RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429285.6

NCOR2-208, Transcript of nuclear receptor corepressor 2, human

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene NCOR2, Length 8,475 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NCOR2-208	ENST00000429285	PACSIN1	Q9BY11	444 aa		13.86	□□□□□ -0.19
NCOR2-208	ENST00000429285	LIN7A	O14910	233 aa	Predicted RBP	13.86	□□□□□ -0.19
NCOR2-208	ENST00000429285	GHR	P10912	638 aa		13.86	□□□□□ -0.19
NCOR2-208	ENST00000429285	POU4F1	Q01851	419 aa		13.86	□□□□□ -0.19
NCOR2-208	ENST00000429285	LONRF1	Q17RB8	773 aa		13.86	□□□□□ -0.19
NCOR2-208	ENST00000429285	SCUBE1	Q8IWY4	988 aa		13.86	□□□□□ -0.19
NCOR2-208	ENST00000429285	PIGO	Q8TEQ8	1089 aa		13.86	□□□□□ -0.19
NCOR2-208	ENST00000429285	FAM213A	Q9BRX8	229 aa		13.86	□□□□□ -0.19
NCOR2-208	ENST00000429285	SETBP1	Q9Y6X0	1596 aa		13.86	□□□□□ -0.19
NCOR2-208	ENST00000429285	GYS1	P13807	737 aa		13.86	□□□□□ -0.19
NCOR2-208	ENST00000429285	GEMIN4	P57678	1058 aa	Known RBP	13.86	□□□□□ -0.19
NCOR2-208	ENST00000429285	ZNF618	Q5T7W0	954 aa		13.86	□□□□□ -0.19
NCOR2-208	ENST00000429285	EXD1	Q8NHP7	514 aa		13.86	□□□□□ -0.19
NCOR2-208	ENST00000429285	COA7	Q96BR5	231 aa		13.86	□□□□□ -0.19
NCOR2-208	ENST00000429285	CYBB	P04839	570 aa		13.86	□□□□□ -0.19
NCOR2-208	ENST00000429285	PTGIS	Q16647	500 aa		13.86	□□□□□ -0.19
NCOR2-208	ENST00000429285	CYP51A1	Q16850	503 aa		13.86	□□□□□ -0.19
NCOR2-208	ENST00000429285	PADI6	Q6TGC4	694 aa		13.86	□□□□□ -0.19
NCOR2-208	ENST00000429285	E2F7	Q96AV8	911 aa		13.86	□□□□□ -0.19
NCOR2-208	ENST00000429285	SPACA6	W5XKT8	324 aa		13.86	□□□□□ -0.19
NCOR2-208	ENST00000429285	SPATA31E1	Q6ZUB1	1445 aa		13.86	□□□□□ -0.19
NCOR2-208	ENST00000429285		F5H423	210 aa	Predicted RBP	13.86	□□□□□ -0.19
NCOR2-208	ENST00000429285	PEX1	O43933	1283 aa		13.86	□□□□□ -0.19
NCOR2-208	ENST00000429285	ALDH1A1	P00352	501 aa		13.86	□□□□□ -0.19
NCOR2-208	ENST00000429285	SCTR	P47872	440 aa		13.86	□□□□□ -0.19
NCOR2-208	ENST00000429285	PUDP	Q08623	228 aa		13.86	□□□□□ -0.19
NCOR2-208	ENST00000429285	STOML2	Q9UJZ1	356 aa		13.86	□□□□□ -0.19
NCOR2-208	ENST00000429285	NCK2	O43639	380 aa		13.86	□□□□□ -0.19
NCOR2-208	ENST00000429285	CCT3	P49368	545 aa	Known RBP	13.86	□□□□□ -0.19
NCOR2-208	ENST00000429285	NFIL3	Q16649	462 aa		13.86	□□□□□ -0.19
NCOR2-208	ENST00000429285	NDUFAF6	Q330K2	333 aa		13.86	□□□□□ -0.19
