RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498638.1

C7orf43-210, Transcript of chromosome 7 open reading frame 43, humanhuman

TSL 3

Gene C7orf43, Length 626 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C7orf43-210ENST00000498638 WASHC5Q12768 1159 aa8.28□□□□□ -1.08
C7orf43-210ENST00000498638 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
C7orf43-210ENST00000498638 PTPROQ16827 1216 aa8.28□□□□□ -1.08
C7orf43-210ENST00000498638 CBWD6Q4V339 395 aa8.28□□□□□ -1.08
C7orf43-210ENST00000498638 CBWD3Q5JTY5 395 aa8.28□□□□□ -1.08
C7orf43-210ENST00000498638 CBWD5Q5RIA9 395 aa8.28□□□□□ -1.08
C7orf43-210ENST00000498638 PCNX4Q63HM2 1172 aa8.28□□□□□ -1.08
C7orf43-210ENST00000498638 AADACL2Q6P093 401 aa8.28□□□□□ -1.08
C7orf43-210ENST00000498638 DHRS4L2Q6PKH6 230 aa8.28□□□□□ -1.08
C7orf43-210ENST00000498638 RINLQ6ZS11 566 aa8.28□□□□□ -1.08
C7orf43-210ENST00000498638 C3orf62Q6ZUJ4 267 aa8.28□□□□□ -1.08
C7orf43-210ENST00000498638 DHDDSQ86SQ9 333 aa8.28□□□□□ -1.08
C7orf43-210ENST00000498638 USP37Q86T82 979 aa8.28□□□□□ -1.08
C7orf43-210ENST00000498638 RASSF3Q86WH2 238 aa8.28□□□□□ -1.08
C7orf43-210ENST00000498638 KBTBD2Q8IY47 623 aa8.28□□□□□ -1.08
C7orf43-210ENST00000498638 ZBED8Q8IZ13 594 aa8.28□□□□□ -1.08
C7orf43-210ENST00000498638 ZBTB8BQ8NAP8 495 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
C7orf43-210ENST00000498638 SMYD1Q8NB12 490 aa8.28□□□□□ -1.08
C7orf43-210ENST00000498638 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
C7orf43-210ENST00000498638 MZB1Q8WU39 189 aa8.28□□□□□ -1.08
C7orf43-210ENST00000498638 WDR60Q8WVS4 1066 aa8.28□□□□□ -1.08
C7orf43-210ENST00000498638 C1orf54Q8WWF1 131 aa8.28□□□□□ -1.08
C7orf43-210ENST00000498638 STON2Q8WXE9 905 aa8.28□□□□□ -1.08
C7orf43-210ENST00000498638 MTBPQ96DY7 904 aa8.28□□□□□ -1.08
C7orf43-210ENST00000498638 BIRC8Q96P09 236 aa8.28□□□□□ -1.08
C7orf43-210ENST00000498638 NACC1Q96RE7 527 aa8.28□□□□□ -1.08
C7orf43-210ENST00000498638 FIZ1Q96SL8 496 aa8.28□□□□□ -1.08
C7orf43-210ENST00000498638 PCDHB18PQ96TA0 734 aa8.28□□□□□ -1.08
C7orf43-210ENST00000498638 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
C7orf43-210ENST00000498638 HSD17B14Q9BPX1 270 aa8.28□□□□□ -1.08
C7orf43-210ENST00000498638 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
C7orf43-210ENST00000498638 PCDH9Q9HC56 1237 aa8.28□□□□□ -1.08
C7orf43-210ENST00000498638 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
C7orf43-210ENST00000498638 MLXIPLQ9NP71 852 aa8.28□□□□□ -1.08
C7orf43-210ENST00000498638 PNPLA8Q9NP80 782 aa8.28□□□□□ -1.08
C7orf43-210ENST00000498638 NPHS2Q9NP85 383 aa8.28□□□□□ -1.08
C7orf43-210ENST00000498638 SAYSD1Q9NPB0 183 aa8.28□□□□□ -1.08
C7orf43-210ENST00000498638 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
C7orf43-210ENST00000498638 CHST7Q9NS84 486 aa8.28□□□□□ -1.08
C7orf43-210ENST00000498638 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
C7orf43-210ENST00000498638 C6orf203Q9P0P8 240 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
C7orf43-210ENST00000498638 CNTN3Q9P232 1028 aa8.28□□□□□ -1.08
C7orf43-210ENST00000498638 HSFX1Q9UBD0 423 aa8.28□□□□□ -1.08
C7orf43-210ENST00000498638 GRID1Q9ULK0 1009 aa8.28□□□□□ -1.08
C7orf43-210ENST00000498638 STRIP2Q9ULQ0 834 aa8.28□□□□□ -1.08
C7orf43-210ENST00000498638 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
C7orf43-210ENST00000498638 SH3GLB1Q9Y371 365 aa8.28□□□□□ -1.08
C7orf43-210ENST00000498638 LTBP1Q14766 1721 aa8.28□□□□□ -1.08
C7orf43-210ENST00000498638 ZNF541Q9H0D2 1346 aa8.28□□□□□ -1.08
