159 aa25.81■■□□□ 1.72
ACER3-211ENST00000531461 LONP2Q86WA8 852 aa25.81■■□□□ 1.72
ACER3-211ENST00000531461 TOP6BLQ8N6T0 577 aa25.81■■□□□ 1.72
ACER3-211ENST00000531461 MYRFLQ96LU7 910 aa25.81■■□□□ 1.72
ACER3-211ENST00000531461 CBWD1Q9BRT8 395 aa25.81■■□□□ 1.72
ACER3-211ENST00000531461 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP25.81■■□□□ 1.72
ACER3-211ENST00000531461 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP25.81■■□□□ 1.72
ACER3-211ENST00000531461 MTMR6Q9Y217 621 aa25.81■■□□□ 1.72
ACER3-211ENST00000531461 GABRDO14764 452 aa25.8■■□□□ 1.72
ACER3-211ENST00000531461 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP25.8■■□□□ 1.72
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ACER3-211ENST00000531461 CDR1P51861 262 aa25.8■■□□□ 1.72
ACER3-211ENST00000531461 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP25.8■■□□□ 1.72
ACER3-211ENST00000531461 RBP5P82980 135 aa25.8■■□□□ 1.72
ACER3-211ENST00000531461 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP25.8■■□□□ 1.72
ACER3-211ENST00000531461 CFAP221Q4G0U5 840 aa25.8■■□□□ 1.72
ACER3-211ENST00000531461 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa25.8■■□□□ 1.72
ACER3-211ENST00000531461 MAB21L3Q8N8X9 362 aa25.8■■□□□ 1.72
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ACER3-211ENST00000531461 PI4K2AQ9BTU6 479 aa25.8■■□□□ 1.72
ACER3-211ENST00000531461 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa25.8■■□□□ 1.72
ACER3-211ENST00000531461 TDP1Q9NUW8 608 aa25.8■■□□□ 1.72
ACER3-211ENST00000531461 RALGAPA1Q6GYQ0 2036 aa25.8■■□□□ 1.72
ACER3-211ENST00000531461 RETP07949 1114 aa25.79■■□□□ 1.72
ACER3-211ENST00000531461 LHX1P48742 406 aa25.79■■□□□ 1.72
ACER3-211ENST00000531461 DPH6Q7L8W6 267 aa25.79■■□□□ 1.72
ACER3-211ENST00000531461 MON1AQ86VX9 555 aa25.79■■□□□ 1.72
ACER3-211ENST00000531461 CCDC65Q8IXS2 484 aa25.79■■□□□ 1.72
ACER3-211ENST00000531461 GPD1LQ8N335 351 aa25.79■■□□□ 1.72
ACER3-211ENST00000531461 TTC8Q8TAM2 541 aa25.79■■□□□ 1.72
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ACER3-211ENST00000531461 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP25.79■■□□□ 1.72
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ACER3-211ENST00000531461 PDE11AQ9HCR9 933 aa25.79■■□□□ 1.72
ACER3-211ENST00000531461 GKN1Q9NS71 199 aa25.79■■□□□ 1.72
ACER3-211ENST00000531461 SIX4Q9UIU6 781 aa25.79■■□□□ 1.72
ACER3-211ENST00000531461 GREB1Q4ZG55 1949 aa25.78■■□□□ 1.72
ACER3-211ENST00000531461 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa25.78■■□□□ 1.72
ACER3-211ENST00000531461 HRO43593 1189 aa25.78■■□□□ 1.72
ACER3-211ENST00000531461 NOL4O94818 638 aa25.78■■□□□ 1.72
ACER3-211ENST00000531461 BFSP1Q12934 665 aa25.78■■□□□ 1.72
ACER3-211ENST00000531461 RUNX3Q13761 415 aa25.78■■□□□ 1.72
ACER3-211ENST00000531461 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa25.78■■□□□ 1.72
ACER3-211ENST00000531461 LIMS2Q7Z4I7 341 aa25.78■■□□□ 1.72
ACER3-211ENST00000531461 PANK2Q9BZ23 570 aa25.78■■□□□ 1.72
ACER3-211ENST00000531461 LRRC27Q9C0I9 530 aa25.78■■□□□ 1.72
ACER3-211ENST00000531461 PARD6AQ9NPB6 346 aa25.78■■□□□ 1.72
ACER3-211ENST00000531461 HPS4Q9NQG7 708 aa25.78■■□□□ 1.72
ACER3-211ENST00000531461 USP18Q9UMW8 372 aa25.78■■□□□ 1.72
ACER3-211ENST00000531461 CCL26Q9Y258 94 aa25.78■■□□□ 1.72
ACER3-211ENST00000531461 SNX9Q9Y5X1 595 aa25.78■■□□□ 1.72
ACER3-211ENST00000531461 GOLGA8IPA6NC78 632 aa25.77■■□□□ 1.72
ACER3-211ENST00000531461 GOLGA8JA6NMD2 632 aa25.77■■□□□ 1.72
ACER3-211ENST00000531461 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa25.77■■□□□ 1.72
ACER3-211ENST00000531461 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP25.77■■□□□ 1.72
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ACER3-211ENST00000531461 TMEM191BP0C7N4 346 aa25.77■■□□□ 1.72
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ACER3-211ENST00000531461 FNTBP49356 437 aa25.77■■□□□ 1.72
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ACER3-211ENST00000531461 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP25.77■■□□□ 1.72
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ACER3-211ENST00000531461 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP25.77■■□□□ 1.72
ACER3-211ENST00000531461 SURF1Q15526 300 aa25.77■■□□□ 1.72
ACER3-211ENST00000531461 TMEM196Q5HYL7 178 aa25.77■■□□□ 1.72
ACER3-211ENST00000531461 TXNDC8Q6A555 127 aa25.77■■□□□ 1.72
ACER3-211ENST00000531461 SCARA3Q6AZY7 606 aa25.77■■□□□ 1.72
ACER3-211ENST00000531461 MTMR12Q9C0I1 747 aa25.77■■□□□ 1.72
ACER3-211ENST00000531461 PCIF1Q9H4Z3 704 aa25.77■■□□□ 1.72
ACER3-211ENST00000531461 INTS13Q9NVM9 706 aa25.77■■□□□ 1.72
ACER3-211ENST00000531461 GTF3C4Q9UKN8 822 aa25.77■■□□□ 1.72
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