NCOR2-208	ENST00000429285	RAB6B	Q9NRW1	208 aa		13.86	□□□□□ -0.19
NCOR2-208	ENST00000429285	GGT7	Q9UJ14	662 aa		13.86	□□□□□ -0.19
NCOR2-208	ENST00000429285	GDA	Q9Y2T3	454 aa		13.86	□□□□□ -0.19
NCOR2-208	ENST00000429285	MEI4	A8MW99	385 aa		13.86	□□□□□ -0.19
NCOR2-208	ENST00000429285	TAF4	O00268	1085 aa		13.86	□□□□□ -0.19
NCOR2-208	ENST00000429285	FDX1	P10109	184 aa		13.86	□□□□□ -0.19
NCOR2-208	ENST00000429285	SETD9	Q8NE22	299 aa		13.86	□□□□□ -0.19
NCOR2-208	ENST00000429285	PPP2R3C	Q969Q6	453 aa		13.86	□□□□□ -0.19
NCOR2-208	ENST00000429285	ZC3H4	Q9UPT8	1303 aa	Known RBP	13.86	□□□□□ -0.19
NCOR2-208	ENST00000429285	P4HA2	O15460	535 aa		13.85	□□□□□ -0.19
NCOR2-208	ENST00000429285	SOAT2	O75908	522 aa		13.85	□□□□□ -0.19
NCOR2-208	ENST00000429285	RAD23A	P54725	363 aa		13.85	□□□□□ -0.19
NCOR2-208	ENST00000429285	STX4	Q12846	297 aa		13.85	□□□□□ -0.19
NCOR2-208	ENST00000429285	C18orf8	Q96DM3	657 aa		13.85	□□□□□ -0.19
NCOR2-208	ENST00000429285	REXO4	Q9GZR2	422 aa	Known RBP	13.85	□□□□□ -0.19
NCOR2-208	ENST00000429285	DAPK2	Q9UIK4	370 aa		13.85	□□□□□ -0.19
NCOR2-208	ENST00000429285	CCDC88C	Q9P219	2028 aa		13.85	□□□□□ -0.19
NCOR2-208	ENST00000429285	USP11	P51784	963 aa		13.85	□□□□□ -0.19
NCOR2-208	ENST00000429285	OSBPL6	Q9BZF3	934 aa		13.85	□□□□□ -0.19
NCOR2-208	ENST00000429285	SRRM3	A6NNA2	597 aa	Predicted RBP	13.85	□□□□□ -0.19
NCOR2-208	ENST00000429285	PDXK	O00764	312 aa		13.85	□□□□□ -0.19
NCOR2-208	ENST00000429285	SESN2	P58004	480 aa	Predicted RBP	13.85	□□□□□ -0.19
NCOR2-208	ENST00000429285	ADCK2	Q7Z695	626 aa		13.85	□□□□□ -0.19
NCOR2-208	ENST00000429285	GPD1L	Q8N335	351 aa		13.85	□□□□□ -0.19
NCOR2-208	ENST00000429285	TRPC4AP	Q8TEL6	797 aa		13.85	□□□□□ -0.19
NCOR2-208	ENST00000429285	AGPAT1	Q99943	283 aa		13.85	□□□□□ -0.19
NCOR2-208	ENST00000429285	THUMPD3	Q9BV44	507 aa	Known RBP	13.85	□□□□□ -0.19
NCOR2-208	ENST00000429285	INTS2	Q9H0H0	1204 aa	Known RBP	13.85	□□□□□ -0.19
NCOR2-208	ENST00000429285	GOLPH3	Q9H4A6	298 aa		13.85	□□□□□ -0.19
NCOR2-208	ENST00000429285	TIMMDC1	Q9NPL8	285 aa		13.85	□□□□□ -0.19
NCOR2-208	ENST00000429285		E9PBE3	544 aa		13.85	□□□□□ -0.19
NCOR2-208	ENST00000429285	CDC25A	P30304	524 aa		13.85	□□□□□ -0.19
NCOR2-208	ENST00000429285	CHI3L1	P36222	383 aa	Predicted RBP	13.85	□□□□□ -0.19
NCOR2-208	ENST00000429285	PFKFB3	Q16875	520 aa	Predicted RBP	13.85	□□□□□ -0.19
NCOR2-208	ENST00000429285	AGAP9	Q5VTM2	703 aa		13.85	□□□□□ -0.19
