RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460160.5

HOXB3-202, Transcript of homeobox B3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene HOXB3, Length 1,525 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-202ENST00000460160 GABRR2P28476 465 aa25.37■■□□□ 1.65
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HOXB3-202ENST00000460160 PTPN5P54829 565 aa25.37■■□□□ 1.65
HOXB3-202ENST00000460160 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP25.37■■□□□ 1.65
HOXB3-202ENST00000460160 ENGASEQ8NFI3 743 aa25.37■■□□□ 1.65
HOXB3-202ENST00000460160 MMS19Q96T76 1030 aa25.37■■□□□ 1.65
HOXB3-202ENST00000460160 GPR88Q9GZN0 384 aa25.37■■□□□ 1.65
HOXB3-202ENST00000460160 XYLT2Q9H1B5 865 aa25.37■■□□□ 1.65
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HOXB3-202ENST00000460160 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP25.36■■□□□ 1.65
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HOXB3-202ENST00000460160 CCDC34Q96HJ3 373 aa25.35■■□□□ 1.65
HOXB3-202ENST00000460160 SYT15Q9BQS2 421 aa25.35■■□□□ 1.65
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HOXB3-202ENST00000460160 GREB1Q4ZG55 1949 aa25.35■■□□□ 1.65
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HOXB3-202ENST00000460160 ATICP31939 592 aa25.34■■□□□ 1.65
HOXB3-202ENST00000460160 STARD6P59095 220 aa25.34■■□□□ 1.65
HOXB3-202ENST00000460160 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP25.34■■□□□ 1.65
HOXB3-202ENST00000460160 FAM160A1Q05DH4 1040 aa25.34■■□□□ 1.65
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HOXB3-202ENST00000460160 CFAP221Q4G0U5 840 aa25.34■■□□□ 1.65
HOXB3-202ENST00000460160 SLC44A4Q53GD3 710 aa25.34■■□□□ 1.65
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HOXB3-202ENST00000460160 CEP135Q66GS9 1140 aa25.34■■□□□ 1.65
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HOXB3-202ENST00000460160 DDR2Q16832 855 aa25.33■■□□□ 1.65
HOXB3-202ENST00000460160 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP25.33■■□□□ 1.65
HOXB3-202ENST00000460160 TMC2Q8TDI7 906 aa25.33■■□□□ 1.65
HOXB3-202ENST00000460160 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP25.33■■□□□ 1.65
HOXB3-202ENST00000460160 RSPRY1Q96DX4 576 aa25.33■■□□□ 1.65
HOXB3-202ENST00000460160 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP25.33■■□□□ 1.65
HOXB3-202ENST00000460160 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa25.33■■□□□ 1.65
HOXB3-202ENST00000460160 COL4A2P08572 1712 aa25.33■■□□□ 1.65
HOXB3-202ENST00000460160 VNN1O95497 513 aa25.32■■□□□ 1.64
HOXB3-202ENST00000460160 PSMC3P17980 439 aa25.32■■□□□ 1.64
HOXB3-202ENST00000460160 NR2F2P24468 414 aa25.32■■□□□ 1.64
HOXB3-202ENST00000460160 CDC25CP30307 473 aa25.32■■□□□ 1.64
HOXB3-202ENST00000460160 TNNC1P63316 161 aa25.32■■□□□ 1.64
HOXB3-202ENST00000460160 CYP4F8P98187 520 aa25.32■■□□□ 1.64
HOXB3-202ENST00000460160 ZCWPW2Q504Y3 356 aa25.32■■□□□ 1.64
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HOXB3-202ENST00000460160 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP25.32■■□□□ 1.64
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HOXB3-202ENST00000460160 PRKCQQ04759 706 aa25.32■■□□□ 1.64
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HOXB3-202ENST00000460160 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa25.32■■□□□ 1.64
HOXB3-202ENST00000460160 C1orf220Q5T0J3 134 aa25.32■■□□□ 1.64
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HOXB3-202ENST00000460160 CCDC105Q8IYK2 499 aa25.32■■□□□ 1.64
HOXB3-202ENST00000460160 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa25.32■■□□□ 1.64
HOXB3-202ENST00000460160 MYLPFQ96A32 169 aa25.32■■□□□ 1.64
HOXB3-202ENST00000460160 SNX25Q9H3E2 840 aa25.32■■□□□ 1.64
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