RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466245.1

TTLL3-223, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

TSL 3

Gene TTLL3, Length 616 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-223	ENST00000466245	LILRA4	P59901	499 aa		10.84	□□□□□ -0.67
TTLL3-223	ENST00000466245	CLDN10	P78369	228 aa		10.84	□□□□□ -0.67
TTLL3-223	ENST00000466245	SHC2	P98077	582 aa		10.84	□□□□□ -0.67
TTLL3-223	ENST00000466245	GRM2	Q14416	872 aa		10.84	□□□□□ -0.67
TTLL3-223	ENST00000466245	CYP4A22	Q5TCH4	519 aa		10.84	□□□□□ -0.67
TTLL3-223	ENST00000466245	TPGS2	Q68CL5	300 aa		10.84	□□□□□ -0.67
TTLL3-223	ENST00000466245	IQCE	Q6IPM2	695 aa		10.84	□□□□□ -0.67
TTLL3-223	ENST00000466245	FOXR2	Q6PJQ5	311 aa		10.84	□□□□□ -0.67
TTLL3-223	ENST00000466245	PDZD4	Q76G19	769 aa	Predicted RBP	10.84	□□□□□ -0.67
TTLL3-223	ENST00000466245	WDR49	Q8IV35	697 aa		10.84	□□□□□ -0.67
TTLL3-223	ENST00000466245	YAF2	Q8IY57	180 aa		10.84	□□□□□ -0.67
TTLL3-223	ENST00000466245	EFCAB13	Q8IY85	973 aa		10.84	□□□□□ -0.67
TTLL3-223	ENST00000466245	GRAMD1C	Q8IYS0	662 aa		10.84	□□□□□ -0.67
TTLL3-223	ENST00000466245	SPEM1	Q8N4L4	309 aa		10.84	□□□□□ -0.67
TTLL3-223	ENST00000466245	LEMD2	Q8NC56	503 aa		10.84	□□□□□ -0.67
TTLL3-223	ENST00000466245	CXorf38	Q8TB03	319 aa		10.84	□□□□□ -0.67
TTLL3-223	ENST00000466245	E2F7	Q96AV8	911 aa		10.84	□□□□□ -0.67
TTLL3-223	ENST00000466245	FAM213A	Q9BRX8	229 aa		10.84	□□□□□ -0.67
TTLL3-223	ENST00000466245	SLC39A2	Q9NP94	309 aa		10.84	□□□□□ -0.67
TTLL3-223	ENST00000466245	TRPV5	Q9NQA5	729 aa		10.84	□□□□□ -0.67
TTLL3-223	ENST00000466245	DPP3	Q9NY33	737 aa		10.84	□□□□□ -0.67
TTLL3-223	ENST00000466245	HSFX1	Q9UBD0	423 aa		10.84	□□□□□ -0.67
TTLL3-223	ENST00000466245	ITGA11	Q9UKX5	1188 aa		10.84	□□□□□ -0.67
TTLL3-223	ENST00000466245	CDY1	Q9Y6F8	540 aa		10.84	□□□□□ -0.67
TTLL3-223	ENST00000466245	CEP295	Q9C0D2	2601 aa		10.83	□□□□□ -0.68
TTLL3-223	ENST00000466245	SDK1	Q7Z5N4	2213 aa		10.83	□□□□□ -0.68
TTLL3-223	ENST00000466245	MICAL2	O94851	1124 aa		10.83	□□□□□ -0.68
TTLL3-223	ENST00000466245	ABLIM3	O94929	683 aa		10.83	□□□□□ -0.68
TTLL3-223	ENST00000466245	TDGF1	P13385	188 aa		10.83	□□□□□ -0.68
TTLL3-223	ENST00000466245	CEBPB	P17676	345 aa		10.83	□□□□□ -0.68
TTLL3-223	ENST00000466245	TKT	P29401	623 aa	Known RBP	10.83	□□□□□ -0.68
TTLL3-223	ENST00000466245	MCM4	P33991	863 aa		10.83	□□□□□ -0.68
