RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493026.2

PSMD11-205, Transcript of proteasome 26S subunit, non-ATPase 11, human

TSL 2

Gene PSMD11, Length 2,387 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PSMD11-205	ENST00000493026	JPH1	Q9HDC5	661 aa	Predicted RBP	13.45	□□□□□ -0.26
PSMD11-205	ENST00000493026	AGO2	Q9UKV8	859 aa	Known RBP	13.45	□□□□□ -0.26
PSMD11-205	ENST00000493026	UBOX5	O94941	541 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PSMD11-205	ENST00000493026	TJP3	O95049	919 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PSMD11-205	ENST00000493026	LSM8	O95777	96 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
PSMD11-205	ENST00000493026	MAGEA4	P43358	317 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PSMD11-205	ENST00000493026	IRX3	P78415	501 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
PSMD11-205	ENST00000493026	IL9R	Q01113	521 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PSMD11-205	ENST00000493026	NFX1	Q12986	1120 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
PSMD11-205	ENST00000493026	BAAT	Q14032	418 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
PSMD11-205	ENST00000493026	MPP2	Q14168	576 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PSMD11-205	ENST00000493026	MTFR1	Q15390	333 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PSMD11-205	ENST00000493026	CCDC142	Q17RM4	750 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PSMD11-205	ENST00000493026	TBC1D10B	Q4KMP7	808 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
PSMD11-205	ENST00000493026	ABHD15	Q6UXT9	468 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PSMD11-205	ENST00000493026	PHACTR1	Q9C0D0	580 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PSMD11-205	ENST00000493026	POLR3F	Q9H1D9	316 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
PSMD11-205	ENST00000493026	RNF146	Q9NTX7	359 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PSMD11-205	ENST00000493026	TAGLN3	Q9UI15	199 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PSMD11-205	ENST00000493026	FAM47DP	A6NHR8	397 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PSMD11-205	ENST00000493026	TLR3	O15455	904 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
PSMD11-205	ENST00000493026	CLTA	P09496	248 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PSMD11-205	ENST00000493026	NQO1	P15559	274 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
PSMD11-205	ENST00000493026	GNA15	P30679	374 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PSMD11-205	ENST00000493026	TAS2R40	P59535	323 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PSMD11-205	ENST00000493026	NCALD	P61601	193 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PSMD11-205	ENST00000493026	PRKCE	Q02156	737 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PSMD11-205	ENST00000493026	TAP1	Q03518	808 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PSMD11-205	ENST00000493026	LRRC14	Q15048	493 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PSMD11-205	ENST00000493026	SWSAP1	Q6NVH7	229 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PSMD11-205	ENST00000493026	MIS18BP1	Q6P0N0	1132 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PSMD11-205	ENST00000493026	ARMCX6	Q7L4S7	300 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PSMD11-205	ENST00000493026	PCGF5	Q86SE9	256 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PSMD11-205	ENST00000493026	TEPSIN	Q96N21	525 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PSMD11-205	ENST00000493026	TGS1	Q96RS0	853 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
PSMD11-205	ENST00000493026	RBM15	Q96T37	977 aa	Known RBP eCLIP	13.44	□□□□□ -0.26	3e-6	■□□□□ 8.8
PSMD11-205	ENST00000493026	KLHL14	Q9P2G3	628 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PSMD11-205	ENST00000493026	SLC9A2	Q9UBY0	812 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PSMD11-205	ENST00000493026	PRPF4	O43172	522 aa	Known RBP eCLIP	13.43	□□□□□ -0.26
PSMD11-205	ENST00000493026	LIAS	O43766	372 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PSMD11-205	ENST00000493026	VNN1	O95497	513 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PSMD11-205	ENST00000493026	CREB1	P16220	341 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PSMD11-205	ENST00000493026	COL9A1	P20849	921 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PSMD11-205	ENST00000493026	MMP8	P22894	467 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PSMD11-205	ENST00000493026	NAMPT	P43490	491 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PSMD11-205	ENST00000493026	ZNF132	P52740	706 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PSMD11-205	ENST00000493026	MORF4L2	Q15014	288 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PSMD11-205	ENST00000493026	TRIP13	Q15645	432 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
