RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409300.5

RAD9B-204, Transcript of RAD9 checkpoint clamp component B, human

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene RAD9B, Length 2,732 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RAD9B-204	ENST00000409300	GATM	P50440	423 aa		11.92	□□□□□ -0.5
RAD9B-204	ENST00000409300	C1QBP	Q07021	282 aa	Known RBP	11.92	□□□□□ -0.5
RAD9B-204	ENST00000409300	MAMLD1	Q13495	774 aa		11.92	□□□□□ -0.5
RAD9B-204	ENST00000409300	LRRC26	Q2I0M4	334 aa		11.92	□□□□□ -0.5
RAD9B-204	ENST00000409300	GOLGA7B	Q2TAP0	167 aa		11.92	□□□□□ -0.5
RAD9B-204	ENST00000409300	PTPN20	Q4JDL3	420 aa		11.92	□□□□□ -0.5
RAD9B-204	ENST00000409300	NOMO2	Q5JPE7	1267 aa		11.92	□□□□□ -0.5
RAD9B-204	ENST00000409300	SLFN11	Q7Z7L1	901 aa		11.92	□□□□□ -0.5
RAD9B-204	ENST00000409300	CPNE8	Q86YQ8	564 aa		11.92	□□□□□ -0.5
RAD9B-204	ENST00000409300	TOP6BL	Q8N6T0	577 aa		11.92	□□□□□ -0.5
RAD9B-204	ENST00000409300	MS4A14	Q96JA4	679 aa		11.92	□□□□□ -0.5
RAD9B-204	ENST00000409300	VCPIP1	Q96JH7	1222 aa		11.92	□□□□□ -0.5
RAD9B-204	ENST00000409300	TMEM106C	Q9BVX2	250 aa		11.92	□□□□□ -0.5
RAD9B-204	ENST00000409300	FAM124B	Q9H5Z6	455 aa	Predicted RBP	11.92	□□□□□ -0.5
RAD9B-204	ENST00000409300	C11orf49	Q9H6J7	331 aa		11.92	□□□□□ -0.5
RAD9B-204	ENST00000409300	TMEM161A	Q9NX61	479 aa		11.92	□□□□□ -0.5
RAD9B-204	ENST00000409300	KIAA1257	Q9ULG3	409 aa		11.92	□□□□□ -0.5
RAD9B-204	ENST00000409300	LRFN2	Q9ULH4	789 aa		11.92	□□□□□ -0.5
RAD9B-204	ENST00000409300	GOLGA8S	H3BPF8	625 aa		11.92	□□□□□ -0.5
RAD9B-204	ENST00000409300	UPP2	O95045	317 aa		11.92	□□□□□ -0.5
RAD9B-204	ENST00000409300	KIF4A	O95239	1232 aa		11.92	□□□□□ -0.5
RAD9B-204	ENST00000409300	COMT	P21964	271 aa		11.92	□□□□□ -0.5
RAD9B-204	ENST00000409300	CDH5	P33151	784 aa	Predicted RBP	11.92	□□□□□ -0.5
RAD9B-204	ENST00000409300	RPL7A	P62424	266 aa	Known RBP	11.92	□□□□□ -0.5
RAD9B-204	ENST00000409300	TUBB2A	Q13885	445 aa		11.92	□□□□□ -0.5
RAD9B-204	ENST00000409300	WHAMMP3	Q1A5X7	153 aa		11.92	□□□□□ -0.5
RAD9B-204	ENST00000409300	DAB2IP	Q5VWQ8	1189 aa		11.92	□□□□□ -0.5
RAD9B-204	ENST00000409300	LCLAT1	Q6UWP7	414 aa		11.92	□□□□□ -0.5
RAD9B-204	ENST00000409300	OSTM1	Q86WC4	334 aa		11.92	□□□□□ -0.5
RAD9B-204	ENST00000409300	URGCP	Q8TCY9	931 aa		11.92	□□□□□ -0.5
RAD9B-204	ENST00000409300	FAM193B	Q96PV7	902 aa	Predicted RBP	11.92	□□□□□ -0.5
