RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393217.6

LRRIQ1-202, Transcript of leucine rich repeats and IQ motif containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LRRIQ1, Length 5,394 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1-202ENST00000393217 PGBD4Q96DM1 585 aa1.33□□□□□ -2.2
LRRIQ1-202ENST00000393217 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP1.33□□□□□ -2.2
LRRIQ1-202ENST00000393217 PPP1R2P1Q96PQ5 205 aa1.33□□□□□ -2.2
LRRIQ1-202ENST00000393217 TMEM209Q96SK2 561 aa1.33□□□□□ -2.2
LRRIQ1-202ENST00000393217 FOXB1Q99853 325 aa1.33□□□□□ -2.2
LRRIQ1-202ENST00000393217 PAGR1Q9BTK6 254 aa1.33□□□□□ -2.2
LRRIQ1-202ENST00000393217 TUBB2BQ9BVA1 445 aa1.33□□□□□ -2.2
LRRIQ1-202ENST00000393217 SARGQ9BW04 601 aa1.33□□□□□ -2.2
LRRIQ1-202ENST00000393217 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP1.33□□□□□ -2.2
LRRIQ1-202ENST00000393217 NUP62CLQ9H1M0 184 aa1.33□□□□□ -2.2
LRRIQ1-202ENST00000393217 C2orf40Q9H1Z8 148 aa1.33□□□□□ -2.2
LRRIQ1-202ENST00000393217 MTG2Q9H4K7 406 aa1.33□□□□□ -2.2
LRRIQ1-202ENST00000393217 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP1.33□□□□□ -2.2
LRRIQ1-202ENST00000393217 NLRC4Q9NPP4 1024 aa1.33□□□□□ -2.2
LRRIQ1-202ENST00000393217 SAGE1Q9NXZ1 904 aa1.33□□□□□ -2.2
LRRIQ1-202ENST00000393217 DNAI1Q9UI46 699 aa1.33□□□□□ -2.2
LRRIQ1-202ENST00000393217 CDC42EP3Q9UKI2 254 aa1.33□□□□□ -2.2
LRRIQ1-202ENST00000393217 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa1.33□□□□□ -2.2
LRRIQ1-202ENST00000393217 PTPRMP28827 1452 aa1.33□□□□□ -2.2
LRRIQ1-202ENST00000393217 METP08581 1390 aa1.33□□□□□ -2.2
LRRIQ1-202ENST00000393217 ABCC4O15439 1325 aa1.33□□□□□ -2.2
LRRIQ1-202ENST00000393217 PI4KAP2A4QPH2 592 aa1.33□□□□□ -2.2
LRRIQ1-202ENST00000393217 RHPN2P1A8MT19 583 aa1.33□□□□□ -2.2
LRRIQ1-202ENST00000393217 FAM171A2A8MVW0 826 aa1.33□□□□□ -2.2
LRRIQ1-202ENST00000393217 H0Y858 1186 aa1.33□□□□□ -2.2
LRRIQ1-202ENST00000393217 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP1.33□□□□□ -2.2
LRRIQ1-202ENST00000393217 CXCL11O14625 94 aa1.33□□□□□ -2.2
LRRIQ1-202ENST00000393217 MAGEB2O15479 319 aa1.33□□□□□ -2.2
LRRIQ1-202ENST00000393217 ASAP2O43150 1006 aa1.33□□□□□ -2.2
LRRIQ1-202ENST00000393217 ZSCAN12O43309 604 aa1.33□□□□□ -2.2
LRRIQ1-202ENST00000393217 STRNO43815 780 aa1.33□□□□□ -2.2
LRRIQ1-202ENST00000393217 MYZAPP0CAP1 466 aa1.33□□□□□ -2.2
LRRIQ1-202ENST00000393217 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP1.33□□□□□ -2.2
LRRIQ1-202ENST00000393217 TOP1P11387 765 aaKnown RBP1.33□□□□□ -2.2
LRRIQ1-202ENST00000393217 PHKG2P15735 406 aa1.33□□□□□ -2.2
LRRIQ1-202ENST00000393217 SYN1P17600 705 aa1.33□□□□□ -2.2
LRRIQ1-202ENST00000393217 CA4P22748 312 aa1.33□□□□□ -2.2
LRRIQ1-202ENST00000393217 AP3M2P53677 418 aa1.33□□□□□ -2.2
LRRIQ1-202ENST00000393217 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP1.33□□□□□ -2.2
LRRIQ1-202ENST00000393217 SATB1Q01826 763 aa1.33□□□□□ -2.2
LRRIQ1-202ENST00000393217 TNFAIP2Q03169 654 aa1.33□□□□□ -2.2
LRRIQ1-202ENST00000393217 STK3Q13188 491 aa1.33□□□□□ -2.2
LRRIQ1-202ENST00000393217 GCKRQ14397 625 aa1.33□□□□□ -2.2
LRRIQ1-202ENST00000393217 GRM3Q14832 879 aa1.33□□□□□ -2.2
LRRIQ1-202ENST00000393217 VEPH1Q14D04 833 aa1.33□□□□□ -2.2
LRRIQ1-202ENST00000393217 MUM1Q2TAK8 710 aa1.33□□□□□ -2.2
LRRIQ1-202ENST00000393217 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa1.33□□□□□ -2.2
LRRIQ1-202ENST00000393217 ZNF792Q3KQV3 632 aa1.33□□□□□ -2.2
LRRIQ1-202ENST00000393217 TTLL5Q6EMB2 1281 aa1.33□□□□□ -2.2
LRRIQ1-202ENST00000393217 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP1.33□□□□□ -2.2
