RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498399.1

TIMMDC1-209, Transcript of translocase of inner mitochondrial membrane domain containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene TIMMDC1, Length 684 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1-209ENST00000498399 HAUS5O94927 633 aa5.05□□□□□ -1.6
TIMMDC1-209ENST00000498399 ZFPL1O95159 310 aa5.05□□□□□ -1.6
TIMMDC1-209ENST00000498399 NUDT3O95989 172 aa5.05□□□□□ -1.6
TIMMDC1-209ENST00000498399 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
TIMMDC1-209ENST00000498399 TRIM27P14373 513 aa5.05□□□□□ -1.6
TIMMDC1-209ENST00000498399 AVPR1BP47901 424 aa5.05□□□□□ -1.6
TIMMDC1-209ENST00000498399 RAB1AP62820 205 aa5.05□□□□□ -1.6
TIMMDC1-209ENST00000498399 SCAPQ12770 1279 aa5.05□□□□□ -1.6
TIMMDC1-209ENST00000498399 SNAPC2Q13487 334 aa5.05□□□□□ -1.6
TIMMDC1-209ENST00000498399 KIAA0753Q2KHM9 967 aa5.05□□□□□ -1.6
TIMMDC1-209ENST00000498399 FLYWCH1Q4VC44 716 aa5.05□□□□□ -1.6
TIMMDC1-209ENST00000498399 DACT2Q5SW24 774 aa5.05□□□□□ -1.6
TIMMDC1-209ENST00000498399 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
TIMMDC1-209ENST00000498399 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
TIMMDC1-209ENST00000498399 DNAJC10Q8IXB1 793 aa5.05□□□□□ -1.6
TIMMDC1-209ENST00000498399 PJA1Q8NG27 643 aa5.05□□□□□ -1.6
TIMMDC1-209ENST00000498399 Q96MF0 132 aa5.05□□□□□ -1.6
TIMMDC1-209ENST00000498399 TOR3AQ9H497 397 aa5.05□□□□□ -1.6
TIMMDC1-209ENST00000498399 GALNT9Q9HCQ5 603 aa5.05□□□□□ -1.6
TIMMDC1-209ENST00000498399 SYBUQ9NX95 663 aa5.05□□□□□ -1.6
TIMMDC1-209ENST00000498399 FAM30AQ9NZY2 134 aa5.05□□□□□ -1.6
TIMMDC1-209ENST00000498399 ZNHIT2Q9UHR6 403 aa5.05□□□□□ -1.6
TIMMDC1-209ENST00000498399 SLC45A2Q9UMX9 530 aa5.05□□□□□ -1.6
TIMMDC1-209ENST00000498399 CDYLQ9Y232 598 aa5.05□□□□□ -1.6
TIMMDC1-209ENST00000498399 KDM5DQ9BY66 1539 aa5.05□□□□□ -1.6
TIMMDC1-209ENST00000498399 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa5.05□□□□□ -1.6
TIMMDC1-209ENST00000498399 CCDC7Q96M83 1385 aa5.04□□□□□ -1.6
TIMMDC1-209ENST00000498399 CFAP74Q9C0B2 1584 aa5.04□□□□□ -1.6
TIMMDC1-209ENST00000498399 ATP7AQ04656 1500 aa5.04□□□□□ -1.6
TIMMDC1-209ENST00000498399 A0A088AWK7 358 aa5.04□□□□□ -1.6
TIMMDC1-209ENST00000498399 HRGP04196 525 aa5.04□□□□□ -1.6
TIMMDC1-209ENST00000498399 TYRP14679 529 aa5.04□□□□□ -1.6
TIMMDC1-209ENST00000498399 AGFG1P52594 562 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
TIMMDC1-209ENST00000498399 SEC24CP53992 1094 aa5.04□□□□□ -1.6
TIMMDC1-209ENST00000498399 CACNB3P54284 484 aa5.04□□□□□ -1.6
TIMMDC1-209ENST00000498399 NANOS3P60323 173 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
TIMMDC1-209ENST00000498399 FAM193AP78312 1265 aa5.04□□□□□ -1.6
TIMMDC1-209ENST00000498399 GPSM2P81274 684 aa5.04□□□□□ -1.6
TIMMDC1-209ENST00000498399 TMF1P82094 1093 aa5.04□□□□□ -1.6
TIMMDC1-209ENST00000498399 FGL2Q14314 439 aa5.04□□□□□ -1.6
TIMMDC1-209ENST00000498399 PLS1Q14651 629 aa5.04□□□□□ -1.6
TIMMDC1-209ENST00000498399 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP5.04□□□□□ -1.6
TIMMDC1-209ENST00000498399 CYP2A13Q16696 494 aa5.04□□□□□ -1.6
TIMMDC1-209ENST00000498399 GEN1Q17RS7 908 aa5.04□□□□□ -1.6
TIMMDC1-209ENST00000498399 ABHD17BQ5VST6 288 aa5.04□□□□□ -1.6
TIMMDC1-209ENST00000498399 OLFML1Q6UWY5 402 aa5.04□□□□□ -1.6
TIMMDC1-209ENST00000498399 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa5.04□□□□□ -1.6
TIMMDC1-209ENST00000498399 FAM43AQ8N2R8 423 aa5.04□□□□□ -1.6
TIMMDC1-209ENST00000498399 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
