RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000376215.9

PDSS1-201, Transcript of decaprenyl diphosphate synthase subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDSS1, Length 1,626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDSS1-201ENST00000376215 PPFIBP1Q86W92 1011 aa25.08■■□□□ 1.6
PDSS1-201ENST00000376215 C12orf29Q8N999 325 aa25.08■■□□□ 1.6
PDSS1-201ENST00000376215 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.6
PDSS1-201ENST00000376215 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP25.08■■□□□ 1.6
PDSS1-201ENST00000376215 TMLHEQ9NVH6 421 aa25.08■■□□□ 1.6
PDSS1-201ENST00000376215 MYO6Q9UM54 1294 aa25.08■■□□□ 1.6
PDSS1-201ENST00000376215 GFPT2O94808 682 aa25.07■■□□□ 1.6
PDSS1-201ENST00000376215 OR1D2P34982 312 aa25.07■■□□□ 1.6
PDSS1-201ENST00000376215 STAT1P42224 750 aa25.07■■□□□ 1.6
PDSS1-201ENST00000376215 TSPY1Q01534 308 aa25.07■■□□□ 1.6
PDSS1-201ENST00000376215 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
PDSS1-201ENST00000376215 FAM171BQ6P995 826 aa25.07■■□□□ 1.6
PDSS1-201ENST00000376215 TNIP3Q96KP6 325 aa25.07■■□□□ 1.6
PDSS1-201ENST00000376215 GTF3C4Q9UKN8 822 aa25.07■■□□□ 1.6
PDSS1-201ENST00000376215 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
PDSS1-201ENST00000376215 MYH10P35580 1976 aa25.06■■□□□ 1.6
PDSS1-201ENST00000376215 ARPP19P56211 112 aa25.06■■□□□ 1.6
PDSS1-201ENST00000376215 ROR1Q01973 937 aa25.06■■□□□ 1.6
PDSS1-201ENST00000376215 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
PDSS1-201ENST00000376215 MDH1BQ5I0G3 518 aa25.06■■□□□ 1.6
PDSS1-201ENST00000376215 ZNF697Q5TEC3 545 aa25.06■■□□□ 1.6
PDSS1-201ENST00000376215 SMYD5Q6GMV2 418 aa25.06■■□□□ 1.6
PDSS1-201ENST00000376215 SLC47A2Q86VL8 602 aa25.06■■□□□ 1.6
PDSS1-201ENST00000376215 DRC7Q8IY82 874 aa25.06■■□□□ 1.6
PDSS1-201ENST00000376215 SPC24Q8NBT2 197 aa25.06■■□□□ 1.6
PDSS1-201ENST00000376215 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
PDSS1-201ENST00000376215 KLHL5Q96PQ7 755 aa25.06■■□□□ 1.6
PDSS1-201ENST00000376215 ZSWIM1Q9BR11 485 aa25.06■■□□□ 1.6
PDSS1-201ENST00000376215 WDR27A2RRH5 827 aa25.05■■□□□ 1.6
PDSS1-201ENST00000376215 PAEPP09466 180 aa25.05■■□□□ 1.6
PDSS1-201ENST00000376215 KRT9P35527 623 aa25.05■■□□□ 1.6
PDSS1-201ENST00000376215 NDUFV1P49821 464 aa25.05■■□□□ 1.6
PDSS1-201ENST00000376215 ADKP55263 362 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
PDSS1-201ENST00000376215 CREMQ03060 361 aa25.05■■□□□ 1.6
PDSS1-201ENST00000376215 SLC39A12Q504Y0 691 aa25.05■■□□□ 1.6
PDSS1-201ENST00000376215 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa25.05■■□□□ 1.6
PDSS1-201ENST00000376215 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa25.05■■□□□ 1.6
PDSS1-201ENST00000376215 TFAP2BQ92481 460 aa25.05■■□□□ 1.6
PDSS1-201ENST00000376215 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
PDSS1-201ENST00000376215 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
PDSS1-201ENST00000376215 MFAP3LO75121 409 aa25.04■■□□□ 1.6
PDSS1-201ENST00000376215 CPB1P15086 417 aa25.04■■□□□ 1.6
PDSS1-201ENST00000376215 GPR17Q13304 367 aa25.04■■□□□ 1.6
PDSS1-201ENST00000376215 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP25.04■■□□□ 1.6
PDSS1-201ENST00000376215 FAM161BQ96MY7 647 aa25.04■■□□□ 1.6
PDSS1-201ENST00000376215 FAM49BQ9NUQ9 324 aa25.04■■□□□ 1.6
PDSS1-201ENST00000376215 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
PDSS1-201ENST00000376215 VNN2O95498 520 aa25.04■■□□□ 1.6
PDSS1-201ENST00000376215 BRD2P25440 801 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
