RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504294.5

SH3BP2-208, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 557 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-208ENST00000504294 ASPAP45381 313 aa15.51■□□□□ 0.07
SH3BP2-208ENST00000504294 RBM10P98175 930 aaKnown RBP15.51■□□□□ 0.07
SH3BP2-208ENST00000504294 INCA1Q0VD86 236 aa15.51■□□□□ 0.07
SH3BP2-208ENST00000504294 DUSP4Q13115 394 aa15.51■□□□□ 0.07
SH3BP2-208ENST00000504294 VWA3BQ502W6 1294 aa15.51■□□□□ 0.07
SH3BP2-208ENST00000504294 TCP11X2Q5H9J9 407 aa15.51■□□□□ 0.07
SH3BP2-208ENST00000504294 FKBP15Q5T1M5 1219 aa15.51■□□□□ 0.07
SH3BP2-208ENST00000504294 ADHFE1Q8IWW8 467 aa15.51■□□□□ 0.07
SH3BP2-208ENST00000504294 CRYBG2Q8N1P7 616 aa15.51■□□□□ 0.07
SH3BP2-208ENST00000504294 TMEM130Q8N3G9 435 aa15.51■□□□□ 0.07
SH3BP2-208ENST00000504294 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa15.51■□□□□ 0.07
SH3BP2-208ENST00000504294 FAM84AQ96KN4 292 aa15.51■□□□□ 0.07
SH3BP2-208ENST00000504294 PGLYRP2Q96PD5 576 aa15.51■□□□□ 0.07
SH3BP2-208ENST00000504294 RTP3Q9BQQ7 232 aa15.51■□□□□ 0.07
SH3BP2-208ENST00000504294 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP15.51■□□□□ 0.07
SH3BP2-208ENST00000504294 ELOVL4Q9GZR5 314 aa15.51■□□□□ 0.07
SH3BP2-208ENST00000504294 DNAJC25Q9H1X3 360 aa15.51■□□□□ 0.07
SH3BP2-208ENST00000504294 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP15.51■□□□□ 0.07
SH3BP2-208ENST00000504294 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP15.51■□□□□ 0.07
SH3BP2-208ENST00000504294 ZMYM5Q9UJ78 669 aa15.51■□□□□ 0.07
SH3BP2-208ENST00000504294 GTF3C4Q9UKN8 822 aa15.51■□□□□ 0.07
SH3BP2-208ENST00000504294 POLIQ9UNA4 740 aa15.51■□□□□ 0.07
SH3BP2-208ENST00000504294 OR4Q2P0C623 313 aa15.5■□□□□ 0.07
SH3BP2-208ENST00000504294 ZNF165P49910 485 aa15.5■□□□□ 0.07
SH3BP2-208ENST00000504294 MFAP3P55082 362 aa15.5■□□□□ 0.07
SH3BP2-208ENST00000504294 SLC8A3P57103 927 aa15.5■□□□□ 0.07
SH3BP2-208ENST00000504294 GCNT1Q02742 428 aa15.5■□□□□ 0.07
SH3BP2-208ENST00000504294 TWF1Q12792 350 aa15.5■□□□□ 0.07
SH3BP2-208ENST00000504294 CUL2Q13617 745 aa15.5■□□□□ 0.07
SH3BP2-208ENST00000504294 EXOC3L4Q17RC7 722 aa15.5■□□□□ 0.07
SH3BP2-208ENST00000504294 ANO6Q4KMQ2 910 aa15.5■□□□□ 0.07
SH3BP2-208ENST00000504294 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa15.5■□□□□ 0.07
SH3BP2-208ENST00000504294 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
SH3BP2-208ENST00000504294 FAM200AQ8TCP9 573 aa15.5■□□□□ 0.07
SH3BP2-208ENST00000504294 MED15Q96RN5 788 aa15.5■□□□□ 0.07
SH3BP2-208ENST00000504294 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
SH3BP2-208ENST00000504294 PI4K2AQ9BTU6 479 aa15.5■□□□□ 0.07
SH3BP2-208ENST00000504294 GPR88Q9GZN0 384 aa15.5■□□□□ 0.07
SH3BP2-208ENST00000504294 NDST4Q9H3R1 872 aa15.5■□□□□ 0.07
SH3BP2-208ENST00000504294 SMYD3Q9H7B4 428 aa15.5■□□□□ 0.07
SH3BP2-208ENST00000504294 ASAH2Q9NR71 780 aa15.5■□□□□ 0.07
SH3BP2-208ENST00000504294 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa15.5■□□□□ 0.07
SH3BP2-208ENST00000504294 YIPF1Q9Y548 306 aa15.5■□□□□ 0.07
SH3BP2-208ENST00000504294 CLUHO75153 1309 aa15.49■□□□□ 0.07
SH3BP2-208ENST00000504294 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa15.49■□□□□ 0.07
SH3BP2-208ENST00000504294 PES1O00541 588 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
SH3BP2-208ENST00000504294 CCL16O15467 120 aa15.49■□□□□ 0.07
SH3BP2-208ENST00000504294 RFPL2O75678 378 aa15.49■□□□□ 0.07
