RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000424082.6

RALGPS1-208, Transcript of Ral GEF with PH domain and SH3 binding motif 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RALGPS1, Length 2,362 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALGPS1-208ENST00000424082 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP19.29■□□□□ 0.68
RALGPS1-208ENST00000424082 CCDC22O60826 627 aa19.29■□□□□ 0.68
RALGPS1-208ENST00000424082 RPS12P25398 132 aaKnown RBP19.29■□□□□ 0.68
RALGPS1-208ENST00000424082 ARSEP51690 589 aa19.29■□□□□ 0.68
RALGPS1-208ENST00000424082 MTHFD1LQ6UB35 978 aa19.29■□□□□ 0.68
RALGPS1-208ENST00000424082 ZNF677Q86XU0 584 aa19.29■□□□□ 0.68
RALGPS1-208ENST00000424082 PHC3Q8NDX5 983 aa19.29■□□□□ 0.68
RALGPS1-208ENST00000424082 BICD1Q96G01 975 aa19.29■□□□□ 0.68
RALGPS1-208ENST00000424082 TAAR1Q96RJ0 339 aa19.29■□□□□ 0.68
RALGPS1-208ENST00000424082 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP19.29■□□□□ 0.68
RALGPS1-208ENST00000424082 PLA2G6O60733 806 aa19.28■□□□□ 0.68
RALGPS1-208ENST00000424082 BANF1O75531 89 aa19.28■□□□□ 0.68
RALGPS1-208ENST00000424082 KRT36O76013 467 aa19.28■□□□□ 0.68
RALGPS1-208ENST00000424082 SKIP12755 728 aa19.28■□□□□ 0.68
RALGPS1-208ENST00000424082 NOMO3P69849 1222 aa19.28■□□□□ 0.68
RALGPS1-208ENST00000424082 GPS1Q13098 491 aa19.28■□□□□ 0.68
RALGPS1-208ENST00000424082 CCDC142Q17RM4 750 aa19.28■□□□□ 0.68
RALGPS1-208ENST00000424082 LIN9Q5TKA1 542 aa19.28■□□□□ 0.68
RALGPS1-208ENST00000424082 ZBED8Q8IZ13 594 aa19.28■□□□□ 0.68
RALGPS1-208ENST00000424082 RFWD2Q8NHY2 731 aa19.28■□□□□ 0.68
RALGPS1-208ENST00000424082 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP19.28■□□□□ 0.68
RALGPS1-208ENST00000424082 ARL8BQ9NVJ2 186 aa19.28■□□□□ 0.68
RALGPS1-208ENST00000424082 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa19.28■□□□□ 0.68
RALGPS1-208ENST00000424082 WDR64B1ANS9 1081 aa19.28■□□□□ 0.68
RALGPS1-208ENST00000424082 GSC2O15499 205 aa19.28■□□□□ 0.68
RALGPS1-208ENST00000424082 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP19.28■□□□□ 0.68
RALGPS1-208ENST00000424082 ZWINTO95229 277 aa19.28■□□□□ 0.68
RALGPS1-208ENST00000424082 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP19.28■□□□□ 0.68
RALGPS1-208ENST00000424082 RPS6KA3P51812 740 aa19.28■□□□□ 0.68
RALGPS1-208ENST00000424082 RPL7AP62424 266 aaKnown RBP19.28■□□□□ 0.68
RALGPS1-208ENST00000424082 ACSBG2Q5FVE4 666 aa19.28■□□□□ 0.68
RALGPS1-208ENST00000424082 TMEM270Q6UE05 265 aa19.28■□□□□ 0.68
RALGPS1-208ENST00000424082 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa19.28■□□□□ 0.68
RALGPS1-208ENST00000424082 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP19.28■□□□□ 0.68
RALGPS1-208ENST00000424082 HAUS1Q96CS2 278 aa19.28■□□□□ 0.68
RALGPS1-208ENST00000424082 DCTN4Q9UJW0 460 aa19.28■□□□□ 0.68
RALGPS1-208ENST00000424082 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP19.27■□□□□ 0.68
RALGPS1-208ENST00000424082 PIAS1O75925 651 aa19.27■□□□□ 0.68
RALGPS1-208ENST00000424082 TNNI1P19237 187 aa19.27■□□□□ 0.68
RALGPS1-208ENST00000424082 SLC34A1Q06495 639 aa19.27■□□□□ 0.68
RALGPS1-208ENST00000424082 KPNB1Q14974 876 aaKnown RBP19.27■□□□□ 0.68
RALGPS1-208ENST00000424082 WDR44Q5JSH3 913 aa19.27■□□□□ 0.68
RALGPS1-208ENST00000424082 FOXB2Q5VYV0 432 aa19.27■□□□□ 0.68
RALGPS1-208ENST00000424082 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP19.27■□□□□ 0.68
RALGPS1-208ENST00000424082 MFSD7Q6UXD7 560 aa19.27■□□□□ 0.68
RALGPS1-208ENST00000424082 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP19.27■□□□□ 0.68
RALGPS1-208ENST00000424082 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP19.27■□□□□ 0.68
RALGPS1-208ENST00000424082 PTPRJQ12913 1337 aa19.27■□□□□ 0.68
