RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483092.1

CCSAP-204, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CCSAP, Length 3,492 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-204ENST00000483092 C10orf82Q8WW14 230 aa17.04■□□□□ 0.32
CCSAP-204ENST00000483092 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP17.04■□□□□ 0.32
CCSAP-204ENST00000483092 TAS2R1Q9NYW7 299 aa17.04■□□□□ 0.32
CCSAP-204ENST00000483092 NEU2Q9Y3R4 380 aa17.04■□□□□ 0.32
CCSAP-204ENST00000483092 ZNF536O15090 1300 aa17.04■□□□□ 0.32
CCSAP-204ENST00000483092 SUPT3HO75486 399 aa17.04■□□□□ 0.32
CCSAP-204ENST00000483092 ZBTB7AO95365 584 aa17.04■□□□□ 0.32
CCSAP-204ENST00000483092 ICAM1P05362 532 aa17.04■□□□□ 0.32
CCSAP-204ENST00000483092 HARSP12081 509 aaKnown RBP17.04■□□□□ 0.32
CCSAP-204ENST00000483092 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP17.04■□□□□ 0.32
CCSAP-204ENST00000483092 PLEKHO2Q8TD55 490 aa17.04■□□□□ 0.32
CCSAP-204ENST00000483092 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP17.04■□□□□ 0.32
CCSAP-204ENST00000483092 ATG4CQ96DT6 458 aa17.04■□□□□ 0.32
CCSAP-204ENST00000483092 TSSK1BQ9BXA7 367 aa17.04■□□□□ 0.32
CCSAP-204ENST00000483092 CYP4F11Q9HBI6 524 aa17.04■□□□□ 0.32
CCSAP-204ENST00000483092 GRID1Q9ULK0 1009 aa17.04■□□□□ 0.32
CCSAP-204ENST00000483092 MYH11P35749 1972 aa17.04■□□□□ 0.32
CCSAP-204ENST00000483092 NCANO14594 1321 aa17.04■□□□□ 0.32
CCSAP-204ENST00000483092 NPM3O75607 178 aaKnown RBP17.03■□□□□ 0.32
CCSAP-204ENST00000483092 MXI1P50539 228 aa17.03■□□□□ 0.32
CCSAP-204ENST00000483092 IRX4P78413 519 aa17.03■□□□□ 0.32
CCSAP-204ENST00000483092 AP1B1Q10567 949 aa17.03■□□□□ 0.32
CCSAP-204ENST00000483092 GPS1Q13098 491 aa17.03■□□□□ 0.32
CCSAP-204ENST00000483092 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP17.03■□□□□ 0.32
CCSAP-204ENST00000483092 MAP7D3Q8IWC1 876 aa17.03■□□□□ 0.32
CCSAP-204ENST00000483092 PYDC1Q8WXC3 89 aa17.03■□□□□ 0.32
CCSAP-204ENST00000483092 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa17.03■□□□□ 0.32
CCSAP-204ENST00000483092 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP17.03■□□□□ 0.32
CCSAP-204ENST00000483092 ATP2A1O14983 1001 aa17.03■□□□□ 0.32
CCSAP-204ENST00000483092 TRPA1O75762 1119 aa17.03■□□□□ 0.32
CCSAP-204ENST00000483092 MYL2P10916 166 aa17.03■□□□□ 0.32
CCSAP-204ENST00000483092 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP17.03■□□□□ 0.32
CCSAP-204ENST00000483092 OCRLQ01968 901 aa17.03■□□□□ 0.32
CCSAP-204ENST00000483092 NR1H3Q13133 447 aa17.03■□□□□ 0.32
CCSAP-204ENST00000483092 MED21Q13503 144 aa17.03■□□□□ 0.32
CCSAP-204ENST00000483092 MYBPC3Q14896 1274 aa17.03■□□□□ 0.32
CCSAP-204ENST00000483092 WDR72Q3MJ13 1102 aa17.03■□□□□ 0.32
CCSAP-204ENST00000483092 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa17.03■□□□□ 0.32
CCSAP-204ENST00000483092 SLC45A4Q5BKX6 768 aa17.03■□□□□ 0.32
CCSAP-204ENST00000483092 TRABD2AQ86V40 505 aa17.03■□□□□ 0.32
CCSAP-204ENST00000483092 SLC47A2Q86VL8 602 aa17.03■□□□□ 0.32
CCSAP-204ENST00000483092 CCDC89Q8N998 374 aa17.03■□□□□ 0.32
CCSAP-204ENST00000483092 XXYLT1Q8NBI6 393 aa17.03■□□□□ 0.32
CCSAP-204ENST00000483092 ATL2Q8NHH9 583 aa17.03■□□□□ 0.32
CCSAP-204ENST00000483092 CCDC110Q8TBZ0 833 aa17.03■□□□□ 0.32
CCSAP-204ENST00000483092 MTBPQ96DY7 904 aa17.03■□□□□ 0.32
CCSAP-204ENST00000483092 GPR88Q9GZN0 384 aa17.03■□□□□ 0.32
CCSAP-204ENST00000483092 ZWILCHQ9H900 591 aa17.03■□□□□ 0.32
