RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000505490.2

ALYREF-202, Transcript of Aly/REF export factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ALYREF, Length 1,088 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALYREF-202ENST00000505490 MYMKA6NI61 221 aa32.52■■■□□ 2.8
ALYREF-202ENST00000505490 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP32.52■■■□□ 2.8
ALYREF-202ENST00000505490 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP32.52■■■□□ 2.8
ALYREF-202ENST00000505490 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP32.52■■■□□ 2.8
ALYREF-202ENST00000505490 PRR23CQ6ZRP0 262 aa32.52■■■□□ 2.8
ALYREF-202ENST00000505490 DYMQ7RTS9 669 aa32.52■■■□□ 2.8
ALYREF-202ENST00000505490 PDCL2Q8N4E4 241 aa32.52■■■□□ 2.8
ALYREF-202ENST00000505490 RIN3Q8TB24 985 aa32.52■■■□□ 2.8
ALYREF-202ENST00000505490 ACBD6Q9BR61 282 aa32.52■■■□□ 2.8
ALYREF-202ENST00000505490 ABCB6Q9NP58 842 aa32.52■■■□□ 2.8
ALYREF-202ENST00000505490 OLFML3Q9NRN5 406 aa32.52■■■□□ 2.8
ALYREF-202ENST00000505490 SDK1Q7Z5N4 2213 aa32.51■■■□□ 2.8
ALYREF-202ENST00000505490 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP32.51■■■□□ 2.8
ALYREF-202ENST00000505490 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP32.51■■■□□ 2.79
ALYREF-202ENST00000505490 RUNX3Q13761 415 aa32.51■■■□□ 2.79
ALYREF-202ENST00000505490 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP32.51■■■□□ 2.79
ALYREF-202ENST00000505490 FSTL4Q6MZW2 842 aa32.51■■■□□ 2.79
ALYREF-202ENST00000505490 PKN3Q6P5Z2 889 aa32.51■■■□□ 2.79
ALYREF-202ENST00000505490 MON1AQ86VX9 555 aa32.51■■■□□ 2.79
ALYREF-202ENST00000505490 C1orf127Q8N9H9 656 aa32.51■■■□□ 2.79
ALYREF-202ENST00000505490 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa32.51■■■□□ 2.79
ALYREF-202ENST00000505490 TDP1Q9NUW8 608 aa32.51■■■□□ 2.79
ALYREF-202ENST00000505490 L1RE1Q9UN81 338 aa32.51■■■□□ 2.79
ALYREF-202ENST00000505490 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP32.51■■■□□ 2.79
ALYREF-202ENST00000505490 CLIC4Q9Y696 253 aa32.51■■■□□ 2.79
ALYREF-202ENST00000505490 EXTL3O43909 919 aa32.5■■■□□ 2.79
ALYREF-202ENST00000505490 CSH1P0DML2 217 aa32.5■■■□□ 2.79
ALYREF-202ENST00000505490 CSH2P0DML3 217 aa32.5■■■□□ 2.79
ALYREF-202ENST00000505490 GAP43P17677 238 aa32.5■■■□□ 2.79
ALYREF-202ENST00000505490 AVPR1AP37288 418 aa32.5■■■□□ 2.79
ALYREF-202ENST00000505490 TAF12Q16514 161 aa32.5■■■□□ 2.79
ALYREF-202ENST00000505490 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP32.5■■■□□ 2.79
ALYREF-202ENST00000505490 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP32.5■■■□□ 2.79
ALYREF-202ENST00000505490 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP32.5■■■□□ 2.79
ALYREF-202ENST00000505490 MAB21L3Q8N8X9 362 aa32.5■■■□□ 2.79
ALYREF-202ENST00000505490 SPATA18Q8TC71 538 aa32.5■■■□□ 2.79
ALYREF-202ENST00000505490 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP32.5■■■□□ 2.79
ALYREF-202ENST00000505490 MYRFLQ96LU7 910 aa32.5■■■□□ 2.79
ALYREF-202ENST00000505490 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa32.5■■■□□ 2.79
ALYREF-202ENST00000505490 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa32.5■■■□□ 2.79
ALYREF-202ENST00000505490 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP32.5■■■□□ 2.79
ALYREF-202ENST00000505490 EXOC7Q9UPT5 735 aa32.5■■■□□ 2.79
ALYREF-202ENST00000505490 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP32.5■■■□□ 2.79
ALYREF-202ENST00000505490 ATG2BQ96BY7 2078 aa32.5■■■□□ 2.79
ALYREF-202ENST00000505490 EML5Q05BV3 1969 aa32.5■■■□□ 2.79
ALYREF-202ENST00000505490 FRMD3A2A2Y4 597 aa32.49■■■□□ 2.79
ALYREF-202ENST00000505490 TADA3O75528 432 aa32.49■■■□□ 2.79
ALYREF-202ENST00000505490 NOL4O94818 638 aa32.49■■■□□ 2.79
