RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000474160.1

SYF2-203, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

TSL 2

Gene SYF2, Length 438 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-203ENST00000474160 MLKLQ8NB16 471 aa20.24■□□□□ 0.83
SYF2-203ENST00000474160 FGF13Q92913 245 aa20.24■□□□□ 0.83
SYF2-203ENST00000474160 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
SYF2-203ENST00000474160 CORO1BQ9BR76 489 aa20.24■□□□□ 0.83
SYF2-203ENST00000474160 DNAI2Q9GZS0 605 aa20.24■□□□□ 0.83
SYF2-203ENST00000474160 NUP62CLQ9H1M0 184 aa20.24■□□□□ 0.83
SYF2-203ENST00000474160 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa20.24■□□□□ 0.83
SYF2-203ENST00000474160 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
SYF2-203ENST00000474160 ZMYM5Q9UJ78 669 aa20.24■□□□□ 0.83
SYF2-203ENST00000474160 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa20.24■□□□□ 0.83
SYF2-203ENST00000474160 TRIM49BA6NDI0 452 aa20.23■□□□□ 0.83
SYF2-203ENST00000474160 ANHXE9PGG2 379 aa20.23■□□□□ 0.83
SYF2-203ENST00000474160 BIN1O00499 593 aa20.23■□□□□ 0.83
SYF2-203ENST00000474160 PMM2O15305 246 aa20.23■□□□□ 0.83
SYF2-203ENST00000474160 TRIM49P0CI25 452 aa20.23■□□□□ 0.83
SYF2-203ENST00000474160 TRIM49CP0CI26 452 aa20.23■□□□□ 0.83
SYF2-203ENST00000474160 GCLMP48507 274 aa20.23■□□□□ 0.83
SYF2-203ENST00000474160 NTHL1P78549 312 aa20.23■□□□□ 0.83
SYF2-203ENST00000474160 SIGLEC14Q08ET2 396 aa20.23■□□□□ 0.83
SYF2-203ENST00000474160 TDGQ13569 410 aa20.23■□□□□ 0.83
SYF2-203ENST00000474160 KLHL10Q6JEL2 608 aa20.23■□□□□ 0.83
SYF2-203ENST00000474160 UNC93AQ86WB7 457 aa20.23■□□□□ 0.83
SYF2-203ENST00000474160 TTC39CQ8N584 583 aa20.23■□□□□ 0.83
SYF2-203ENST00000474160 FBXL13Q8NEE6 735 aa20.23■□□□□ 0.83
SYF2-203ENST00000474160 OR6B3Q8NGW1 331 aa20.23■□□□□ 0.83
SYF2-203ENST00000474160 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa20.23■□□□□ 0.83
SYF2-203ENST00000474160 TNIP3Q96KP6 325 aa20.23■□□□□ 0.83
SYF2-203ENST00000474160 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
SYF2-203ENST00000474160 DNAJC25Q9H1X3 360 aa20.23■□□□□ 0.83
SYF2-203ENST00000474160 KCNK12Q9HB15 430 aa20.23■□□□□ 0.83
SYF2-203ENST00000474160 CYP3A43Q9HB55 503 aa20.23■□□□□ 0.83
SYF2-203ENST00000474160 GTF3C4Q9UKN8 822 aa20.23■□□□□ 0.83
SYF2-203ENST00000474160 CLSTN1O94985 981 aa20.22■□□□□ 0.83
SYF2-203ENST00000474160 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
SYF2-203ENST00000474160 LMO2P25791 158 aa20.22■□□□□ 0.83
SYF2-203ENST00000474160 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
SYF2-203ENST00000474160 TMEM31Q5JXX7 168 aa20.22■□□□□ 0.83
SYF2-203ENST00000474160 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
SYF2-203ENST00000474160 NPAS3Q8IXF0 933 aa20.22■□□□□ 0.83
SYF2-203ENST00000474160 ITFG1Q8TB96 612 aa20.22■□□□□ 0.83
SYF2-203ENST00000474160 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
SYF2-203ENST00000474160 TMLHEQ9NVH6 421 aa20.22■□□□□ 0.83
SYF2-203ENST00000474160 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
SYF2-203ENST00000474160 DACH1Q9UI36 760 aa20.22■□□□□ 0.83
SYF2-203ENST00000474160 RWDD2AQ9UIY3 292 aa20.22■□□□□ 0.83
SYF2-203ENST00000474160 CTNND2Q9UQB3 1225 aa20.22■□□□□ 0.83
SYF2-203ENST00000474160 COQ4Q9Y3A0 265 aa20.22■□□□□ 0.83
SYF2-203ENST00000474160 NOTCH4Q99466 2003 aa20.22■□□□□ 0.83