RAD9B-204	ENST00000409300	TUBB2B	Q9BVA1	445 aa		11.92	□□□□□ -0.5
RAD9B-204	ENST00000409300	TBC1D13	Q9NVG8	400 aa		11.92	□□□□□ -0.5
RAD9B-204	ENST00000409300	DDX43	Q9NXZ2	648 aa	Known RBP	11.92	□□□□□ -0.5
RAD9B-204	ENST00000409300	DNAJB4	Q9UDY4	337 aa		11.92	□□□□□ -0.5
RAD9B-204	ENST00000409300	MYO1F	O00160	1098 aa		11.91	□□□□□ -0.5
RAD9B-204	ENST00000409300	TULP2	O00295	520 aa		11.91	□□□□□ -0.5
RAD9B-204	ENST00000409300	SPOP	O43791	374 aa		11.91	□□□□□ -0.5
RAD9B-204	ENST00000409300	CALB1	P05937	261 aa		11.91	□□□□□ -0.5
RAD9B-204	ENST00000409300	CLTB	P09497	229 aa		11.91	□□□□□ -0.5
RAD9B-204	ENST00000409300	OR1G1	P47890	313 aa		11.91	□□□□□ -0.5
RAD9B-204	ENST00000409300	RGS7	P49802	495 aa		11.91	□□□□□ -0.5
RAD9B-204	ENST00000409300	TERF1	P54274	439 aa		11.91	□□□□□ -0.5
RAD9B-204	ENST00000409300	ERCC6L	Q2NKX8	1250 aa		11.91	□□□□□ -0.5
RAD9B-204	ENST00000409300	CCDC181	Q5TID7	509 aa		11.91	□□□□□ -0.5
RAD9B-204	ENST00000409300	CREG2	Q8IUH2	290 aa		11.91	□□□□□ -0.5
RAD9B-204	ENST00000409300	B3GALNT2	Q8NCR0	500 aa		11.91	□□□□□ -0.5
RAD9B-204	ENST00000409300	DDX27	Q96GQ7	796 aa	Known RBP	11.91	□□□□□ -0.5
RAD9B-204	ENST00000409300	MRPL47	Q9HD33	250 aa	Known RBP	11.91	□□□□□ -0.5
RAD9B-204	ENST00000409300	AVEN	Q9NQS1	362 aa	Predicted RBP	11.91	□□□□□ -0.5
RAD9B-204	ENST00000409300	PARVA	Q9NVD7	372 aa		11.91	□□□□□ -0.5
RAD9B-204	ENST00000409300	HESX1	Q9UBX0	185 aa		11.91	□□□□□ -0.5
RAD9B-204	ENST00000409300	PRG3	Q9Y2Y8	225 aa	Predicted RBP	11.91	□□□□□ -0.5
RAD9B-204	ENST00000409300	LOC101059915	A0A1B0GWI6	518 aa	Predicted RBP	11.91	□□□□□ -0.5
RAD9B-204	ENST00000409300	PDE2A	O00408	941 aa	Predicted RBP	11.91	□□□□□ -0.5
RAD9B-204	ENST00000409300	HADHB	P55084	474 aa	Known RBP	11.91	□□□□□ -0.5
RAD9B-204	ENST00000409300	PDCL	Q13371	301 aa		11.91	□□□□□ -0.5
RAD9B-204	ENST00000409300	C1orf53	Q5VUE5	145 aa		11.91	□□□□□ -0.5
RAD9B-204	ENST00000409300	PPP1R2P3	Q6NXS1	205 aa		11.91	□□□□□ -0.5
RAD9B-204	ENST00000409300	TTC30A	Q86WT1	665 aa		11.91	□□□□□ -0.5
RAD9B-204	ENST00000409300	CEP112	Q8N8E3	955 aa		11.91	□□□□□ -0.5
RAD9B-204	ENST00000409300	SLC2A14	Q8TDB8	520 aa		11.91	□□□□□ -0.5
RAD9B-204	ENST00000409300	APBB2	Q92870	758 aa		11.91	□□□□□ -0.5
RAD9B-204	ENST00000409300	C18orf8	Q96DM3	657 aa		11.91	□□□□□ -0.5
RAD9B-204	ENST00000409300	TNIP3	Q96KP6	325 aa		11.91	□□□□□ -0.5
