RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487269.1

FAM204A-208, Transcript of family with sequence similarity 204 member A, human

TSL 2

Gene FAM204A, Length 659 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM204A-208	ENST00000487269	OR5B17	Q8NGF7	314 aa		12.82	□□□□□ -0.36
FAM204A-208	ENST00000487269	SPPL2B	Q8TCT7	592 aa		12.82	□□□□□ -0.36
FAM204A-208	ENST00000487269	CSGALNACT1	Q8TDX6	532 aa		12.82	□□□□□ -0.36
FAM204A-208	ENST00000487269	E2F7	Q96AV8	911 aa		12.82	□□□□□ -0.36
FAM204A-208	ENST00000487269	INTS4	Q96HW7	963 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
FAM204A-208	ENST00000487269	ZNF560	Q96MR9	790 aa		12.82	□□□□□ -0.36
FAM204A-208	ENST00000487269	PKMYT1	Q99640	499 aa		12.82	□□□□□ -0.36
FAM204A-208	ENST00000487269	EPC1	Q9H2F5	836 aa		12.82	□□□□□ -0.36
FAM204A-208	ENST00000487269	MORC2	Q9Y6X9	1032 aa	Predicted RBP	12.82	□□□□□ -0.36
FAM204A-208	ENST00000487269	MYBPHL	A2RUH7	354 aa		12.81	□□□□□ -0.36
FAM204A-208	ENST00000487269	OTOL1	A6NHN0	477 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
FAM204A-208	ENST00000487269		K7ELQ4	463 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
FAM204A-208	ENST00000487269	DPYSL4	O14531	572 aa		12.81	□□□□□ -0.36
FAM204A-208	ENST00000487269	ATP2C2	O75185	946 aa		12.81	□□□□□ -0.36
FAM204A-208	ENST00000487269	PRPF40A	O75400	957 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
FAM204A-208	ENST00000487269	TADA3	O75528	432 aa		12.81	□□□□□ -0.36
FAM204A-208	ENST00000487269	KRT19	P08727	400 aa		12.81	□□□□□ -0.36
FAM204A-208	ENST00000487269	CYP2F1	P24903	491 aa		12.81	□□□□□ -0.36
FAM204A-208	ENST00000487269	CASP1	P29466	404 aa		12.81	□□□□□ -0.36
FAM204A-208	ENST00000487269	NLRP12	P59046	1061 aa		12.81	□□□□□ -0.36
FAM204A-208	ENST00000487269	SRSF5	Q13243	272 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
FAM204A-208	ENST00000487269	VEPH1	Q14D04	833 aa		12.81	□□□□□ -0.36
FAM204A-208	ENST00000487269	PON2	Q15165	354 aa		12.81	□□□□□ -0.36
FAM204A-208	ENST00000487269	TAF12	Q16514	161 aa		12.81	□□□□□ -0.36
FAM204A-208	ENST00000487269	FOXD4L6	Q3SYB3	417 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
FAM204A-208	ENST00000487269	ARHGAP29	Q52LW3	1261 aa		12.81	□□□□□ -0.36
FAM204A-208	ENST00000487269	ARHGAP15	Q53QZ3	475 aa		12.81	□□□□□ -0.36
FAM204A-208	ENST00000487269	TRIM68	Q6AZZ1	485 aa		12.81	□□□□□ -0.36
FAM204A-208	ENST00000487269	FOXD4L3	Q6VB84	417 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
FAM204A-208	ENST00000487269	NT5DC4	Q86YG4	428 aa		12.81	□□□□□ -0.36
FAM204A-208	ENST00000487269	CBWD2	Q8IUF1	395 aa		12.81	□□□□□ -0.36
FAM204A-208	ENST00000487269	DCP1B	Q8IZD4	617 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
FAM204A-208	ENST00000487269	MAB21L3	Q8N8X9	362 aa		12.81	□□□□□ -0.36
FAM204A-208	ENST00000487269	BPIFB1	Q8TDL5	484 aa		12.81	□□□□□ -0.36
FAM204A-208	ENST00000487269	CHFR	Q96EP1	664 aa		12.81	□□□□□ -0.36
FAM204A-208	ENST00000487269	GKN1	Q9NS71	199 aa		12.81	□□□□□ -0.36
FAM204A-208	ENST00000487269	DDX43	Q9NXZ2	648 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
FAM204A-208	ENST00000487269	NCDN	Q9UBB6	729 aa		12.81	□□□□□ -0.36
FAM204A-208	ENST00000487269	GTF3C4	Q9UKN8	822 aa		12.81	□□□□□ -0.36
FAM204A-208	ENST00000487269	PCDHB5	Q9Y5E4	795 aa		12.81	□□□□□ -0.36
FAM204A-208	ENST00000487269	SNX9	Q9Y5X1	595 aa		12.81	□□□□□ -0.36
FAM204A-208	ENST00000487269	TCHH	Q07283	1943 aa		12.81	□□□□□ -0.36
FAM204A-208	ENST00000487269	MED19	A0JLT2	244 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
FAM204A-208	ENST00000487269	CHURC1-FNTB	B4DL54	471 aa		12.8	□□□□□ -0.36
FAM204A-208	ENST00000487269	SPTLC2	O15270	562 aa		12.8	□□□□□ -0.36
FAM204A-208	ENST00000487269	FGF19	O95750	216 aa		12.8	□□□□□ -0.36
FAM204A-208	ENST00000487269	TGM1	P22735	817 aa		12.8	□□□□□ -0.36
FAM204A-208	ENST00000487269	CDC25C	P30307	473 aa		12.8	□□□□□ -0.36
FAM204A-208	ENST00000487269	TIE1	P35590	1138 aa		12.8	□□□□□ -0.36
