RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460558.5

ECHDC1-211, Transcript of ethylmalonyl-CoA decarboxylase 1, humanhuman

TSL 5

Gene ECHDC1, Length 301 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC1-211ENST00000460558 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
ECHDC1-211ENST00000460558 YOD1Q5VVQ6 348 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
ECHDC1-211ENST00000460558 CDPF1Q6NVV7 123 aa4.6□□□□□ -1.67
ECHDC1-211ENST00000460558 LETMD1Q6P1Q0 360 aa4.6□□□□□ -1.67
ECHDC1-211ENST00000460558 WDR5BQ86VZ2 330 aa4.6□□□□□ -1.67
ECHDC1-211ENST00000460558 TRIM59Q8IWR1 403 aa4.6□□□□□ -1.67
ECHDC1-211ENST00000460558 SCUBE1Q8IWY4 988 aa4.6□□□□□ -1.67
ECHDC1-211ENST00000460558 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa4.6□□□□□ -1.67
ECHDC1-211ENST00000460558 BVESQ8NE79 360 aa4.6□□□□□ -1.67
ECHDC1-211ENST00000460558 MDM1Q8TC05 714 aa4.6□□□□□ -1.67
ECHDC1-211ENST00000460558 DCAF4Q8WV16 495 aa4.6□□□□□ -1.67
ECHDC1-211ENST00000460558 GAB3Q8WWW8 586 aa4.6□□□□□ -1.67
ECHDC1-211ENST00000460558 OSBP2Q969R2 916 aa4.6□□□□□ -1.67
ECHDC1-211ENST00000460558 CASD1Q96PB1 797 aa4.6□□□□□ -1.67
ECHDC1-211ENST00000460558 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
ECHDC1-211ENST00000460558 CEP41Q9BYV8 373 aa4.6□□□□□ -1.67
ECHDC1-211ENST00000460558 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
ECHDC1-211ENST00000460558 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP4.6□□□□□ -1.67
ECHDC1-211ENST00000460558 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
ECHDC1-211ENST00000460558 GBP3Q9H0R5 595 aa4.6□□□□□ -1.67
ECHDC1-211ENST00000460558 ADAMTS10Q9H324 1103 aa4.6□□□□□ -1.67
ECHDC1-211ENST00000460558 LMAN1LQ9HAT1 526 aa4.6□□□□□ -1.67
ECHDC1-211ENST00000460558 GP6Q9HCN6 339 aa4.6□□□□□ -1.67
ECHDC1-211ENST00000460558 JADE2Q9NQC1 790 aa4.6□□□□□ -1.67
ECHDC1-211ENST00000460558 HEBP1Q9NRV9 189 aa4.6□□□□□ -1.67
ECHDC1-211ENST00000460558 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa4.6□□□□□ -1.67
ECHDC1-211ENST00000460558 COL20A1Q9P218 1284 aa4.6□□□□□ -1.67
ECHDC1-211ENST00000460558 STK39Q9UEW8 545 aa4.6□□□□□ -1.67
ECHDC1-211ENST00000460558 CDH7Q9ULB5 785 aa4.6□□□□□ -1.67
ECHDC1-211ENST00000460558 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa4.6□□□□□ -1.67
ECHDC1-211ENST00000460558 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
ECHDC1-211ENST00000460558 A0A087WV48 116 aa4.59□□□□□ -1.67
ECHDC1-211ENST00000460558 TRBV23-1A0A0A0MS06 115 aa4.59□□□□□ -1.67
ECHDC1-211ENST00000460558 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa4.59□□□□□ -1.67
ECHDC1-211ENST00000460558 SPAARA0A1B0GVQ0 90 aa4.59□□□□□ -1.67
ECHDC1-211ENST00000460558 K7ESF4 209 aa4.59□□□□□ -1.67
ECHDC1-211ENST00000460558 GOLIM4O00461 696 aa4.59□□□□□ -1.67
ECHDC1-211ENST00000460558 TBX1O43435 398 aa4.59□□□□□ -1.67
ECHDC1-211ENST00000460558 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
ECHDC1-211ENST00000460558 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP4.59□□□□□ -1.67
ECHDC1-211ENST00000460558 RPS6KA5O75582 802 aa4.59□□□□□ -1.67
ECHDC1-211ENST00000460558 RFPL2O75678 378 aa4.59□□□□□ -1.67
ECHDC1-211ENST00000460558 ABCB11O95342 1321 aa4.59□□□□□ -1.67
ECHDC1-211ENST00000460558 CAVIN2O95810 425 aa4.59□□□□□ -1.67
ECHDC1-211ENST00000460558 GLUD1P00367 558 aa4.59□□□□□ -1.67
ECHDC1-211ENST00000460558 CNPP09543 421 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
ECHDC1-211ENST00000460558 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
ECHDC1-211ENST00000460558 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