RALGPS1-208ENST00000424082 HLA-DRAP01903 254 aa19.27■□□□□ 0.67
RALGPS1-208ENST00000424082 TNFAIP1Q13829 316 aa19.27■□□□□ 0.67
RALGPS1-208ENST00000424082 PGM5Q15124 567 aa19.27■□□□□ 0.67
RALGPS1-208ENST00000424082 LRRC74BQ6ZQY2 392 aa19.27■□□□□ 0.67
RALGPS1-208ENST00000424082 CEP170P1Q96L14 293 aa19.27■□□□□ 0.67
RALGPS1-208ENST00000424082 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa19.27■□□□□ 0.67
RALGPS1-208ENST00000424082 ANKEF1Q9NU02 776 aa19.27■□□□□ 0.67
RALGPS1-208ENST00000424082 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP19.27■□□□□ 0.67
RALGPS1-208ENST00000424082 SLC24A2Q9UI40 661 aa19.27■□□□□ 0.67
RALGPS1-208ENST00000424082 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP19.26■□□□□ 0.67
RALGPS1-208ENST00000424082 GOLGA8SH3BPF8 625 aa19.26■□□□□ 0.67
RALGPS1-208ENST00000424082 GOLGA8MH3BSY2 632 aa19.26■□□□□ 0.67
RALGPS1-208ENST00000424082 CAPN9O14815 690 aa19.26■□□□□ 0.67
RALGPS1-208ENST00000424082 HAUS5O94927 633 aa19.26■□□□□ 0.67
RALGPS1-208ENST00000424082 PSMG1O95456 288 aa19.26■□□□□ 0.67
RALGPS1-208ENST00000424082 ACO1P21399 889 aaKnown RBP19.26■□□□□ 0.67
RALGPS1-208ENST00000424082 GNA15P30679 374 aa19.26■□□□□ 0.67
RALGPS1-208ENST00000424082 PIK3CAP42336 1068 aa19.26■□□□□ 0.67
RALGPS1-208ENST00000424082 BPIFB4P59827 614 aa19.26■□□□□ 0.67
RALGPS1-208ENST00000424082 NOP14P78316 857 aaKnown RBP19.26■□□□□ 0.67
RALGPS1-208ENST00000424082 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP19.26■□□□□ 0.67
RALGPS1-208ENST00000424082 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa19.26■□□□□ 0.67
RALGPS1-208ENST00000424082 TAS1R3Q7RTX0 852 aa19.26■□□□□ 0.67
RALGPS1-208ENST00000424082 SLITRK1Q96PX8 696 aa19.26■□□□□ 0.67
RALGPS1-208ENST00000424082 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP19.26■□□□□ 0.67
RALGPS1-208ENST00000424082 TUBB6Q9BUF5 446 aa19.26■□□□□ 0.67
RALGPS1-208ENST00000424082 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP19.26■□□□□ 0.67
RALGPS1-208ENST00000424082 LTBP3Q9NS15 1303 aa19.26■□□□□ 0.67
RALGPS1-208ENST00000424082 WDR91A4D1P6 747 aa19.26■□□□□ 0.67
RALGPS1-208ENST00000424082 CFAP69A5D8W1 941 aa19.26■□□□□ 0.67
RALGPS1-208ENST00000424082 GSTA2P09210 222 aa19.26■□□□□ 0.67
RALGPS1-208ENST00000424082 KRT4P19013 534 aa19.26■□□□□ 0.67
RALGPS1-208ENST00000424082 ADRA1DP25100 572 aa19.26■□□□□ 0.67
RALGPS1-208ENST00000424082 ACOT2P49753 483 aa19.26■□□□□ 0.67
RALGPS1-208ENST00000424082 JAK3P52333 1124 aa19.26■□□□□ 0.67
RALGPS1-208ENST00000424082 RPS6P62753 249 aaKnown RBP19.26■□□□□ 0.67
RALGPS1-208ENST00000424082 OVGP1Q12889 678 aa19.26■□□□□ 0.67
RALGPS1-208ENST00000424082 ANKMY2Q8IV38 441 aa19.26■□□□□ 0.67
RALGPS1-208ENST00000424082 ABRAQ8N0Z2 381 aa19.26■□□□□ 0.67
RALGPS1-208ENST00000424082 ALLCQ8N6M5 410 aa19.26■□□□□ 0.67
RALGPS1-208ENST00000424082 NSL1Q96IY1 281 aa19.26■□□□□ 0.67
RALGPS1-208ENST00000424082 TRIM4Q9C037 500 aa19.26■□□□□ 0.67
RALGPS1-208ENST00000424082 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP19.26■□□□□ 0.67
RALGPS1-208ENST00000424082 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP19.26■□□□□ 0.67
RALGPS1-208ENST00000424082 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP19.26■□□□□ 0.67
RALGPS1-208ENST00000424082 HEY2Q9UBP5 337 aa19.26■□□□□ 0.67
RALGPS1-208ENST00000424082 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa19.26■□□□□ 0.67
RALGPS1-208ENST00000424082 TBX10O75333 385 aa19.25■□□□□ 0.67
RALGPS1-208ENST00000424082 RASA2Q15283 850 aa19.25■□□□□ 0.67
RALGPS1-208ENST00000424082 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP19.25■□□□□ 0.67
RALGPS1-208ENST00000424082 ZACNQ401N2 412 aa19.25■□□□□ 0.67
RALGPS1-208ENST00000424082 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.8 ms