RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000434333.1

HLA-B-250, Transcript of major histocompatibility complex, class I, B, humanhuman

Gene HLA-B, Length 863 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-B-250ENST00000434333 PI4K2AQ9BTU6 479 aa21.62■■□□□ 1.05
HLA-B-250ENST00000434333 SLC46A2Q9BY10 475 aa21.62■■□□□ 1.05
HLA-B-250ENST00000434333 HSPBP1Q9NZL4 362 aa21.62■■□□□ 1.05
HLA-B-250ENST00000434333 SNX9Q9Y5X1 595 aa21.62■■□□□ 1.05
HLA-B-250ENST00000434333 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP21.62■■□□□ 1.05
HLA-B-250ENST00000434333 SPTBN4Q9H254 2564 aa21.61■■□□□ 1.05
HLA-B-250ENST00000434333 F11P03951 625 aa21.61■■□□□ 1.05
HLA-B-250ENST00000434333 KRT19P08727 400 aa21.61■■□□□ 1.05
HLA-B-250ENST00000434333 CHRNB1P11230 501 aa21.61■■□□□ 1.05
HLA-B-250ENST00000434333 CCNE1P24864 410 aa21.61■■□□□ 1.05
HLA-B-250ENST00000434333 CASP1P29466 404 aa21.61■■□□□ 1.05
HLA-B-250ENST00000434333 RBP5P82980 135 aa21.61■■□□□ 1.05
HLA-B-250ENST00000434333 AMPD3Q01432 767 aa21.61■■□□□ 1.05
HLA-B-250ENST00000434333 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
HLA-B-250ENST00000434333 WDR44Q5JSH3 913 aa21.61■■□□□ 1.05
HLA-B-250ENST00000434333 LIMS2Q7Z4I7 341 aa21.61■■□□□ 1.05
HLA-B-250ENST00000434333 HSCBQ8IWL3 235 aa21.61■■□□□ 1.05
HLA-B-250ENST00000434333 TOP6BLQ8N6T0 577 aa21.61■■□□□ 1.05
HLA-B-250ENST00000434333 SPATA18Q8TC71 538 aa21.61■■□□□ 1.05
HLA-B-250ENST00000434333 ZFYVE19Q96K21 471 aa21.61■■□□□ 1.05
HLA-B-250ENST00000434333 PCDHA7Q9UN72 937 aa21.61■■□□□ 1.05
HLA-B-250ENST00000434333 ZNF233A6NK53 670 aa21.6■■□□□ 1.05
HLA-B-250ENST00000434333 SLC38A8A6NNN8 435 aa21.6■■□□□ 1.05
HLA-B-250ENST00000434333 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
HLA-B-250ENST00000434333 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
HLA-B-250ENST00000434333 TDGF1P13385 188 aa21.6■■□□□ 1.05
HLA-B-250ENST00000434333 SOX9P48436 509 aa21.6■■□□□ 1.05
HLA-B-250ENST00000434333 NLRP12P59046 1061 aa21.6■■□□□ 1.05
HLA-B-250ENST00000434333 SOWAHAQ2M3V2 549 aa21.6■■□□□ 1.05
HLA-B-250ENST00000434333 SDHAF4Q5VUM1 108 aa21.6■■□□□ 1.05
HLA-B-250ENST00000434333 MAMSTRQ6ZN01 415 aa21.6■■□□□ 1.05
HLA-B-250ENST00000434333 UNC13DQ70J99 1090 aa21.6■■□□□ 1.05
HLA-B-250ENST00000434333 ADGRF2Q8IZF7 708 aa21.6■■□□□ 1.05
HLA-B-250ENST00000434333 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa21.6■■□□□ 1.05
HLA-B-250ENST00000434333 SCFD1Q8WVM8 642 aa21.6■■□□□ 1.05
HLA-B-250ENST00000434333 MSANTD3Q96H12 275 aa21.6■■□□□ 1.05
HLA-B-250ENST00000434333 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa21.6■■□□□ 1.05
HLA-B-250ENST00000434333 LMAN1LQ9HAT1 526 aa21.6■■□□□ 1.05
HLA-B-250ENST00000434333 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa21.6■■□□□ 1.05
HLA-B-250ENST00000434333 GTF3C4Q9UKN8 822 aa21.6■■□□□ 1.05
HLA-B-250ENST00000434333 DMXL1Q9Y485 3027 aa21.59■■□□□ 1.05
HLA-B-250ENST00000434333 MYBPHLA2RUH7 354 aa21.59■■□□□ 1.05
HLA-B-250ENST00000434333 DPYSL4O14531 572 aa21.59■■□□□ 1.05
