RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429595.1

PTPRK-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRK, Length 558 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-211ENST00000429595 PSMC6P62333 389 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRK-211ENST00000429595 EIF4HQ15056 248 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
PTPRK-211ENST00000429595 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
PTPRK-211ENST00000429595 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
PTPRK-211ENST00000429595 FAM209AQ5JX71 171 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRK-211ENST00000429595 KANK2Q63ZY3 851 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRK-211ENST00000429595 TRIM68Q6AZZ1 485 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRK-211ENST00000429595 SLC4A10Q6U841 1118 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRK-211ENST00000429595 CXXC5Q7LFL8 322 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
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PTPRK-211ENST00000429595 CHFRQ96EP1 664 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRK-211ENST00000429595 SUCLG2Q96I99 432 aa7.38□□□□□ -1.23
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PTPRK-211ENST00000429595 H3BNC9 293 aa7.37□□□□□ -1.23
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PTPRK-211ENST00000429595 PTPN21Q16825 1174 aa7.37□□□□□ -1.23
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PTPRK-211ENST00000429595 TM4SF20Q53R12 229 aa7.37□□□□□ -1.23
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PTPRK-211ENST00000429595 PPP2R3CQ969Q6 453 aa7.37□□□□□ -1.23
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PTPRK-211ENST00000429595 GRIN2DO15399 1336 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRK-211ENST00000429595 TRBV23-1A0A0A0MS06 115 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRK-211ENST00000429595 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa7.36□□□□□ -1.23
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PTPRK-211ENST00000429595 RPS19P39019 145 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
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PTPRK-211ENST00000429595 GUCY1A3Q02108 690 aa7.36□□□□□ -1.23
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PTPRK-211ENST00000429595 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
PTPRK-211ENST00000429595 PCDHA9Q9Y5H5 950 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRK-211ENST00000429595 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
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PTPRK-211ENST00000429595 MMEP08473 750 aa7.35□□□□□ -1.23
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PTPRK-211ENST00000429595 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
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PTPRK-211ENST00000429595 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa7.35□□□□□ -1.23
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PTPRK-211ENST00000429595 UCKL1Q9NWZ5 548 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRK-211ENST00000429595 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP7.35□□□□□ -1.23
PTPRK-211ENST00000429595 PLA2G3Q9NZ20 509 aa7.35□□□□□ -1.23
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PTPRK-211ENST00000429595 HECAQ9UBI9 543 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
PTPRK-211ENST00000429595 PFDN2Q9UHV9 154 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRK-211ENST00000429595 RCAN3Q9UKA8 241 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRK-211ENST00000429595 REV3LO60673 3130 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRK-211ENST00000429595 FLT1P17948 1338 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRK-211ENST00000429595 CCDC66A2RUB6 948 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRK-211ENST00000429595 CTAGE5O15320 804 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRK-211ENST00000429595 PDPK1O15530 556 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRK-211ENST00000429595 MYL3P08590 195 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRK-211ENST00000429595 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
PTPRK-211ENST00000429595 MCM7P33993 719 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRK-211ENST00000429595 CLCN5P51795 746 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRK-211ENST00000429595 KRTAP1-1Q07627 177 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRK-211ENST00000429595 RASGRF1Q13972 1273 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRK-211ENST00000429595 CRY1Q16526 586 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRK-211ENST00000429595 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
PTPRK-211ENST00000429595 GORABQ5T7V8 394 aa7.34□□□□□ -1.23
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