RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379215.8

ECHDC3-201, Transcript of enoyl-CoA hydratase domain containing 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ECHDC3, Length 1,649 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC3-201ENST00000379215 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP26.03■■□□□ 1.76
ECHDC3-201ENST00000379215 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP26.03■■□□□ 1.76
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ECHDC3-201ENST00000379215 SCINQ9Y6U3 715 aa26.03■■□□□ 1.76
ECHDC3-201ENST00000379215 CARNS1A5YM72 827 aa26.03■■□□□ 1.76
ECHDC3-201ENST00000379215 PDGFRBP09619 1106 aa26.03■■□□□ 1.76
ECHDC3-201ENST00000379215 SNX16P57768 344 aa26.03■■□□□ 1.76
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ECHDC3-201ENST00000379215 CD300LGQ6UXG3 332 aa26.03■■□□□ 1.76
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ECHDC3-201ENST00000379215 ERICH1Q86X53 443 aa26.03■■□□□ 1.76
ECHDC3-201ENST00000379215 TPCN2Q8NHX9 752 aa26.03■■□□□ 1.76
ECHDC3-201ENST00000379215 ARHGEF26Q96DR7 871 aa26.03■■□□□ 1.76
ECHDC3-201ENST00000379215 TUBB2BQ9BVA1 445 aa26.03■■□□□ 1.76
ECHDC3-201ENST00000379215 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa26.03■■□□□ 1.76
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ECHDC3-201ENST00000379215 NME7Q9Y5B8 376 aa26.03■■□□□ 1.76
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ECHDC3-201ENST00000379215 TOP1MTQ969P6 601 aa26.02■■□□□ 1.76
ECHDC3-201ENST00000379215 C11orf70Q9BRQ4 267 aa26.02■■□□□ 1.76
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ECHDC3-201ENST00000379215 TADA2AO75478 443 aa26.01■■□□□ 1.75
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ECHDC3-201ENST00000379215 C12orf29Q8N999 325 aa26.01■■□□□ 1.75
ECHDC3-201ENST00000379215 DPEP3Q9H4B8 488 aa26.01■■□□□ 1.75
ECHDC3-201ENST00000379215 WDR35Q9P2L0 1181 aa26.01■■□□□ 1.75
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ECHDC3-201ENST00000379215 SYN3O14994 580 aa26■■□□□ 1.75
ECHDC3-201ENST00000379215 PALMO75781 387 aa26■■□□□ 1.75
ECHDC3-201ENST00000379215 DGKIO75912 1065 aa26■■□□□ 1.75
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ECHDC3-201ENST00000379215 BRCC3P46736 316 aa26■■□□□ 1.75
ECHDC3-201ENST00000379215 BCAT1P54687 386 aa26■■□□□ 1.75
ECHDC3-201ENST00000379215 SLC8A3P57103 927 aa26■■□□□ 1.75
ECHDC3-201ENST00000379215 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP26■■□□□ 1.75
ECHDC3-201ENST00000379215 SYT15Q9BQS2 421 aa26■■□□□ 1.75
ECHDC3-201ENST00000379215 ACBD6Q9BR61 282 aa26■■□□□ 1.75
ECHDC3-201ENST00000379215 NUP85Q9BW27 656 aa26■■□□□ 1.75
ECHDC3-201ENST00000379215 DNAJB4Q9UDY4 337 aa26■■□□□ 1.75
ECHDC3-201ENST00000379215 FAN1Q9Y2M0 1017 aa26■■□□□ 1.75
ECHDC3-201ENST00000379215 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP26■■□□□ 1.75
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ECHDC3-201ENST00000379215 B4GALT3O60512 393 aa25.99■■□□□ 1.75
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ECHDC3-201ENST00000379215 PTP4A2Q12974 167 aa25.99■■□□□ 1.75
