RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531226.5

PACSIN3-208, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

TSL 5

Gene PACSIN3, Length 654 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-208ENST00000531226 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa20.32■□□□□ 0.84
PACSIN3-208ENST00000531226 CCDC150Q8NCX0 1101 aa20.32■□□□□ 0.84
PACSIN3-208ENST00000531226 SEMA4DQ92854 862 aa20.32■□□□□ 0.84
PACSIN3-208ENST00000531226 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
PACSIN3-208ENST00000531226 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
PACSIN3-208ENST00000531226 SDCBP2Q9H190 292 aa20.32■□□□□ 0.84
PACSIN3-208ENST00000531226 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
PACSIN3-208ENST00000531226 ABCB6Q9NP58 842 aa20.32■□□□□ 0.84
PACSIN3-208ENST00000531226 CRTAC1Q9NQ79 661 aa20.32■□□□□ 0.84
PACSIN3-208ENST00000531226 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
PACSIN3-208ENST00000531226 COQ4Q9Y3A0 265 aa20.32■□□□□ 0.84
PACSIN3-208ENST00000531226 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
PACSIN3-208ENST00000531226 MYBPHLA2RUH7 354 aa20.31■□□□□ 0.84
PACSIN3-208ENST00000531226 A8MXQ7 604 aa20.31■□□□□ 0.84
PACSIN3-208ENST00000531226 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
PACSIN3-208ENST00000531226 ATP2C2O75185 946 aa20.31■□□□□ 0.84
PACSIN3-208ENST00000531226 LRRN2O75325 713 aa20.31■□□□□ 0.84
PACSIN3-208ENST00000531226 RHOP08100 348 aa20.31■□□□□ 0.84
PACSIN3-208ENST00000531226 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
PACSIN3-208ENST00000531226 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
PACSIN3-208ENST00000531226 EPHB3P54753 998 aa20.31■□□□□ 0.84
PACSIN3-208ENST00000531226 CDH8P55286 799 aa20.31■□□□□ 0.84
PACSIN3-208ENST00000531226 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
PACSIN3-208ENST00000531226 CCDC183Q5T5S1 534 aa20.31■□□□□ 0.84
PACSIN3-208ENST00000531226 IQCEQ6IPM2 695 aa20.31■□□□□ 0.84
PACSIN3-208ENST00000531226 RNF135Q8IUD6 432 aa20.31■□□□□ 0.84
PACSIN3-208ENST00000531226 TRIM59Q8IWR1 403 aa20.31■□□□□ 0.84
PACSIN3-208ENST00000531226 PLCD3Q8N3E9 789 aa20.31■□□□□ 0.84
PACSIN3-208ENST00000531226 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
PACSIN3-208ENST00000531226 BCO2Q9BYV7 579 aa20.31■□□□□ 0.84
PACSIN3-208ENST00000531226 NIF3L1Q9GZT8 377 aa20.31■□□□□ 0.84
PACSIN3-208ENST00000531226 DNAJC25Q9H1X3 360 aa20.31■□□□□ 0.84
PACSIN3-208ENST00000531226 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP20.31■□□□□ 0.842e-6■■■■■ 96.1
PACSIN3-208ENST00000531226 RAB20Q9NX57 234 aa20.31■□□□□ 0.84
PACSIN3-208ENST00000531226 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP20.31■□□□□ 0.84
PACSIN3-208ENST00000531226 PATJQ8NI35 1801 aa20.31■□□□□ 0.84
PACSIN3-208ENST00000531226 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa20.31■□□□□ 0.84
PACSIN3-208ENST00000531226 SOAT2O75908 522 aa20.3■□□□□ 0.84
PACSIN3-208ENST00000531226 CCDC192P0DO97 292 aa20.3■□□□□ 0.84
PACSIN3-208ENST00000531226 ATF6P18850 670 aa20.3■□□□□ 0.84
PACSIN3-208ENST00000531226 FMO5P49326 533 aa20.3■□□□□ 0.84
PACSIN3-208ENST00000531226 CFAP221Q4G0U5 840 aa20.3■□□□□ 0.84
PACSIN3-208ENST00000531226 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
PACSIN3-208ENST00000531226 C4orf50Q6ZRC1 276 aa20.3■□□□□ 0.84
PACSIN3-208ENST00000531226 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
PACSIN3-208ENST00000531226 MYLPFQ96A32 169 aa20.3■□□□□ 0.84
PACSIN3-208ENST00000531226 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP20.3■□□□□ 0.84
PACSIN3-208ENST00000531226 FAXDC2Q96IV6 333 aa20.3■□□□□ 0.84
