RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468807.1

TTC28-204, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 28, humanhuman

TSL 2

Gene TTC28, Length 594 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-204ENST00000468807 TOP6BLQ8N6T0 577 aa23.39■■□□□ 1.33
TTC28-204ENST00000468807 TTC8Q8TAM2 541 aa23.39■■□□□ 1.33
TTC28-204ENST00000468807 CLDN23Q96B33 292 aa23.39■■□□□ 1.33
TTC28-204ENST00000468807 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
TTC28-204ENST00000468807 SEMA4AQ9H3S1 761 aa23.39■■□□□ 1.33
TTC28-204ENST00000468807 TASP1Q9H6P5 420 aa23.39■■□□□ 1.33
TTC28-204ENST00000468807 IL21Q9HBE4 155 aa23.39■■□□□ 1.33
TTC28-204ENST00000468807 KIAA1586Q9HCI6 787 aa23.39■■□□□ 1.33
TTC28-204ENST00000468807 TRPV5Q9NQA5 729 aa23.39■■□□□ 1.33
TTC28-204ENST00000468807 GDAP2Q9NXN4 497 aa23.39■■□□□ 1.33
TTC28-204ENST00000468807 GTF3C4Q9UKN8 822 aa23.39■■□□□ 1.33
TTC28-204ENST00000468807 SHISA7A6NL88 538 aa23.38■■□□□ 1.33
TTC28-204ENST00000468807 SLC38A8A6NNN8 435 aa23.38■■□□□ 1.33
TTC28-204ENST00000468807 CHADO15335 359 aa23.38■■□□□ 1.33
TTC28-204ENST00000468807 PRAMEF12O95522 483 aa23.38■■□□□ 1.33
TTC28-204ENST00000468807 DLATP10515 647 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
TTC28-204ENST00000468807 CCNE1P24864 410 aa23.38■■□□□ 1.33
TTC28-204ENST00000468807 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
TTC28-204ENST00000468807 RESP18Q5W5W9 173 aa23.38■■□□□ 1.33
TTC28-204ENST00000468807 ATL3Q6DD88 541 aa23.38■■□□□ 1.33
TTC28-204ENST00000468807 OSTM1Q86WC4 334 aa23.38■■□□□ 1.33
TTC28-204ENST00000468807 CEP57L1Q8IYX8 460 aa23.38■■□□□ 1.33
TTC28-204ENST00000468807 SCFD1Q8WVM8 642 aa23.38■■□□□ 1.33
TTC28-204ENST00000468807 HPDLQ96IR7 371 aa23.38■■□□□ 1.33
TTC28-204ENST00000468807 ZFYVE19Q96K21 471 aa23.38■■□□□ 1.33
TTC28-204ENST00000468807 HINFPQ9BQA5 517 aa23.38■■□□□ 1.33
TTC28-204ENST00000468807 SLC39A2Q9NP94 309 aa23.38■■□□□ 1.33
TTC28-204ENST00000468807 FBXO4Q9UKT5 387 aa23.38■■□□□ 1.33
TTC28-204ENST00000468807 UBE4BO95155 1302 aa23.37■■□□□ 1.33
TTC28-204ENST00000468807 SPTBN4Q9H254 2564 aa23.37■■□□□ 1.33
TTC28-204ENST00000468807 TGFB1I1O43294 461 aa23.37■■□□□ 1.33
TTC28-204ENST00000468807 HCRTO43612 131 aa23.37■■□□□ 1.33
TTC28-204ENST00000468807 TNNI1P19237 187 aa23.37■■□□□ 1.33
TTC28-204ENST00000468807 CYP2F1P24903 491 aa23.37■■□□□ 1.33
TTC28-204ENST00000468807 RPS9P46781 194 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
TTC28-204ENST00000468807 LHX1P48742 406 aa23.37■■□□□ 1.33
TTC28-204ENST00000468807 FCHO2Q0JRZ9 810 aa23.37■■□□□ 1.33
TTC28-204ENST00000468807 CUL4BQ13620 913 aa23.37■■□□□ 1.33
TTC28-204ENST00000468807 DDR2Q16832 855 aa23.37■■□□□ 1.33
TTC28-204ENST00000468807 SOWAHAQ2M3V2 549 aa23.37■■□□□ 1.33
TTC28-204ENST00000468807 HS2ST1Q7LGA3 356 aa23.37■■□□□ 1.33
TTC28-204ENST00000468807 WDR49Q8IV35 697 aa23.37■■□□□ 1.33
TTC28-204ENST00000468807 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa23.37■■□□□ 1.33
TTC28-204ENST00000468807 CCDC127Q96BQ5 260 aa23.37■■□□□ 1.33
TTC28-204ENST00000468807 FNBP1Q96RU3 617 aa23.37■■□□□ 1.33
TTC28-204ENST00000468807 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
TTC28-204ENST00000468807 FANCMQ8IYD8 2048 aa23.37■■□□□ 1.33
TTC28-204ENST00000468807 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa23.37■■□□□ 1.33
TTC28-204ENST00000468807 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
