RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000377244.7

SNX15-202, Transcript of sorting nexin 15, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SNX15, Length 1,939 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX15-202ENST00000377244 TNIP3Q96KP6 325 aa26.98■■□□□ 1.91
SNX15-202ENST00000377244 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP26.98■■□□□ 1.91
SNX15-202ENST00000377244 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa26.98■■□□□ 1.91
SNX15-202ENST00000377244 GBF1Q92538 1859 aa26.98■■□□□ 1.91
SNX15-202ENST00000377244 ARHGEF37A1IGU5 675 aa26.98■■□□□ 1.91
SNX15-202ENST00000377244 SYN3O14994 580 aa26.98■■□□□ 1.91
SNX15-202ENST00000377244 MICAL2O94851 1124 aa26.98■■□□□ 1.91
SNX15-202ENST00000377244 EFEMP2O95967 443 aa26.98■■□□□ 1.91
SNX15-202ENST00000377244 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP26.98■■□□□ 1.91
SNX15-202ENST00000377244 FGFR3P22607 806 aa26.98■■□□□ 1.91
SNX15-202ENST00000377244 MDH1BQ5I0G3 518 aa26.98■■□□□ 1.91
SNX15-202ENST00000377244 SMYD5Q6GMV2 418 aa26.98■■□□□ 1.91
SNX15-202ENST00000377244 CPA5Q8WXQ8 436 aa26.98■■□□□ 1.91
SNX15-202ENST00000377244 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP26.98■■□□□ 1.91
SNX15-202ENST00000377244 TSPAN16Q9UKR8 245 aa26.98■■□□□ 1.91
SNX15-202ENST00000377244 CHD7Q9P2D1 2997 aa26.97■■□□□ 1.91
SNX15-202ENST00000377244 MYBPHLA2RUH7 354 aa26.97■■□□□ 1.91
SNX15-202ENST00000377244 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa26.97■■□□□ 1.91
SNX15-202ENST00000377244 NAA35Q5VZE5 725 aa26.97■■□□□ 1.91
SNX15-202ENST00000377244 SPRED2Q7Z698 418 aa26.97■■□□□ 1.91
SNX15-202ENST00000377244 TMEM169Q96HH4 297 aa26.97■■□□□ 1.91
SNX15-202ENST00000377244 GDF15Q99988 308 aa26.97■■□□□ 1.91
SNX15-202ENST00000377244 GTF3C4Q9UKN8 822 aa26.97■■□□□ 1.91
SNX15-202ENST00000377244 PCDHGC3Q9UN70 934 aa26.97■■□□□ 1.91
SNX15-202ENST00000377244 ARHGEF15O94989 841 aa26.96■■□□□ 1.91
SNX15-202ENST00000377244 ABL1P00519 1130 aa26.96■■□□□ 1.91
SNX15-202ENST00000377244 PCSK1P29120 753 aa26.96■■□□□ 1.91
SNX15-202ENST00000377244 ADORA2BP29275 332 aa26.96■■□□□ 1.91
SNX15-202ENST00000377244 MAGEA1P43355 309 aa26.96■■□□□ 1.91
SNX15-202ENST00000377244 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP26.96■■□□□ 1.91
SNX15-202ENST00000377244 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa26.96■■□□□ 1.91
SNX15-202ENST00000377244 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP26.96■■□□□ 1.91
SNX15-202ENST00000377244 UBA3Q8TBC4 463 aa26.96■■□□□ 1.91
SNX15-202ENST00000377244 SPATA18Q8TC71 538 aa26.96■■□□□ 1.91
SNX15-202ENST00000377244 SPG21Q9NZD8 308 aa26.96■■□□□ 1.91
SNX15-202ENST00000377244 CDH9Q9ULB4 789 aa26.96■■□□□ 1.91
SNX15-202ENST00000377244 KIAA1257Q9ULG3 409 aa26.96■■□□□ 1.91
SNX15-202ENST00000377244 M0QYV0 167 aa26.96■■□□□ 1.91
SNX15-202ENST00000377244 CLDN5O00501 218 aa26.96■■□□□ 1.91
SNX15-202ENST00000377244 MED7O43513 233 aa26.96■■□□□ 1.91
SNX15-202ENST00000377244 OAZ2O95190 189 aa26.96■■□□□ 1.91
SNX15-202ENST00000377244 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP26.96■■□□□ 1.91
SNX15-202ENST00000377244 OR4Q2P0C623 313 aa26.96■■□□□ 1.91
SNX15-202ENST00000377244 UNGP13051 313 aaPredicted RBP26.96■■□□□ 1.91
SNX15-202ENST00000377244 NOMO3P69849 1222 aa26.96■■□□□ 1.91
SNX15-202ENST00000377244 KRT83P78385 493 aa26.96■■□□□ 1.91
SNX15-202ENST00000377244 CNGA2Q16280 664 aa26.96■■□□□ 1.91
SNX15-202ENST00000377244 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP26.96■■□□□ 1.91
