RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000341403.9

UBXN8-202, Transcript of UBX domain protein 8, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene UBXN8, Length 1,202 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN8-202ENST00000341403 CCDC33Q8N5R6 958 aa10□□□□□ -0.81
UBXN8-202ENST00000341403 NIPA2Q8N8Q9 360 aa10□□□□□ -0.81
UBXN8-202ENST00000341403 TERB1Q8NA31 727 aa10□□□□□ -0.81
UBXN8-202ENST00000341403 ICA1LQ8NDH6 482 aa10□□□□□ -0.81
UBXN8-202ENST00000341403 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa10□□□□□ -0.81
UBXN8-202ENST00000341403 FBXL13Q8NEE6 735 aa10□□□□□ -0.81
UBXN8-202ENST00000341403 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
UBXN8-202ENST00000341403 PYROXD1Q8WU10 500 aa10□□□□□ -0.81
UBXN8-202ENST00000341403 C1orf54Q8WWF1 131 aa10□□□□□ -0.81
UBXN8-202ENST00000341403 NRG4Q8WWG1 115 aa10□□□□□ -0.81
UBXN8-202ENST00000341403 DLG3Q92796 817 aa10□□□□□ -0.81
UBXN8-202ENST00000341403 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
UBXN8-202ENST00000341403 SLC5A5Q92911 643 aa10□□□□□ -0.81
UBXN8-202ENST00000341403 GMCL1Q96IK5 515 aa10□□□□□ -0.81
UBXN8-202ENST00000341403 FAM161BQ96MY7 647 aa10□□□□□ -0.81
UBXN8-202ENST00000341403 BIRC8Q96P09 236 aa10□□□□□ -0.81
UBXN8-202ENST00000341403 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa10□□□□□ -0.81
UBXN8-202ENST00000341403 CRAMP1Q96RY5 1269 aa10□□□□□ -0.81
UBXN8-202ENST00000341403 KCNK16Q96T55 309 aa10□□□□□ -0.81
UBXN8-202ENST00000341403 SERPINI1Q99574 410 aa10□□□□□ -0.81
UBXN8-202ENST00000341403 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa10□□□□□ -0.81
UBXN8-202ENST00000341403 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa10□□□□□ -0.81
UBXN8-202ENST00000341403 ZNF696Q9H7X3 374 aa10□□□□□ -0.81
UBXN8-202ENST00000341403 VPS37BQ9H9H4 285 aa10□□□□□ -0.81
UBXN8-202ENST00000341403 S100A14Q9HCY8 104 aa10□□□□□ -0.81
UBXN8-202ENST00000341403 SLCO1B3Q9NPD5 702 aa10□□□□□ -0.81
UBXN8-202ENST00000341403 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
UBXN8-202ENST00000341403 LMCD1Q9NZU5 365 aa10□□□□□ -0.81
UBXN8-202ENST00000341403 TBK1Q9UHD2 729 aa10□□□□□ -0.81
UBXN8-202ENST00000341403 SERPINB13Q9UIV8 391 aa10□□□□□ -0.81
UBXN8-202ENST00000341403 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
UBXN8-202ENST00000341403 PLA2G4CQ9UP65 541 aa10□□□□□ -0.81
UBXN8-202ENST00000341403 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa10□□□□□ -0.81
UBXN8-202ENST00000341403 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
UBXN8-202ENST00000341403 GOLGA8QA0A0J9YX86 632 aa9.99□□□□□ -0.81
UBXN8-202ENST00000341403 ARHGEF35A5YM69 484 aa9.99□□□□□ -0.81
UBXN8-202ENST00000341403 GOLGA8OA6NCC3 632 aa9.99□□□□□ -0.81
UBXN8-202ENST00000341403 GOLGA8NF8WBI6 632 aa9.99□□□□□ -0.81
UBXN8-202ENST00000341403 C6orf229H3BNL8 230 aa9.99□□□□□ -0.81
UBXN8-202ENST00000341403 MEIS2O14770 477 aa9.99□□□□□ -0.81
UBXN8-202ENST00000341403 PFDN1O60925 122 aa9.99□□□□□ -0.81
UBXN8-202ENST00000341403 KRT37O76014 449 aa9.99□□□□□ -0.81
UBXN8-202ENST00000341403 LSM8O95777 96 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
UBXN8-202ENST00000341403 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