CCSAP-204ENST00000483092 MYOZ2Q9NPC6 264 aa17.03■□□□□ 0.32
CCSAP-204ENST00000483092 GGPS1O95749 300 aa17.02■□□□□ 0.32
CCSAP-204ENST00000483092 ETS1P14921 441 aa17.02■□□□□ 0.32
CCSAP-204ENST00000483092 ALDH18A1P54886 795 aaKnown RBP17.02■□□□□ 0.32
CCSAP-204ENST00000483092 PDK4Q16654 411 aa17.02■□□□□ 0.32
CCSAP-204ENST00000483092 SATL1Q86VE3 508 aa17.02■□□□□ 0.32
CCSAP-204ENST00000483092 LCA5Q86VQ0 697 aa17.02■□□□□ 0.32
CCSAP-204ENST00000483092 ACCSQ96QU6 501 aa17.02■□□□□ 0.32
CCSAP-204ENST00000483092 FAM192AQ9GZU8 254 aa17.02■□□□□ 0.32
CCSAP-204ENST00000483092 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP17.02■□□□□ 0.32
CCSAP-204ENST00000483092 ZNRF3Q9ULT6 936 aa17.02■□□□□ 0.32
CCSAP-204ENST00000483092 ADRB2P07550 413 aa17.02■□□□□ 0.32
CCSAP-204ENST00000483092 ANXA13P27216 316 aa17.02■□□□□ 0.32
CCSAP-204ENST00000483092 AP2B1P63010 937 aa17.02■□□□□ 0.32
CCSAP-204ENST00000483092 NME8Q8N427 588 aa17.02■□□□□ 0.32
CCSAP-204ENST00000483092 CLEC4DQ8WXI8 215 aa17.02■□□□□ 0.32
CCSAP-204ENST00000483092 CEP170P1Q96L14 293 aa17.02■□□□□ 0.32
CCSAP-204ENST00000483092 TIPINQ9BVW5 301 aa17.02■□□□□ 0.32
CCSAP-204ENST00000483092 MOGSQ13724 837 aa17.02■□□□□ 0.31
CCSAP-204ENST00000483092 MMEL1Q495T6 779 aa17.02■□□□□ 0.31
CCSAP-204ENST00000483092 TCP10LQ8TDR4 215 aa17.02■□□□□ 0.31
CCSAP-204ENST00000483092 POMGNT1Q8WZA1 660 aa17.02■□□□□ 0.31
CCSAP-204ENST00000483092 CLMNQ96JQ2 1002 aa17.02■□□□□ 0.31
CCSAP-204ENST00000483092 MANSC1Q9H8J5 431 aa17.02■□□□□ 0.31
CCSAP-204ENST00000483092 KRT82Q9NSB4 513 aa17.02■□□□□ 0.31
CCSAP-204ENST00000483092 DENND3A2RUS2 1198 aa17.01■□□□□ 0.31
CCSAP-204ENST00000483092 MEI4A8MW99 385 aa17.01■□□□□ 0.31
CCSAP-204ENST00000483092 SH2D4BQ5SQS7 431 aa17.01■□□□□ 0.31
CCSAP-204ENST00000483092 RTKN2Q8IZC4 609 aa17.01■□□□□ 0.31
CCSAP-204ENST00000483092 EFCAB3Q8N7B9 438 aa17.01■□□□□ 0.31
CCSAP-204ENST00000483092 PCDHB18PQ96TA0 734 aa17.01■□□□□ 0.31
CCSAP-204ENST00000483092 EBF3Q9H4W6 596 aa17.01■□□□□ 0.31
CCSAP-204ENST00000483092 GABBR1Q9UBS5 961 aa17.01■□□□□ 0.31
CCSAP-204ENST00000483092 SEL1LQ9UBV2 794 aa17.01■□□□□ 0.31
CCSAP-204ENST00000483092 DHX15O43143 795 aaKnown RBP17.01■□□□□ 0.31
CCSAP-204ENST00000483092 CCNE2O96020 404 aa17.01■□□□□ 0.31
CCSAP-204ENST00000483092 KRT10P13645 584 aa17.01■□□□□ 0.31
CCSAP-204ENST00000483092 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP17.01■□□□□ 0.31
CCSAP-204ENST00000483092 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP17.01■□□□□ 0.31
CCSAP-204ENST00000483092 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP17.01■□□□□ 0.31
CCSAP-204ENST00000483092 SMC1BQ8NDV3 1235 aa17.01■□□□□ 0.31
CCSAP-204ENST00000483092 GMLQ99445 158 aa17.01■□□□□ 0.31
CCSAP-204ENST00000483092 TMEM117Q9H0C3 514 aa17.01■□□□□ 0.31
CCSAP-204ENST00000483092 FCHO1O14526 889 aa17.01■□□□□ 0.31
CCSAP-204ENST00000483092 DNAJC6O75061 913 aa17.01■□□□□ 0.31
CCSAP-204ENST00000483092 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP17.01■□□□□ 0.31
CCSAP-204ENST00000483092 ANPEPP15144 967 aa17.01■□□□□ 0.31
CCSAP-204ENST00000483092 DYNLT1P63172 113 aa17.01■□□□□ 0.31
CCSAP-204ENST00000483092 ASPHQ12797 758 aa17.01■□□□□ 0.31
CCSAP-204ENST00000483092 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP17.01■□□□□ 0.31
CCSAP-204ENST00000483092 TNFAIP8L3Q5GJ75 292 aa17.01■□□□□ 0.31
CCSAP-204ENST00000483092 LPCAT4Q643R3 524 aa17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.7 ms