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HLA-B-250ENST00000434333 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
HLA-B-250ENST00000434333 MYL7Q01449 175 aa21.59■■□□□ 1.05
HLA-B-250ENST00000434333 GAS6Q14393 721 aa21.59■■□□□ 1.05
HLA-B-250ENST00000434333 SURF1Q15526 300 aa21.59■■□□□ 1.05
HLA-B-250ENST00000434333 TAF12Q16514 161 aa21.59■■□□□ 1.05
HLA-B-250ENST00000434333 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa21.59■■□□□ 1.05
HLA-B-250ENST00000434333 TXNDC11Q6PKC3 985 aa21.59■■□□□ 1.05
HLA-B-250ENST00000434333 BPIFB1Q8TDL5 484 aa21.59■■□□□ 1.05
HLA-B-250ENST00000434333 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa21.59■■□□□ 1.05
HLA-B-250ENST00000434333 GCNAQ96QF7 691 aa21.59■■□□□ 1.05
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HLA-B-250ENST00000434333 BLZF1Q9H2G9 400 aa21.59■■□□□ 1.05
HLA-B-250ENST00000434333 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
HLA-B-250ENST00000434333 MAGEF1Q9HAY2 307 aa21.59■■□□□ 1.05
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HLA-B-250ENST00000434333 GTSE1Q9NYZ3 720 aa21.59■■□□□ 1.05
HLA-B-250ENST00000434333 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa21.59■■□□□ 1.05
HLA-B-250ENST00000434333 GPR179Q6PRD1 2367 aa21.59■■□□□ 1.05
HLA-B-250ENST00000434333 UBE4BO95155 1302 aa21.58■■□□□ 1.05
HLA-B-250ENST00000434333 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa21.58■■□□□ 1.05
HLA-B-250ENST00000434333 TADA3O75528 432 aa21.58■■□□□ 1.05
HLA-B-250ENST00000434333 CYP2F1P24903 491 aa21.58■■□□□ 1.05
HLA-B-250ENST00000434333 CTHP32929 405 aa21.58■■□□□ 1.05
HLA-B-250ENST00000434333 LHX1P48742 406 aa21.58■■□□□ 1.05
HLA-B-250ENST00000434333 DDR2Q16832 855 aa21.58■■□□□ 1.05
HLA-B-250ENST00000434333 RESP18Q5W5W9 173 aa21.58■■□□□ 1.05
HLA-B-250ENST00000434333 DPH6Q7L8W6 267 aa21.58■■□□□ 1.05
HLA-B-250ENST00000434333 WDR49Q8IV35 697 aa21.58■■□□□ 1.05
HLA-B-250ENST00000434333 CMTM8Q8IZV2 173 aa21.58■■□□□ 1.05
HLA-B-250ENST00000434333 IER2Q9BTL4 223 aa21.58■■□□□ 1.05
HLA-B-250ENST00000434333 KIAA1586Q9HCI6 787 aa21.58■■□□□ 1.05
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HLA-B-250ENST00000434333 CSH2P0DML3 217 aa21.57■■□□□ 1.04
HLA-B-250ENST00000434333 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
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HLA-B-250ENST00000434333 MAB21L3Q8N8X9 362 aa21.57■■□□□ 1.04
HLA-B-250ENST00000434333 TTC8Q8TAM2 541 aa21.57■■□□□ 1.04
HLA-B-250ENST00000434333 RIN3Q8TB24 985 aa21.57■■□□□ 1.04
HLA-B-250ENST00000434333 HPDLQ96IR7 371 aa21.57■■□□□ 1.04
HLA-B-250ENST00000434333 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
HLA-B-250ENST00000434333 ZMYM5Q9UJ78 669 aa21.57■■□□□ 1.04
HLA-B-250ENST00000434333 CCL26Q9Y258 94 aa21.57■■□□□ 1.04
HLA-B-250ENST00000434333 ATP2C2O75185 946 aa21.56■■□□□ 1.04
HLA-B-250ENST00000434333 TNNC2P02585 160 aa21.56■■□□□ 1.04
HLA-B-250ENST00000434333 LMO2P25791 158 aa21.56■■□□□ 1.04
HLA-B-250ENST00000434333 PCSK1P29120 753 aa21.56■■□□□ 1.04
HLA-B-250ENST00000434333 ME1P48163 572 aa21.56■■□□□ 1.04
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