SNX15-202ENST00000377244 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP26.96■■□□□ 1.91
SNX15-202ENST00000377244 SLC2A14Q8TDB8 520 aa26.96■■□□□ 1.91
SNX15-202ENST00000377244 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP26.96■■□□□ 1.91
SNX15-202ENST00000377244 ACBD6Q9BR61 282 aa26.96■■□□□ 1.91
SNX15-202ENST00000377244 CHD9Q3L8U1 2897 aa26.95■■□□□ 1.91
SNX15-202ENST00000377244 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP26.95■■□□□ 1.9
SNX15-202ENST00000377244 KIAA1328Q86T90 577 aa26.95■■□□□ 1.9
SNX15-202ENST00000377244 TTC30AQ86WT1 665 aa26.95■■□□□ 1.9
SNX15-202ENST00000377244 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP26.95■■□□□ 1.9
SNX15-202ENST00000377244 THEM5Q8N1Q8 247 aa26.95■■□□□ 1.9
SNX15-202ENST00000377244 WDTC1Q8N5D0 677 aa26.95■■□□□ 1.9
SNX15-202ENST00000377244 TTPALQ9BTX7 342 aa26.95■■□□□ 1.9
SNX15-202ENST00000377244 LACRTQ9GZZ8 138 aa26.95■■□□□ 1.9
SNX15-202ENST00000377244 TRIM10Q9UDY6 481 aa26.95■■□□□ 1.9
SNX15-202ENST00000377244 C2CD6Q53TS8 623 aa26.94■■□□□ 1.9
SNX15-202ENST00000377244 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP26.94■■□□□ 1.9
SNX15-202ENST00000377244 LCLAT1Q6UWP7 414 aa26.94■■□□□ 1.9
SNX15-202ENST00000377244 LRRTM3Q86VH5 581 aa26.94■■□□□ 1.9
SNX15-202ENST00000377244 REXO1L1PQ8IX06 675 aa26.94■■□□□ 1.9
SNX15-202ENST00000377244 FUKQ8N0W3 1084 aa26.94■■□□□ 1.9
SNX15-202ENST00000377244 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa26.94■■□□□ 1.9
SNX15-202ENST00000377244 TMLHEQ9NVH6 421 aa26.94■■□□□ 1.9
SNX15-202ENST00000377244 CYTH4Q9UIA0 394 aa26.94■■□□□ 1.9
SNX15-202ENST00000377244 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa26.94■■□□□ 1.9
SNX15-202ENST00000377244 NLRC5Q86WI3 1866 aa26.94■■□□□ 1.9
SNX15-202ENST00000377244 FTLP02792 175 aaPredicted RBP26.94■■□□□ 1.9
SNX15-202ENST00000377244 VAV2P52735 878 aa26.94■■□□□ 1.9
SNX15-202ENST00000377244 ARHGAP17Q68EM7 881 aa26.94■■□□□ 1.9
SNX15-202ENST00000377244 PCED1BQ96HM7 432 aa26.94■■□□□ 1.9
SNX15-202ENST00000377244 AAASQ9NRG9 546 aa26.94■■□□□ 1.9
SNX15-202ENST00000377244 LINC01553A4QN01 128 aa26.93■■□□□ 1.9
SNX15-202ENST00000377244 ABCB4P21439 1286 aa26.93■■□□□ 1.9
SNX15-202ENST00000377244 MSNP26038 577 aaKnown RBP26.93■■□□□ 1.9
SNX15-202ENST00000377244 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP26.93■■□□□ 1.9
SNX15-202ENST00000377244 CTXN3Q4LDR2 81 aa26.93■■□□□ 1.9
SNX15-202ENST00000377244 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP26.93■■□□□ 1.9
SNX15-202ENST00000377244 TRIM72Q6ZMU5 477 aa26.93■■□□□ 1.9
SNX15-202ENST00000377244 PAQR9Q6ZVX9 377 aa26.93■■□□□ 1.9
SNX15-202ENST00000377244 PKMYT1Q99640 499 aa26.93■■□□□ 1.9
SNX15-202ENST00000377244 B3GNT5Q9BYG0 378 aa26.93■■□□□ 1.9
SNX15-202ENST00000377244 LZTFL1Q9NQ48 299 aa26.93■■□□□ 1.9
SNX15-202ENST00000377244 MYH10P35580 1976 aa26.93■■□□□ 1.9
SNX15-202ENST00000377244 C2CD2LO14523 706 aa26.92■■□□□ 1.9
SNX15-202ENST00000377244 FGF18O76093 207 aa26.92■■□□□ 1.9
SNX15-202ENST00000377244 GZMAP12544 262 aa26.92■■□□□ 1.9
SNX15-202ENST00000377244 GALCP54803 685 aa26.92■■□□□ 1.9
SNX15-202ENST00000377244 CENPCQ03188 943 aa26.92■■□□□ 1.9
SNX15-202ENST00000377244 USP41Q3LFD5 358 aa26.92■■□□□ 1.9
SNX15-202ENST00000377244 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa26.92■■□□□ 1.9
SNX15-202ENST00000377244 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa26.92■■□□□ 1.9
SNX15-202ENST00000377244 ISCUQ9H1K1 167 aa26.92■■□□□ 1.9
SNX15-202ENST00000377244 DUSP10Q9Y6W6 482 aa26.92■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.1 ms