RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496183.5

RBM39-241, Transcript of RNA binding motif protein 39, humanhuman

TSL 2

Gene RBM39, Length 632 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39-241ENST00000496183 MASP2O00187 686 aa5.91□□□□□ -1.46
RBM39-241ENST00000496183 VPS4BO75351 444 aa5.91□□□□□ -1.46
RBM39-241ENST00000496183 PROP1O75360 226 aa5.91□□□□□ -1.46
RBM39-241ENST00000496183 KIF20AO95235 890 aa5.91□□□□□ -1.46
RBM39-241ENST00000496183 TTLL1O95922 423 aa5.91□□□□□ -1.46
RBM39-241ENST00000496183 MAPK10P53779 464 aa5.91□□□□□ -1.46
RBM39-241ENST00000496183 TCF15Q12870 199 aa5.91□□□□□ -1.46
RBM39-241ENST00000496183 GTF2H3Q13889 308 aa5.91□□□□□ -1.46
RBM39-241ENST00000496183 PLS1Q14651 629 aa5.91□□□□□ -1.46
RBM39-241ENST00000496183 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa5.91□□□□□ -1.46
RBM39-241ENST00000496183 TAF2Q6P1X5 1199 aa5.91□□□□□ -1.46
RBM39-241ENST00000496183 ATRIPQ8WXE1 791 aa5.91□□□□□ -1.46
RBM39-241ENST00000496183 FAM136AQ96C01 138 aa5.91□□□□□ -1.46
RBM39-241ENST00000496183 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP5.91□□□□□ -1.46
RBM39-241ENST00000496183 ACTRT3Q9BYD9 372 aa5.91□□□□□ -1.46
RBM39-241ENST00000496183 EHD3Q9NZN3 535 aa5.91□□□□□ -1.46
RBM39-241ENST00000496183 PLEKHM1Q9Y4G2 1056 aa5.91□□□□□ -1.46
RBM39-241ENST00000496183 ENTPD2Q9Y5L3 495 aa5.91□□□□□ -1.46
RBM39-241ENST00000496183 UACAQ9BZF9 1416 aa5.91□□□□□ -1.46
RBM39-241ENST00000496183 GOLGA3Q08378 1498 aa5.9□□□□□ -1.46
RBM39-241ENST00000496183 UGGT2Q9NYU1 1516 aa5.9□□□□□ -1.46
RBM39-241ENST00000496183 PCSK5Q92824 1860 aa5.9□□□□□ -1.46
RBM39-241ENST00000496183 MYO1CO00159 1063 aa5.9□□□□□ -1.46
RBM39-241ENST00000496183 AP1G1O43747 822 aa5.9□□□□□ -1.46
RBM39-241ENST00000496183 IGLV2-14P01704 120 aa5.9□□□□□ -1.46
RBM39-241ENST00000496183 ATXN1LP0C7T5 689 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
RBM39-241ENST00000496183 PIM1P11309 404 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.46
RBM39-241ENST00000496183 LPOP22079 712 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.46
RBM39-241ENST00000496183 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.46
RBM39-241ENST00000496183 SOX8P57073 446 aa5.9□□□□□ -1.46
RBM39-241ENST00000496183 LOXL3P58215 753 aa5.9□□□□□ -1.46
RBM39-241ENST00000496183 NKX6-1P78426 367 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.46
RBM39-241ENST00000496183 MCL1Q07820 350 aa5.9□□□□□ -1.46
RBM39-241ENST00000496183 FGL2Q14314 439 aa5.9□□□□□ -1.46
RBM39-241ENST00000496183 TXNRD1Q16881 649 aa5.9□□□□□ -1.46
RBM39-241ENST00000496183 CCDC142Q17RM4 750 aa5.9□□□□□ -1.46
RBM39-241ENST00000496183 DAAM2Q86T65 1068 aa5.9□□□□□ -1.46
RBM39-241ENST00000496183 PPP1R3BQ86XI6 285 aa5.9□□□□□ -1.46
RBM39-241ENST00000496183 DENND1CQ8IV53 801 aa5.9□□□□□ -1.46
RBM39-241ENST00000496183 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
RBM39-241ENST00000496183 FAM46DQ8NEK8 389 aa5.9□□□□□ -1.46
RBM39-241ENST00000496183 KLHDC4Q8TBB5 520 aa5.9□□□□□ -1.46
RBM39-241ENST00000496183 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.46
RBM39-241ENST00000496183 FKBP10Q96AY3 582 aa5.9□□□□□ -1.46
RBM39-241ENST00000496183 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa5.9□□□□□ -1.46
RBM39-241ENST00000496183 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
RBM39-241ENST00000496183 PIH1D1Q9NWS0 290 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
RBM39-241ENST00000496183 SALL3Q9BXA9 1300 aa5.9□□□□□ -1.47
