RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455609.1

C9orf41-AS1-201, C9orf41 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene C9orf41-AS1, Length 719 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 FGF19O95750 216 aa16.67■□□□□ 0.26
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 WARSP23381 471 aaKnown RBP16.67■□□□□ 0.26
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CYP2F1P24903 491 aa16.67■□□□□ 0.26
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 LMO2P25791 158 aa16.67■□□□□ 0.26
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 VIPR2P41587 438 aa16.67■□□□□ 0.26
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 NUBP1P53384 320 aa16.67■□□□□ 0.26
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 MYL6P60660 151 aa16.67■□□□□ 0.26
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP16.67■□□□□ 0.26
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 DLG4P78352 724 aa16.67■□□□□ 0.26
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CLDN10P78369 228 aa16.67■□□□□ 0.26
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PFKPQ01813 784 aa16.67■□□□□ 0.26
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 BIRC3Q13489 604 aa16.67■□□□□ 0.26
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP16.67■□□□□ 0.26
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 GRM2Q14416 872 aa16.67■□□□□ 0.26
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 WDR72Q3MJ13 1102 aa16.67■□□□□ 0.26
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CEP135Q66GS9 1140 aa16.67■□□□□ 0.26
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP16.67■□□□□ 0.26
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 STKLD1Q8NE28 680 aa16.67■□□□□ 0.26
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ENGASEQ8NFI3 743 aa16.67■□□□□ 0.26
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SYT15Q9BQS2 421 aa16.67■□□□□ 0.26
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP16.67■□□□□ 0.26
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 XYLT2Q9H1B5 865 aa16.67■□□□□ 0.26
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TRPV4Q9HBA0 871 aa16.67■□□□□ 0.26
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 IL21Q9HBE4 155 aa16.67■□□□□ 0.26
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ABCB6Q9NP58 842 aa16.67■□□□□ 0.26
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CDH9Q9ULB4 789 aa16.67■□□□□ 0.26
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 NCANO14594 1321 aa16.67■□□□□ 0.26
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 STAU1O95793 577 aaKnown RBP16.66■□□□□ 0.26
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PDGFRBP09619 1106 aa16.66■□□□□ 0.26
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 NR2F2P24468 414 aa16.66■□□□□ 0.26
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ATICP31939 592 aa16.66■□□□□ 0.26
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 AP3M2P53677 418 aa16.66■□□□□ 0.26
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TNNC1P63316 161 aa16.66■□□□□ 0.26
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CYP4F8P98187 520 aa16.66■□□□□ 0.26
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 FAM160A1Q05DH4 1040 aa16.66■□□□□ 0.26
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP16.66■□□□□ 0.26
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TAF12Q16514 161 aa16.66■□□□□ 0.26
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SLC44A4Q53GD3 710 aa16.66■□□□□ 0.26
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SDHAF4Q5VUM1 108 aa16.66■□□□□ 0.26
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa16.66■□□□□ 0.26
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 FAM171BQ6P995 826 aa16.66■□□□□ 0.26
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 VITQ6UXI7 678 aa16.66■□□□□ 0.26
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP16.66■□□□□ 0.26
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP16.66■□□□□ 0.26
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP16.66■□□□□ 0.26
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 MKNK1Q9BUB5 465 aa16.66■□□□□ 0.26
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CRTAC1Q9NQ79 661 aa16.66■□□□□ 0.26
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa16.66■□□□□ 0.26
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 NME7Q9Y5B8 376 aa16.66■□□□□ 0.26
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TACC1O75410 805 aa16.65■□□□□ 0.26
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 VNN1O95497 513 aa16.65■□□□□ 0.26
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP16.65■□□□□ 0.26
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP16.65■□□□□ 0.26
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CDC25CP30307 473 aa16.65■□□□□ 0.26
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 STARD6P59095 220 aa16.65■□□□□ 0.26
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP16.65■□□□□ 0.26
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 NCOA4Q13772 614 aa16.65■□□□□ 0.26
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 NFIL3Q16649 462 aa16.65■□□□□ 0.26
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 DDR2Q16832 855 aa16.65■□□□□ 0.26
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CFAP221Q4G0U5 840 aa16.65■□□□□ 0.26
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa16.65■□□□□ 0.26
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 GPR158Q5T848 1215 aa16.65■□□□□ 0.26
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TMC2Q8TDI7 906 aa16.65■□□□□ 0.26
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 MYLPFQ96A32 169 aa16.65■□□□□ 0.26
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP16.65■□□□□ 0.26
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SHDQ96IW2 340 aa16.65■□□□□ 0.26
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 GCNAQ96QF7 691 aa16.65■□□□□ 0.26
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP16.65■□□□□ 0.26
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SNX25Q9H3E2 840 aa16.65■□□□□ 0.26
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 BRD9Q9H8M2 597 aa16.65■□□□□ 0.26
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP16.65■□□□□ 0.26
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 HEPACAM2A8MVW5 462 aa16.64■□□□□ 0.25
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 AKAP3O75969 853 aa16.64■□□□□ 0.25
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CLSTN1O94985 981 aa16.64■□□□□ 0.25
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CSH1P0DML2 217 aa16.64■□□□□ 0.25
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CSH2P0DML3 217 aa16.64■□□□□ 0.25
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PSMC3P17980 439 aa16.64■□□□□ 0.25
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP16.64■□□□□ 0.25
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PRKCQQ04759 706 aa16.64■□□□□ 0.25
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ZNF699Q32M78 642 aa16.64■□□□□ 0.25
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ZCWPW2Q504Y3 356 aa16.64■□□□□ 0.25
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 C4orf50Q6ZRC1 276 aa16.64■□□□□ 0.25
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 GPIHBP1Q8IV16 184 aa16.64■□□□□ 0.25
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP16.64■□□□□ 0.25
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SCN4BQ8IWT1 228 aa16.64■□□□□ 0.25
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CCDC105Q8IYK2 499 aa16.64■□□□□ 0.25
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 OR6B3Q8NGW1 331 aa16.64■□□□□ 0.25
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa16.64■□□□□ 0.25
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 DNASE1L2Q92874 299 aa16.64■□□□□ 0.25
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP16.64■□□□□ 0.25
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ELMO3Q96BJ8 720 aa16.64■□□□□ 0.25
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 RSPRY1Q96DX4 576 aa16.64■□□□□ 0.25
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 FOXQ1Q9C009 403 aa16.64■□□□□ 0.25
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 VRTNQ9H8Y1 702 aa16.64■□□□□ 0.25
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 RMND1Q9NWS8 449 aa16.64■□□□□ 0.25
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP16.64■□□□□ 0.25
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP16.64■□□□□ 0.25
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CACNA1AO00555 2505 aa16.63■□□□□ 0.25
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP16.63■□□□□ 0.25
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 H0Y858 1186 aa16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.2 ms