RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000521189.1

CLVS1-207, Transcript of clavesin 1, humanhuman

TSL 2

Gene CLVS1, Length 2,532 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLVS1-207ENST00000521189 NAT8LQ8N9F0 302 aa7.23□□□□□ -1.25
CLVS1-207ENST00000521189 SLC4A11Q8NBS3 891 aa7.23□□□□□ -1.25
CLVS1-207ENST00000521189 DACT3Q96B18 629 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
CLVS1-207ENST00000521189 LRGUKQ96M69 825 aa7.23□□□□□ -1.25
CLVS1-207ENST00000521189 ZNF560Q96MR9 790 aa7.23□□□□□ -1.25
CLVS1-207ENST00000521189 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
CLVS1-207ENST00000521189 TEX13BQ9BXU2 312 aa7.23□□□□□ -1.25
CLVS1-207ENST00000521189 DPH5Q9H2P9 285 aa7.23□□□□□ -1.25
CLVS1-207ENST00000521189 TMEM245Q9H330 911 aa7.23□□□□□ -1.25
CLVS1-207ENST00000521189 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
CLVS1-207ENST00000521189 AZI2Q9H6S1 392 aa7.23□□□□□ -1.25
CLVS1-207ENST00000521189 SH3BGRL2Q9UJC5 107 aa7.23□□□□□ -1.25
CLVS1-207ENST00000521189 BAG5Q9UL15 447 aa7.23□□□□□ -1.25
CLVS1-207ENST00000521189 CSNK1G3Q9Y6M4 447 aa7.23□□□□□ -1.25
CLVS1-207ENST00000521189 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa7.23□□□□□ -1.25
CLVS1-207ENST00000521189 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa7.23□□□□□ -1.25
CLVS1-207ENST00000521189 LOC100653049A0A140TA62 436 aa7.22□□□□□ -1.25
CLVS1-207ENST00000521189 EVPLLA8MZ36 301 aa7.22□□□□□ -1.25
CLVS1-207ENST00000521189 H0Y626 953 aa7.22□□□□□ -1.25
CLVS1-207ENST00000521189 KPNA4O00629 521 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
CLVS1-207ENST00000521189 CLOCKO15516 846 aa7.22□□□□□ -1.25
CLVS1-207ENST00000521189 KRT34O76011 436 aa7.22□□□□□ -1.25
CLVS1-207ENST00000521189 LTA4HP09960 611 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
CLVS1-207ENST00000521189 C7P10643 843 aa7.22□□□□□ -1.25
CLVS1-207ENST00000521189 ATP6V1B1P15313 513 aa7.22□□□□□ -1.25
CLVS1-207ENST00000521189 TMEM11P17152 192 aa7.22□□□□□ -1.25
CLVS1-207ENST00000521189 SULT1E1P49888 294 aa7.22□□□□□ -1.25
CLVS1-207ENST00000521189 CLCN4P51793 760 aa7.22□□□□□ -1.25
CLVS1-207ENST00000521189 VAV2P52735 878 aa7.22□□□□□ -1.25
CLVS1-207ENST00000521189 AP1S2P56377 157 aa7.22□□□□□ -1.25
CLVS1-207ENST00000521189 PEX3P56589 373 aa7.22□□□□□ -1.25
CLVS1-207ENST00000521189 HAND2P61296 217 aa7.22□□□□□ -1.25
CLVS1-207ENST00000521189 KCNJ2P63252 427 aa7.22□□□□□ -1.25
CLVS1-207ENST00000521189 ADAM17P78536 824 aa7.22□□□□□ -1.25
CLVS1-207ENST00000521189 GRIK5Q16478 980 aa7.22□□□□□ -1.25
CLVS1-207ENST00000521189 C6orf163Q5TEZ5 329 aa7.22□□□□□ -1.25
CLVS1-207ENST00000521189 USPL1Q5W0Q7 1092 aa7.22□□□□□ -1.25
CLVS1-207ENST00000521189 RESP18Q5W5W9 173 aa7.22□□□□□ -1.25
CLVS1-207ENST00000521189 PDPK2PQ6A1A2 396 aa7.22□□□□□ -1.25
CLVS1-207ENST00000521189 ERAP2Q6P179 960 aa7.22□□□□□ -1.25
CLVS1-207ENST00000521189 FERMT3Q86UX7 667 aa7.22□□□□□ -1.25
CLVS1-207ENST00000521189 ADSSL1Q8N142 457 aa7.22□□□□□ -1.25
CLVS1-207ENST00000521189 TCAIMQ8N3R3 496 aa7.22□□□□□ -1.25
CLVS1-207ENST00000521189 RFWD2Q8NHY2 731 aa7.22□□□□□ -1.25
CLVS1-207ENST00000521189 ADAMTS16Q8TE57 1224 aa7.22□□□□□ -1.25
CLVS1-207ENST00000521189 SCFD1Q8WVM8 642 aa7.22□□□□□ -1.25
CLVS1-207ENST00000521189 ZDHHC16Q969W1 377 aa7.22□□□□□ -1.25
CLVS1-207ENST00000521189 CHAMP1Q96JM3 812 aa7.22□□□□□ -1.25
CLVS1-207ENST00000521189 MFSD14AQ96MC6 490 aa7.22□□□□□ -1.25
CLVS1-207ENST00000521189 SLC4A5Q9BY07 1137 aa7.22□□□□□ -1.25
