RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512014.5

SH3BP2-222, Transcript of SH3 domain binding protein 2, human

TSL 3

Gene SH3BP2, Length 688 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SH3BP2-222	ENST00000512014	PTPN5	P54829	565 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SH3BP2-222	ENST00000512014	DLG4	P78352	724 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SH3BP2-222	ENST00000512014	NUCB2	P80303	420 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SH3BP2-222	ENST00000512014	TSPY1	Q01534	308 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SH3BP2-222	ENST00000512014	MYO1E	Q12965	1108 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SH3BP2-222	ENST00000512014	KCNB1	Q14721	858 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZCWPW2	Q504Y3	356 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SH3BP2-222	ENST00000512014	PHLDB3	Q6NSJ2	640 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SH3BP2-222	ENST00000512014	DCP1B	Q8IZD4	617 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZSCAN18	Q8TBC5	510 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
SH3BP2-222	ENST00000512014	GIPC2	Q8TF65	315 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SH3BP2-222	ENST00000512014	LRRC3B	Q96PB8	259 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SH3BP2-222	ENST00000512014	FNBP1	Q96RU3	617 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SH3BP2-222	ENST00000512014	PRRX2	Q99811	253 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SH3BP2-222	ENST00000512014	MRPL45	Q9BRJ2	306 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
SH3BP2-222	ENST00000512014	PI4K2A	Q9BTU6	479 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SH3BP2-222	ENST00000512014	FOXQ1	Q9C009	403 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SH3BP2-222	ENST00000512014	CRTAC1	Q9NQ79	661 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SH3BP2-222	ENST00000512014	TRAF3IP3	Q9Y228	551 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SH3BP2-222	ENST00000512014	PCDHB5	Q9Y5E4	795 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SH3BP2-222	ENST00000512014	NUP210	Q8TEM1	1887 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
SH3BP2-222	ENST00000512014	F5	P12259	2224 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SH3BP2-222	ENST00000512014	GREB1	Q4ZG55	1949 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SH3BP2-222	ENST00000512014	ARNTL	O00327	626 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SH3BP2-222	ENST00000512014	TADA3	O75528	432 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SH3BP2-222	ENST00000512014	STAU1	O95793	577 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
SH3BP2-222	ENST00000512014	CYP2F1	P24903	491 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SH3BP2-222	ENST00000512014	GABRR2	P28476	465 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SH3BP2-222	ENST00000512014	LHX1	P48742	406 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SH3BP2-222	ENST00000512014	MYL6	P60660	151 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SH3BP2-222	ENST00000512014	PSMC1	P62191	440 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
SH3BP2-222	ENST00000512014	MYL7	Q01449	175 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SH3BP2-222	ENST00000512014	GRM2	Q14416	872 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SH3BP2-222	ENST00000512014	NFE2	Q16621	373 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
SH3BP2-222	ENST00000512014	NFIL3	Q16649	462 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SH3BP2-222	ENST00000512014	SLC44A4	Q53GD3	710 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SH3BP2-222	ENST00000512014	SDHAF4	Q5VUM1	108 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SH3BP2-222	ENST00000512014	ITIH5	Q86UX2	942 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SH3BP2-222	ENST00000512014	CCDC105	Q8IYK2	499 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SH3BP2-222	ENST00000512014	ELMO3	Q96BJ8	720 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SH3BP2-222	ENST00000512014	VRTN	Q9H8Y1	702 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZFP14	Q9HCL3	533 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SH3BP2-222	ENST00000512014	ABCB6	Q9NP58	842 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SH3BP2-222	ENST00000512014	MAPK8IP1	Q9UQF2	711 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SH3BP2-222	ENST00000512014	KIF26A	Q9ULI4	1882 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
SH3BP2-222	ENST00000512014	TICRR	Q7Z2Z1	1910 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SH3BP2-222	ENST00000512014	LRRN2	O75325	713 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SH3BP2-222	ENST00000512014	TACC1	O75410	805 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SH3BP2-222	ENST00000512014	F11	P03951	625 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SH3BP2-222	ENST00000512014	MCCD1	P59942	119 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
