RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485459.5

RABGGTB-210, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 788 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-210ENST00000485459 ATRIPQ8WXE1 791 aa5.31□□□□□ -1.56
RABGGTB-210ENST00000485459 SARAFQ96BY9 339 aa5.31□□□□□ -1.56
RABGGTB-210ENST00000485459 NELL2Q99435 816 aa5.31□□□□□ -1.56
RABGGTB-210ENST00000485459 TIMP4Q99727 224 aa5.31□□□□□ -1.56
RABGGTB-210ENST00000485459 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa5.31□□□□□ -1.56
RABGGTB-210ENST00000485459 HESX1Q9UBX0 185 aa5.31□□□□□ -1.56
RABGGTB-210ENST00000485459 STAP2Q9UGK3 403 aa5.31□□□□□ -1.56
RABGGTB-210ENST00000485459 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP5.31□□□□□ -1.56
RABGGTB-210ENST00000485459 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP5.31□□□□□ -1.56
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RABGGTB-210ENST00000485459 MYO1CO00159 1063 aa5.3□□□□□ -1.56
RABGGTB-210ENST00000485459 PPM1DO15297 605 aa5.3□□□□□ -1.56
RABGGTB-210ENST00000485459 AKAP10O43572 662 aa5.3□□□□□ -1.56
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RABGGTB-210ENST00000485459 ATXN1LP0C7T5 689 aaKnown RBP5.3□□□□□ -1.56
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RABGGTB-210ENST00000485459 WT1P19544 449 aaPredicted RBP5.3□□□□□ -1.56
RABGGTB-210ENST00000485459 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP5.3□□□□□ -1.56
RABGGTB-210ENST00000485459 CCT8P50990 548 aa5.3□□□□□ -1.56
RABGGTB-210ENST00000485459 RAB27AP51159 221 aa5.3□□□□□ -1.56
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RABGGTB-210ENST00000485459 IQCB1Q15051 598 aa5.3□□□□□ -1.56
RABGGTB-210ENST00000485459 EMC10Q5UCC4 262 aa5.3□□□□□ -1.56
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RABGGTB-210ENST00000485459 ICE2Q659A1 982 aa5.3□□□□□ -1.56
RABGGTB-210ENST00000485459 SFRP4Q6FHJ7 346 aaPredicted RBP5.3□□□□□ -1.56
RABGGTB-210ENST00000485459 DAAM2Q86T65 1068 aa5.3□□□□□ -1.56
RABGGTB-210ENST00000485459 DENND1CQ8IV53 801 aa5.3□□□□□ -1.56
RABGGTB-210ENST00000485459 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP5.3□□□□□ -1.56
RABGGTB-210ENST00000485459 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP5.3□□□□□ -1.56
RABGGTB-210ENST00000485459 RFKQ969G6 155 aa5.3□□□□□ -1.56
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RABGGTB-210ENST00000485459 CHMP4AQ9BY43 222 aa5.3□□□□□ -1.56
RABGGTB-210ENST00000485459 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa5.3□□□□□ -1.56
RABGGTB-210ENST00000485459 DKK3Q9UBP4 350 aa5.3□□□□□ -1.56
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RABGGTB-210ENST00000485459 DNAJB5O75953 348 aa5.29□□□□□ -1.56
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RABGGTB-210ENST00000485459 HTR1BP28222 390 aa5.29□□□□□ -1.56
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RABGGTB-210ENST00000485459 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP5.29□□□□□ -1.56
RABGGTB-210ENST00000485459 FGL2Q14314 439 aa5.29□□□□□ -1.56
RABGGTB-210ENST00000485459 ZNF551Q7Z340 670 aaPredicted RBP5.29□□□□□ -1.56
RABGGTB-210ENST00000485459 TPH2Q8IWU9 490 aa5.29□□□□□ -1.56
RABGGTB-210ENST00000485459 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP5.29□□□□□ -1.563e-9■■■■■ 50.3
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RABGGTB-210ENST00000485459 PADI4Q9UM07 663 aa5.29□□□□□ -1.56
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RABGGTB-210ENST00000485459 PIH1D1Q9NWS0 290 aaKnown RBP5.28□□□□□ -1.56
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RABGGTB-210ENST00000485459 A0A1W2PPL8 197 aa5.27□□□□□ -1.57
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RABGGTB-210ENST00000485459 H3BML4 177 aa5.27□□□□□ -1.57
RABGGTB-210ENST00000485459 DCLK1O15075 740 aa5.27□□□□□ -1.57
RABGGTB-210ENST00000485459 TLR5O60602 858 aa5.27□□□□□ -1.57
RABGGTB-210ENST00000485459 RBMXL2O75526 392 aaKnown RBP5.27□□□□□ -1.57
RABGGTB-210ENST00000485459 CDK4P11802 303 aa5.27□□□□□ -1.57
RABGGTB-210ENST00000485459 DRD4P21917 467 aa5.27□□□□□ -1.57
RABGGTB-210ENST00000485459 FCRLBQ6BAA4 426 aa5.27□□□□□ -1.57
RABGGTB-210ENST00000485459 SUMO4Q6EEV6 95 aa5.27□□□□□ -1.57
RABGGTB-210ENST00000485459 RGS7BPQ6MZT1 257 aaPredicted RBP5.27□□□□□ -1.57
RABGGTB-210ENST00000485459 PTF1AQ7RTS3 328 aa5.27□□□□□ -1.57
RABGGTB-210ENST00000485459 FAM109AQ8N4B1 249 aa5.27□□□□□ -1.57
RABGGTB-210ENST00000485459 PTDSS2Q9BVG9 487 aa5.27□□□□□ -1.57
RABGGTB-210ENST00000485459 CDH19Q9H159 772 aa5.27□□□□□ -1.57
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RABGGTB-210ENST00000485459 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa5.27□□□□□ -1.57
RABGGTB-210ENST00000485459 FANCIQ9NVI1 1328 aa5.26□□□□□ -1.57
RABGGTB-210ENST00000485459 A0A088AWK7 358 aa5.26□□□□□ -1.57
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RABGGTB-210ENST00000485459 UBXN7O94888 489 aa5.26□□□□□ -1.57
RABGGTB-210ENST00000485459 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP5.26□□□□□ -1.571e-8■■■□□ 14.6
RABGGTB-210ENST00000485459 ITPKBP27987 946 aa5.26□□□□□ -1.57
RABGGTB-210ENST00000485459 PPIFP30405 207 aaKnown RBP5.26□□□□□ -1.57
RABGGTB-210ENST00000485459 VIPR2P41587 438 aa5.26□□□□□ -1.57
RABGGTB-210ENST00000485459 CLCN2P51788 898 aa5.26□□□□□ -1.57
RABGGTB-210ENST00000485459 PDE1AP54750 535 aa5.26□□□□□ -1.57
RABGGTB-210ENST00000485459 UCP3P55916 312 aa5.26□□□□□ -1.57
RABGGTB-210ENST00000485459 PROK1P58294 105 aa5.26□□□□□ -1.57
RABGGTB-210ENST00000485459 KRT17Q04695 432 aa5.26□□□□□ -1.57
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