C7orf43-210ENST00000498638 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
C7orf43-210ENST00000498638 B2RBV5 119 aa8.27□□□□□ -1.09
C7orf43-210ENST00000498638 H3BNX3 289 aa8.27□□□□□ -1.09
C7orf43-210ENST00000498638 ZNF701M0R085 212 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
C7orf43-210ENST00000498638 CBFA2T3O75081 653 aa8.27□□□□□ -1.09
C7orf43-210ENST00000498638 CAPNS1P04632 268 aa8.27□□□□□ -1.09
C7orf43-210ENST00000498638 ITGAVP06756 1048 aa8.27□□□□□ -1.09
C7orf43-210ENST00000498638 SERPINA6P08185 405 aa8.27□□□□□ -1.09
C7orf43-210ENST00000498638 FAM163BP0C2L3 166 aa8.27□□□□□ -1.09
C7orf43-210ENST00000498638 PRDX5P30044 214 aa8.27□□□□□ -1.09
C7orf43-210ENST00000498638 STIP1P31948 543 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
C7orf43-210ENST00000498638 ABCD1P33897 745 aa8.27□□□□□ -1.09
C7orf43-210ENST00000498638 VAMP7P51809 220 aa8.27□□□□□ -1.09
C7orf43-210ENST00000498638 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP8.27□□□□□ -1.09
C7orf43-210ENST00000498638 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
C7orf43-210ENST00000498638 ARL4CP56559 192 aa8.27□□□□□ -1.09
C7orf43-210ENST00000498638 SESN3P58005 492 aa8.27□□□□□ -1.09
C7orf43-210ENST00000498638 NOP14P78316 857 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
C7orf43-210ENST00000498638 GABPAQ06546 454 aa8.27□□□□□ -1.09
C7orf43-210ENST00000498638 GRAPQ13588 217 aa8.27□□□□□ -1.09
C7orf43-210ENST00000498638 MAPK6Q16659 721 aa8.27□□□□□ -1.09
C7orf43-210ENST00000498638 AOC3Q16853 763 aa8.27□□□□□ -1.09
C7orf43-210ENST00000498638 LGSNQ5TDP6 509 aa8.27□□□□□ -1.09
C7orf43-210ENST00000498638 LIN9Q5TKA1 542 aa8.27□□□□□ -1.09
C7orf43-210ENST00000498638 SYDE2Q5VT97 1194 aa8.27□□□□□ -1.09
C7orf43-210ENST00000498638 WDR78Q5VTH9 848 aa8.27□□□□□ -1.09
C7orf43-210ENST00000498638 ARMC3Q5W041 872 aa8.27□□□□□ -1.09
C7orf43-210ENST00000498638 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa8.27□□□□□ -1.09
C7orf43-210ENST00000498638 PGM2L1Q6PCE3 622 aa8.27□□□□□ -1.09
C7orf43-210ENST00000498638 C1orf228Q6PIY5 440 aa8.27□□□□□ -1.09
C7orf43-210ENST00000498638 POTEGQ6S5H5 508 aa8.27□□□□□ -1.09
C7orf43-210ENST00000498638 UGT2A3Q6UWM9 527 aa8.27□□□□□ -1.09
C7orf43-210ENST00000498638 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa8.27□□□□□ -1.09
C7orf43-210ENST00000498638 ANO5Q75V66 913 aa8.27□□□□□ -1.09
C7orf43-210ENST00000498638 ARCQ7LC44 396 aa8.27□□□□□ -1.09
C7orf43-210ENST00000498638 PALB2Q86YC2 1186 aa8.27□□□□□ -1.09
C7orf43-210ENST00000498638 ULK2Q8IYT8 1036 aa8.27□□□□□ -1.09
C7orf43-210ENST00000498638 RTKN2Q8IZC4 609 aa8.27□□□□□ -1.09
C7orf43-210ENST00000498638 ADGRF4Q8IZF3 695 aa8.27□□□□□ -1.09
C7orf43-210ENST00000498638 SYCP3Q8IZU3 236 aa8.27□□□□□ -1.09
C7orf43-210ENST00000498638 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
C7orf43-210ENST00000498638 TMC2Q8TDI7 906 aa8.27□□□□□ -1.09
C7orf43-210ENST00000498638 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
C7orf43-210ENST00000498638 DCAF4Q8WV16 495 aa8.27□□□□□ -1.09
C7orf43-210ENST00000498638 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
C7orf43-210ENST00000498638 COA7Q96BR5 231 aa8.27□□□□□ -1.09
C7orf43-210ENST00000498638 CCDC17Q96LX7 622 aa8.27□□□□□ -1.09
C7orf43-210ENST00000498638 LRGUKQ96M69 825 aa8.27□□□□□ -1.09
C7orf43-210ENST00000498638 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa8.27□□□□□ -1.09
C7orf43-210ENST00000498638 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
C7orf43-210ENST00000498638 ZHX3Q9H4I2 956 aa8.27□□□□□ -1.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.3 ms