RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000423855.6

RNPC3-201, Transcript of RNA binding region (RNP1, RRM) containing 3, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene RNPC3, Length 1,872 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNPC3-201ENST00000423855 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa9.89□□□□□ -0.83
RNPC3-201ENST00000423855 NR2E3Q9Y5X4 410 aa9.89□□□□□ -0.83
RNPC3-201ENST00000423855 CTAGE15A4D2H0 777 aa9.89□□□□□ -0.83
RNPC3-201ENST00000423855 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa9.89□□□□□ -0.83
RNPC3-201ENST00000423855 CYB561D2O14569 222 aa9.89□□□□□ -0.83
RNPC3-201ENST00000423855 HUS1O60921 280 aa9.89□□□□□ -0.83
RNPC3-201ENST00000423855 SRGAP2O75044 1071 aa9.89□□□□□ -0.83
RNPC3-201ENST00000423855 EFEMP2O95967 443 aa9.89□□□□□ -0.83
RNPC3-201ENST00000423855 H2AFZP0C0S5 128 aa9.89□□□□□ -0.83
RNPC3-201ENST00000423855 CCDC172P0C7W6 258 aa9.89□□□□□ -0.83
RNPC3-201ENST00000423855 CTAGE8P0CG41 777 aa9.89□□□□□ -0.83
RNPC3-201ENST00000423855 CYP11B1P15538 503 aa9.89□□□□□ -0.83
RNPC3-201ENST00000423855 CHRNB2P17787 502 aa9.89□□□□□ -0.83
RNPC3-201ENST00000423855 NDST1P52848 882 aa9.89□□□□□ -0.83
RNPC3-201ENST00000423855 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
RNPC3-201ENST00000423855 MEI1Q5TIA1 1274 aa9.89□□□□□ -0.83
RNPC3-201ENST00000423855 WSCD1Q658N2 575 aa9.89□□□□□ -0.83
RNPC3-201ENST00000423855 H2AFVQ71UI9 128 aa9.89□□□□□ -0.83
RNPC3-201ENST00000423855 CTAGE6Q86UF2 777 aa9.89□□□□□ -0.83
RNPC3-201ENST00000423855 VPS36Q86VN1 386 aa9.89□□□□□ -0.83
RNPC3-201ENST00000423855 PALB2Q86YC2 1186 aa9.89□□□□□ -0.83
RNPC3-201ENST00000423855 HERC6Q8IVU3 1022 aa9.89□□□□□ -0.83
RNPC3-201ENST00000423855 CTAGE4Q8IX94 777 aa9.89□□□□□ -0.83
RNPC3-201ENST00000423855 SLC4A11Q8NBS3 891 aa9.89□□□□□ -0.83
RNPC3-201ENST00000423855 APPL2Q8NEU8 664 aa9.89□□□□□ -0.83
RNPC3-201ENST00000423855 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa9.89□□□□□ -0.83
RNPC3-201ENST00000423855 SUSD3Q96L08 255 aa9.89□□□□□ -0.83
RNPC3-201ENST00000423855 ALS2CR12Q96Q35 445 aa9.89□□□□□ -0.83
RNPC3-201ENST00000423855 SLC9A7Q96T83 725 aa9.89□□□□□ -0.83
RNPC3-201ENST00000423855 YME1L1Q96TA2 773 aa9.89□□□□□ -0.83
RNPC3-201ENST00000423855 AGPAT1Q99943 283 aa9.89□□□□□ -0.83
RNPC3-201ENST00000423855 ZSWIM1Q9BR11 485 aa9.89□□□□□ -0.83
RNPC3-201ENST00000423855 TMEM175Q9BSA9 504 aa9.89□□□□□ -0.83
RNPC3-201ENST00000423855 ISCUQ9H1K1 167 aa9.89□□□□□ -0.83
RNPC3-201ENST00000423855 EPC1Q9H2F5 836 aa9.89□□□□□ -0.83
RNPC3-201ENST00000423855 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
RNPC3-201ENST00000423855 ZNF446Q9NWS9 450 aa9.89□□□□□ -0.83
RNPC3-201ENST00000423855 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
RNPC3-201ENST00000423855 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
RNPC3-201ENST00000423855 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
RNPC3-201ENST00000423855 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa9.89□□□□□ -0.83
RNPC3-201ENST00000423855 NCANO14594 1321 aa9.89□□□□□ -0.83
RNPC3-201ENST00000423855 C5orf42Q9H799 3197 aa9.88□□□□□ -0.83
RNPC3-201ENST00000423855 LCHNA4D1U4 455 aa9.88□□□□□ -0.83
RNPC3-201ENST00000423855 GABRDO14764 452 aa9.88□□□□□ -0.83
RNPC3-201ENST00000423855 BUB1O43683 1085 aa9.88□□□□□ -0.83
RNPC3-201ENST00000423855 PALMO75781 387 aa9.88□□□□□ -0.83
RNPC3-201ENST00000423855 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP9.88□□□□□ -0.83
RNPC3-201ENST00000423855 CYP11A1P05108 521 aa9.88□□□□□ -0.83