TIMMDC1-209ENST00000498399 PLBD2Q8NHP8 589 aa5.04□□□□□ -1.6
TIMMDC1-209ENST00000498399 NUP133Q8WUM0 1156 aa5.04□□□□□ -1.6
TIMMDC1-209ENST00000498399 CRAMP1Q96RY5 1269 aa5.04□□□□□ -1.6
TIMMDC1-209ENST00000498399 PNKPQ96T60 521 aa5.04□□□□□ -1.6
TIMMDC1-209ENST00000498399 PACSIN1Q9BY11 444 aa5.04□□□□□ -1.6
TIMMDC1-209ENST00000498399 WDCPQ9H6R7 721 aa5.04□□□□□ -1.6
TIMMDC1-209ENST00000498399 CASS4Q9NQ75 786 aa5.04□□□□□ -1.6
TIMMDC1-209ENST00000498399 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP5.04□□□□□ -1.6
TIMMDC1-209ENST00000498399 PNPOQ9NVS9 261 aa5.04□□□□□ -1.6
TIMMDC1-209ENST00000498399 STAP2Q9UGK3 403 aa5.04□□□□□ -1.6
TIMMDC1-209ENST00000498399 KCNE5Q9UJ90 142 aa5.04□□□□□ -1.6
TIMMDC1-209ENST00000498399 L1RE1Q9UN81 338 aa5.04□□□□□ -1.6
TIMMDC1-209ENST00000498399 TEX14Q8IWB6 1497 aa5.04□□□□□ -1.6
TIMMDC1-209ENST00000498399 KIF7Q2M1P5 1343 aa5.03□□□□□ -1.6
TIMMDC1-209ENST00000498399 RNF123Q5XPI4 1314 aa5.03□□□□□ -1.6
TIMMDC1-209ENST00000498399 ZBED9Q6R2W3 1325 aa5.03□□□□□ -1.6
TIMMDC1-209ENST00000498399 A2MP01023 1474 aa5.03□□□□□ -1.6
TIMMDC1-209ENST00000498399 CFAP69A5D8W1 941 aa5.03□□□□□ -1.6
TIMMDC1-209ENST00000498399 KIAA0355O15063 1070 aa5.03□□□□□ -1.6
TIMMDC1-209ENST00000498399 LMNAP02545 664 aaKnown RBP5.03□□□□□ -1.6
TIMMDC1-209ENST00000498399 FTH1P19P0C7X4 201 aa5.03□□□□□ -1.6
TIMMDC1-209ENST00000498399 MTHFD1P11586 935 aaKnown RBP5.03□□□□□ -1.6
TIMMDC1-209ENST00000498399 FDXRP22570 491 aa5.03□□□□□ -1.6
TIMMDC1-209ENST00000498399 NKX6-1P78426 367 aaPredicted RBP5.03□□□□□ -1.6
TIMMDC1-209ENST00000498399 TAP1Q03518 808 aa5.03□□□□□ -1.6
TIMMDC1-209ENST00000498399 PICALMQ13492 652 aa5.03□□□□□ -1.6
TIMMDC1-209ENST00000498399 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP5.03□□□□□ -1.6
TIMMDC1-209ENST00000498399 CNN3Q15417 329 aaKnown RBP5.03□□□□□ -1.6
TIMMDC1-209ENST00000498399 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP5.03□□□□□ -1.6
TIMMDC1-209ENST00000498399 ARMC6Q6NXE6 501 aa5.03□□□□□ -1.6
TIMMDC1-209ENST00000498399 MAEAQ7L5Y9 396 aa5.03□□□□□ -1.6
TIMMDC1-209ENST00000498399 FAM9BQ8IZU0 186 aa5.03□□□□□ -1.6
TIMMDC1-209ENST00000498399 NLGN4YQ8NFZ3 816 aaPredicted RBP5.03□□□□□ -1.6
TIMMDC1-209ENST00000498399 LINC00476Q8WZB0 136 aa5.03□□□□□ -1.6
TIMMDC1-209ENST00000498399 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP5.03□□□□□ -1.6
TIMMDC1-209ENST00000498399 BOD1Q96IK1 185 aa5.03□□□□□ -1.6
TIMMDC1-209ENST00000498399 RIOX1Q9H6W3 641 aa5.03□□□□□ -1.6
TIMMDC1-209ENST00000498399 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP5.03□□□□□ -1.6
TIMMDC1-209ENST00000498399 UNKLQ9H9P5 680 aaKnown RBP5.03□□□□□ -1.6
TIMMDC1-209ENST00000498399 CNNM1Q9NRU3 951 aa5.03□□□□□ -1.6
TIMMDC1-209ENST00000498399 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP5.03□□□□□ -1.6
TIMMDC1-209ENST00000498399 TBCCD1Q9NVR7 557 aa5.03□□□□□ -1.6
TIMMDC1-209ENST00000498399 PCDHGB6Q9Y5F9 930 aa5.03□□□□□ -1.6
TIMMDC1-209ENST00000498399 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa5.03□□□□□ -1.6
TIMMDC1-209ENST00000498399 CNTLNQ9NXG0 1405 aa5.03□□□□□ -1.6
TIMMDC1-209ENST00000498399 UNC13BO14795 1591 aa5.03□□□□□ -1.6
TIMMDC1-209ENST00000498399 KAT6AQ92794 2004 aa5.02□□□□□ -1.61
TIMMDC1-209ENST00000498399 SALL3Q9BXA9 1300 aa5.02□□□□□ -1.61
TIMMDC1-209ENST00000498399 NEO1Q92859 1461 aa5.02□□□□□ -1.61
TIMMDC1-209ENST00000498399 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa5.02□□□□□ -1.61
TIMMDC1-209ENST00000498399 F2RL2O00254 374 aa5.02□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.7 ms