TTLL3-223	ENST00000466245	PPP1R2	P41236	205 aa		10.83	□□□□□ -0.68
TTLL3-223	ENST00000466245	BRCC3	P46736	316 aa		10.83	□□□□□ -0.68
TTLL3-223	ENST00000466245	TAF6	P49848	677 aa		10.83	□□□□□ -0.68
TTLL3-223	ENST00000466245	AP3M2	P53677	418 aa		10.83	□□□□□ -0.68
TTLL3-223	ENST00000466245	PSMD6	Q15008	389 aa		10.83	□□□□□ -0.68
TTLL3-223	ENST00000466245	SNRNP35	Q16560	246 aa	Known RBP	10.83	□□□□□ -0.68
TTLL3-223	ENST00000466245	SV2C	Q496J9	727 aa		10.83	□□□□□ -0.68
TTLL3-223	ENST00000466245	ZCWPW2	Q504Y3	356 aa		10.83	□□□□□ -0.68
TTLL3-223	ENST00000466245	TANGO2	Q6ICL3	276 aa		10.83	□□□□□ -0.68
TTLL3-223	ENST00000466245	ZNF280D	Q6N043	979 aa		10.83	□□□□□ -0.68
TTLL3-223	ENST00000466245	ZNF461	Q8TAF7	563 aa		10.83	□□□□□ -0.68
TTLL3-223	ENST00000466245	SMARCD2	Q92925	531 aa		10.83	□□□□□ -0.68
TTLL3-223	ENST00000466245	SAAL1	Q96ER3	474 aa		10.83	□□□□□ -0.68
TTLL3-223	ENST00000466245	ZNF560	Q96MR9	790 aa		10.83	□□□□□ -0.68
TTLL3-223	ENST00000466245	CORO1B	Q9BR76	489 aa		10.83	□□□□□ -0.68
TTLL3-223	ENST00000466245	SLITRK6	Q9H5Y7	841 aa		10.83	□□□□□ -0.68
TTLL3-223	ENST00000466245	INTS13	Q9NVM9	706 aa		10.83	□□□□□ -0.68
TTLL3-223	ENST00000466245	DSE	Q9UL01	958 aa		10.83	□□□□□ -0.68
TTLL3-223	ENST00000466245	CHURC1-FNTB	B4DL54	471 aa		10.82	□□□□□ -0.68
TTLL3-223	ENST00000466245	ADAM12	O43184	909 aa		10.82	□□□□□ -0.68
TTLL3-223	ENST00000466245	SMC2	O95347	1197 aa		10.82	□□□□□ -0.68
TTLL3-223	ENST00000466245	STAU1	O95793	577 aa	Known RBP	10.82	□□□□□ -0.68
TTLL3-223	ENST00000466245	FAM163B	P0C2L3	166 aa		10.82	□□□□□ -0.68
TTLL3-223	ENST00000466245	PRR29	P0C7W0	189 aa		10.82	□□□□□ -0.68
TTLL3-223	ENST00000466245	ODC1	P11926	461 aa		10.82	□□□□□ -0.68
TTLL3-223	ENST00000466245	PML	P29590	882 aa		10.82	□□□□□ -0.68
TTLL3-223	ENST00000466245	FNTB	P49356	437 aa		10.82	□□□□□ -0.68
TTLL3-223	ENST00000466245	KPNA1	P52294	538 aa	Predicted RBP	10.82	□□□□□ -0.68
TTLL3-223	ENST00000466245	MLLT6	P55198	1093 aa	Predicted RBP	10.82	□□□□□ -0.68
TTLL3-223	ENST00000466245	UBE2H	P62256	183 aa		10.82	□□□□□ -0.68
TTLL3-223	ENST00000466245	SATB1	Q01826	763 aa		10.82	□□□□□ -0.68
TTLL3-223	ENST00000466245	YWHAH	Q04917	246 aa	Predicted RBP	10.82	□□□□□ -0.68
TTLL3-223	ENST00000466245	SPAG1	Q07617	926 aa		10.82	□□□□□ -0.68
TTLL3-223	ENST00000466245	DUOXA2	Q1HG44	320 aa		10.82	□□□□□ -0.68
TTLL3-223	ENST00000466245	EDRF1	Q3B7T1	1238 aa		10.82	□□□□□ -0.68
