RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439720.3

RABGEF1-203, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,065 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-203ENST00000439720 POLLQ9UGP5 575 aa8.82□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 MTUS1Q9ULD2 1270 aa8.82□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 ACTL7BQ9Y614 415 aa8.82□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 MYH11P35749 1972 aa8.82□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 B2RBV5 119 aa8.82□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP8.82□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 BUD23O43709 281 aaKnown RBP8.82□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP8.82□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 CIB2O75838 187 aa8.82□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 SLC34A2O95436 690 aa8.82□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 SMIM18P0DKX4 95 aa8.82□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 IDO1P14902 403 aa8.82□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 UQCRBP14927 111 aa8.82□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 ATP6V1B1P15313 513 aa8.82□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 VCLP18206 1134 aa8.82□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 NR2F2P24468 414 aa8.82□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 HALP42357 657 aa8.82□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 TBL3Q12788 808 aaKnown RBP8.82□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 GRM2Q14416 872 aa8.82□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 MMEL1Q495T6 779 aa8.82□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 MDH1BQ5I0G3 518 aa8.82□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 C6orf163Q5TEZ5 329 aa8.82□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 C1orf146Q5VVC0 180 aa8.82□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP8.82□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 RHBDF2Q6PJF5 856 aa8.82□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 LVRNQ6Q4G3 990 aa8.82□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 RGS9BPQ6ZS82 235 aa8.82□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 DGKHQ86XP1 1220 aa8.82□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 CPNE8Q86YQ8 564 aa8.82□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 SAMD14Q8IZD0 417 aaPredicted RBP8.82□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 CDHR1Q96JP9 859 aa8.82□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 ZSWIM1Q9BR11 485 aa8.82□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 GRIP2Q9C0E4 1043 aa8.82□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa8.82□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 BTBD19C9JJ37 291 aa8.81□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 RARBP10826 455 aa8.81□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 COL6A2P12110 1019 aa8.81□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 STAT1P42224 750 aa8.81□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 MARSP56192 900 aaKnown RBP8.81□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP8.81□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 NCOA4Q13772 614 aa8.81□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 MESDQ14696 234 aa8.81□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 USH1GQ495M9 461 aa8.81□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 CAVIN4Q5BKX8 364 aa8.81□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 PPP4R4Q6NUP7 873 aa8.81□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 FOXR2Q6PJQ5 311 aa8.81□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 CAPN12Q6ZSI9 719 aa8.81□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP8.81□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 ZBED8Q8IZ13 594 aa8.81□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 RIN3Q8TB24 985 aa8.81□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 SNX29Q8TEQ0 813 aa8.81□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 ZFPM2Q8WW38 1151 aa8.81□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP8.81□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 THTPAQ9BU02 230 aa8.81□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 TUBB6Q9BUF5 446 aa8.81□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 EPB41L1Q9H4G0 881 aa8.81□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP8.81□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 COMMD8Q9NX08 183 aa8.81□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 GCNT4Q9P109 453 aa8.81□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 WHRNQ9P202 907 aa8.81□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 FAF1Q9UNN5 650 aaPredicted RBP8.81□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF541Q9H0D2 1346 aa8.81□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 394 aa8.81□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 EXOC1LA0A1B0GW35 172 aa8.81□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 USP17L3A6NCW0 530 aa8.81□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 USP17L4A6NCW7 530 aa8.81□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 IQCJ-SCHIP1C9J366 451 aaPredicted RBP8.81□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 TCEA3O75764 348 aa8.81□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 CLPTM1O96005 669 aa8.81□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 TFAP2AP05549 437 aa8.81□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 MAN1A1P33908 653 aa8.81□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 CHN2P52757 468 aa8.81□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP8.81□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP8.81□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 NR1H3Q13133 447 aa8.81□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 HNRNPDQ14103 355 aaKnown RBP8.81□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP8.81□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 KCTD21Q4G0X4 260 aa8.81□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF362Q5T0B9 420 aaPredicted RBP8.81□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 RNF207Q6ZRF8 634 aa8.81□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 USP17L1Q7RTZ2 530 aa8.81□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 ARPINQ7Z6K5 226 aa8.81□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 METTL25Q8N6Q8 603 aa8.81□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 ZFP28Q8NHY6 868 aa8.81□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 SLC30A5Q8TAD4 765 aa8.81□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 CCDC110Q8TBZ0 833 aa8.81□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 PYDC1Q8WXC3 89 aa8.81□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 SH3KBP1Q96B97 665 aa8.81□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 MAML3Q96JK9 1138 aa8.81□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 OSBPL8Q9BZF1 889 aa8.81□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP8.81□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 EURLQ9NYK6 297 aa8.81□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 MAFFQ9ULX9 164 aa8.81□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 DOLKQ9UPQ8 538 aa8.81□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 HEMK1Q9Y5R4 338 aaPredicted RBP8.81□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP8.8□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 F8W8V4 182 aa8.8□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 CSPG5O95196 566 aa8.8□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 BPNT1O95861 308 aa8.8□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 COMTP21964 271 aa8.8□□□□□ -1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45 ms