RAD9B-204	ENST00000409300	MCEE	Q96PE7	176 aa		11.91	□□□□□ -0.5
RAD9B-204	ENST00000409300	ABCB6	Q9NP58	842 aa		11.91	□□□□□ -0.5
RAD9B-204	ENST00000409300	TBX21	Q9UL17	535 aa		11.91	□□□□□ -0.5
RAD9B-204	ENST00000409300	CTAGE15	A4D2H0	777 aa		11.9	□□□□□ -0.5
RAD9B-204	ENST00000409300	MTA2	O94776	668 aa		11.9	□□□□□ -0.5
RAD9B-204	ENST00000409300	ERBB2	P04626	1255 aa		11.9	□□□□□ -0.5
RAD9B-204	ENST00000409300	CTAGE8	P0CG41	777 aa		11.9	□□□□□ -0.5
RAD9B-204	ENST00000409300	PRLR	P16471	622 aa		11.9	□□□□□ -0.5
RAD9B-204	ENST00000409300	GTF2F1	P35269	517 aa	Known RBP eCLIP	11.9	□□□□□ -0.5
RAD9B-204	ENST00000409300	TEX35	Q5T0J7	233 aa		11.9	□□□□□ -0.5
RAD9B-204	ENST00000409300	PLEKHA7	Q6IQ23	1121 aa		11.9	□□□□□ -0.5
RAD9B-204	ENST00000409300	DNAJC24	Q6P3W2	148 aa		11.9	□□□□□ -0.5
RAD9B-204	ENST00000409300	DCUN1D2	Q6PH85	259 aa		11.9	□□□□□ -0.5
RAD9B-204	ENST00000409300	LIMS2	Q7Z4I7	341 aa		11.9	□□□□□ -0.5
RAD9B-204	ENST00000409300	CTAGE6	Q86UF2	777 aa		11.9	□□□□□ -0.5
RAD9B-204	ENST00000409300	CTAGE4	Q8IX94	777 aa		11.9	□□□□□ -0.5
RAD9B-204	ENST00000409300	CRYBG2	Q8N1P7	616 aa		11.9	□□□□□ -0.5
RAD9B-204	ENST00000409300	HCST	Q9UBK5	93 aa		11.9	□□□□□ -0.5
RAD9B-204	ENST00000409300	SCIN	Q9Y6U3	715 aa		11.9	□□□□□ -0.5
RAD9B-204	ENST00000409300	TTC3	P53804	2025 aa		11.9	□□□□□ -0.5
RAD9B-204	ENST00000409300	CLDN5	O00501	218 aa		11.9	□□□□□ -0.5
RAD9B-204	ENST00000409300	CTIF	O43310	598 aa	Known RBP	11.9	□□□□□ -0.5
RAD9B-204	ENST00000409300	PFKM	P08237	780 aa		11.9	□□□□□ -0.5
RAD9B-204	ENST00000409300	WARS	P23381	471 aa	Known RBP	11.9	□□□□□ -0.5
RAD9B-204	ENST00000409300	TCEAL1	Q15170	157 aa		11.9	□□□□□ -0.5
RAD9B-204	ENST00000409300	C11orf63	Q6NUN7	778 aa		11.9	□□□□□ -0.5
RAD9B-204	ENST00000409300	PMF1	Q6P1K2	205 aa		11.9	□□□□□ -0.5
RAD9B-204	ENST00000409300	NECAB2	Q7Z6G3	386 aa		11.9	□□□□□ -0.5
RAD9B-204	ENST00000409300	ANKLE1	Q8NAG6	615 aa		11.9	□□□□□ -0.5
RAD9B-204	ENST00000409300	UBXN4	Q92575	508 aa		11.9	□□□□□ -0.5
RAD9B-204	ENST00000409300	HES6	Q96HZ4	224 aa		11.9	□□□□□ -0.5
RAD9B-204	ENST00000409300	KANSL3	Q9P2N6	904 aa		11.9	□□□□□ -0.5
RAD9B-204	ENST00000409300		E5RJQ4	531 aa		11.89	□□□□□ -0.51
RAD9B-204	ENST00000409300	GABRD	O14764	452 aa		11.89	□□□□□ -0.51
RAD9B-204	ENST00000409300	ODC1	P11926	461 aa		11.89	□□□□□ -0.51

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