FAM204A-208	ENST00000487269	PNPLA4	P41247	253 aa		12.8	□□□□□ -0.36
FAM204A-208	ENST00000487269	FNTB	P49356	437 aa		12.8	□□□□□ -0.36
FAM204A-208	ENST00000487269	TSPY1	Q01534	308 aa		12.8	□□□□□ -0.36
FAM204A-208	ENST00000487269	SOWAHA	Q2M3V2	549 aa		12.8	□□□□□ -0.36
FAM204A-208	ENST00000487269	INTS6L	Q5JSJ4	861 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
FAM204A-208	ENST00000487269	NAIF1	Q69YI7	327 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
FAM204A-208	ENST00000487269	PKN3	Q6P5Z2	889 aa		12.8	□□□□□ -0.36
FAM204A-208	ENST00000487269	SHC4	Q6S5L8	630 aa		12.8	□□□□□ -0.36
FAM204A-208	ENST00000487269	MAMSTR	Q6ZN01	415 aa		12.8	□□□□□ -0.36
FAM204A-208	ENST00000487269	CMTM8	Q8IZV2	173 aa		12.8	□□□□□ -0.36
FAM204A-208	ENST00000487269	GPD1L	Q8N335	351 aa		12.8	□□□□□ -0.36
FAM204A-208	ENST00000487269	C2orf15	Q8WU43	125 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
FAM204A-208	ENST00000487269	USP13	Q92995	863 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
FAM204A-208	ENST00000487269	DHX58	Q96C10	678 aa		12.8	□□□□□ -0.36
FAM204A-208	ENST00000487269	TRIM9	Q9C026	710 aa		12.8	□□□□□ -0.36
FAM204A-208	ENST00000487269	ZSCAN16	Q9H4T2	348 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
FAM204A-208	ENST00000487269	C8orf33	Q9H7E9	229 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
FAM204A-208	ENST00000487269	PARD6A	Q9NPB6	346 aa		12.8	□□□□□ -0.36
FAM204A-208	ENST00000487269	HPS4	Q9NQG7	708 aa		12.8	□□□□□ -0.36
FAM204A-208	ENST00000487269	INTS13	Q9NVM9	706 aa		12.8	□□□□□ -0.36
FAM204A-208	ENST00000487269	KBTBD4	Q9NVX7	518 aa		12.8	□□□□□ -0.36
FAM204A-208	ENST00000487269	OBP2A	Q9NY56	170 aa		12.8	□□□□□ -0.36
FAM204A-208	ENST00000487269	ITGA11	Q9UKX5	1188 aa		12.8	□□□□□ -0.36
FAM204A-208	ENST00000487269	MAGED2	Q9UNF1	606 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
FAM204A-208	ENST00000487269	NUP210	Q8TEM1	1887 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
FAM204A-208	ENST00000487269		K7ESF4	209 aa		12.79	□□□□□ -0.36
FAM204A-208	ENST00000487269	RIOK3	O14730	519 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
FAM204A-208	ENST00000487269	HR	O43593	1189 aa		12.79	□□□□□ -0.36
FAM204A-208	ENST00000487269	HUS1	O60921	280 aa		12.79	□□□□□ -0.36
FAM204A-208	ENST00000487269	LDHA	P00338	332 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
FAM204A-208	ENST00000487269	ARSA	P15289	507 aa		12.79	□□□□□ -0.36
FAM204A-208	ENST00000487269	LMO2	P25791	158 aa		12.79	□□□□□ -0.36
FAM204A-208	ENST00000487269	WEE1	P30291	646 aa		12.79	□□□□□ -0.36
FAM204A-208	ENST00000487269	CXCL12	P48061	93 aa		12.79	□□□□□ -0.36
FAM204A-208	ENST00000487269	CCR3	P51677	355 aa		12.79	□□□□□ -0.36
FAM204A-208	ENST00000487269	MLLT6	P55198	1093 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
FAM204A-208	ENST00000487269	RBP5	P82980	135 aa		12.79	□□□□□ -0.36
FAM204A-208	ENST00000487269	SMARCB1	Q12824	385 aa		12.79	□□□□□ -0.36
FAM204A-208	ENST00000487269	ALCAM	Q13740	583 aa		12.79	□□□□□ -0.36
FAM204A-208	ENST00000487269	CCIN	Q13939	588 aa		12.79	□□□□□ -0.36
FAM204A-208	ENST00000487269	HEATR6	Q6AI08	1181 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
FAM204A-208	ENST00000487269	ERMP1	Q7Z2K6	904 aa		12.79	□□□□□ -0.36
FAM204A-208	ENST00000487269	RALGPS2	Q86X27	583 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
FAM204A-208	ENST00000487269	CCDC65	Q8IXS2	484 aa		12.79	□□□□□ -0.36
FAM204A-208	ENST00000487269	ADGRF2	Q8IZF7	708 aa		12.79	□□□□□ -0.36
FAM204A-208	ENST00000487269	SPEM1	Q8N4L4	309 aa		12.79	□□□□□ -0.36
FAM204A-208	ENST00000487269	LRRC52	Q8N7C0	313 aa		12.79	□□□□□ -0.36
FAM204A-208	ENST00000487269	CACTIN	Q8WUQ7	758 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
FAM204A-208	ENST00000487269	KBTBD7	Q8WVZ9	684 aa		12.79	□□□□□ -0.36
FAM204A-208	ENST00000487269	DCBLD2	Q96PD2	775 aa		12.79	□□□□□ -0.36
FAM204A-208	ENST00000487269	GCNA	Q96QF7	691 aa		12.79	□□□□□ -0.36

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