RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362869.1

RNU6-552P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 552, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-552P, Length 119 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-552P-201ENST00000362869 NPR1P16066 1061 aa3.9□□□□□ -1.79
RNU6-552P-201ENST00000362869 VIPR2P41587 438 aa3.9□□□□□ -1.79
RNU6-552P-201ENST00000362869 PXNP49023 591 aaPredicted RBP3.9□□□□□ -1.79
RNU6-552P-201ENST00000362869 PTH2RP49190 550 aa3.9□□□□□ -1.79
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZNF134P52741 427 aa3.9□□□□□ -1.79
RNU6-552P-201ENST00000362869 LILRA4P59901 499 aa3.9□□□□□ -1.79
RNU6-552P-201ENST00000362869 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP3.9□□□□□ -1.79
RNU6-552P-201ENST00000362869 IQCB1Q15051 598 aa3.9□□□□□ -1.79
RNU6-552P-201ENST00000362869 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa3.9□□□□□ -1.79
RNU6-552P-201ENST00000362869 TEDDM1Q5T9Z0 273 aa3.9□□□□□ -1.79
RNU6-552P-201ENST00000362869 SFRP4Q6FHJ7 346 aaPredicted RBP3.9□□□□□ -1.79
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZNF783Q6ZMS7 281 aa3.9□□□□□ -1.79
RNU6-552P-201ENST00000362869 MAEAQ7L5Y9 396 aa3.9□□□□□ -1.79
RNU6-552P-201ENST00000362869 RD3Q7Z3Z2 195 aa3.9□□□□□ -1.79
RNU6-552P-201ENST00000362869 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP3.9□□□□□ -1.79
RNU6-552P-201ENST00000362869 MYO1HQ8N1T3 1032 aa3.9□□□□□ -1.79
RNU6-552P-201ENST00000362869 FAM109AQ8N4B1 249 aa3.9□□□□□ -1.79
RNU6-552P-201ENST00000362869 BOLLQ8N9W6 283 aaKnown RBP3.9□□□□□ -1.79
RNU6-552P-201ENST00000362869 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa3.9□□□□□ -1.79
RNU6-552P-201ENST00000362869 FKBP10Q96AY3 582 aa3.9□□□□□ -1.79
RNU6-552P-201ENST00000362869 MOGAT1Q96PD6 335 aa3.9□□□□□ -1.79
RNU6-552P-201ENST00000362869 ALG8Q9BVK2 526 aa3.9□□□□□ -1.79
RNU6-552P-201ENST00000362869 TRIM54Q9BYV2 358 aa3.9□□□□□ -1.79
RNU6-552P-201ENST00000362869 TMEM60Q9H2L4 133 aa3.9□□□□□ -1.79
RNU6-552P-201ENST00000362869 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa3.9□□□□□ -1.79
RNU6-552P-201ENST00000362869 PRDM13Q9H4Q3 707 aa3.9□□□□□ -1.79
RNU6-552P-201ENST00000362869 FAM204AQ9H8W3 233 aa3.9□□□□□ -1.79
RNU6-552P-201ENST00000362869 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP3.9□□□□□ -1.79
RNU6-552P-201ENST00000362869 C1orf112Q9NSG2 853 aa3.9□□□□□ -1.79
RNU6-552P-201ENST00000362869 KLC4Q9NSK0 619 aa3.9□□□□□ -1.79
RNU6-552P-201ENST00000362869 KLHL42Q9P2K6 505 aa3.9□□□□□ -1.79
RNU6-552P-201ENST00000362869 SLC17A6Q9P2U8 582 aa3.9□□□□□ -1.79
RNU6-552P-201ENST00000362869 TMX2Q9Y320 296 aa3.9□□□□□ -1.79
RNU6-552P-201ENST00000362869 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa3.9□□□□□ -1.79
RNU6-552P-201ENST00000362869 ADGRA2Q96PE1 1338 aa3.9□□□□□ -1.79
RNU6-552P-201ENST00000362869 GOLGA6CA6NDK9 693 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-552P-201ENST00000362869 GOLGA6BA6NDN3 693 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-552P-201ENST00000362869 LINC00473A8K010 186 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-552P-201ENST00000362869 VWC2LB2RUY7 222 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-552P-201ENST00000362869 THP07101 528 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-552P-201ENST00000362869 GOLGA6DP0CG33 693 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-552P-201ENST00000362869 KITP10721 976 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-552P-201ENST00000362869 PPIFP30405 207 aaKnown RBP3.89□□□□□ -1.79
RNU6-552P-201ENST00000362869 SLC11A2P49281 568 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-552P-201ENST00000362869 ELLP55199 621 aaPredicted RBP3.89□□□□□ -1.79
RNU6-552P-201ENST00000362869 UCP3P55916 312 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-552P-201ENST00000362869 SATB1Q01826 763 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZNF362Q5T0B9 420 aaPredicted RBP3.89□□□□□ -1.79