SH3BP2-208ENST00000504294 SEC24AO95486 1093 aa15.49■□□□□ 0.07
SH3BP2-208ENST00000504294 WEE2P0C1S8 567 aa15.49■□□□□ 0.07
SH3BP2-208ENST00000504294 CSH1P0DML2 217 aa15.49■□□□□ 0.07
SH3BP2-208ENST00000504294 CSH2P0DML3 217 aa15.49■□□□□ 0.07
SH3BP2-208ENST00000504294 RFX1P22670 979 aa15.49■□□□□ 0.07
SH3BP2-208ENST00000504294 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
SH3BP2-208ENST00000504294 LMO2P25791 158 aa15.49■□□□□ 0.07
SH3BP2-208ENST00000504294 KCNQ1P51787 676 aa15.49■□□□□ 0.07
SH3BP2-208ENST00000504294 NDST1P52848 882 aa15.49■□□□□ 0.07
SH3BP2-208ENST00000504294 CYP27A1Q02318 531 aa15.49■□□□□ 0.07
SH3BP2-208ENST00000504294 NFKBIBQ15653 356 aa15.49■□□□□ 0.07
SH3BP2-208ENST00000504294 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
SH3BP2-208ENST00000504294 SPOPLQ6IQ16 392 aa15.49■□□□□ 0.07
SH3BP2-208ENST00000504294 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
SH3BP2-208ENST00000504294 LRRTM3Q86VH5 581 aa15.49■□□□□ 0.07
SH3BP2-208ENST00000504294 OSTM1Q86WC4 334 aa15.49■□□□□ 0.07
SH3BP2-208ENST00000504294 IRF2BP1Q8IU81 584 aa15.49■□□□□ 0.07
SH3BP2-208ENST00000504294 ATAD1Q8NBU5 361 aa15.49■□□□□ 0.07
SH3BP2-208ENST00000504294 SEMA4DQ92854 862 aa15.49■□□□□ 0.07
SH3BP2-208ENST00000504294 NXPE3Q969Y0 559 aa15.49■□□□□ 0.07
SH3BP2-208ENST00000504294 ZNF707Q96C28 371 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
SH3BP2-208ENST00000504294 GCNAQ96QF7 691 aa15.49■□□□□ 0.07
SH3BP2-208ENST00000504294 TMEM209Q96SK2 561 aa15.49■□□□□ 0.07
SH3BP2-208ENST00000504294 ANP32EQ9BTT0 268 aa15.49■□□□□ 0.07
SH3BP2-208ENST00000504294 APOL5Q9BWW9 433 aa15.49■□□□□ 0.07
SH3BP2-208ENST00000504294 CISHQ9NSE2 258 aa15.49■□□□□ 0.07
SH3BP2-208ENST00000504294 GCNT4Q9P109 453 aa15.49■□□□□ 0.07
SH3BP2-208ENST00000504294 SYCE3A1L190 88 aa15.48■□□□□ 0.07
SH3BP2-208ENST00000504294 SOBPA7XYQ1 873 aa15.48■□□□□ 0.07
SH3BP2-208ENST00000504294 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa15.48■□□□□ 0.07
SH3BP2-208ENST00000504294 CILPO75339 1184 aa15.48■□□□□ 0.07
SH3BP2-208ENST00000504294 FSHRP23945 695 aa15.48■□□□□ 0.07
SH3BP2-208ENST00000504294 CDH8P55286 799 aa15.48■□□□□ 0.07
SH3BP2-208ENST00000504294 FILIP1LQ4L180 1135 aa15.48■□□□□ 0.07
SH3BP2-208ENST00000504294 MDH1BQ5I0G3 518 aa15.48■□□□□ 0.07
SH3BP2-208ENST00000504294 CDKAL1Q5VV42 579 aa15.48■□□□□ 0.07
SH3BP2-208ENST00000504294 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
SH3BP2-208ENST00000504294 PPM1KQ8N3J5 372 aa15.48■□□□□ 0.07
SH3BP2-208ENST00000504294 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
SH3BP2-208ENST00000504294 PSMG2Q969U7 264 aa15.48■□□□□ 0.07
SH3BP2-208ENST00000504294 SPATA17Q96L03 361 aa15.48■□□□□ 0.07
SH3BP2-208ENST00000504294 PKMYT1Q99640 499 aa15.48■□□□□ 0.07
SH3BP2-208ENST00000504294 MED10Q9BTT4 135 aa15.48■□□□□ 0.07
SH3BP2-208ENST00000504294 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
SH3BP2-208ENST00000504294 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
SH3BP2-208ENST00000504294 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
SH3BP2-208ENST00000504294 FANCLQ9NW38 375 aa15.48■□□□□ 0.07
SH3BP2-208ENST00000504294 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
SH3BP2-208ENST00000504294 MYBPHLA2RUH7 354 aa15.47■□□□□ 0.07
SH3BP2-208ENST00000504294 RHOP08100 348 aa15.47■□□□□ 0.07
SH3BP2-208ENST00000504294 IL9P15248 144 aa15.47■□□□□ 0.07
SH3BP2-208ENST00000504294 CDC25CP30307 473 aa15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.1 ms