ALYREF-202ENST00000505490 GARTP22102 1010 aa32.49■■■□□ 2.79
ALYREF-202ENST00000505490 TSPY1Q01534 308 aa32.49■■■□□ 2.79
ALYREF-202ENST00000505490 CUL4AQ13619 759 aa32.49■■■□□ 2.79
ALYREF-202ENST00000505490 SCARA3Q6AZY7 606 aa32.49■■■□□ 2.79
ALYREF-202ENST00000505490 TMEM86AQ8N2M4 240 aa32.49■■■□□ 2.79
ALYREF-202ENST00000505490 LRRC52Q8N7C0 313 aa32.49■■■□□ 2.79
ALYREF-202ENST00000505490 ACCSQ96QU6 501 aa32.49■■■□□ 2.79
ALYREF-202ENST00000505490 FAM213AQ9BRX8 229 aa32.49■■■□□ 2.79
ALYREF-202ENST00000505490 GDAP2Q9NXN4 497 aa32.49■■■□□ 2.79
ALYREF-202ENST00000505490 CCDC39Q9UFE4 941 aa32.49■■■□□ 2.79
ALYREF-202ENST00000505490 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa32.49■■■□□ 2.79
ALYREF-202ENST00000505490 ADRB1P08588 477 aa32.48■■■□□ 2.79
ALYREF-202ENST00000505490 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP32.48■■■□□ 2.79
ALYREF-202ENST00000505490 GPR15P49685 360 aa32.48■■■□□ 2.79
ALYREF-202ENST00000505490 TXNDC8Q6A555 127 aa32.48■■■□□ 2.79
ALYREF-202ENST00000505490 PI4K2AQ9BTU6 479 aa32.48■■■□□ 2.79
ALYREF-202ENST00000505490 LOC105378220A0A1B0GUY1 285 aaPredicted RBP32.47■■■□□ 2.79
ALYREF-202ENST00000505490 LDHAP00338 332 aaKnown RBP32.47■■■□□ 2.79
ALYREF-202ENST00000505490 ITGB3P05106 788 aa32.47■■■□□ 2.79
ALYREF-202ENST00000505490 CASP5P51878 434 aa32.47■■■□□ 2.79
ALYREF-202ENST00000505490 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP32.47■■■□□ 2.79
ALYREF-202ENST00000505490 TRIM68Q6AZZ1 485 aa32.47■■■□□ 2.79
ALYREF-202ENST00000505490 LOXL4Q96JB6 756 aa32.47■■■□□ 2.79
ALYREF-202ENST00000505490 EBF3Q9H4W6 596 aa32.47■■■□□ 2.79
ALYREF-202ENST00000505490 AGAP1Q9UPQ3 857 aa32.47■■■□□ 2.79
ALYREF-202ENST00000505490 GABRDO14764 452 aa32.46■■■□□ 2.79
ALYREF-202ENST00000505490 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP32.46■■■□□ 2.79
ALYREF-202ENST00000505490 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP32.46■■■□□ 2.79
ALYREF-202ENST00000505490 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP32.46■■■□□ 2.79
ALYREF-202ENST00000505490 RRAGBQ5VZM2 374 aa32.46■■■□□ 2.79
ALYREF-202ENST00000505490 SV2BQ7L1I2 683 aa32.46■■■□□ 2.79
ALYREF-202ENST00000505490 LIMS2Q7Z4I7 341 aa32.46■■■□□ 2.79
ALYREF-202ENST00000505490 GAB3Q8WWW8 586 aa32.46■■■□□ 2.79
ALYREF-202ENST00000505490 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP32.46■■■□□ 2.79
ALYREF-202ENST00000505490 SAAL1Q96ER3 474 aa32.46■■■□□ 2.79
ALYREF-202ENST00000505490 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP32.46■■■□□ 2.79
ALYREF-202ENST00000505490 ITGA11Q9UKX5 1188 aa32.46■■■□□ 2.79
ALYREF-202ENST00000505490 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa32.46■■■□□ 2.79
ALYREF-202ENST00000505490 CHD8Q9HCK8 2581 aa32.45■■■□□ 2.79
ALYREF-202ENST00000505490 RAP1GAPP47736 663 aa32.45■■■□□ 2.79
ALYREF-202ENST00000505490 BFSP1Q12934 665 aa32.45■■■□□ 2.79
ALYREF-202ENST00000505490 CFAP221Q4G0U5 840 aa32.45■■■□□ 2.79
ALYREF-202ENST00000505490 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP32.45■■■□□ 2.79
ALYREF-202ENST00000505490 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP32.45■■■□□ 2.79
ALYREF-202ENST00000505490 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP32.45■■■□□ 2.79
ALYREF-202ENST00000505490 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP32.45■■■□□ 2.79
ALYREF-202ENST00000505490 SIX4Q9UIU6 781 aa32.45■■■□□ 2.79
ALYREF-202ENST00000505490 GDF9O60383 454 aa32.44■■■□□ 2.78
ALYREF-202ENST00000505490 ATG13O75143 517 aa32.44■■■□□ 2.78
ALYREF-202ENST00000505490 CYP2F1P24903 491 aa32.44■■■□□ 2.78
ALYREF-202ENST00000505490 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP32.44■■■□□ 2.78
ALYREF-202ENST00000505490 ALCAMQ13740 583 aa32.44■■■□□ 2.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.7 ms