RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362897.1

RNU6-78P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 78, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-78P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-78P-201ENST00000362897 THAP12O43422 761 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-78P-201ENST00000362897 LPXNO60711 386 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-78P-201ENST00000362897 SPDEFO95238 335 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-78P-201ENST00000362897 ANXA2P07355 339 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
RNU6-78P-201ENST00000362897 IL1R1P14778 569 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-78P-201ENST00000362897 CD6P30203 668 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-78P-201ENST00000362897 PXNP49023 591 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
RNU6-78P-201ENST00000362897 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
RNU6-78P-201ENST00000362897 DGCR2P98153 550 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-78P-201ENST00000362897 FOXE3Q13461 319 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-78P-201ENST00000362897 TUBB3Q13509 450 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-78P-201ENST00000362897 TP53BP2Q13625 1128 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-78P-201ENST00000362897 DYRK1AQ13627 763 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-78P-201ENST00000362897 PMS2P11Q13670 270 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-78P-201ENST00000362897 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
RNU6-78P-201ENST00000362897 HLXQ14774 488 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
RNU6-78P-201ENST00000362897 MGAT5BQ3V5L5 792 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-78P-201ENST00000362897 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
RNU6-78P-201ENST00000362897 PLA1AQ53H76 456 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-78P-201ENST00000362897 MIIPQ5JXC2 388 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-78P-201ENST00000362897 XRRA1Q6P2D8 792 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-78P-201ENST00000362897 TMEM108Q6UXF1 575 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-78P-201ENST00000362897 MICALCLQ6ZW33 695 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-78P-201ENST00000362897 UNC13DQ70J99 1090 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-78P-201ENST00000362897 TMPRSS9Q7Z410 1059 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-78P-201ENST00000362897 GAS2L3Q86XJ1 694 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-78P-201ENST00000362897 YAF2Q8IY57 180 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-78P-201ENST00000362897 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
RNU6-78P-201ENST00000362897 DEPTORQ8TB45 409 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-78P-201ENST00000362897 HAS1Q92839 578 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-78P-201ENST00000362897 NACC2Q96BF6 587 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZNF503Q96F45 646 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-78P-201ENST00000362897 SNX22Q96L94 193 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-78P-201ENST00000362897 SGCZQ96LD1 299 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-78P-201ENST00000362897 RPS6KC1Q96S38 1066 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-78P-201ENST00000362897 PPP1R9BQ96SB3 815 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-78P-201ENST00000362897 COLEC11Q9BWP8 271 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZNF341Q9BYN7 854 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-78P-201ENST00000362897 UNKLQ9H9P5 680 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
RNU6-78P-201ENST00000362897 CERS4Q9HA82 394 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-78P-201ENST00000362897 TMEM74BQ9NUR3 256 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-78P-201ENST00000362897 INTS13Q9NVM9 706 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZNF212Q9UDV6 495 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-78P-201ENST00000362897 DMTF1Q9Y222 760 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-78P-201ENST00000362897 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP3.29□□□□□ -1.88
RNU6-78P-201ENST00000362897 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-78P-201ENST00000362897 CENPVL1A0A0U1RR11 272 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-78P-201ENST00000362897 LOC102723971A0A1B0GUV8 181 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-78P-201ENST00000362897 A0A1W2PPC4 97 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-78P-201ENST00000362897 F5H697 171 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-78P-201ENST00000362897 NCK2O43639 380 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-78P-201ENST00000362897 TRIAP1O43715 76 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-78P-201ENST00000362897 INMTO95050 263 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-78P-201ENST00000362897 MT-ND5P03915 603 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-78P-201ENST00000362897 TXNP10599 105 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
RNU6-78P-201ENST00000362897 ACVR2AP27037 513 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-78P-201ENST00000362897 PPIFP30405 207 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
RNU6-78P-201ENST00000362897 LRPAP1P30533 357 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-78P-201ENST00000362897 HTR3AP46098 478 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-78P-201ENST00000362897 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP3.28□□□□□ -1.88
RNU6-78P-201ENST00000362897 BTKQ06187 659 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-78P-201ENST00000362897 INSCQ1MX18 579 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-78P-201ENST00000362897 LSM12Q3MHD2 195 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
RNU6-78P-201ENST00000362897 FAM209BQ5JX69 171 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-78P-201ENST00000362897 LY6G5CQ5SRR4 150 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-78P-201ENST00000362897 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
RNU6-78P-201ENST00000362897 LCE4AQ5TA78 99 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-78P-201ENST00000362897 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-78P-201ENST00000362897 IZUMO3Q5VZ72 239 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-78P-201ENST00000362897 SP5Q6BEB4 398 aaPredicted RBP3.28□□□□□ -1.88
RNU6-78P-201ENST00000362897 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-78P-201ENST00000362897 RHOUQ7L0Q8 258 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-78P-201ENST00000362897 RNF44Q7L0R7 432 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-78P-201ENST00000362897 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-78P-201ENST00000362897 SDR16C5Q8N3Y7 309 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-78P-201ENST00000362897 ATP11CQ8NB49 1132 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-78P-201ENST00000362897 FANCBQ8NB91 859 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-78P-201ENST00000362897 PROKR1Q8TCW9 393 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-78P-201ENST00000362897 SSH3Q8TE77 659 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-78P-201ENST00000362897 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP3.28□□□□□ -1.88
RNU6-78P-201ENST00000362897 PMM1Q92871 262 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-78P-201ENST00000362897 SLC39A13Q96H72 371 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-78P-201ENST00000362897 OSBPL9Q96SU4 736 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-78P-201ENST00000362897 MESP1Q9BRJ9 268 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-78P-201ENST00000362897 PTDSS2Q9BVG9 487 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-78P-201ENST00000362897 VPS11Q9H270 941 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-78P-201ENST00000362897 CHST8Q9H2A9 424 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-78P-201ENST00000362897 ARFGAP3Q9NP61 516 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-78P-201ENST00000362897 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-78P-201ENST00000362897 TBCCD1Q9NVR7 557 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-78P-201ENST00000362897 GPRC5BQ9NZH0 403 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-78P-201ENST00000362897 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-78P-201ENST00000362897 TESQ9UGI8 421 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
RNU6-78P-201ENST00000362897 NCANO14594 1321 aa3.27□□□□□ -1.89
RNU6-78P-201ENST00000362897 H7C4K7 107 aa3.27□□□□□ -1.89
RNU6-78P-201ENST00000362897 RAB27BO00194 218 aa3.27□□□□□ -1.89
RNU6-78P-201ENST00000362897 PRRG2O14669 202 aa3.27□□□□□ -1.89
RNU6-78P-201ENST00000362897 CCP110O43303 1012 aa3.27□□□□□ -1.89
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZNF202O95125 648 aa3.27□□□□□ -1.89
RNU6-78P-201ENST00000362897 SETSIPP0DME0 302 aa3.27□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.1 ms