RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485349.5

SKIV2L-211, Transcript of Ski2 like RNA helicase, humanhuman

TSL 2

Gene SKIV2L, Length 734 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2L-211ENST00000485349 SDHAF4Q5VUM1 108 aa18.21■□□□□ 0.51
SKIV2L-211ENST00000485349 SYCP3Q8IZU3 236 aa18.21■□□□□ 0.51
SKIV2L-211ENST00000485349 CMTM8Q8IZV2 173 aa18.21■□□□□ 0.51
SKIV2L-211ENST00000485349 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP18.21■□□□□ 0.51
SKIV2L-211ENST00000485349 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP18.21■□□□□ 0.51
SKIV2L-211ENST00000485349 MTMR12Q9C0I1 747 aa18.21■□□□□ 0.51
SKIV2L-211ENST00000485349 PCIF1Q9H4Z3 704 aa18.21■□□□□ 0.51
SKIV2L-211ENST00000485349 PANK4Q9NVE7 773 aa18.21■□□□□ 0.51
SKIV2L-211ENST00000485349 GMEB2Q9UKD1 530 aa18.21■□□□□ 0.51
SKIV2L-211ENST00000485349 MTMR6Q9Y217 621 aa18.21■□□□□ 0.51
SKIV2L-211ENST00000485349 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa18.21■□□□□ 0.51
SKIV2L-211ENST00000485349 GREB1Q4ZG55 1949 aa18.2■□□□□ 0.5
SKIV2L-211ENST00000485349 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa18.2■□□□□ 0.5
SKIV2L-211ENST00000485349 K7ESF4 209 aa18.2■□□□□ 0.5
SKIV2L-211ENST00000485349 EXTL3O43909 919 aa18.2■□□□□ 0.5
SKIV2L-211ENST00000485349 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP18.2■□□□□ 0.5
SKIV2L-211ENST00000485349 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP18.2■□□□□ 0.5
SKIV2L-211ENST00000485349 F11P03951 625 aa18.2■□□□□ 0.5
SKIV2L-211ENST00000485349 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP18.2■□□□□ 0.5
SKIV2L-211ENST00000485349 ALCAMQ13740 583 aa18.2■□□□□ 0.5
SKIV2L-211ENST00000485349 CCINQ13939 588 aa18.2■□□□□ 0.5
SKIV2L-211ENST00000485349 SLC39A14Q15043 492 aa18.2■□□□□ 0.5
SKIV2L-211ENST00000485349 DGKKQ5KSL6 1271 aa18.2■□□□□ 0.5
SKIV2L-211ENST00000485349 PRR23BQ6ZRT6 265 aa18.2■□□□□ 0.5
SKIV2L-211ENST00000485349 OSTM1Q86WC4 334 aa18.2■□□□□ 0.5
SKIV2L-211ENST00000485349 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP18.2■□□□□ 0.5
SKIV2L-211ENST00000485349 LRRC52Q8N7C0 313 aa18.2■□□□□ 0.5
SKIV2L-211ENST00000485349 PDILTQ8N807 584 aa18.2■□□□□ 0.5
SKIV2L-211ENST00000485349 MAB21L3Q8N8X9 362 aa18.2■□□□□ 0.5
SKIV2L-211ENST00000485349 GLIS3Q8NEA6 775 aa18.2■□□□□ 0.5
SKIV2L-211ENST00000485349 RIN3Q8TB24 985 aa18.2■□□□□ 0.5
SKIV2L-211ENST00000485349 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP18.2■□□□□ 0.5
SKIV2L-211ENST00000485349 PKMYT1Q99640 499 aa18.2■□□□□ 0.5
SKIV2L-211ENST00000485349 PDE11AQ9HCR9 933 aa18.2■□□□□ 0.5
SKIV2L-211ENST00000485349 FOXD4L1Q9NU39 408 aa18.2■□□□□ 0.5
SKIV2L-211ENST00000485349 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP18.2■□□□□ 0.5
SKIV2L-211ENST00000485349 SIX4Q9UIU6 781 aa18.2■□□□□ 0.5
SKIV2L-211ENST00000485349 ITGA11Q9UKX5 1188 aa18.2■□□□□ 0.5
SKIV2L-211ENST00000485349 RAB23Q9ULC3 237 aa18.2■□□□□ 0.5
SKIV2L-211ENST00000485349 USP18Q9UMW8 372 aa18.2■□□□□ 0.5
SKIV2L-211ENST00000485349 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP18.2■□□□□ 0.5
SKIV2L-211ENST00000485349 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP18.2■□□□□ 0.5
SKIV2L-211ENST00000485349 PTPRJQ12913 1337 aa18.2■□□□□ 0.5
SKIV2L-211ENST00000485349 RALGAPA1Q6GYQ0 2036 aa18.2■□□□□ 0.5
SKIV2L-211ENST00000485349 PTPRDP23468 1912 aa18.19■□□□□ 0.5
SKIV2L-211ENST00000485349 HELZP42694 1942 aaKnown RBP18.19■□□□□ 0.5
SKIV2L-211ENST00000485349 ATG2BQ96BY7 2078 aa18.19■□□□□ 0.5
SKIV2L-211ENST00000485349 HCRTO43612 131 aa18.19■□□□□ 0.5
SKIV2L-211ENST00000485349 HUS1O60921 280 aa18.19■□□□□ 0.5
