RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515854.5

ATP2C1-223, Transcript of ATPase secretory pathway Ca2+ transporting 1, human

TSL 4

Gene ATP2C1, Length 561 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATP2C1-223	ENST00000515854	PROSC	O94903	275 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATP2C1-223	ENST00000515854	FAM163B	P0C2L3	166 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATP2C1-223	ENST00000515854	CD19	P15391	556 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATP2C1-223	ENST00000515854	ANK1	P16157	1881 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATP2C1-223	ENST00000515854	ATF7	P17544	494 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
ATP2C1-223	ENST00000515854	AKAP5	P24588	427 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATP2C1-223	ENST00000515854	MCM3	P25205	808 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATP2C1-223	ENST00000515854	TNFRSF8	P28908	595 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATP2C1-223	ENST00000515854	LRPAP1	P30533	357 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATP2C1-223	ENST00000515854	MAN1A1	P33908	653 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATP2C1-223	ENST00000515854	PNPLA4	P41247	253 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATP2C1-223	ENST00000515854	VEGFB	P49765	207 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATP2C1-223	ENST00000515854	DNA2	P51530	1060 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATP2C1-223	ENST00000515854	NDST1	P52848	882 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATP2C1-223	ENST00000515854	ACLY	P53396	1101 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATP2C1-223	ENST00000515854	GSC	P56915	257 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
ATP2C1-223	ENST00000515854	VSNL1	P62760	191 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATP2C1-223	ENST00000515854	TNNC1	P63316	161 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATP2C1-223	ENST00000515854	MYO1E	Q12965	1108 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATP2C1-223	ENST00000515854	MAMLD1	Q13495	774 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATP2C1-223	ENST00000515854	ITGA7	Q13683	1181 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATP2C1-223	ENST00000515854	ARHGEF6	Q15052	776 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATP2C1-223	ENST00000515854	CNGA2	Q16280	664 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATP2C1-223	ENST00000515854	PTGIS	Q16647	500 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATP2C1-223	ENST00000515854	PTPRO	Q16827	1216 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATP2C1-223	ENST00000515854	TRIM71	Q2Q1W2	868 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
ATP2C1-223	ENST00000515854	ZNF394	Q53GI3	561 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATP2C1-223	ENST00000515854	FAM47C	Q5HY64	1035 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATP2C1-223	ENST00000515854	FAM26D	Q5JW98	314 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATP2C1-223	ENST00000515854	FBXO47	Q5MNV8	452 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATP2C1-223	ENST00000515854	BEND6	Q5SZJ8	279 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
ATP2C1-223	ENST00000515854	C9orf57	Q5W0N0	161 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATP2C1-223	ENST00000515854	CCDC70	Q6NSX1	233 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATP2C1-223	ENST00000515854	LLGL2	Q6P1M3	1020 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATP2C1-223	ENST00000515854	DENND1B	Q6P3S1	775 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATP2C1-223	ENST00000515854	CCNI2	Q6ZMN8	369 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
ATP2C1-223	ENST00000515854	MMS22L	Q6ZRQ5	1243 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATP2C1-223	ENST00000515854	LIMS2	Q7Z4I7	341 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATP2C1-223	ENST00000515854	MRPL10	Q7Z7H8	261 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
ATP2C1-223	ENST00000515854	RNF180	Q86T96	592 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATP2C1-223	ENST00000515854	UNC93A	Q86WB7	457 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATP2C1-223	ENST00000515854	CPNE8	Q86YQ8	564 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATP2C1-223	ENST00000515854	PASD1	Q8IV76	773 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATP2C1-223	ENST00000515854	DOCK3	Q8IZD9	2030 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATP2C1-223	ENST00000515854	UBL4B	Q8N7F7	174 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATP2C1-223	ENST00000515854	SLC43A3	Q8NBI5	491 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATP2C1-223	ENST00000515854	ARRDC4	Q8NCT1	418 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATP2C1-223	ENST00000515854	C1orf131	Q8NDD1	294 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