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ECHDC3-201ENST00000379215 SYNCQ9H7C4 482 aa25.99■■□□□ 1.75
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ECHDC3-201ENST00000379215 PARVAQ9NVD7 372 aa25.99■■□□□ 1.75
ECHDC3-201ENST00000379215 ADAM28Q9UKQ2 775 aa25.99■■□□□ 1.75
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ECHDC3-201ENST00000379215 RRM1P23921 792 aa25.99■■□□□ 1.75
ECHDC3-201ENST00000379215 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP25.99■■□□□ 1.75
ECHDC3-201ENST00000379215 GATMP50440 423 aa25.99■■□□□ 1.75
ECHDC3-201ENST00000379215 GSCP56915 257 aaPredicted RBP25.99■■□□□ 1.75
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ECHDC3-201ENST00000379215 TAP1Q03518 808 aa25.99■■□□□ 1.75
ECHDC3-201ENST00000379215 PDCLQ13371 301 aa25.99■■□□□ 1.75
ECHDC3-201ENST00000379215 OVOS1Q6IE37 1185 aa25.99■■□□□ 1.75
ECHDC3-201ENST00000379215 C11orf63Q6NUN7 778 aa25.99■■□□□ 1.75
ECHDC3-201ENST00000379215 STK32AQ8WU08 396 aa25.99■■□□□ 1.75
ECHDC3-201ENST00000379215 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP25.99■■□□□ 1.75
ECHDC3-201ENST00000379215 HTATIP2Q9BUP3 242 aa25.99■■□□□ 1.75
ECHDC3-201ENST00000379215 OSGEPQ9NPF4 335 aa25.99■■□□□ 1.75
ECHDC3-201ENST00000379215 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP25.98■■□□□ 1.75
ECHDC3-201ENST00000379215 FANCGO15287 622 aa25.98■■□□□ 1.75
ECHDC3-201ENST00000379215 UPP2O95045 317 aa25.98■■□□□ 1.75
ECHDC3-201ENST00000379215 FPGSQ05932 587 aa25.98■■□□□ 1.75
ECHDC3-201ENST00000379215 BST2Q10589 180 aaKnown RBP25.98■■□□□ 1.75
ECHDC3-201ENST00000379215 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP25.98■■□□□ 1.75
ECHDC3-201ENST00000379215 PKDCCQ504Y2 493 aa25.98■■□□□ 1.75
ECHDC3-201ENST00000379215 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa25.98■■□□□ 1.75
ECHDC3-201ENST00000379215 SLFN11Q7Z7L1 901 aa25.98■■□□□ 1.75
ECHDC3-201ENST00000379215 LRRC57Q8N9N7 239 aa25.98■■□□□ 1.75
ECHDC3-201ENST00000379215 CYLDQ9NQC7 956 aa25.98■■□□□ 1.75
ECHDC3-201ENST00000379215 URI1O94763 535 aaPredicted RBP25.97■■□□□ 1.75
ECHDC3-201ENST00000379215 ITGB1P05556 798 aa25.97■■□□□ 1.75
ECHDC3-201ENST00000379215 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP25.97■■□□□ 1.75
ECHDC3-201ENST00000379215 DAAM2Q86T65 1068 aa25.97■■□□□ 1.75
ECHDC3-201ENST00000379215 C18orf8Q96DM3 657 aa25.97■■□□□ 1.75
ECHDC3-201ENST00000379215 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP25.97■■□□□ 1.75
ECHDC3-201ENST00000379215 I3L4J1 428 aa25.96■■□□□ 1.75
ECHDC3-201ENST00000379215 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP25.96■■□□□ 1.75
ECHDC3-201ENST00000379215 SLC11A1P49279 550 aa25.96■■□□□ 1.75
ECHDC3-201ENST00000379215 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP25.96■■□□□ 1.75
ECHDC3-201ENST00000379215 TSPY1Q01534 308 aa25.96■■□□□ 1.75
ECHDC3-201ENST00000379215 PLCB3Q01970 1234 aa25.96■■□□□ 1.75
ECHDC3-201ENST00000379215 PTPN20Q4JDL3 420 aa25.96■■□□□ 1.75
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