ECHDC1-211ENST00000460558 NOS3P29474 1203 aa4.59□□□□□ -1.67
ECHDC1-211ENST00000460558 L1CAMP32004 1257 aa4.59□□□□□ -1.67
ECHDC1-211ENST00000460558 ADD2P35612 726 aa4.59□□□□□ -1.67
ECHDC1-211ENST00000460558 CCR10P46092 362 aa4.59□□□□□ -1.67
ECHDC1-211ENST00000460558 BCAR1P56945 870 aa4.59□□□□□ -1.67
ECHDC1-211ENST00000460558 FAM189BP81408 668 aa4.59□□□□□ -1.67
ECHDC1-211ENST00000460558 TFAP4Q01664 338 aa4.59□□□□□ -1.67
ECHDC1-211ENST00000460558 SP2Q02086 613 aa4.59□□□□□ -1.67
ECHDC1-211ENST00000460558 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
ECHDC1-211ENST00000460558 CREB5Q02930 508 aa4.59□□□□□ -1.67
ECHDC1-211ENST00000460558 TMEM62Q0P6H9 643 aa4.59□□□□□ -1.67
ECHDC1-211ENST00000460558 NEDD9Q14511 834 aa4.59□□□□□ -1.67
ECHDC1-211ENST00000460558 ITPR2Q14571 2701 aa4.59□□□□□ -1.67
ECHDC1-211ENST00000460558 METTL7BQ6UX53 244 aa4.59□□□□□ -1.67
ECHDC1-211ENST00000460558 KBTBD6Q86V97 674 aa4.59□□□□□ -1.67
ECHDC1-211ENST00000460558 MGAQ8IWI9 3026 aa4.59□□□□□ -1.67
ECHDC1-211ENST00000460558 GSTCDQ8NEC7 633 aa4.59□□□□□ -1.67
ECHDC1-211ENST00000460558 RIN3Q8TB24 985 aa4.59□□□□□ -1.67
ECHDC1-211ENST00000460558 SSH1Q8WYL5 1049 aa4.59□□□□□ -1.67
ECHDC1-211ENST00000460558 DNASE1L2Q92874 299 aa4.59□□□□□ -1.67
ECHDC1-211ENST00000460558 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
ECHDC1-211ENST00000460558 IGSF21Q96ID5 467 aa4.59□□□□□ -1.67
ECHDC1-211ENST00000460558 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
ECHDC1-211ENST00000460558 COX4I2Q96KJ9 171 aa4.59□□□□□ -1.67
ECHDC1-211ENST00000460558 PCNX1Q96RV3 2341 aa4.59□□□□□ -1.67
ECHDC1-211ENST00000460558 KXD1Q9BQD3 176 aa4.59□□□□□ -1.67
ECHDC1-211ENST00000460558 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
ECHDC1-211ENST00000460558 PXMP2Q9NR77 195 aa4.59□□□□□ -1.67
ECHDC1-211ENST00000460558 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
ECHDC1-211ENST00000460558 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
ECHDC1-211ENST00000460558 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa4.59□□□□□ -1.67
ECHDC1-211ENST00000460558 DKK4Q9UBT3 224 aa4.59□□□□□ -1.67
ECHDC1-211ENST00000460558 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
ECHDC1-211ENST00000460558 FHOD1Q9Y613 1164 aa4.59□□□□□ -1.67
ECHDC1-211ENST00000460558 CABIN1Q9Y6J0 2220 aa4.58□□□□□ -1.68
ECHDC1-211ENST00000460558 CENPEQ02224 2701 aa4.58□□□□□ -1.68
ECHDC1-211ENST00000460558 SALL3Q9BXA9 1300 aa4.58□□□□□ -1.68
ECHDC1-211ENST00000460558 RRN3P2A6NIE6 340 aa4.58□□□□□ -1.68
ECHDC1-211ENST00000460558 GSG1L2A8MUP6 293 aa4.58□□□□□ -1.68
ECHDC1-211ENST00000460558 C9orf172C9J069 976 aa4.58□□□□□ -1.68
ECHDC1-211ENST00000460558 PYCARD-AS1I3L0S3 204 aa4.58□□□□□ -1.68
ECHDC1-211ENST00000460558 CDX4O14627 284 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
ECHDC1-211ENST00000460558 SURF6O75683 361 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
ECHDC1-211ENST00000460558 PPM1BO75688 479 aa4.58□□□□□ -1.68
ECHDC1-211ENST00000460558 AKAP3O75969 853 aa4.58□□□□□ -1.68
ECHDC1-211ENST00000460558 ALX3O95076 343 aa4.58□□□□□ -1.68
ECHDC1-211ENST00000460558 PAPLNO95428 1278 aa4.58□□□□□ -1.68
ECHDC1-211ENST00000460558 GNAI2P04899 355 aa4.58□□□□□ -1.68
ECHDC1-211ENST00000460558 SCG5P05408 212 aa4.58□□□□□ -1.68
ECHDC1-211ENST00000460558 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
ECHDC1-211ENST00000460558 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
ECHDC1-211ENST00000460558 ETV3P41162 512 aa4.58□□□□□ -1.68
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