RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000375391.5

TMCO3-201, Transcript of transmembrane and coiled-coil domains 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TMCO3, Length 2,132 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO3-201ENST00000375391 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa21.56■■□□□ 1.04
TMCO3-201ENST00000375391 IGSF21Q96ID5 467 aa21.56■■□□□ 1.04
TMCO3-201ENST00000375391 COLEC11Q9BWP8 271 aa21.56■■□□□ 1.04
TMCO3-201ENST00000375391 PDCL3Q9H2J4 239 aa21.56■■□□□ 1.04
TMCO3-201ENST00000375391 SALL4Q9UJQ4 1053 aa21.56■■□□□ 1.04
TMCO3-201ENST00000375391 O00370 1275 aa21.56■■□□□ 1.04
TMCO3-201ENST00000375391 CAPN15O75808 1086 aa21.56■■□□□ 1.04
TMCO3-201ENST00000375391 LCA5LO95447 670 aa21.56■■□□□ 1.04
TMCO3-201ENST00000375391 ADORA2BP29275 332 aa21.56■■□□□ 1.04
TMCO3-201ENST00000375391 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
TMCO3-201ENST00000375391 MDH1BQ5I0G3 518 aa21.56■■□□□ 1.04
TMCO3-201ENST00000375391 RASIP1Q5U651 963 aa21.56■■□□□ 1.04
TMCO3-201ENST00000375391 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
TMCO3-201ENST00000375391 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
TMCO3-201ENST00000375391 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
TMCO3-201ENST00000375391 SLC2A14Q8TDB8 520 aa21.56■■□□□ 1.04
TMCO3-201ENST00000375391 AUTS2Q8WXX7 1259 aa21.56■■□□□ 1.04
TMCO3-201ENST00000375391 TMEM30AQ9NV96 361 aa21.56■■□□□ 1.04
TMCO3-201ENST00000375391 TSPAN16Q9UKR8 245 aa21.56■■□□□ 1.04
TMCO3-201ENST00000375391 NR2E3Q9Y5X4 410 aa21.56■■□□□ 1.04
TMCO3-201ENST00000375391 MICAL2O94851 1124 aa21.55■■□□□ 1.04
TMCO3-201ENST00000375391 PAEPP09466 180 aa21.55■■□□□ 1.04
TMCO3-201ENST00000375391 RPL17P18621 184 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
TMCO3-201ENST00000375391 CACNA2D1P54289 1103 aa21.55■■□□□ 1.04
TMCO3-201ENST00000375391 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
TMCO3-201ENST00000375391 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
TMCO3-201ENST00000375391 PAQR9Q6ZVX9 377 aa21.55■■□□□ 1.04
TMCO3-201ENST00000375391 TTC30AQ86WT1 665 aa21.55■■□□□ 1.04
TMCO3-201ENST00000375391 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa21.55■■□□□ 1.04
TMCO3-201ENST00000375391 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa21.55■■□□□ 1.04
TMCO3-201ENST00000375391 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
TMCO3-201ENST00000375391 TMEM175Q9BSA9 504 aa21.55■■□□□ 1.04
TMCO3-201ENST00000375391 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa21.55■■□□□ 1.04
TMCO3-201ENST00000375391 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
TMCO3-201ENST00000375391 BEST1O76090 585 aa21.55■■□□□ 1.04
TMCO3-201ENST00000375391 CYP11A1P05108 521 aa21.55■■□□□ 1.04
TMCO3-201ENST00000375391 UNGP13051 313 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
TMCO3-201ENST00000375391 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
TMCO3-201ENST00000375391 PBX2P40425 430 aa21.55■■□□□ 1.04
TMCO3-201ENST00000375391 MAGEA1P43355 309 aa21.55■■□□□ 1.04
TMCO3-201ENST00000375391 BPIFB4P59827 614 aa21.55■■□□□ 1.04
TMCO3-201ENST00000375391 SYT15Q9BQS2 421 aa21.55■■□□□ 1.04
TMCO3-201ENST00000375391 PCDHB8Q9UN66 801 aa21.55■■□□□ 1.04
TMCO3-201ENST00000375391 INSL6Q9Y581 213 aa21.55■■□□□ 1.04
TMCO3-201ENST00000375391 TSC2P49815 1807 aa21.55■■□□□ 1.04
TMCO3-201ENST00000375391 FTLP02792 175 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
TMCO3-201ENST00000375391 CCDC175P0C221 793 aa21.54■■□□□ 1.04
TMCO3-201ENST00000375391 ARHGAP25P42331 645 aa21.54■■□□□ 1.04