PDSS1-201ENST00000376215 ARID5AQ03989 594 aa25.04■■□□□ 1.6
PDSS1-201ENST00000376215 RAB33AQ14088 237 aa25.04■■□□□ 1.6
PDSS1-201ENST00000376215 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa25.04■■□□□ 1.6
PDSS1-201ENST00000376215 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa25.04■■□□□ 1.6
PDSS1-201ENST00000376215 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
PDSS1-201ENST00000376215 MYLPFQ96A32 169 aa25.04■■□□□ 1.6
PDSS1-201ENST00000376215 PCED1BQ96HM7 432 aa25.04■■□□□ 1.6
PDSS1-201ENST00000376215 PGLYRP2Q96PD5 576 aa25.04■■□□□ 1.6
PDSS1-201ENST00000376215 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa25.04■■□□□ 1.6
PDSS1-201ENST00000376215 AIPL1Q9NZN9 384 aa25.04■■□□□ 1.6
PDSS1-201ENST00000376215 CCDC130P13994 396 aa25.03■■□□□ 1.6
PDSS1-201ENST00000376215 CD19P15391 556 aa25.03■■□□□ 1.6
PDSS1-201ENST00000376215 GNA15P30679 374 aa25.03■■□□□ 1.6
PDSS1-201ENST00000376215 PTPROQ16827 1216 aa25.03■■□□□ 1.6
PDSS1-201ENST00000376215 SFMBT2Q5VUG0 894 aa25.03■■□□□ 1.6
PDSS1-201ENST00000376215 DNAJC7Q99615 494 aa25.03■■□□□ 1.6
PDSS1-201ENST00000376215 B3GNT5Q9BYG0 378 aa25.03■■□□□ 1.6
PDSS1-201ENST00000376215 ABLIM3O94929 683 aa25.02■■□□□ 1.6
PDSS1-201ENST00000376215 ADH1AP07327 375 aa25.02■■□□□ 1.6
PDSS1-201ENST00000376215 TPM1P09493 284 aa25.02■■□□□ 1.6
PDSS1-201ENST00000376215 VDRP11473 427 aa25.02■■□□□ 1.6
PDSS1-201ENST00000376215 PTK2Q05397 1052 aa25.02■■□□□ 1.6
PDSS1-201ENST00000376215 ARID5BQ14865 1188 aa25.02■■□□□ 1.6
PDSS1-201ENST00000376215 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP25.02■■□□□ 1.6
PDSS1-201ENST00000376215 PAQR9Q6ZVX9 377 aa25.02■■□□□ 1.6
PDSS1-201ENST00000376215 PALB2Q86YC2 1186 aa25.02■■□□□ 1.6
PDSS1-201ENST00000376215 FUKQ8N0W3 1084 aa25.02■■□□□ 1.6
PDSS1-201ENST00000376215 TC2NQ8N9U0 490 aa25.02■■□□□ 1.6
PDSS1-201ENST00000376215 CYFIP2Q96F07 1278 aa25.02■■□□□ 1.6
PDSS1-201ENST00000376215 MTMR11A4FU01 709 aa25.01■■□□□ 1.59
PDSS1-201ENST00000376215 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP25.01■■□□□ 1.59
PDSS1-201ENST00000376215 CLDN5O00501 218 aa25.01■■□□□ 1.59
PDSS1-201ENST00000376215 CYP11B1P15538 503 aa25.01■■□□□ 1.59
PDSS1-201ENST00000376215 FERP16591 822 aa25.01■■□□□ 1.59
PDSS1-201ENST00000376215 CYP27A1Q02318 531 aa25.01■■□□□ 1.59
PDSS1-201ENST00000376215 ADGRE1Q14246 886 aa25.01■■□□□ 1.59
PDSS1-201ENST00000376215 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP25.01■■□□□ 1.59
PDSS1-201ENST00000376215 SGO2Q562F6 1265 aa25.01■■□□□ 1.59
PDSS1-201ENST00000376215 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP25.01■■□□□ 1.59
PDSS1-201ENST00000376215 ATAD1Q8NBU5 361 aa25.01■■□□□ 1.59
PDSS1-201ENST00000376215 ZNF461Q8TAF7 563 aa25.01■■□□□ 1.59
PDSS1-201ENST00000376215 SLC2A14Q8TDB8 520 aa25.01■■□□□ 1.59
PDSS1-201ENST00000376215 EPS8L1Q8TE68 723 aa25.01■■□□□ 1.59
PDSS1-201ENST00000376215 ZNF606Q8WXB4 792 aa25.01■■□□□ 1.59
PDSS1-201ENST00000376215 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP25.01■■□□□ 1.59
PDSS1-201ENST00000376215 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa25.01■■□□□ 1.59
PDSS1-201ENST00000376215 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP25.01■■□□□ 1.59
PDSS1-201ENST00000376215 ABHD10Q9NUJ1 306 aa25.01■■□□□ 1.59
PDSS1-201ENST00000376215 IMPACTQ9P2X3 320 aa25.01■■□□□ 1.59
PDSS1-201ENST00000376215 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP25.01■■□□□ 1.59
PDSS1-201ENST00000376215 KIAA1257Q9ULG3 409 aa25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.8 ms