TTLL3-223	ENST00000466245	DGKK	Q5KSL6	1271 aa		10.82	□□□□□ -0.68
TTLL3-223	ENST00000466245	DPH6	Q7L8W6	267 aa		10.82	□□□□□ -0.68
TTLL3-223	ENST00000466245	CBWD2	Q8IUF1	395 aa		10.82	□□□□□ -0.68
TTLL3-223	ENST00000466245	TCEAL8	Q8IYN2	117 aa		10.82	□□□□□ -0.68
TTLL3-223	ENST00000466245	C1orf127	Q8N9H9	656 aa		10.82	□□□□□ -0.68
TTLL3-223	ENST00000466245	LOXL4	Q96JB6	756 aa		10.82	□□□□□ -0.68
TTLL3-223	ENST00000466245	ASB16	Q96NS5	453 aa		10.82	□□□□□ -0.68
TTLL3-223	ENST00000466245	IPO9	Q96P70	1041 aa	Known RBP	10.82	□□□□□ -0.68
TTLL3-223	ENST00000466245	GPR88	Q9GZN0	384 aa		10.82	□□□□□ -0.68
TTLL3-223	ENST00000466245	C8orf33	Q9H7E9	229 aa	Predicted RBP	10.82	□□□□□ -0.68
TTLL3-223	ENST00000466245	ZNF334	Q9HCZ1	680 aa	Predicted RBP	10.82	□□□□□ -0.68
TTLL3-223	ENST00000466245	GDAP2	Q9NXN4	497 aa		10.82	□□□□□ -0.68
TTLL3-223	ENST00000466245	OR6C75	A6NL08	312 aa		10.81	□□□□□ -0.68
TTLL3-223	ENST00000466245	PPEF2	O14830	753 aa		10.81	□□□□□ -0.68
TTLL3-223	ENST00000466245	PAPSS2	O95340	614 aa	Predicted RBP	10.81	□□□□□ -0.68
TTLL3-223	ENST00000466245	PROS1	P07225	676 aa		10.81	□□□□□ -0.68
TTLL3-223	ENST00000466245	TMEM191B	P0C7N4	346 aa		10.81	□□□□□ -0.68
TTLL3-223	ENST00000466245	ATF2	P15336	505 aa		10.81	□□□□□ -0.68
TTLL3-223	ENST00000466245	WNT7B	P56706	349 aa		10.81	□□□□□ -0.68
TTLL3-223	ENST00000466245	RBP5	P82980	135 aa		10.81	□□□□□ -0.68
TTLL3-223	ENST00000466245	ROR1	Q01973	937 aa		10.81	□□□□□ -0.68
TTLL3-223	ENST00000466245	CYP24A1	Q07973	514 aa		10.81	□□□□□ -0.68
TTLL3-223	ENST00000466245	SMARCB1	Q12824	385 aa		10.81	□□□□□ -0.68
TTLL3-223	ENST00000466245	FZD5	Q13467	585 aa		10.81	□□□□□ -0.68
TTLL3-223	ENST00000466245	ACAP1	Q15027	740 aa		10.81	□□□□□ -0.68
TTLL3-223	ENST00000466245	SLC5A9	Q2M3M2	681 aa		10.81	□□□□□ -0.68
TTLL3-223	ENST00000466245	FAM78A	Q5JUQ0	283 aa		10.81	□□□□□ -0.68
TTLL3-223	ENST00000466245	N4BP2L1	Q5TBK1	243 aa	Predicted RBP	10.81	□□□□□ -0.68
TTLL3-223	ENST00000466245	ZNF658	Q5TYW1	1059 aa	Predicted RBP	10.81	□□□□□ -0.68
TTLL3-223	ENST00000466245	HEATR6	Q6AI08	1181 aa	Known RBP	10.81	□□□□□ -0.68
TTLL3-223	ENST00000466245	LIMS2	Q7Z4I7	341 aa		10.81	□□□□□ -0.68
TTLL3-223	ENST00000466245	USP37	Q86T82	979 aa		10.81	□□□□□ -0.68
TTLL3-223	ENST00000466245	NELFCD	Q8IXH7	590 aa		10.81	□□□□□ -0.68

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