TMCO3-201ENST00000375391 SPA17Q15506 151 aa21.54■■□□□ 1.04
TMCO3-201ENST00000375391 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa21.54■■□□□ 1.04
TMCO3-201ENST00000375391 SGO2Q562F6 1265 aa21.54■■□□□ 1.04
TMCO3-201ENST00000375391 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
TMCO3-201ENST00000375391 UNC93AQ86WB7 457 aa21.54■■□□□ 1.04
TMCO3-201ENST00000375391 CRYBG2Q8N1P7 616 aa21.54■■□□□ 1.04
TMCO3-201ENST00000375391 SLC39A11Q8N1S5 342 aa21.54■■□□□ 1.04
TMCO3-201ENST00000375391 PCED1BQ96HM7 432 aa21.54■■□□□ 1.04
TMCO3-201ENST00000375391 RAD9AQ99638 391 aa21.54■■□□□ 1.04
TMCO3-201ENST00000375391 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
TMCO3-201ENST00000375391 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP21.54■■□□□ 1.04
TMCO3-201ENST00000375391 MYO9BQ13459 2157 aa21.54■■□□□ 1.04
TMCO3-201ENST00000375391 M0QYV0 167 aa21.53■■□□□ 1.04
TMCO3-201ENST00000375391 ADAM12O43184 909 aa21.53■■□□□ 1.04
TMCO3-201ENST00000375391 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
TMCO3-201ENST00000375391 FUKQ8N0W3 1084 aa21.53■■□□□ 1.04
TMCO3-201ENST00000375391 TMEM86AQ8N2M4 240 aa21.53■■□□□ 1.04
TMCO3-201ENST00000375391 FIBCD1Q8N539 461 aa21.53■■□□□ 1.04
TMCO3-201ENST00000375391 ZNF558Q96NG5 402 aa21.53■■□□□ 1.04
TMCO3-201ENST00000375391 THAP2Q9H0W7 228 aa21.53■■□□□ 1.04
TMCO3-201ENST00000375391 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP21.53■■□□□ 1.044e-6■■■■■ 92.8
TMCO3-201ENST00000375391 VDRP11473 427 aa21.53■■□□□ 1.04
TMCO3-201ENST00000375391 DNAJB2P25686 324 aa21.53■■□□□ 1.04
TMCO3-201ENST00000375391 LHX1P48742 406 aa21.53■■□□□ 1.04
TMCO3-201ENST00000375391 GALCP54803 685 aa21.53■■□□□ 1.04
TMCO3-201ENST00000375391 ARPP19P56211 112 aa21.53■■□□□ 1.04
TMCO3-201ENST00000375391 NOMO3P69849 1222 aa21.53■■□□□ 1.04
TMCO3-201ENST00000375391 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa21.53■■□□□ 1.04
TMCO3-201ENST00000375391 ARHGEF26Q96DR7 871 aa21.53■■□□□ 1.04
TMCO3-201ENST00000375391 PGLYRP2Q96PD5 576 aa21.53■■□□□ 1.04
TMCO3-201ENST00000375391 C17orf80Q9BSJ5 609 aa21.53■■□□□ 1.04
TMCO3-201ENST00000375391 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa21.53■■□□□ 1.04
TMCO3-201ENST00000375391 GJB6O95452 261 aa21.52■■□□□ 1.04
TMCO3-201ENST00000375391 EFEMP2O95967 443 aa21.52■■□□□ 1.04
TMCO3-201ENST00000375391 FGFR3P22607 806 aa21.52■■□□□ 1.04
TMCO3-201ENST00000375391 VPS36Q86VN1 386 aa21.52■■□□□ 1.04
TMCO3-201ENST00000375391 SLC9A7Q96T83 725 aa21.52■■□□□ 1.04
TMCO3-201ENST00000375391 B3GNT5Q9BYG0 378 aa21.52■■□□□ 1.04
TMCO3-201ENST00000375391 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
TMCO3-201ENST00000375391 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa21.52■■□□□ 1.04
TMCO3-201ENST00000375391 KIAA1671Q9BY89 1806 aa21.52■■□□□ 1.03
TMCO3-201ENST00000375391 RGS7P49802 495 aa21.52■■□□□ 1.03
TMCO3-201ENST00000375391 CNGA2Q16280 664 aa21.52■■□□□ 1.03
TMCO3-201ENST00000375391 KIAA1328Q86T90 577 aa21.52■■□□□ 1.03
TMCO3-201ENST00000375391 METTL23Q86XA0 190 aa21.52■■□□□ 1.03
TMCO3-201ENST00000375391 STKLD1Q8NE28 680 aa21.52■■□□□ 1.03
TMCO3-201ENST00000375391 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.03
TMCO3-201ENST00000375391 C11orf70Q9BRQ4 267 aa21.52■■□□□ 1.03
TMCO3-201ENST00000375391 CERS4Q9HA82 394 aa21.52■■□□□ 1.03
TMCO3-201ENST00000375391 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.03
TMCO3-201ENST00000375391 TRAPPC3O43617 180 aa21.51■■□□□ 1.03
TMCO3-201ENST00000375391 CA3P07451 260 aa21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.6 ms