RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000431413.5

HERC3-206, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 761 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-206ENST00000431413 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP16.28■□□□□ 0.2
HERC3-206ENST00000431413 BPIFB1Q8TDL5 484 aa16.28■□□□□ 0.2
HERC3-206ENST00000431413 RSPRY1Q96DX4 576 aa16.28■□□□□ 0.2
HERC3-206ENST00000431413 C7orf25Q9BPX7 421 aa16.28■□□□□ 0.2
HERC3-206ENST00000431413 PI4K2AQ9BTU6 479 aa16.28■□□□□ 0.2
HERC3-206ENST00000431413 MKNK1Q9BUB5 465 aa16.28■□□□□ 0.2
HERC3-206ENST00000431413 IL21Q9HBE4 155 aa16.28■□□□□ 0.2
HERC3-206ENST00000431413 HSPBP1Q9NZL4 362 aa16.28■□□□□ 0.2
HERC3-206ENST00000431413 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP16.28■□□□□ 0.2
HERC3-206ENST00000431413 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa16.28■□□□□ 0.2
HERC3-206ENST00000431413 ANK1P16157 1881 aa16.28■□□□□ 0.2
HERC3-206ENST00000431413 F5P12259 2224 aa16.27■□□□□ 0.2
HERC3-206ENST00000431413 UBE4BO95155 1302 aa16.27■□□□□ 0.2
HERC3-206ENST00000431413 VPS13AQ96RL7 3174 aa16.27■□□□□ 0.2
HERC3-206ENST00000431413 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP16.27■□□□□ 0.2
HERC3-206ENST00000431413 CCR3P51677 355 aa16.27■□□□□ 0.2
HERC3-206ENST00000431413 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP16.27■□□□□ 0.2
HERC3-206ENST00000431413 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP16.27■□□□□ 0.2
HERC3-206ENST00000431413 UNC13DQ70J99 1090 aa16.27■□□□□ 0.2
HERC3-206ENST00000431413 CBWD2Q8IUF1 395 aa16.27■□□□□ 0.2
HERC3-206ENST00000431413 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP16.27■□□□□ 0.2
HERC3-206ENST00000431413 GPIHBP1Q8IV16 184 aa16.27■□□□□ 0.2
HERC3-206ENST00000431413 WDR49Q8IV35 697 aa16.27■□□□□ 0.2
HERC3-206ENST00000431413 CMTM8Q8IZV2 173 aa16.27■□□□□ 0.2
HERC3-206ENST00000431413 CXorf38Q8TB03 319 aa16.27■□□□□ 0.2
HERC3-206ENST00000431413 ZNF507Q8TCN5 953 aa16.27■□□□□ 0.2
HERC3-206ENST00000431413 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP16.27■□□□□ 0.2
HERC3-206ENST00000431413 HPS3Q969F9 1004 aa16.27■□□□□ 0.2
HERC3-206ENST00000431413 HPDLQ96IR7 371 aa16.27■□□□□ 0.2
HERC3-206ENST00000431413 FNBP1Q96RU3 617 aa16.27■□□□□ 0.2
HERC3-206ENST00000431413 PRMT8Q9NR22 394 aaPredicted RBP16.27■□□□□ 0.2
HERC3-206ENST00000431413 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP16.27■□□□□ 0.2
HERC3-206ENST00000431413 COL4A3Q01955 1670 aa16.27■□□□□ 0.19
HERC3-206ENST00000431413 CFAP54Q96N23 3096 aa16.27■□□□□ 0.19
HERC3-206ENST00000431413 TSC2P49815 1807 aa16.26■□□□□ 0.19
HERC3-206ENST00000431413 NCANO14594 1321 aa16.26■□□□□ 0.19
HERC3-206ENST00000431413 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa16.26■□□□□ 0.19
HERC3-206ENST00000431413 SLC38A8A6NNN8 435 aa16.26■□□□□ 0.19
HERC3-206ENST00000431413 NLRP12P59046 1061 aa16.26■□□□□ 0.19
HERC3-206ENST00000431413 FOXK2Q01167 660 aa16.26■□□□□ 0.19
HERC3-206ENST00000431413 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP16.26■□□□□ 0.19
HERC3-206ENST00000431413 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP16.26■□□□□ 0.19
HERC3-206ENST00000431413 CFAP221Q4G0U5 840 aa16.26■□□□□ 0.19
HERC3-206ENST00000431413 DGKKQ5KSL6 1271 aa16.26■□□□□ 0.19
HERC3-206ENST00000431413 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP16.26■□□□□ 0.19
HERC3-206ENST00000431413 C4orf50Q6ZRC1 276 aa16.26■□□□□ 0.19
HERC3-206ENST00000431413 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP16.26■□□□□ 0.19
