RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426585.5

TPTEP1-204, Transcript of TPTE pseudogene 1, human

TSL 1 (best)

Gene TPTEP1, Length 5,725 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TPTEP1-204	ENST00000426585	ITGB3	P05106	788 aa		13.37	□□□□□ -0.27
TPTEP1-204	ENST00000426585	GHR	P10912	638 aa		13.37	□□□□□ -0.27
TPTEP1-204	ENST00000426585	ITGA4	P13612	1032 aa		13.37	□□□□□ -0.27
TPTEP1-204	ENST00000426585	GFAP	P14136	432 aa		13.37	□□□□□ -0.27
TPTEP1-204	ENST00000426585	ABCE1	P61221	599 aa	Known RBP	13.37	□□□□□ -0.27
TPTEP1-204	ENST00000426585	SPDYE1	Q8NFV5	336 aa	Predicted RBP	13.37	□□□□□ -0.27
TPTEP1-204	ENST00000426585	TAS1R2	Q8TE23	839 aa		13.37	□□□□□ -0.27
TPTEP1-204	ENST00000426585	SPATA31A6	Q5VVP1	1343 aa		13.37	□□□□□ -0.27
TPTEP1-204	ENST00000426585	MTSS1	O43312	755 aa		13.36	□□□□□ -0.27
TPTEP1-204	ENST00000426585	CYP2C8	P10632	490 aa		13.36	□□□□□ -0.27
TPTEP1-204	ENST00000426585	ERVK-9	P63128	1117 aa		13.36	□□□□□ -0.27
TPTEP1-204	ENST00000426585	AGBL3	Q8NEM8	1001 aa		13.36	□□□□□ -0.27
TPTEP1-204	ENST00000426585	SH3TC2	Q8TF17	1288 aa		13.36	□□□□□ -0.27
TPTEP1-204	ENST00000426585	OLA1	Q9NTK5	396 aa	Known RBP	13.36	□□□□□ -0.27
TPTEP1-204	ENST00000426585	SATB2	Q9UPW6	733 aa		13.36	□□□□□ -0.27
TPTEP1-204	ENST00000426585	SIK3	Q9Y2K2	1263 aa		13.36	□□□□□ -0.27
TPTEP1-204	ENST00000426585	LRRC36	Q1X8D7	754 aa		13.36	□□□□□ -0.27
TPTEP1-204	ENST00000426585	ARID3B	Q8IVW6	561 aa	Predicted RBP	13.36	□□□□□ -0.27
TPTEP1-204	ENST00000426585	LBHD1	Q9BQE6	289 aa	Predicted RBP	13.36	□□□□□ -0.27
TPTEP1-204	ENST00000426585	INTS13	Q9NVM9	706 aa		13.36	□□□□□ -0.27
TPTEP1-204	ENST00000426585	SLC24A2	Q9UI40	661 aa		13.36	□□□□□ -0.27
TPTEP1-204	ENST00000426585	AURKC	Q9UQB9	309 aa		13.36	□□□□□ -0.27
TPTEP1-204	ENST00000426585	ZSCAN5C	A6NGD5	496 aa	Predicted RBP	13.36	□□□□□ -0.27
TPTEP1-204	ENST00000426585	RIPK2	O43353	540 aa		13.36	□□□□□ -0.27
TPTEP1-204	ENST00000426585	TCF7	P36402	384 aa	Predicted RBP	13.36	□□□□□ -0.27
TPTEP1-204	ENST00000426585	SPOCD1	Q6ZMY3	1216 aa		13.36	□□□□□ -0.27
TPTEP1-204	ENST00000426585	PRUNE1	Q86TP1	453 aa		13.36	□□□□□ -0.27
TPTEP1-204	ENST00000426585	LRRC6	Q86X45	466 aa		13.36	□□□□□ -0.27
TPTEP1-204	ENST00000426585	SPATA2L	Q8IUW3	424 aa	Predicted RBP	13.36	□□□□□ -0.27
TPTEP1-204	ENST00000426585	TFB1M	Q8WVM0	346 aa	Known RBP	13.36	□□□□□ -0.27
TPTEP1-204	ENST00000426585	SPON2	Q9BUD6	331 aa		13.36	□□□□□ -0.27
TPTEP1-204	ENST00000426585	SUFU	Q9UMX1	484 aa		13.36	□□□□□ -0.27
TPTEP1-204	ENST00000426585	MST1R	Q04912	1400 aa		13.36	□□□□□ -0.27
TPTEP1-204	ENST00000426585	LSM8	O95777	96 aa	Known RBP	13.36	□□□□□ -0.27
TPTEP1-204	ENST00000426585	KCNA2	P16389	499 aa		13.36	□□□□□ -0.27
TPTEP1-204	ENST00000426585	TRIP10	Q15642	601 aa		13.36	□□□□□ -0.27
TPTEP1-204	ENST00000426585	USP33	Q8TEY7	942 aa		13.36	□□□□□ -0.27
TPTEP1-204	ENST00000426585	RMDN1	Q96DB5	314 aa		13.36	□□□□□ -0.27
TPTEP1-204	ENST00000426585	AGO4	Q9HCK5	861 aa	Known RBP	13.36	□□□□□ -0.27
TPTEP1-204	ENST00000426585	HEY2	Q9UBP5	337 aa		13.36	□□□□□ -0.27
TPTEP1-204	ENST00000426585	BMP6	P22004	513 aa		13.36	□□□□□ -0.27
TPTEP1-204	ENST00000426585	SHMT1	P34896	483 aa		13.36	□□□□□ -0.27
TPTEP1-204	ENST00000426585	ASPSCR1	Q9BZE9	553 aa		13.36	□□□□□ -0.27
TPTEP1-204	ENST00000426585	DDX20	Q9UHI6	824 aa	Known RBP	13.36	□□□□□ -0.27
TPTEP1-204	ENST00000426585	BCL9	O00512	1426 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TPTEP1-204	ENST00000426585	LOC102724159	A0A0B4J2E5	919 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TPTEP1-204	ENST00000426585	AIM2	O14862	343 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TPTEP1-204	ENST00000426585	SRP72	O76094	671 aa	Known RBP	13.35	□□□□□ -0.27
TPTEP1-204	ENST00000426585	ZBTB7A	O95365	584 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TPTEP1-204	ENST00000426585	FAM153B	P0C7A2	387 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TPTEP1-204	ENST00000426585	SUPT20HL2	P0C7V6	817 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TPTEP1-204	ENST00000426585	GRIK1	P39086	918 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TPTEP1-204	ENST00000426585	RECQL	P46063	649 aa	Predicted RBP	13.35	□□□□□ -0.27
TPTEP1-204	ENST00000426585	IRX1	P78414	480 aa	Predicted RBP	13.35	□□□□□ -0.27