TTC28-204ENST00000468807 ARNTLO00327 626 aa23.36■■□□□ 1.33
TTC28-204ENST00000468807 KINO60870 393 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
TTC28-204ENST00000468807 PCSK1P29120 753 aa23.36■■□□□ 1.33
TTC28-204ENST00000468807 SOX9P48436 509 aa23.36■■□□□ 1.33
TTC28-204ENST00000468807 MTAPQ13126 283 aa23.36■■□□□ 1.33
TTC28-204ENST00000468807 FZD5Q13467 585 aa23.36■■□□□ 1.33
TTC28-204ENST00000468807 CCDC142Q17RM4 750 aa23.36■■□□□ 1.33
TTC28-204ENST00000468807 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa23.36■■□□□ 1.33
TTC28-204ENST00000468807 TSSK4Q6SA08 328 aa23.36■■□□□ 1.33
TTC28-204ENST00000468807 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
TTC28-204ENST00000468807 BPIFB1Q8TDL5 484 aa23.36■■□□□ 1.33
TTC28-204ENST00000468807 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
TTC28-204ENST00000468807 LRRC3BQ96PB8 259 aa23.36■■□□□ 1.33
TTC28-204ENST00000468807 MMS19Q96T76 1030 aa23.36■■□□□ 1.33
TTC28-204ENST00000468807 SLC46A2Q9BY10 475 aa23.36■■□□□ 1.33
TTC28-204ENST00000468807 LMAN1LQ9HAT1 526 aa23.36■■□□□ 1.33
TTC28-204ENST00000468807 ZNF292O60281 2723 aa23.36■■□□□ 1.33
TTC28-204ENST00000468807 CSH1P0DML2 217 aa23.35■■□□□ 1.33
TTC28-204ENST00000468807 CSH2P0DML3 217 aa23.35■■□□□ 1.33
TTC28-204ENST00000468807 AVPR1AP37288 418 aa23.35■■□□□ 1.33
TTC28-204ENST00000468807 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
TTC28-204ENST00000468807 ZNF528Q3MIS6 628 aa23.35■■□□□ 1.33
TTC28-204ENST00000468807 SCN4BQ8IWT1 228 aa23.35■■□□□ 1.33
TTC28-204ENST00000468807 MAB21L3Q8N8X9 362 aa23.35■■□□□ 1.33
TTC28-204ENST00000468807 XXYLT1Q8NBI6 393 aa23.35■■□□□ 1.33
TTC28-204ENST00000468807 OBP2AQ9NY56 170 aa23.35■■□□□ 1.33
TTC28-204ENST00000468807 SERTAD1Q9UHV2 236 aa23.35■■□□□ 1.33
TTC28-204ENST00000468807 DENND4CQ5VZ89 1909 aa23.34■■□□□ 1.33
TTC28-204ENST00000468807 MYBPHLA2RUH7 354 aa23.34■■□□□ 1.33
TTC28-204ENST00000468807 CLSTN1O94985 981 aa23.34■■□□□ 1.33
TTC28-204ENST00000468807 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP23.34■■□□□ 1.33
TTC28-204ENST00000468807 NLRP12P59046 1061 aa23.34■■□□□ 1.33
TTC28-204ENST00000468807 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP23.34■■□□□ 1.33
TTC28-204ENST00000468807 EHHADHQ08426 723 aa23.34■■□□□ 1.33
TTC28-204ENST00000468807 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa23.34■■□□□ 1.33
TTC28-204ENST00000468807 SPATA18Q8TC71 538 aa23.34■■□□□ 1.33
TTC28-204ENST00000468807 ATRIPQ8WXE1 791 aa23.34■■□□□ 1.33
TTC28-204ENST00000468807 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP23.34■■□□□ 1.33
TTC28-204ENST00000468807 ABCB6Q9NP58 842 aa23.34■■□□□ 1.33
TTC28-204ENST00000468807 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP23.34■■□□□ 1.33
TTC28-204ENST00000468807 GTSE1Q9NYZ3 720 aa23.34■■□□□ 1.33
TTC28-204ENST00000468807 RCOR1Q9UKL0 485 aa23.34■■□□□ 1.33
TTC28-204ENST00000468807 OBSL1O75147 1896 aa23.33■■□□□ 1.33
TTC28-204ENST00000468807 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa23.33■■□□□ 1.33
TTC28-204ENST00000468807 GABRDO14764 452 aa23.33■■□□□ 1.33
TTC28-204ENST00000468807 CYP24A1Q07973 514 aa23.33■■□□□ 1.33
TTC28-204ENST00000468807 TXNDC8Q6A555 127 aa23.33■■□□□ 1.33
TTC28-204ENST00000468807 DPH6Q7L8W6 267 aa23.33■■□□□ 1.33
TTC28-204ENST00000468807 CMTM8Q8IZV2 173 aa23.33■■□□□ 1.33
TTC28-204ENST00000468807 ZNF687Q8N1G0 1237 aa23.33■■□□□ 1.33
TTC28-204ENST00000468807 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.7 ms