ATP2C1-223	ENST00000515854	FEZF2	Q8TBJ5	459 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATP2C1-223	ENST00000515854	RAET1E	Q8TD07	263 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATP2C1-223	ENST00000515854	ALG3	Q92685	438 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATP2C1-223	ENST00000515854	KRT35	Q92764	455 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATP2C1-223	ENST00000515854	EVPL	Q92817	2033 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATP2C1-223	ENST00000515854	C18orf25	Q96B23	403 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
ATP2C1-223	ENST00000515854	BTBD6	Q96KE9	485 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATP2C1-223	ENST00000515854	TWNK	Q96RR1	684 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATP2C1-223	ENST00000515854	C11orf70	Q9BRQ4	267 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATP2C1-223	ENST00000515854	TSEN34	Q9BSV6	310 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
ATP2C1-223	ENST00000515854	TRAIP	Q9BWF2	469 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATP2C1-223	ENST00000515854	KRTAP17-1	Q9BYP8	105 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATP2C1-223	ENST00000515854	ERVK-5	Q9HDB9	667 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATP2C1-223	ENST00000515854	ARFGAP3	Q9NP61	516 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATP2C1-223	ENST00000515854	PARVA	Q9NVD7	372 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATP2C1-223	ENST00000515854	GDAP2	Q9NXN4	497 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATP2C1-223	ENST00000515854	TUBGCP4	Q9UGJ1	667 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATP2C1-223	ENST00000515854	PARP2	Q9UGN5	583 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATP2C1-223	ENST00000515854	LIMD1	Q9UGP4	676 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATP2C1-223	ENST00000515854	HMGXB4	Q9UGU5	601 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATP2C1-223	ENST00000515854	DMGDH	Q9UI17	866 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
ATP2C1-223	ENST00000515854	CYTH4	Q9UIA0	394 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATP2C1-223	ENST00000515854	LCMT1	Q9UIC8	334 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATP2C1-223	ENST00000515854	ANAPC7	Q9UJX3	599 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATP2C1-223	ENST00000515854	L1RE1	Q9UN81	338 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATP2C1-223	ENST00000515854	ST3GAL5	Q9UNP4	418 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATP2C1-223	ENST00000515854	WDR3	Q9UNX4	943 aa	Known RBP eCLIP	4.76	□□□□□ -1.65
ATP2C1-223	ENST00000515854	SQOR	Q9Y6N5	450 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATP2C1-223	ENST00000515854	SCIN	Q9Y6U3	715 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATP2C1-223	ENST00000515854	CASP8AP2	Q9UKL3	1982 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATP2C1-223	ENST00000515854	THSD7B	Q9C0I4	1608 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATP2C1-223	ENST00000515854	SCN10A	Q9Y5Y9	1956 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATP2C1-223	ENST00000515854	KPNA7	A9QM74	516 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATP2C1-223	ENST00000515854	C3orf80	F5H4A9	247 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATP2C1-223	ENST00000515854	MYO1F	O00160	1098 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATP2C1-223	ENST00000515854	KRIT1	O00522	736 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATP2C1-223	ENST00000515854	PTGES	O14684	152 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATP2C1-223	ENST00000515854	MAP2K7	O14733	419 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATP2C1-223	ENST00000515854	SPOP	O43791	374 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATP2C1-223	ENST00000515854	FKTN	O75072	461 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATP2C1-223	ENST00000515854	ZNF623	O75123	536 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATP2C1-223	ENST00000515854	MICAL2	O94851	1124 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATP2C1-223	ENST00000515854	SEC31A	O94979	1220 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
ATP2C1-223	ENST00000515854	IGHA1	P01876	353 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATP2C1-223	ENST00000515854	FGG	P02679	453 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATP2C1-223	ENST00000515854	INHA	P05111	366 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATP2C1-223	ENST00000515854	CTSH	P09668	335 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATP2C1-223	ENST00000515854	PYGM	P11217	842 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATP2C1-223	ENST00000515854	ITGA4	P13612	1032 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATP2C1-223	ENST00000515854	HSPA6	P17066	643 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATP2C1-223	ENST00000515854	GGCX	P38435	758 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATP2C1-223	ENST00000515854	THPO	P40225	353 aa		4.75	□□□□□ -1.65

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