SKIV2L-211ENST00000485349 TADA3O75528 432 aa18.19■□□□□ 0.5
SKIV2L-211ENST00000485349 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP18.19■□□□□ 0.5
SKIV2L-211ENST00000485349 LDHAP00338 332 aaKnown RBP18.19■□□□□ 0.5
SKIV2L-211ENST00000485349 KRT19P08727 400 aa18.19■□□□□ 0.5
SKIV2L-211ENST00000485349 AVPR1AP37288 418 aa18.19■□□□□ 0.5
SKIV2L-211ENST00000485349 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP18.19■□□□□ 0.5
SKIV2L-211ENST00000485349 DDR2Q16832 855 aa18.19■□□□□ 0.5
SKIV2L-211ENST00000485349 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa18.19■□□□□ 0.5
SKIV2L-211ENST00000485349 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP18.19■□□□□ 0.5
SKIV2L-211ENST00000485349 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP18.19■□□□□ 0.5
SKIV2L-211ENST00000485349 TXNDC8Q6A555 127 aa18.19■□□□□ 0.5
SKIV2L-211ENST00000485349 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP18.19■□□□□ 0.5
SKIV2L-211ENST00000485349 TRIM68Q6AZZ1 485 aa18.19■□□□□ 0.5
SKIV2L-211ENST00000485349 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa18.19■□□□□ 0.5
SKIV2L-211ENST00000485349 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP18.19■□□□□ 0.5
SKIV2L-211ENST00000485349 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP18.19■□□□□ 0.5
SKIV2L-211ENST00000485349 HPS3Q969F9 1004 aa18.19■□□□□ 0.5
SKIV2L-211ENST00000485349 ACBD6Q9BR61 282 aa18.19■□□□□ 0.5
SKIV2L-211ENST00000485349 HPS4Q9NQG7 708 aa18.19■□□□□ 0.5
SKIV2L-211ENST00000485349 GKN1Q9NS71 199 aa18.19■□□□□ 0.5
SKIV2L-211ENST00000485349 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP18.19■□□□□ 0.5
SKIV2L-211ENST00000485349 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP18.18■□□□□ 0.5
SKIV2L-211ENST00000485349 HRO43593 1189 aa18.18■□□□□ 0.5
SKIV2L-211ENST00000485349 CYP2F1P24903 491 aa18.18■□□□□ 0.5
SKIV2L-211ENST00000485349 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP18.18■□□□□ 0.5
SKIV2L-211ENST00000485349 MYL7Q01449 175 aa18.18■□□□□ 0.5
SKIV2L-211ENST00000485349 LMNB2Q03252 620 aa18.18■□□□□ 0.5
SKIV2L-211ENST00000485349 SPEM2Q0P670 501 aa18.18■□□□□ 0.5
SKIV2L-211ENST00000485349 LAIR1Q6GTX8 287 aa18.18■□□□□ 0.5
SKIV2L-211ENST00000485349 ADGRF2Q8IZF7 708 aa18.18■□□□□ 0.5
SKIV2L-211ENST00000485349 TMEM86AQ8N2M4 240 aa18.18■□□□□ 0.5
SKIV2L-211ENST00000485349 CHFRQ96EP1 664 aa18.18■□□□□ 0.5
SKIV2L-211ENST00000485349 FAM83CQ9BQN1 747 aa18.18■□□□□ 0.5
SKIV2L-211ENST00000485349 EBF3Q9H4W6 596 aa18.18■□□□□ 0.5
SKIV2L-211ENST00000485349 TMEM206Q9H813 350 aa18.18■□□□□ 0.5
SKIV2L-211ENST00000485349 ABCB6Q9NP58 842 aa18.18■□□□□ 0.5
SKIV2L-211ENST00000485349 GDAP2Q9NXN4 497 aa18.18■□□□□ 0.5
SKIV2L-211ENST00000485349 ZMYM5Q9UJ78 669 aa18.18■□□□□ 0.5
SKIV2L-211ENST00000485349 GTF3C4Q9UKN8 822 aa18.18■□□□□ 0.5
SKIV2L-211ENST00000485349 SNX9Q9Y5X1 595 aa18.18■□□□□ 0.5
SKIV2L-211ENST00000485349 MYO16Q9Y6X6 1858 aa18.18■□□□□ 0.5
SKIV2L-211ENST00000485349 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa18.17■□□□□ 0.5
SKIV2L-211ENST00000485349 SPAG17Q6Q759 2223 aa18.17■□□□□ 0.5
SKIV2L-211ENST00000485349 TMEM191BP0C7N4 346 aa18.17■□□□□ 0.5
SKIV2L-211ENST00000485349 CSH1P0DML2 217 aa18.17■□□□□ 0.5
SKIV2L-211ENST00000485349 CSH2P0DML3 217 aa18.17■□□□□ 0.5
SKIV2L-211ENST00000485349 NASPP49321 788 aaPredicted RBP18.17■□□□□ 0.5
SKIV2L-211ENST00000485349 RBP5P82980 135 aa18.17■□□□□ 0.5
SKIV2L-211ENST00000485349 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP18.17■□□□□ 0.5
SKIV2L-211ENST00000485349 PKN3Q6P5Z2 889 aa18.17■□□□□ 0.5
SKIV2L-211ENST00000485349 LONP2Q86WA8 852 aa18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.2 ms