RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000416918.5

TRAPPC12-205, Transcript of trafficking protein particle complex 12, humanhuman

TSL 3

Gene TRAPPC12, Length 473 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC12-205ENST00000416918 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa11.66□□□□□ -0.54
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TRAPPC12-205ENST00000416918 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa11.66□□□□□ -0.54
TRAPPC12-205ENST00000416918 TOP6BLQ8N6T0 577 aa11.66□□□□□ -0.54
TRAPPC12-205ENST00000416918 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
TRAPPC12-205ENST00000416918 OSMRQ99650 979 aa11.66□□□□□ -0.54
TRAPPC12-205ENST00000416918 ELOVL4Q9GZR5 314 aa11.66□□□□□ -0.54
TRAPPC12-205ENST00000416918 SNTG2Q9NY99 539 aa11.66□□□□□ -0.54
TRAPPC12-205ENST00000416918 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa11.66□□□□□ -0.54
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TRAPPC12-205ENST00000416918 ZNF487B1APH4 448 aa11.65□□□□□ -0.54
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TRAPPC12-205ENST00000416918 DAPK3O43293 454 aa11.65□□□□□ -0.54
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TRAPPC12-205ENST00000416918 GOLGA6DP0CG33 693 aa11.65□□□□□ -0.54
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TRAPPC12-205ENST00000416918 NDST1P52848 882 aa11.65□□□□□ -0.54
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TRAPPC12-205ENST00000416918 ZNF394Q53GI3 561 aa11.65□□□□□ -0.54
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TRAPPC12-205ENST00000416918 TFDP3Q5H9I0 405 aa11.65□□□□□ -0.54
TRAPPC12-205ENST00000416918 DENND1BQ6P3S1 775 aa11.65□□□□□ -0.54
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TRAPPC12-205ENST00000416918 TMEM110Q86TL2 294 aa11.65□□□□□ -0.54
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TRAPPC12-205ENST00000416918 CCDC50Q8IVM0 306 aa11.65□□□□□ -0.54
TRAPPC12-205ENST00000416918 MAP7D3Q8IWC1 876 aa11.65□□□□□ -0.54
TRAPPC12-205ENST00000416918 FAM76AQ8TAV0 307 aa11.65□□□□□ -0.54
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TRAPPC12-205ENST00000416918 BTBD6Q96KE9 485 aa11.65□□□□□ -0.54
TRAPPC12-205ENST00000416918 HSFY1Q96LI6 401 aa11.65□□□□□ -0.54
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TRAPPC12-205ENST00000416918 CNPY3Q9BT09 278 aa11.65□□□□□ -0.54
TRAPPC12-205ENST00000416918 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
TRAPPC12-205ENST00000416918 SNX25Q9H3E2 840 aa11.65□□□□□ -0.54
TRAPPC12-205ENST00000416918 SMYD3Q9H7B4 428 aa11.65□□□□□ -0.54
TRAPPC12-205ENST00000416918 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa11.65□□□□□ -0.54
TRAPPC12-205ENST00000416918 GINS2Q9Y248 185 aa11.65□□□□□ -0.54
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TRAPPC12-205ENST00000416918 ZNF623O75123 536 aa11.64□□□□□ -0.55
TRAPPC12-205ENST00000416918 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
TRAPPC12-205ENST00000416918 SYF2O95926 243 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
TRAPPC12-205ENST00000416918 MYZAPP0CAP1 466 aa11.64□□□□□ -0.55
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TRAPPC12-205ENST00000416918 PSMA2P25787 234 aa11.64□□□□□ -0.55
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TRAPPC12-205ENST00000416918 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
TRAPPC12-205ENST00000416918 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
TRAPPC12-205ENST00000416918 PTPROQ16827 1216 aa11.64□□□□□ -0.55
TRAPPC12-205ENST00000416918 PTPN20Q4JDL3 420 aa11.64□□□□□ -0.55
TRAPPC12-205ENST00000416918 ZNF365Q70YC5 407 aa11.64□□□□□ -0.55
TRAPPC12-205ENST00000416918 TMC3Q7Z5M5 1100 aa11.64□□□□□ -0.55
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TRAPPC12-205ENST00000416918 XYLT1Q86Y38 959 aa11.64□□□□□ -0.55
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TRAPPC12-205ENST00000416918 SNF8Q96H20 258 aa11.64□□□□□ -0.55
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TRAPPC12-205ENST00000416918 TMEM109Q9BVC6 243 aa11.64□□□□□ -0.55
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TRAPPC12-205ENST00000416918 DCLK3Q9C098 648 aa11.64□□□□□ -0.55
TRAPPC12-205ENST00000416918 SDCBP2Q9H190 292 aa11.64□□□□□ -0.55
TRAPPC12-205ENST00000416918 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa11.64□□□□□ -0.55
TRAPPC12-205ENST00000416918 VPS18Q9P253 973 aa11.64□□□□□ -0.55
TRAPPC12-205ENST00000416918 SNX9Q9Y5X1 595 aa11.64□□□□□ -0.55
TRAPPC12-205ENST00000416918 ESYT3A0FGR9 886 aa11.63□□□□□ -0.55
TRAPPC12-205ENST00000416918 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
TRAPPC12-205ENST00000416918 H3BQF6 201 aa11.63□□□□□ -0.55
TRAPPC12-205ENST00000416918 AGPSO00116 658 aa11.63□□□□□ -0.55
TRAPPC12-205ENST00000416918 RPS6KA5O75582 802 aa11.63□□□□□ -0.55
TRAPPC12-205ENST00000416918 CFHP08603 1231 aa11.63□□□□□ -0.55
TRAPPC12-205ENST00000416918 NUDT17P0C025 328 aa11.63□□□□□ -0.55
TRAPPC12-205ENST00000416918 RALAP11233 206 aa11.63□□□□□ -0.55
TRAPPC12-205ENST00000416918 WARSP23381 471 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
TRAPPC12-205ENST00000416918 ECHS1P30084 290 aa11.63□□□□□ -0.55
TRAPPC12-205ENST00000416918 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
TRAPPC12-205ENST00000416918 RPL34P49207 117 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
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