RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473970.2

RPARP-AS1-201, RPARP antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene RPARP-AS1, Length 1,297 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPARP-AS1-201ENST00000473970 FBXO4Q9UKT5 387 aa16.11■□□□□ 0.17
RPARP-AS1-201ENST00000473970 ZNF292O60281 2723 aa16.11■□□□□ 0.17
RPARP-AS1-201ENST00000473970 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa16.1■□□□□ 0.17
RPARP-AS1-201ENST00000473970 PRR23AA6NEV1 266 aa16.1■□□□□ 0.17
RPARP-AS1-201ENST00000473970 SHISA7A6NL88 538 aa16.1■□□□□ 0.17
RPARP-AS1-201ENST00000473970 HEPACAM2A8MVW5 462 aa16.1■□□□□ 0.17
RPARP-AS1-201ENST00000473970 ARNTLO00327 626 aa16.1■□□□□ 0.17
RPARP-AS1-201ENST00000473970 ZNF263O14978 683 aa16.1■□□□□ 0.17
RPARP-AS1-201ENST00000473970 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
RPARP-AS1-201ENST00000473970 STAU1O95793 577 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
RPARP-AS1-201ENST00000473970 KRT19P08727 400 aa16.1■□□□□ 0.17
RPARP-AS1-201ENST00000473970 CSH1P0DML2 217 aa16.1■□□□□ 0.17
RPARP-AS1-201ENST00000473970 CSH2P0DML3 217 aa16.1■□□□□ 0.17
RPARP-AS1-201ENST00000473970 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP16.1■□□□□ 0.178e-8■■■■□ 25.1
RPARP-AS1-201ENST00000473970 GDI1P31150 447 aa16.1■□□□□ 0.17
RPARP-AS1-201ENST00000473970 VIPR2P41587 438 aa16.1■□□□□ 0.17
RPARP-AS1-201ENST00000473970 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
RPARP-AS1-201ENST00000473970 UBXN2BQ14CS0 331 aa16.1■□□□□ 0.17
RPARP-AS1-201ENST00000473970 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
RPARP-AS1-201ENST00000473970 SOWAHAQ2M3V2 549 aa16.1■□□□□ 0.17
RPARP-AS1-201ENST00000473970 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa16.1■□□□□ 0.17
RPARP-AS1-201ENST00000473970 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP16.1■□□□□ 0.17
RPARP-AS1-201ENST00000473970 ADGRF2Q8IZF7 708 aa16.1■□□□□ 0.17
RPARP-AS1-201ENST00000473970 ZNF687Q8N1G0 1237 aa16.1■□□□□ 0.17
RPARP-AS1-201ENST00000473970 OR5B17Q8NGF7 314 aa16.1■□□□□ 0.17
RPARP-AS1-201ENST00000473970 HPDLQ96IR7 371 aa16.1■□□□□ 0.17
RPARP-AS1-201ENST00000473970 GCNAQ96QF7 691 aa16.1■□□□□ 0.17
RPARP-AS1-201ENST00000473970 ATXN3LQ9H3M9 355 aa16.1■□□□□ 0.17
RPARP-AS1-201ENST00000473970 HEBP1Q9NRV9 189 aa16.1■□□□□ 0.17
RPARP-AS1-201ENST00000473970 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
RPARP-AS1-201ENST00000473970 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP16.1■□□□□ 0.17
RPARP-AS1-201ENST00000473970 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa16.1■□□□□ 0.17
RPARP-AS1-201ENST00000473970 SNX9Q9Y5X1 595 aa16.1■□□□□ 0.17
RPARP-AS1-201ENST00000473970 PTPRJQ12913 1337 aa16.1■□□□□ 0.17
RPARP-AS1-201ENST00000473970 KLRC4O43908 158 aa16.09■□□□□ 0.17
RPARP-AS1-201ENST00000473970 SOAT2O75908 522 aa16.09■□□□□ 0.17
RPARP-AS1-201ENST00000473970 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
RPARP-AS1-201ENST00000473970 KRT85P78386 507 aa16.09■□□□□ 0.17
RPARP-AS1-201ENST00000473970 PLCB2Q00722 1185 aa16.09■□□□□ 0.17
RPARP-AS1-201ENST00000473970 CYP24A1Q07973 514 aa16.09■□□□□ 0.17
RPARP-AS1-201ENST00000473970 FZD5Q13467 585 aa16.09■□□□□ 0.17
RPARP-AS1-201ENST00000473970 CUL4BQ13620 913 aa16.09■□□□□ 0.17
RPARP-AS1-201ENST00000473970 GRM2Q14416 872 aa16.09■□□□□ 0.17
RPARP-AS1-201ENST00000473970 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
RPARP-AS1-201ENST00000473970 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
RPARP-AS1-201ENST00000473970 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa16.09■□□□□ 0.17
RPARP-AS1-201ENST00000473970 FAM171BQ6P995 826 aa16.09■□□□□ 0.17
RPARP-AS1-201ENST00000473970 ZC3H14Q6PJT7 736 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