PACSIN3-208ENST00000531226 MYADMQ96S97 322 aa20.3■□□□□ 0.84
PACSIN3-208ENST00000531226 CORO1BQ9BR76 489 aa20.3■□□□□ 0.84
PACSIN3-208ENST00000531226 ASB3Q9Y575 518 aa20.3■□□□□ 0.84
PACSIN3-208ENST00000531226 BDP1A6H8Y1 2624 aa20.3■□□□□ 0.84
PACSIN3-208ENST00000531226 PMM2O15305 246 aa20.29■□□□□ 0.84
PACSIN3-208ENST00000531226 EPHA5P54756 1037 aa20.29■□□□□ 0.84
PACSIN3-208ENST00000531226 SLC5A9Q2M3M2 681 aa20.29■□□□□ 0.84
PACSIN3-208ENST00000531226 LEMD2Q8NC56 503 aa20.29■□□□□ 0.84
PACSIN3-208ENST00000531226 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa20.29■□□□□ 0.84
PACSIN3-208ENST00000531226 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP20.29■□□□□ 0.84
PACSIN3-208ENST00000531226 PSMG2Q969U7 264 aa20.29■□□□□ 0.84
PACSIN3-208ENST00000531226 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
PACSIN3-208ENST00000531226 DPEP3Q9H4B8 488 aa20.29■□□□□ 0.84
PACSIN3-208ENST00000531226 CYP3A43Q9HB55 503 aa20.29■□□□□ 0.84
PACSIN3-208ENST00000531226 ASAH2Q9NR71 780 aa20.29■□□□□ 0.84
PACSIN3-208ENST00000531226 TMEM63CQ9P1W3 806 aa20.29■□□□□ 0.84
PACSIN3-208ENST00000531226 EPS15L1Q9UBC2 864 aa20.29■□□□□ 0.84
PACSIN3-208ENST00000531226 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
PACSIN3-208ENST00000531226 CYP2F1P24903 491 aa20.28■□□□□ 0.84
PACSIN3-208ENST00000531226 INCA1Q0VD86 236 aa20.28■□□□□ 0.84
PACSIN3-208ENST00000531226 VEPH1Q14D04 833 aa20.28■□□□□ 0.84
PACSIN3-208ENST00000531226 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
PACSIN3-208ENST00000531226 MDH1BQ5I0G3 518 aa20.28■□□□□ 0.84
PACSIN3-208ENST00000531226 WDR44Q5JSH3 913 aa20.28■□□□□ 0.84
PACSIN3-208ENST00000531226 PRSS36Q5K4E3 855 aa20.28■□□□□ 0.84
PACSIN3-208ENST00000531226 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
PACSIN3-208ENST00000531226 ITIH5Q86UX2 942 aa20.28■□□□□ 0.84
PACSIN3-208ENST00000531226 UNC93AQ86WB7 457 aa20.28■□□□□ 0.84
PACSIN3-208ENST00000531226 HS6ST3Q8IZP7 471 aa20.28■□□□□ 0.84
PACSIN3-208ENST00000531226 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa20.28■□□□□ 0.84
PACSIN3-208ENST00000531226 ITFG1Q8TB96 612 aa20.28■□□□□ 0.84
PACSIN3-208ENST00000531226 PCED1BQ96HM7 432 aa20.28■□□□□ 0.84
PACSIN3-208ENST00000531226 LPIN3Q9BQK8 851 aa20.28■□□□□ 0.84
PACSIN3-208ENST00000531226 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
PACSIN3-208ENST00000531226 CDH7Q9ULB5 785 aa20.28■□□□□ 0.84
PACSIN3-208ENST00000531226 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
PACSIN3-208ENST00000531226 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP20.28■□□□□ 0.84
PACSIN3-208ENST00000531226 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
PACSIN3-208ENST00000531226 ZNF197O14709 1029 aa20.27■□□□□ 0.84
PACSIN3-208ENST00000531226 P4HA2O15460 535 aa20.27■□□□□ 0.84
PACSIN3-208ENST00000531226 LAMP2P13473 410 aa20.27■□□□□ 0.84
PACSIN3-208ENST00000531226 MAGEA11P43364 429 aa20.27■□□□□ 0.84
PACSIN3-208ENST00000531226 NDST1P52848 882 aa20.27■□□□□ 0.84
PACSIN3-208ENST00000531226 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
PACSIN3-208ENST00000531226 KCNH2Q12809 1159 aa20.27■□□□□ 0.84
PACSIN3-208ENST00000531226 CYP4A22Q5TCH4 519 aa20.27■□□□□ 0.84
PACSIN3-208ENST00000531226 SASS6Q6UVJ0 657 aa20.27■□□□□ 0.84
PACSIN3-208ENST00000531226 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
PACSIN3-208ENST00000531226 TMC8Q8IU68 726 aa20.27■□□□□ 0.84
PACSIN3-208ENST00000531226 FAM200AQ8TCP9 573 aa20.27■□□□□ 0.84
PACSIN3-208ENST00000531226 FGF13Q92913 245 aa20.27■□□□□ 0.84
PACSIN3-208ENST00000531226 TNIP3Q96KP6 325 aa20.27■□□□□ 0.84
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