SYF2-203ENST00000474160 MYBPHLA2RUH7 354 aa20.21■□□□□ 0.83
SYF2-203ENST00000474160 SOBPA7XYQ1 873 aa20.21■□□□□ 0.83
SYF2-203ENST00000474160 A8MXQ7 604 aa20.21■□□□□ 0.83
SYF2-203ENST00000474160 CSH1P0DML2 217 aa20.21■□□□□ 0.83
SYF2-203ENST00000474160 CSH2P0DML3 217 aa20.21■□□□□ 0.83
SYF2-203ENST00000474160 MARSP56192 900 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
SYF2-203ENST00000474160 NOP14P78316 857 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
SYF2-203ENST00000474160 HTR4Q13639 388 aa20.21■□□□□ 0.83
SYF2-203ENST00000474160 TAF12Q16514 161 aa20.21■□□□□ 0.83
SYF2-203ENST00000474160 TCERG1LQ5VWI1 586 aa20.21■□□□□ 0.83
SYF2-203ENST00000474160 TMC8Q8IU68 726 aa20.21■□□□□ 0.83
SYF2-203ENST00000474160 FAM200AQ8TCP9 573 aa20.21■□□□□ 0.83
SYF2-203ENST00000474160 TAS1R2Q8TE23 839 aa20.21■□□□□ 0.83
SYF2-203ENST00000474160 EEF2KMTQ96G04 330 aa20.21■□□□□ 0.83
SYF2-203ENST00000474160 LRRC3Q9BY71 257 aa20.21■□□□□ 0.83
SYF2-203ENST00000474160 BCO2Q9BYV7 579 aa20.21■□□□□ 0.83
SYF2-203ENST00000474160 NIF3L1Q9GZT8 377 aa20.21■□□□□ 0.83
SYF2-203ENST00000474160 RAB20Q9NX57 234 aa20.21■□□□□ 0.83
SYF2-203ENST00000474160 EHD2Q9NZN4 543 aa20.21■□□□□ 0.83
SYF2-203ENST00000474160 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
SYF2-203ENST00000474160 DUSP12Q9UNI6 340 aa20.21■□□□□ 0.83
SYF2-203ENST00000474160 DOCK6Q96HP0 2047 aa20.2■□□□□ 0.83
SYF2-203ENST00000474160 PRR33A8MZF0 331 aa20.2■□□□□ 0.82
SYF2-203ENST00000474160 P4HA2O15460 535 aa20.2■□□□□ 0.82
SYF2-203ENST00000474160 MBD3O95983 291 aa20.2■□□□□ 0.82
SYF2-203ENST00000474160 ATF6P18850 670 aa20.2■□□□□ 0.82
SYF2-203ENST00000474160 CDC25CP30307 473 aa20.2■□□□□ 0.82
SYF2-203ENST00000474160 CETN1Q12798 172 aa20.2■□□□□ 0.82
SYF2-203ENST00000474160 SLC5A9Q2M3M2 681 aa20.2■□□□□ 0.82
SYF2-203ENST00000474160 CCDC40Q4G0X9 1142 aa20.2■□□□□ 0.82
SYF2-203ENST00000474160 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
SYF2-203ENST00000474160 TRIM67Q6ZTA4 783 aa20.2■□□□□ 0.82
SYF2-203ENST00000474160 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa20.2■□□□□ 0.82
SYF2-203ENST00000474160 TTC9BQ8N6N2 239 aa20.2■□□□□ 0.82
SYF2-203ENST00000474160 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa20.2■□□□□ 0.82
SYF2-203ENST00000474160 SLC35C1Q96A29 364 aa20.2■□□□□ 0.82
SYF2-203ENST00000474160 PI4K2AQ9BTU6 479 aa20.2■□□□□ 0.82
SYF2-203ENST00000474160 SMYD3Q9H7B4 428 aa20.2■□□□□ 0.82
SYF2-203ENST00000474160 CRTAC1Q9NQ79 661 aa20.2■□□□□ 0.82
SYF2-203ENST00000474160 ATP8B3O60423 1300 aa20.2■□□□□ 0.82
SYF2-203ENST00000474160 MYO10Q9HD67 2058 aa20.19■□□□□ 0.82
SYF2-203ENST00000474160 TRIM66O15016 1216 aa20.19■□□□□ 0.82
SYF2-203ENST00000474160 PDGFRBP09619 1106 aa20.19■□□□□ 0.82
SYF2-203ENST00000474160 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
SYF2-203ENST00000474160 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
SYF2-203ENST00000474160 ASPAP45381 313 aa20.19■□□□□ 0.82
SYF2-203ENST00000474160 INCA1Q0VD86 236 aa20.19■□□□□ 0.82
SYF2-203ENST00000474160 WDR44Q5JSH3 913 aa20.19■□□□□ 0.82
SYF2-203ENST00000474160 MYLPFQ96A32 169 aa20.19■□□□□ 0.82
SYF2-203ENST00000474160 E2F7Q96AV8 911 aa20.19■□□□□ 0.82
SYF2-203ENST00000474160 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
SYF2-203ENST00000474160 SPATA17Q96L03 361 aa20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.8 ms