NCOR2-208	ENST00000429285	LRRC1	Q9BTT6	524 aa		13.85	□□□□□ -0.19
NCOR2-208	ENST00000429285	SPON2	Q9BUD6	331 aa		13.85	□□□□□ -0.19
NCOR2-208	ENST00000429285	CCDC28B	Q9BUN5	200 aa		13.85	□□□□□ -0.19
NCOR2-208	ENST00000429285	IL1RL2	Q9HB29	575 aa		13.85	□□□□□ -0.19
NCOR2-208	ENST00000429285	RBAK	Q9NYW8	714 aa	Predicted RBP	13.85	□□□□□ -0.19
NCOR2-208	ENST00000429285	ARHGEF7	Q14155	803 aa		13.85	□□□□□ -0.19
NCOR2-208	ENST00000429285	PDIA5	Q14554	519 aa		13.85	□□□□□ -0.19
NCOR2-208	ENST00000429285	NECTIN1	Q15223	517 aa		13.85	□□□□□ -0.19
NCOR2-208	ENST00000429285	SLC25A24	Q6NUK1	477 aa		13.85	□□□□□ -0.19
NCOR2-208	ENST00000429285	USP17L2	Q6R6M4	530 aa		13.85	□□□□□ -0.19
NCOR2-208	ENST00000429285	KIAA0408	Q6ZU52	694 aa		13.85	□□□□□ -0.19
NCOR2-208	ENST00000429285	LPCAT2	Q7L5N7	544 aa		13.85	□□□□□ -0.19
NCOR2-208	ENST00000429285	DLG3	Q92796	817 aa		13.85	□□□□□ -0.19
NCOR2-208	ENST00000429285	ERP44	Q9BS26	406 aa		13.85	□□□□□ -0.19
NCOR2-208	ENST00000429285	YIPF2	Q9BWQ6	316 aa		13.85	□□□□□ -0.19
NCOR2-208	ENST00000429285	SPAST	Q9UBP0	616 aa		13.85	□□□□□ -0.19
NCOR2-208	ENST00000429285	STAT5A	P42229	794 aa		13.85	□□□□□ -0.19
NCOR2-208	ENST00000429285	STAT5B	P51692	787 aa		13.85	□□□□□ -0.19
NCOR2-208	ENST00000429285	SNX30	Q5VWJ9	437 aa		13.85	□□□□□ -0.19
NCOR2-208	ENST00000429285	L3MBTL3	Q96JM7	780 aa	Predicted RBP	13.85	□□□□□ -0.19
NCOR2-208	ENST00000429285	TRIM51	Q9BSJ1	452 aa		13.85	□□□□□ -0.19
NCOR2-208	ENST00000429285		A0A087WWV3	80 aa		13.84	□□□□□ -0.19
NCOR2-208	ENST00000429285	ALDH1A2	O94788	518 aa		13.84	□□□□□ -0.19
NCOR2-208	ENST00000429285	PHKA1	P46020	1223 aa		13.84	□□□□□ -0.19
NCOR2-208	ENST00000429285	PTRHD1	Q6GMV3	140 aa	Known RBP	13.84	□□□□□ -0.19
NCOR2-208	ENST00000429285	RSAD1	Q9HA92	442 aa		13.84	□□□□□ -0.19
NCOR2-208	ENST00000429285	ZSWIM5	Q9P217	1185 aa		13.84	□□□□□ -0.19
NCOR2-208	ENST00000429285	PPEF1	O14829	653 aa	Predicted RBP	13.84	□□□□□ -0.19
NCOR2-208	ENST00000429285	TARS	P26639	723 aa	Known RBP	13.84	□□□□□ -0.19
NCOR2-208	ENST00000429285	SLC16A2	P36021	539 aa		13.84	□□□□□ -0.19
NCOR2-208	ENST00000429285	IREB2	P48200	963 aa	Known RBP	13.84	□□□□□ -0.19
NCOR2-208	ENST00000429285	HNMT	P50135	292 aa		13.84	□□□□□ -0.19
NCOR2-208	ENST00000429285	PDK1	Q15118	436 aa		13.84	□□□□□ -0.19
NCOR2-208	ENST00000429285	TSGA10IP	Q3SY00	556 aa		13.84	□□□□□ -0.19

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