RBM39-241ENST00000496183 KDM5BQ9UGL1 1544 aa5.89□□□□□ -1.47
RBM39-241ENST00000496183 RFPL1O75677 317 aa5.89□□□□□ -1.47
RBM39-241ENST00000496183 AHSGP02765 367 aa5.89□□□□□ -1.47
RBM39-241ENST00000496183 THP07101 528 aa5.89□□□□□ -1.47
RBM39-241ENST00000496183 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP5.89□□□□□ -1.47
RBM39-241ENST00000496183 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
RBM39-241ENST00000496183 BMPR2Q13873 1038 aa5.89□□□□□ -1.47
RBM39-241ENST00000496183 IQCB1Q15051 598 aa5.89□□□□□ -1.47
RBM39-241ENST00000496183 LONRF3Q496Y0 759 aa5.89□□□□□ -1.47
RBM39-241ENST00000496183 ODR4Q5SWX8 454 aa5.89□□□□□ -1.47
RBM39-241ENST00000496183 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
RBM39-241ENST00000496183 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa5.89□□□□□ -1.47
RBM39-241ENST00000496183 PPP1R32Q7Z5V6 425 aa5.89□□□□□ -1.47
RBM39-241ENST00000496183 CGRRF1Q99675 332 aa5.89□□□□□ -1.47
RBM39-241ENST00000496183 TIMP4Q99727 224 aa5.89□□□□□ -1.47
RBM39-241ENST00000496183 LRFN3Q9BTN0 628 aa5.89□□□□□ -1.47
RBM39-241ENST00000496183 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa5.89□□□□□ -1.47
RBM39-241ENST00000496183 CPNE5Q9HCH3 593 aa5.89□□□□□ -1.47
RBM39-241ENST00000496183 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa5.89□□□□□ -1.47
RBM39-241ENST00000496183 ADM5C9JUS6 153 aa5.88□□□□□ -1.47
RBM39-241ENST00000496183 H3BML4 177 aa5.88□□□□□ -1.47
RBM39-241ENST00000496183 AKAP10O43572 662 aa5.88□□□□□ -1.47
RBM39-241ENST00000496183 TLR5O60602 858 aa5.88□□□□□ -1.47
RBM39-241ENST00000496183 CYP2C9P11712 490 aa5.88□□□□□ -1.47
RBM39-241ENST00000496183 NDUFB7P17568 137 aa5.88□□□□□ -1.47
RBM39-241ENST00000496183 WT1P19544 449 aaPredicted RBP5.88□□□□□ -1.47
RBM39-241ENST00000496183 CHRM3P20309 590 aa5.88□□□□□ -1.47
RBM39-241ENST00000496183 ZNF618Q5T7W0 954 aa5.88□□□□□ -1.47
RBM39-241ENST00000496183 TSTD2Q5T7W7 516 aa5.88□□□□□ -1.47
RBM39-241ENST00000496183 ICE2Q659A1 982 aa5.88□□□□□ -1.47
RBM39-241ENST00000496183 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP5.88□□□□□ -1.47
RBM39-241ENST00000496183 ZNF384Q8TF68 577 aa5.88□□□□□ -1.47
RBM39-241ENST00000496183 LRIG1Q96JA1 1093 aa5.88□□□□□ -1.47
RBM39-241ENST00000496183 HAPLN3Q96S86 360 aa5.88□□□□□ -1.47
RBM39-241ENST00000496183 CDH19Q9H159 772 aa5.88□□□□□ -1.47
RBM39-241ENST00000496183 KLK15Q9H2R5 256 aa5.88□□□□□ -1.47
RBM39-241ENST00000496183 VSX1Q9NZR4 365 aaPredicted RBP5.88□□□□□ -1.47
RBM39-241ENST00000496183 HESX1Q9UBX0 185 aa5.88□□□□□ -1.47
RBM39-241ENST00000496183 AGAP1Q9UPQ3 857 aa5.88□□□□□ -1.47
RBM39-241ENST00000496183 SHOC2Q9UQ13 582 aa5.88□□□□□ -1.47
RBM39-241ENST00000496183 WNT6Q9Y6F9 365 aa5.88□□□□□ -1.47
RBM39-241ENST00000496183 DISP1Q96F81 1524 aa5.88□□□□□ -1.47
RBM39-241ENST00000496183 KIAA0556O60303 1618 aa5.88□□□□□ -1.47
RBM39-241ENST00000496183 PRSS29PA6NIE9 313 aa5.87□□□□□ -1.47
RBM39-241ENST00000496183 GRPP07492 148 aa5.87□□□□□ -1.47
RBM39-241ENST00000496183 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP5.87□□□□□ -1.47
RBM39-241ENST00000496183 PXNP49023 591 aaPredicted RBP5.87□□□□□ -1.47
RBM39-241ENST00000496183 ALDH9A1P49189 494 aa5.87□□□□□ -1.47
RBM39-241ENST00000496183 RAB27AP51159 221 aa5.87□□□□□ -1.47
RBM39-241ENST00000496183 C21orf58P58505 322 aa5.87□□□□□ -1.47
RBM39-241ENST00000496183 RAB1AP62820 205 aa5.87□□□□□ -1.47
RBM39-241ENST00000496183 TMEM108Q6UXF1 575 aa5.87□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.3 ms