PSMD11-205	ENST00000493026	GNPTAB	Q3T906	1256 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PSMD11-205	ENST00000493026	FAM133B	Q5BKY9	247 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
PSMD11-205	ENST00000493026	TRAF7	Q6Q0C0	670 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PSMD11-205	ENST00000493026	PHF12	Q96QT6	1004 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PSMD11-205	ENST00000493026	CGRRF1	Q99675	332 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PSMD11-205	ENST00000493026	C11orf70	Q9BRQ4	267 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PSMD11-205	ENST00000493026	HEMGN	Q9BXL5	484 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PSMD11-205	ENST00000493026	TRIM55	Q9BYV6	548 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PSMD11-205	ENST00000493026	ZNF518B	Q9C0D4	1074 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PSMD11-205	ENST00000493026	RPAP3	Q9H6T3	665 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
PSMD11-205	ENST00000493026	ARHGEF3	Q9NR81	526 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PSMD11-205	ENST00000493026	FETUB	Q9UGM5	382 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PSMD11-205	ENST00000493026	SEPT9	Q9UHD8	586 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
PSMD11-205	ENST00000493026	SMG5	Q9UPR3	1016 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
PSMD11-205	ENST00000493026	PCDHB4	Q9Y5E5	795 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PSMD11-205	ENST00000493026	CD2AP	Q9Y5K6	639 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PSMD11-205	ENST00000493026	TMEM191C	A6NGB0	347 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PSMD11-205	ENST00000493026	SPATA31C2	B4DYI2	1134 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PSMD11-205	ENST00000493026	DNALI1	O14645	258 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
PSMD11-205	ENST00000493026	NDUFB5	O43674	189 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PSMD11-205	ENST00000493026	CALB1	P05937	261 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PSMD11-205	ENST00000493026	TMEM191B	P0C7N4	346 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PSMD11-205	ENST00000493026	NF2	P35240	595 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PSMD11-205	ENST00000493026	ACTR2	P61160	394 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PSMD11-205	ENST00000493026	GRM1	Q13255	1194 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PSMD11-205	ENST00000493026	CEP57	Q86XR8	500 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PSMD11-205	ENST00000493026	NIM1K	Q8IY84	436 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PSMD11-205	ENST00000493026	CYP4X1	Q8N118	509 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PSMD11-205	ENST00000493026	GIMAP7	Q8NHV1	300 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PSMD11-205	ENST00000493026	MGARP	Q8TDB4	240 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PSMD11-205	ENST00000493026	NKD2	Q969F2	451 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
PSMD11-205	ENST00000493026	NIF3L1	Q9GZT8	377 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PSMD11-205	ENST00000493026	PORCN	Q9H237	461 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PSMD11-205	ENST00000493026	ECT2	Q9H8V3	914 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PSMD11-205	ENST00000493026	RBAK	Q9NYW8	714 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
PSMD11-205	ENST00000493026	CTNNAL1	Q9UBT7	734 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PSMD11-205	ENST00000493026	ADAMTS5	Q9UNA0	930 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PSMD11-205	ENST00000493026	AGAP1	Q9UPQ3	857 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PSMD11-205	ENST00000493026	EFR3B	Q9Y2G0	817 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PSMD11-205	ENST00000493026		A0A0B4J269	797 aa		13.42	□□□□□ -0.26
PSMD11-205	ENST00000493026	GSTTP1	A0A1W2PQM5	241 aa		13.42	□□□□□ -0.26
PSMD11-205	ENST00000493026	RASA4B	C9J798	803 aa		13.42	□□□□□ -0.26
PSMD11-205	ENST00000493026	ATP2A1	O14983	1001 aa		13.42	□□□□□ -0.26
PSMD11-205	ENST00000493026	RASA4	O43374	803 aa		13.42	□□□□□ -0.26
PSMD11-205	ENST00000493026	ATP5H	O75947	161 aa		13.42	□□□□□ -0.26
PSMD11-205	ENST00000493026	CCNB1	P14635	433 aa		13.42	□□□□□ -0.26
PSMD11-205	ENST00000493026	RAB27A	P51159	221 aa		13.42	□□□□□ -0.26
PSMD11-205	ENST00000493026	SOX10	P56693	466 aa		13.42	□□□□□ -0.26
PSMD11-205	ENST00000493026	POU5F1B	Q06416	359 aa		13.42	□□□□□ -0.26
PSMD11-205	ENST00000493026	EMC2	Q15006	297 aa		13.42	□□□□□ -0.26
PSMD11-205	ENST00000493026	LLGL1	Q15334	1064 aa		13.42	□□□□□ -0.26
PSMD11-205	ENST00000493026	P3H1	Q32P28	736 aa		13.42	□□□□□ -0.26

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