RNU6-552P-201ENST00000362869 AKNAD1Q5T1N1 836 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-552P-201ENST00000362869 ARHGAP40Q5TG30 622 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-552P-201ENST00000362869 ICE2Q659A1 982 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-552P-201ENST00000362869 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP3.89□□□□□ -1.79
RNU6-552P-201ENST00000362869 FBXO42Q6P3S6 717 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-552P-201ENST00000362869 ARHGEF25Q86VW2 580 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-552P-201ENST00000362869 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP3.89□□□□□ -1.79
RNU6-552P-201ENST00000362869 OR6B3Q8NGW1 331 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-552P-201ENST00000362869 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP3.89□□□□□ -1.79
RNU6-552P-201ENST00000362869 NELL2Q99435 816 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-552P-201ENST00000362869 AMBRA1Q9C0C7 1298 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-552P-201ENST00000362869 ASB6Q9NWX5 421 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-552P-201ENST00000362869 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-552P-201ENST00000362869 EHD3Q9NZN3 535 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-552P-201ENST00000362869 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP3.89□□□□□ -1.79
RNU6-552P-201ENST00000362869 XPR1Q9UBH6 696 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-552P-201ENST00000362869 SHOC2Q9UQ13 582 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-552P-201ENST00000362869 VSTM5A8MXK1 200 aa3.88□□□□□ -1.79
RNU6-552P-201ENST00000362869 PPM1DO15297 605 aa3.88□□□□□ -1.79
RNU6-552P-201ENST00000362869 NXPH3O95157 252 aa3.88□□□□□ -1.79
RNU6-552P-201ENST00000362869 TTLL1O95922 423 aa3.88□□□□□ -1.79
RNU6-552P-201ENST00000362869 PDHA1P08559 390 aa3.88□□□□□ -1.79
RNU6-552P-201ENST00000362869 SLC7A1P30825 629 aa3.88□□□□□ -1.79
RNU6-552P-201ENST00000362869 ARFIP2P53365 341 aa3.88□□□□□ -1.79
RNU6-552P-201ENST00000362869 SLC13A2Q13183 592 aa3.88□□□□□ -1.79
RNU6-552P-201ENST00000362869 CNN3Q15417 329 aaKnown RBP3.88□□□□□ -1.79
RNU6-552P-201ENST00000362869 TBCCQ15814 346 aa3.88□□□□□ -1.79
RNU6-552P-201ENST00000362869 RGS7BPQ6MZT1 257 aaPredicted RBP3.88□□□□□ -1.79
RNU6-552P-201ENST00000362869 SWSAP1Q6NVH7 229 aa3.88□□□□□ -1.79
RNU6-552P-201ENST00000362869 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa3.88□□□□□ -1.79
RNU6-552P-201ENST00000362869 MPP5Q8N3R9 675 aa3.88□□□□□ -1.79
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP3.88□□□□□ -1.79
RNU6-552P-201ENST00000362869 SLC15A4Q8N697 577 aa3.88□□□□□ -1.79
RNU6-552P-201ENST00000362869 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa3.88□□□□□ -1.79
RNU6-552P-201ENST00000362869 IL31RAQ8NI17 732 aa3.88□□□□□ -1.79
RNU6-552P-201ENST00000362869 ATRIPQ8WXE1 791 aa3.88□□□□□ -1.79
RNU6-552P-201ENST00000362869 NELL1Q92832 810 aa3.88□□□□□ -1.79
RNU6-552P-201ENST00000362869 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP3.88□□□□□ -1.79
RNU6-552P-201ENST00000362869 UROC1Q96N76 676 aa3.88□□□□□ -1.79
RNU6-552P-201ENST00000362869 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP3.88□□□□□ -1.79
RNU6-552P-201ENST00000362869 C22orf23Q9BZE7 217 aa3.88□□□□□ -1.79
RNU6-552P-201ENST00000362869 KLK15Q9H2R5 256 aa3.88□□□□□ -1.79
RNU6-552P-201ENST00000362869 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa3.88□□□□□ -1.79
RNU6-552P-201ENST00000362869 SERHLQ9NQF3 203 aa3.88□□□□□ -1.79
RNU6-552P-201ENST00000362869 IL17RBQ9NRM6 502 aa3.88□□□□□ -1.79
RNU6-552P-201ENST00000362869 SEMA4GQ9NTN9 838 aa3.88□□□□□ -1.79
RNU6-552P-201ENST00000362869 PTGFRNQ9P2B2 879 aa3.88□□□□□ -1.79
RNU6-552P-201ENST00000362869 SERTAD3Q9UJW9 196 aa3.88□□□□□ -1.79
RNU6-552P-201ENST00000362869 ENTPD2Q9Y5L3 495 aa3.88□□□□□ -1.79
RNU6-552P-201ENST00000362869 A0A087WWL8 130 aa3.87□□□□□ -1.79
RNU6-552P-201ENST00000362869 CFAP69A5D8W1 941 aa3.87□□□□□ -1.79
RNU6-552P-201ENST00000362869 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP3.87□□□□□ -1.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.4 ms