TPTEP1-204	ENST00000426585	ZNF844	Q08AG5	666 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TPTEP1-204	ENST00000426585	OVGP1	Q12889	678 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TPTEP1-204	ENST00000426585	LAMB3	Q13751	1172 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TPTEP1-204	ENST00000426585	PWP2	Q15269	919 aa	Known RBP	13.35	□□□□□ -0.27
TPTEP1-204	ENST00000426585	CYTH1	Q15438	398 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TPTEP1-204	ENST00000426585	FAM153C	Q494X1	144 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TPTEP1-204	ENST00000426585	C2CD6	Q53TS8	623 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TPTEP1-204	ENST00000426585	TAS2R42	Q7RTR8	314 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TPTEP1-204	ENST00000426585	KDELC2	Q7Z4H8	507 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TPTEP1-204	ENST00000426585	SLC35C1	Q96A29	364 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TPTEP1-204	ENST00000426585	POP1	Q99575	1024 aa	Known RBP	13.35	□□□□□ -0.27
TPTEP1-204	ENST00000426585	MTMR12	Q9C0I1	747 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TPTEP1-204	ENST00000426585	FAM153A	Q9UHL3	310 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TPTEP1-204	ENST00000426585	CASZ1	Q86V15	1759 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TPTEP1-204	ENST00000426585	TNFRSF8	P28908	595 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TPTEP1-204	ENST00000426585	HDAC4	P56524	1084 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TPTEP1-204	ENST00000426585	SKOR1	P84550	965 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TPTEP1-204	ENST00000426585	OTUD4	Q01804	1114 aa	Known RBP	13.35	□□□□□ -0.27
TPTEP1-204	ENST00000426585	PDK2	Q15119	407 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TPTEP1-204	ENST00000426585	NT5DC3	Q86UY8	548 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TPTEP1-204	ENST00000426585	DNAAF5	Q86Y56	855 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TPTEP1-204	ENST00000426585	CALML6	Q8TD86	181 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TPTEP1-204	ENST00000426585	STX18	Q9P2W9	335 aa	Known RBP	13.35	□□□□□ -0.27
TPTEP1-204	ENST00000426585	HAO1	Q9UJM8	370 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TPTEP1-204	ENST00000426585	TMEM247	A6NEH6	219 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TPTEP1-204	ENST00000426585	RGL2	O15211	777 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TPTEP1-204	ENST00000426585	GLRA3	O75311	464 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TPTEP1-204	ENST00000426585	ACADS	P16219	412 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TPTEP1-204	ENST00000426585	CPA2	P48052	419 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TPTEP1-204	ENST00000426585	DCAF6	Q58WW2	860 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TPTEP1-204	ENST00000426585	SPDYC	Q5MJ68	293 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TPTEP1-204	ENST00000426585	SLC7A14	Q8TBB6	771 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TPTEP1-204	ENST00000426585	SEMA4A	Q9H3S1	761 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TPTEP1-204	ENST00000426585	CCDC134	Q9H6E4	229 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TPTEP1-204	ENST00000426585	KIF17	Q9P2E2	1029 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TPTEP1-204	ENST00000426585	TJP2	Q9UDY2	1190 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TPTEP1-204	ENST00000426585	RIC1	Q4ADV7	1423 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TPTEP1-204	ENST00000426585	ADCY3	O60266	1144 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TPTEP1-204	ENST00000426585	TMCC1	O94876	653 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TPTEP1-204	ENST00000426585	COPA	P53621	1224 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TPTEP1-204	ENST00000426585	PDAP1	Q13442	181 aa	Known RBP	13.35	□□□□□ -0.27
TPTEP1-204	ENST00000426585	EIF1AD	Q8N9N8	165 aa	Known RBP	13.35	□□□□□ -0.27
TPTEP1-204	ENST00000426585	ZNF669	Q96BR6	464 aa	Predicted RBP	13.35	□□□□□ -0.27
TPTEP1-204	ENST00000426585	PRMT6	Q96LA8	375 aa	Predicted RBP	13.35	□□□□□ -0.27
TPTEP1-204	ENST00000426585	MTMR9	Q96QG7	549 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TPTEP1-204	ENST00000426585	NUDT12	Q9BQG2	462 aa		13.35	□□□□□ -0.27

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