SH3BP2-222	ENST00000512014	CYP4F8	P98187	520 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SH3BP2-222	ENST00000512014	PNOC	Q13519	176 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SH3BP2-222	ENST00000512014	MLF2	Q15773	248 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
SH3BP2-222	ENST00000512014	DDR2	Q16832	855 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SH3BP2-222	ENST00000512014	CFAP221	Q4G0U5	840 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SH3BP2-222	ENST00000512014	GPIHBP1	Q8IV16	184 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SH3BP2-222	ENST00000512014	SMYD4	Q8IYR2	804 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZNF687	Q8N1G0	1237 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SH3BP2-222	ENST00000512014	GUF1	Q8N442	669 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
SH3BP2-222	ENST00000512014	SYT15	Q9BQS2	421 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SH3BP2-222	ENST00000512014	ATXN3L	Q9H3M9	355 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SH3BP2-222	ENST00000512014	FAM86C1	Q9NVL1	165 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SH3BP2-222	ENST00000512014	MTF2	Q9Y483	593 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
SH3BP2-222	ENST00000512014	HEPACAM2	A8MVW5	462 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SH3BP2-222	ENST00000512014		H0Y858	1186 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SH3BP2-222	ENST00000512014	AKAP3	O75969	853 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SH3BP2-222	ENST00000512014	NOL4	O94818	638 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SH3BP2-222	ENST00000512014	PRAMEF12	O95522	483 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SH3BP2-222	ENST00000512014	DCN	P07585	359 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
SH3BP2-222	ENST00000512014	PCSK1	P29120	753 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SH3BP2-222	ENST00000512014	WEE1	P30291	646 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SH3BP2-222	ENST00000512014	NLRP12	P59046	1061 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SH3BP2-222	ENST00000512014	PFKP	Q01813	784 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SH3BP2-222	ENST00000512014	PRKCQ	Q04759	706 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SH3BP2-222	ENST00000512014	FZD5	Q13467	585 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SH3BP2-222	ENST00000512014	WDR72	Q3MJ13	1102 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZACN	Q401N2	412 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SH3BP2-222	ENST00000512014	GPR158	Q5T848	1215 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SH3BP2-222	ENST00000512014	ARID3B	Q8IVW6	561 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
SH3BP2-222	ENST00000512014	MFSD6L	Q8IWD5	586 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SH3BP2-222	ENST00000512014	DTWD2	Q8NBA8	298 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SH3BP2-222	ENST00000512014	PJA1	Q8NG27	643 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SH3BP2-222	ENST00000512014	SPATA20	Q8TB22	786 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SH3BP2-222	ENST00000512014	FAM200A	Q8TCP9	573 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SH3BP2-222	ENST00000512014	TMC2	Q8TDI7	906 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SH3BP2-222	ENST00000512014	DNASE1L2	Q92874	299 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SH3BP2-222	ENST00000512014	MYLPF	Q96A32	169 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SH3BP2-222	ENST00000512014	FUBP3	Q96I24	572 aa	Known RBP eCLIP	13.6	□□□□□ -0.23
SH3BP2-222	ENST00000512014	SLC46A2	Q9BY10	475 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SH3BP2-222	ENST00000512014	GPR88	Q9GZN0	384 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SH3BP2-222	ENST00000512014	SDCBP2	Q9H190	292 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SH3BP2-222	ENST00000512014	DPEP3	Q9H4B8	488 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SH3BP2-222	ENST00000512014	HEBP1	Q9NRV9	189 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SH3BP2-222	ENST00000512014	TMEM30A	Q9NV96	361 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SH3BP2-222	ENST00000512014	CDH9	Q9ULB4	789 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SH3BP2-222	ENST00000512014	CACNA1I	Q9P0X4	2223 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SH3BP2-222	ENST00000512014	MIA3	Q5JRA6	1907 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SH3BP2-222	ENST00000512014	ANAPC1	Q9H1A4	1944 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SH3BP2-222	ENST00000512014	KANSL1L	A0AUZ9	987 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SH3BP2-222	ENST00000512014	MAPK13	O15264	365 aa		13.59	□□□□□ -0.23

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