CLVS1-207ENST00000521189 NYXQ9GZU5 481 aa7.22□□□□□ -1.25
CLVS1-207ENST00000521189 LHX5Q9H2C1 402 aa7.22□□□□□ -1.25
CLVS1-207ENST00000521189 TRIM45Q9H8W5 580 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
CLVS1-207ENST00000521189 LY9Q9HBG7 655 aa7.22□□□□□ -1.25
CLVS1-207ENST00000521189 ZNF287Q9HBT7 754 aa7.22□□□□□ -1.25
CLVS1-207ENST00000521189 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa7.22□□□□□ -1.25
CLVS1-207ENST00000521189 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa7.22□□□□□ -1.25
CLVS1-207ENST00000521189 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa7.22□□□□□ -1.25
CLVS1-207ENST00000521189 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa7.22□□□□□ -1.25
CLVS1-207ENST00000521189 OVOS2Q6IE36 1432 aa7.22□□□□□ -1.25
CLVS1-207ENST00000521189 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa7.22□□□□□ -1.25
CLVS1-207ENST00000521189 A0A0A6YYJ9 748 aa7.22□□□□□ -1.25
CLVS1-207ENST00000521189 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa7.22□□□□□ -1.25
CLVS1-207ENST00000521189 EFCAB10A6NFE3 127 aa7.22□□□□□ -1.25
CLVS1-207ENST00000521189 SLCO1B7G3V0H7 640 aa7.22□□□□□ -1.25
CLVS1-207ENST00000521189 UBXN8O00124 270 aa7.22□□□□□ -1.25
CLVS1-207ENST00000521189 PSIP1O75475 530 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
CLVS1-207ENST00000521189 HEXBP07686 556 aa7.22□□□□□ -1.25
CLVS1-207ENST00000521189 KRT16P08779 473 aa7.22□□□□□ -1.25
CLVS1-207ENST00000521189 CPA1P15085 419 aa7.22□□□□□ -1.25
CLVS1-207ENST00000521189 PDCP20941 246 aa7.22□□□□□ -1.25
CLVS1-207ENST00000521189 HLA-FP30511 346 aa7.22□□□□□ -1.25
CLVS1-207ENST00000521189 STARP49675 285 aa7.22□□□□□ -1.25
CLVS1-207ENST00000521189 RAP1GDS1P52306 607 aa7.22□□□□□ -1.25
CLVS1-207ENST00000521189 TSPAN5P62079 268 aa7.22□□□□□ -1.25
CLVS1-207ENST00000521189 DLG4P78352 724 aa7.22□□□□□ -1.25
CLVS1-207ENST00000521189 PRAMEP78395 509 aa7.22□□□□□ -1.25
CLVS1-207ENST00000521189 AMPD2Q01433 879 aa7.22□□□□□ -1.25
CLVS1-207ENST00000521189 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
CLVS1-207ENST00000521189 AP3B2Q13367 1082 aa7.22□□□□□ -1.25
CLVS1-207ENST00000521189 COTL1Q14019 142 aa7.22□□□□□ -1.25
CLVS1-207ENST00000521189 MORC3Q14149 939 aa7.22□□□□□ -1.25
CLVS1-207ENST00000521189 ERV3-1Q14264 604 aa7.22□□□□□ -1.25
CLVS1-207ENST00000521189 DMC1Q14565 340 aa7.22□□□□□ -1.25
CLVS1-207ENST00000521189 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP7.22□□□□□ -1.25
CLVS1-207ENST00000521189 CCDC6Q16204 474 aa7.22□□□□□ -1.25
CLVS1-207ENST00000521189 CCNG2Q16589 344 aa7.22□□□□□ -1.25
CLVS1-207ENST00000521189 TCTE1Q5JU00 501 aa7.22□□□□□ -1.25
CLVS1-207ENST00000521189 RTP2Q5QGT7 225 aa7.22□□□□□ -1.25
CLVS1-207ENST00000521189 C11orf88Q6PI97 169 aa7.22□□□□□ -1.25
CLVS1-207ENST00000521189 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
CLVS1-207ENST00000521189 HDDC2Q7Z4H3 204 aa7.22□□□□□ -1.25
CLVS1-207ENST00000521189 COMTD1Q86VU5 262 aa7.22□□□□□ -1.25
CLVS1-207ENST00000521189 GALNT13Q8IUC8 556 aa7.22□□□□□ -1.25
CLVS1-207ENST00000521189 VSTM4Q8IW00 320 aa7.22□□□□□ -1.25
CLVS1-207ENST00000521189 LRRC34Q8IZ02 419 aa7.22□□□□□ -1.25
CLVS1-207ENST00000521189 ADAM32Q8TC27 787 aa7.22□□□□□ -1.25
CLVS1-207ENST00000521189 SLC26A7Q8TE54 656 aa7.22□□□□□ -1.25
CLVS1-207ENST00000521189 SSH3Q8TE77 659 aa7.22□□□□□ -1.25
CLVS1-207ENST00000521189 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.1 ms