LRRIQ1-202ENST00000393217 TMEM179Q6ZVK1 233 aa1.33□□□□□ -2.2
LRRIQ1-202ENST00000393217 BRINP3Q76B58 766 aa1.33□□□□□ -2.2
LRRIQ1-202ENST00000393217 BZW1Q7L1Q6 419 aaKnown RBP1.33□□□□□ -2.2
LRRIQ1-202ENST00000393217 ARMCX2Q7L311 632 aa1.33□□□□□ -2.2
LRRIQ1-202ENST00000393217 TAOK1Q7L7X3 1001 aa1.33□□□□□ -2.2
LRRIQ1-202ENST00000393217 HAUS6Q7Z4H7 955 aa1.33□□□□□ -2.2
LRRIQ1-202ENST00000393217 AMIGO3Q86WK7 504 aa1.33□□□□□ -2.2
LRRIQ1-202ENST00000393217 FAM126BQ8IXS8 530 aa1.33□□□□□ -2.2
LRRIQ1-202ENST00000393217 STPG3Q8N7X2 389 aa1.33□□□□□ -2.2
LRRIQ1-202ENST00000393217 ANKRD44Q8N8A2 993 aa1.33□□□□□ -2.2
LRRIQ1-202ENST00000393217 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa1.33□□□□□ -2.2
LRRIQ1-202ENST00000393217 IQUBQ8NA54 791 aa1.33□□□□□ -2.2
LRRIQ1-202ENST00000393217 C3orf20Q8ND61 904 aa1.33□□□□□ -2.2
LRRIQ1-202ENST00000393217 RDM1Q8NG50 284 aa1.33□□□□□ -2.2
LRRIQ1-202ENST00000393217 GSDMBQ8TAX9 411 aa1.33□□□□□ -2.2
LRRIQ1-202ENST00000393217 SLC35G2Q8TBE7 412 aa1.33□□□□□ -2.2
LRRIQ1-202ENST00000393217 SOCS4Q8WXH5 440 aa1.33□□□□□ -2.2
LRRIQ1-202ENST00000393217 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP1.33□□□□□ -2.2
LRRIQ1-202ENST00000393217 C16orf92Q96LL3 132 aa1.33□□□□□ -2.2
LRRIQ1-202ENST00000393217 CCDC114Q96M63 670 aa1.33□□□□□ -2.2
LRRIQ1-202ENST00000393217 CCDC138Q96M89 665 aa1.33□□□□□ -2.2
LRRIQ1-202ENST00000393217 FNBP1Q96RU3 617 aa1.33□□□□□ -2.2
LRRIQ1-202ENST00000393217 TBCBQ99426 244 aa1.33□□□□□ -2.2
LRRIQ1-202ENST00000393217 ARPC5LQ9BPX5 153 aa1.33□□□□□ -2.2
LRRIQ1-202ENST00000393217 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP1.33□□□□□ -2.2
LRRIQ1-202ENST00000393217 NUP58Q9BVL2 599 aa1.33□□□□□ -2.2
LRRIQ1-202ENST00000393217 PCDH18Q9HCL0 1135 aa1.33□□□□□ -2.2
LRRIQ1-202ENST00000393217 TMEM140Q9NV12 185 aa1.33□□□□□ -2.2
LRRIQ1-202ENST00000393217 PRSS50Q9UI38 385 aa1.33□□□□□ -2.2
LRRIQ1-202ENST00000393217 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa1.33□□□□□ -2.2
LRRIQ1-202ENST00000393217 POLHQ9Y253 713 aa1.33□□□□□ -2.2
LRRIQ1-202ENST00000393217 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP1.33□□□□□ -2.2
LRRIQ1-202ENST00000393217 USH1CQ9Y6N9 552 aa1.33□□□□□ -2.2
LRRIQ1-202ENST00000393217 NUMBLQ9Y6R0 609 aa1.33□□□□□ -2.2
LRRIQ1-202ENST00000393217 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP1.33□□□□□ -2.2
LRRIQ1-202ENST00000393217 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP1.33□□□□□ -2.2
LRRIQ1-202ENST00000393217 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP1.33□□□□□ -2.2
LRRIQ1-202ENST00000393217 MYO5CQ9NQX4 1742 aa1.33□□□□□ -2.2
LRRIQ1-202ENST00000393217 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa1.32□□□□□ -2.2
LRRIQ1-202ENST00000393217 RFX7Q2KHR2 1363 aa1.32□□□□□ -2.2
LRRIQ1-202ENST00000393217 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP1.32□□□□□ -2.2
LRRIQ1-202ENST00000393217 RRN3P2A6NIE6 340 aa1.32□□□□□ -2.2
LRRIQ1-202ENST00000393217 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP1.32□□□□□ -2.2
LRRIQ1-202ENST00000393217 CHL1O00533 1208 aa1.32□□□□□ -2.2
LRRIQ1-202ENST00000393217 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP1.32□□□□□ -2.2
LRRIQ1-202ENST00000393217 THAP12O43422 761 aa1.32□□□□□ -2.2
LRRIQ1-202ENST00000393217 NCK2O43639 380 aa1.32□□□□□ -2.2
LRRIQ1-202ENST00000393217 SH3BP5O60239 455 aa1.32□□□□□ -2.2
LRRIQ1-202ENST00000393217 PCDHGA12O60330 932 aa1.32□□□□□ -2.2
LRRIQ1-202ENST00000393217 YEATS4O95619 227 aa1.32□□□□□ -2.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.4 ms