HERC3-206ENST00000431413 ZNF687Q8N1G0 1237 aa16.26■□□□□ 0.19
HERC3-206ENST00000431413 ZBTB44Q8NCP5 570 aa16.26■□□□□ 0.19
HERC3-206ENST00000431413 GLIS3Q8NEA6 775 aa16.26■□□□□ 0.19
HERC3-206ENST00000431413 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP16.26■□□□□ 0.19
HERC3-206ENST00000431413 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP16.26■□□□□ 0.19
HERC3-206ENST00000431413 SLC46A2Q9BY10 475 aa16.26■□□□□ 0.19
HERC3-206ENST00000431413 KIF9Q9HAQ2 790 aa16.26■□□□□ 0.19
HERC3-206ENST00000431413 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa16.26■□□□□ 0.19
HERC3-206ENST00000431413 TMLHEQ9NVH6 421 aa16.26■□□□□ 0.19
HERC3-206ENST00000431413 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP16.26■□□□□ 0.19
HERC3-206ENST00000431413 SIX4Q9UIU6 781 aa16.26■□□□□ 0.19
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HERC3-206ENST00000431413 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa16.25■□□□□ 0.19
HERC3-206ENST00000431413 MYBPHLA2RUH7 354 aa16.25■□□□□ 0.19
HERC3-206ENST00000431413 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa16.25■□□□□ 0.19
HERC3-206ENST00000431413 GABRDO14764 452 aa16.25■□□□□ 0.19
HERC3-206ENST00000431413 PRAMEF12O95522 483 aa16.25■□□□□ 0.19
HERC3-206ENST00000431413 F11P03951 625 aa16.25■□□□□ 0.19
HERC3-206ENST00000431413 CHRNB1P11230 501 aa16.25■□□□□ 0.19
HERC3-206ENST00000431413 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP16.25■□□□□ 0.19
HERC3-206ENST00000431413 TNNI1P19237 187 aa16.25■□□□□ 0.19
HERC3-206ENST00000431413 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP16.25■□□□□ 0.19
HERC3-206ENST00000431413 CYP2F1P24903 491 aa16.25■□□□□ 0.19
HERC3-206ENST00000431413 CXCL12P48061 93 aa16.25■□□□□ 0.19
HERC3-206ENST00000431413 DDR2Q16832 855 aa16.25■□□□□ 0.19
HERC3-206ENST00000431413 SOWAHAQ2M3V2 549 aa16.25■□□□□ 0.19
HERC3-206ENST00000431413 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa16.25■□□□□ 0.19
HERC3-206ENST00000431413 CEP57L1Q8IYX8 460 aa16.25■□□□□ 0.19
HERC3-206ENST00000431413 MAB21L3Q8N8X9 362 aa16.25■□□□□ 0.19
HERC3-206ENST00000431413 XXYLT1Q8NBI6 393 aa16.25■□□□□ 0.19
HERC3-206ENST00000431413 RDH13Q8NBN7 331 aa16.25■□□□□ 0.19
HERC3-206ENST00000431413 OR5B17Q8NGF7 314 aa16.25■□□□□ 0.19
HERC3-206ENST00000431413 NELL1Q92832 810 aa16.25■□□□□ 0.19
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HERC3-206ENST00000431413 NCDNQ9UBB6 729 aa16.25■□□□□ 0.19
HERC3-206ENST00000431413 PCDHA7Q9UN72 937 aa16.25■□□□□ 0.19
HERC3-206ENST00000431413 DLATP10515 647 aaKnown RBP16.24■□□□□ 0.19
HERC3-206ENST00000431413 CTHP32929 405 aa16.24■□□□□ 0.19
HERC3-206ENST00000431413 HOXD13P35453 343 aa16.24■□□□□ 0.19
HERC3-206ENST00000431413 ID4P47928 161 aa16.24■□□□□ 0.19
HERC3-206ENST00000431413 AMPD2Q01433 879 aa16.24■□□□□ 0.19
HERC3-206ENST00000431413 RESP18Q5W5W9 173 aa16.24■□□□□ 0.19
HERC3-206ENST00000431413 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP16.24■□□□□ 0.19
HERC3-206ENST00000431413 TSSK4Q6SA08 328 aa16.24■□□□□ 0.19
HERC3-206ENST00000431413 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa16.24■□□□□ 0.19
HERC3-206ENST00000431413 MON1AQ86VX9 555 aa16.24■□□□□ 0.19
HERC3-206ENST00000431413 SCN4BQ8IWT1 228 aa16.24■□□□□ 0.19
HERC3-206ENST00000431413 NELFCDQ8IXH7 590 aa16.24■□□□□ 0.19
HERC3-206ENST00000431413 SPEM1Q8N4L4 309 aa16.24■□□□□ 0.19
HERC3-206ENST00000431413 FSIP1Q8NA03 581 aa16.24■□□□□ 0.19
HERC3-206ENST00000431413 SUMF1Q8NBK3 374 aa16.24■□□□□ 0.19
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