RPARP-AS1-201ENST00000473970 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
RPARP-AS1-201ENST00000473970 FRMD5Q7Z6J6 570 aa16.09■□□□□ 0.17
RPARP-AS1-201ENST00000473970 SLC9A9Q8IVB4 645 aa16.09■□□□□ 0.17
RPARP-AS1-201ENST00000473970 FAM200AQ8TCP9 573 aa16.09■□□□□ 0.17
RPARP-AS1-201ENST00000473970 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
RPARP-AS1-201ENST00000473970 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
RPARP-AS1-201ENST00000473970 SPATA32Q96LK8 384 aa16.09■□□□□ 0.17
RPARP-AS1-201ENST00000473970 FNBP1Q96RU3 617 aa16.09■□□□□ 0.17
RPARP-AS1-201ENST00000473970 CGRRF1Q99675 332 aa16.09■□□□□ 0.17
RPARP-AS1-201ENST00000473970 LPIN3Q9BQK8 851 aa16.09■□□□□ 0.17
RPARP-AS1-201ENST00000473970 BLZF1Q9H2G9 400 aa16.09■□□□□ 0.17
RPARP-AS1-201ENST00000473970 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
RPARP-AS1-201ENST00000473970 TMLHEQ9NVH6 421 aa16.09■□□□□ 0.17
RPARP-AS1-201ENST00000473970 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
RPARP-AS1-201ENST00000473970 SERTAD1Q9UHV2 236 aa16.09■□□□□ 0.17
RPARP-AS1-201ENST00000473970 HPSEQ9Y251 543 aa16.09■□□□□ 0.17
RPARP-AS1-201ENST00000473970 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa16.09■□□□□ 0.17
RPARP-AS1-201ENST00000473970 COL4A3Q01955 1670 aa16.08■□□□□ 0.17
RPARP-AS1-201ENST00000473970 TACC1O75410 805 aa16.08■□□□□ 0.16
RPARP-AS1-201ENST00000473970 F11P03951 625 aa16.08■□□□□ 0.16
RPARP-AS1-201ENST00000473970 SP9P0CG40 484 aa16.08■□□□□ 0.16
RPARP-AS1-201ENST00000473970 WARSP23381 471 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
RPARP-AS1-201ENST00000473970 TARSP26639 723 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
RPARP-AS1-201ENST00000473970 MAGEA11P43364 429 aa16.08■□□□□ 0.16
RPARP-AS1-201ENST00000473970 AFMP43652 599 aa16.08■□□□□ 0.16
RPARP-AS1-201ENST00000473970 AP3M2P53677 418 aa16.08■□□□□ 0.16
RPARP-AS1-201ENST00000473970 TAF12Q16514 161 aa16.08■□□□□ 0.16
RPARP-AS1-201ENST00000473970 GPR158Q5T848 1215 aa16.08■□□□□ 0.16
RPARP-AS1-201ENST00000473970 ASCL5Q7RTU5 278 aa16.08■□□□□ 0.16
RPARP-AS1-201ENST00000473970 YAF2Q8IY57 180 aa16.08■□□□□ 0.16
RPARP-AS1-201ENST00000473970 MYRFLQ96LU7 910 aa16.08■□□□□ 0.16
RPARP-AS1-201ENST00000473970 SLC39A2Q9NP94 309 aa16.08■□□□□ 0.16
RPARP-AS1-201ENST00000473970 CDH9Q9ULB4 789 aa16.08■□□□□ 0.16
RPARP-AS1-201ENST00000473970 ZDHHC9Q9Y397 364 aa16.08■□□□□ 0.16
RPARP-AS1-201ENST00000473970 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
RPARP-AS1-201ENST00000473970 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa16.08■□□□□ 0.16
RPARP-AS1-201ENST00000473970 DPYSL4O14531 572 aa16.07■□□□□ 0.16
RPARP-AS1-201ENST00000473970 LAMTOR5O43504 91 aa16.07■□□□□ 0.16
RPARP-AS1-201ENST00000473970 NOL4O94818 638 aa16.07■□□□□ 0.16
RPARP-AS1-201ENST00000473970 PFKFB1P16118 471 aa16.07■□□□□ 0.16
RPARP-AS1-201ENST00000473970 TNNI1P19237 187 aa16.07■□□□□ 0.16
RPARP-AS1-201ENST00000473970 CASP1P29466 404 aa16.07■□□□□ 0.16
RPARP-AS1-201ENST00000473970 ATICP31939 592 aa16.07■□□□□ 0.16
RPARP-AS1-201ENST00000473970 NLRP12P59046 1061 aa16.07■□□□□ 0.16
RPARP-AS1-201ENST00000473970 CLDN10P78369 228 aa16.07■□□□□ 0.16
RPARP-AS1-201ENST00000473970 STXBP5Q5T5C0 1151 aa16.07■□□□□ 0.16
RPARP-AS1-201ENST00000473970 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
RPARP-AS1-201ENST00000473970 VSTM1Q6UX27 236 aa16.07■□□□□ 0.16
RPARP-AS1-201ENST00000473970 C4orf50Q6ZRC1 276 aa16.07■□□□□ 0.16
RPARP-AS1-201ENST00000473970 TMEM150AQ86TG1 271 aa16.07■□□□□ 0.16
RPARP-AS1-201ENST00000473970 OSTM1Q86WC4 334 aa16.07■□□□□ 0.16
RPARP-AS1-201ENST00000473970 NELFCDQ8IXH7 590 aa16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.2 ms