RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379615.3

PGGT1B-202, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PGGT1B, Length 903 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-202ENST00000379615 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa16.43■□□□□ 0.22
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PGGT1B-202ENST00000379615 UNC93AQ86WB7 457 aa16.43■□□□□ 0.22
PGGT1B-202ENST00000379615 OSTM1Q86WC4 334 aa16.43■□□□□ 0.22
PGGT1B-202ENST00000379615 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP16.43■□□□□ 0.22
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PGGT1B-202ENST00000379615 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP16.43■□□□□ 0.22
PGGT1B-202ENST00000379615 GTF3C4Q9UKN8 822 aa16.43■□□□□ 0.22
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PGGT1B-202ENST00000379615 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP16.42■□□□□ 0.22
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PGGT1B-202ENST00000379615 PLCD3Q8N3E9 789 aa16.42■□□□□ 0.22
PGGT1B-202ENST00000379615 SEMA4DQ92854 862 aa16.42■□□□□ 0.22
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PGGT1B-202ENST00000379615 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa16.42■□□□□ 0.22
PGGT1B-202ENST00000379615 BCO2Q9BYV7 579 aa16.42■□□□□ 0.22
PGGT1B-202ENST00000379615 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP16.42■□□□□ 0.22
PGGT1B-202ENST00000379615 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa16.42■□□□□ 0.22
PGGT1B-202ENST00000379615 CLUHO75153 1309 aa16.42■□□□□ 0.22
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PGGT1B-202ENST00000379615 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP16.41■□□□□ 0.22
PGGT1B-202ENST00000379615 CDH8P55286 799 aa16.41■□□□□ 0.22
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PGGT1B-202ENST00000379615 TAF12Q16514 161 aa16.41■□□□□ 0.22
PGGT1B-202ENST00000379615 CFAP221Q4G0U5 840 aa16.41■□□□□ 0.22
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PGGT1B-202ENST00000379615 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa16.41■□□□□ 0.22
PGGT1B-202ENST00000379615 ATP8B3O60423 1300 aa16.41■□□□□ 0.22
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PGGT1B-202ENST00000379615 LOC730098B7Z3J9 87 aa16.4■□□□□ 0.22
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PGGT1B-202ENST00000379615 FGF19O95750 216 aa16.4■□□□□ 0.22
PGGT1B-202ENST00000379615 TPM2P07951 284 aa16.4■□□□□ 0.22
PGGT1B-202ENST00000379615 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP16.4■□□□□ 0.22
PGGT1B-202ENST00000379615 MAGEA11P43364 429 aa16.4■□□□□ 0.22
PGGT1B-202ENST00000379615 RAP1GAPP47736 663 aa16.4■□□□□ 0.22
PGGT1B-202ENST00000379615 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP16.4■□□□□ 0.22
PGGT1B-202ENST00000379615 CYP27A1Q02318 531 aa16.4■□□□□ 0.22
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PGGT1B-202ENST00000379615 VSTM1Q6UX27 236 aa16.4■□□□□ 0.22
PGGT1B-202ENST00000379615 IRF2BP1Q8IU81 584 aa16.4■□□□□ 0.22
PGGT1B-202ENST00000379615 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa16.4■□□□□ 0.22
PGGT1B-202ENST00000379615 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa16.4■□□□□ 0.22
PGGT1B-202ENST00000379615 NT5C1BQ96P26 610 aa16.4■□□□□ 0.22
PGGT1B-202ENST00000379615 NT5C1AQ9BXI3 368 aa16.4■□□□□ 0.22
PGGT1B-202ENST00000379615 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP16.4■□□□□ 0.22
PGGT1B-202ENST00000379615 ASAH2Q9NR71 780 aa16.4■□□□□ 0.22
PGGT1B-202ENST00000379615 TMLHEQ9NVH6 421 aa16.4■□□□□ 0.22
PGGT1B-202ENST00000379615 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP16.4■□□□□ 0.22
PGGT1B-202ENST00000379615 CDH22Q9UJ99 828 aa16.4■□□□□ 0.22
PGGT1B-202ENST00000379615 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP16.4■□□□□ 0.22
PGGT1B-202ENST00000379615 RHOP08100 348 aa16.39■□□□□ 0.21
PGGT1B-202ENST00000379615 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP16.39■□□□□ 0.21
PGGT1B-202ENST00000379615 NDST1P52848 882 aa16.39■□□□□ 0.21
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PGGT1B-202ENST00000379615 MAN2A1Q16706 1144 aa16.39■□□□□ 0.21
PGGT1B-202ENST00000379615 MDH1BQ5I0G3 518 aa16.39■□□□□ 0.21
PGGT1B-202ENST00000379615 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP16.39■□□□□ 0.21
PGGT1B-202ENST00000379615 CRYBG2Q8N1P7 616 aa16.39■□□□□ 0.21
PGGT1B-202ENST00000379615 EHBP1Q8NDI1 1231 aa16.39■□□□□ 0.21
PGGT1B-202ENST00000379615 PSMG2Q969U7 264 aa16.39■□□□□ 0.21
PGGT1B-202ENST00000379615 ELMO3Q96BJ8 720 aa16.39■□□□□ 0.21
PGGT1B-202ENST00000379615 CEP295NLQ96MC4 621 aa16.39■□□□□ 0.21
PGGT1B-202ENST00000379615 CORO1BQ9BR76 489 aa16.39■□□□□ 0.21
PGGT1B-202ENST00000379615 ELOVL4Q9GZR5 314 aa16.39■□□□□ 0.21
PGGT1B-202ENST00000379615 SDCBP2Q9H190 292 aa16.39■□□□□ 0.21
PGGT1B-202ENST00000379615 CRISPLD1Q9H336 500 aa16.39■□□□□ 0.21
PGGT1B-202ENST00000379615 CRTAC1Q9NQ79 661 aa16.39■□□□□ 0.21
PGGT1B-202ENST00000379615 CEP72Q9P209 647 aa16.39■□□□□ 0.21
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