RNPC3-201ENST00000423855 TMEM253P0C7T8 217 aa9.88□□□□□ -0.83
RNPC3-201ENST00000423855 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
RNPC3-201ENST00000423855 TCP1P17987 556 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
RNPC3-201ENST00000423855 WARSP23381 471 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
RNPC3-201ENST00000423855 LMO2P25791 158 aa9.88□□□□□ -0.83
RNPC3-201ENST00000423855 CLCN6P51797 869 aa9.88□□□□□ -0.83
RNPC3-201ENST00000423855 GALCP54803 685 aa9.88□□□□□ -0.83
RNPC3-201ENST00000423855 HADHBP55084 474 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
RNPC3-201ENST00000423855 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
RNPC3-201ENST00000423855 CCDC142Q17RM4 750 aa9.88□□□□□ -0.83
RNPC3-201ENST00000423855 TEX35Q5T0J7 233 aa9.88□□□□□ -0.83
RNPC3-201ENST00000423855 SMYD5Q6GMV2 418 aa9.88□□□□□ -0.83
RNPC3-201ENST00000423855 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
RNPC3-201ENST00000423855 GLYCTKQ8IVS8 523 aa9.88□□□□□ -0.83
RNPC3-201ENST00000423855 NOA1Q8NC60 698 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
RNPC3-201ENST00000423855 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
RNPC3-201ENST00000423855 COG1Q8WTW3 980 aa9.88□□□□□ -0.83
RNPC3-201ENST00000423855 TFAP2BQ92481 460 aa9.88□□□□□ -0.83
RNPC3-201ENST00000423855 OSBPL9Q96SU4 736 aa9.88□□□□□ -0.83
RNPC3-201ENST00000423855 RTP3Q9BQQ7 232 aa9.88□□□□□ -0.83
RNPC3-201ENST00000423855 VN1R3Q9BXE9 311 aa9.88□□□□□ -0.83
RNPC3-201ENST00000423855 PARD6BQ9BYG5 372 aa9.88□□□□□ -0.83
RNPC3-201ENST00000423855 GPR62Q9BZJ7 368 aa9.88□□□□□ -0.83
RNPC3-201ENST00000423855 DPEP3Q9H4B8 488 aa9.88□□□□□ -0.83
RNPC3-201ENST00000423855 ADAM28Q9UKQ2 775 aa9.88□□□□□ -0.83
RNPC3-201ENST00000423855 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa9.88□□□□□ -0.83
RNPC3-201ENST00000423855 HYOU1Q9Y4L1 999 aa9.88□□□□□ -0.83
RNPC3-201ENST00000423855 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa9.88□□□□□ -0.83
RNPC3-201ENST00000423855 ZNF185O15231 689 aa9.87□□□□□ -0.83
RNPC3-201ENST00000423855 ALDH2P05091 517 aa9.87□□□□□ -0.83
RNPC3-201ENST00000423855 CFHP08603 1231 aa9.87□□□□□ -0.83
RNPC3-201ENST00000423855 ODC1P11926 461 aa9.87□□□□□ -0.83
RNPC3-201ENST00000423855 BRD2P25440 801 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
RNPC3-201ENST00000423855 GNA15P30679 374 aa9.87□□□□□ -0.83
RNPC3-201ENST00000423855 PDE6CP51160 858 aa9.87□□□□□ -0.83
RNPC3-201ENST00000423855 CKAP4Q07065 602 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
RNPC3-201ENST00000423855 SHHQ15465 462 aa9.87□□□□□ -0.83
RNPC3-201ENST00000423855 KIAA0319Q5VV43 1072 aa9.87□□□□□ -0.83
RNPC3-201ENST00000423855 TAF3Q5VWG9 929 aa9.87□□□□□ -0.83
RNPC3-201ENST00000423855 DSTYKQ6XUX3 929 aa9.87□□□□□ -0.83
RNPC3-201ENST00000423855 DPH6Q7L8W6 267 aa9.87□□□□□ -0.83
RNPC3-201ENST00000423855 TPCN2Q8NHX9 752 aa9.87□□□□□ -0.83
RNPC3-201ENST00000423855 GDF15Q99988 308 aa9.87□□□□□ -0.83
RNPC3-201ENST00000423855 ABCB6Q9NP58 842 aa9.87□□□□□ -0.83
RNPC3-201ENST00000423855 FAN1Q9Y2M0 1017 aa9.87□□□□□ -0.83
RNPC3-201ENST00000423855 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa9.87□□□□□ -0.83
RNPC3-201ENST00000423855 PATJQ8NI35 1801 aa9.87□□□□□ -0.83
RNPC3-201ENST00000423855 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP9.87□□□□□ -0.838e-6■■■■■ 107
RNPC3-201ENST00000423855 H0YGN5 161 aa9.87□□□□□ -0.83
RNPC3-201ENST00000423855 CES2O00748 559 aa9.87□□□□□ -0.83
RNPC3-201ENST00000423855 ARHGEF15O94989 841 aa9.87□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.8 ms