UBXN8-202ENST00000341403 EIF2S1P05198 315 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
UBXN8-202ENST00000341403 CALB1P05937 261 aa9.99□□□□□ -0.81
UBXN8-202ENST00000341403 WEE2P0C1S8 567 aa9.99□□□□□ -0.81
UBXN8-202ENST00000341403 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
UBXN8-202ENST00000341403 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
UBXN8-202ENST00000341403 SERPINB3P29508 390 aa9.99□□□□□ -0.81
UBXN8-202ENST00000341403 CDC25CP30307 473 aa9.99□□□□□ -0.81
UBXN8-202ENST00000341403 ADSLP30566 484 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
UBXN8-202ENST00000341403 CCNFP41002 786 aa9.99□□□□□ -0.81
UBXN8-202ENST00000341403 SERPINB9P50453 376 aa9.99□□□□□ -0.81
UBXN8-202ENST00000341403 SESN3P58005 492 aa9.99□□□□□ -0.81
UBXN8-202ENST00000341403 RHBDL3P58872 404 aa9.99□□□□□ -0.81
UBXN8-202ENST00000341403 RTP1P59025 263 aa9.99□□□□□ -0.81
UBXN8-202ENST00000341403 GTF2BQ00403 316 aa9.99□□□□□ -0.81
UBXN8-202ENST00000341403 TNIP1Q15025 636 aa9.99□□□□□ -0.81
UBXN8-202ENST00000341403 SLC1A5Q15758 541 aa9.99□□□□□ -0.81
UBXN8-202ENST00000341403 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
UBXN8-202ENST00000341403 PTPROQ16827 1216 aa9.99□□□□□ -0.81
UBXN8-202ENST00000341403 QRICH1Q2TAL8 776 aa9.99□□□□□ -0.81
UBXN8-202ENST00000341403 ERFEQ4G0M1 354 aa9.99□□□□□ -0.81
UBXN8-202ENST00000341403 PRR16Q569H4 304 aa9.99□□□□□ -0.81
UBXN8-202ENST00000341403 C1orf146Q5VVC0 180 aa9.99□□□□□ -0.81
UBXN8-202ENST00000341403 IRAK1BP1Q5VVH5 260 aa9.99□□□□□ -0.81
UBXN8-202ENST00000341403 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa9.99□□□□□ -0.81
UBXN8-202ENST00000341403 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa9.99□□□□□ -0.81
UBXN8-202ENST00000341403 CYS1Q717R9 158 aa9.99□□□□□ -0.81
UBXN8-202ENST00000341403 BRINP3Q76B58 766 aa9.99□□□□□ -0.81
UBXN8-202ENST00000341403 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
UBXN8-202ENST00000341403 PALB2Q86YC2 1186 aa9.99□□□□□ -0.81
UBXN8-202ENST00000341403 CRLF3Q8IUI8 442 aa9.99□□□□□ -0.81
UBXN8-202ENST00000341403 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa9.99□□□□□ -0.81
UBXN8-202ENST00000341403 WDR75Q8IWA0 830 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
UBXN8-202ENST00000341403 TPH2Q8IWU9 490 aa9.99□□□□□ -0.81
UBXN8-202ENST00000341403 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
UBXN8-202ENST00000341403 ACMSDQ8TDX5 336 aa9.99□□□□□ -0.81
UBXN8-202ENST00000341403 MZB1Q8WU39 189 aa9.99□□□□□ -0.81
UBXN8-202ENST00000341403 SLC20A1Q8WUM9 679 aa9.99□□□□□ -0.81
UBXN8-202ENST00000341403 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
UBXN8-202ENST00000341403 SLC39A7Q92504 469 aa9.99□□□□□ -0.81
UBXN8-202ENST00000341403 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
UBXN8-202ENST00000341403 CMTM5Q96DZ9 223 aa9.99□□□□□ -0.81
UBXN8-202ENST00000341403 C9orf72Q96LT7 481 aa9.99□□□□□ -0.81
UBXN8-202ENST00000341403 PAFAH2Q99487 392 aa9.99□□□□□ -0.81
UBXN8-202ENST00000341403 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
UBXN8-202ENST00000341403 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa9.99□□□□□ -0.81
UBXN8-202ENST00000341403 PIDD1Q9HB75 910 aa9.99□□□□□ -0.81
UBXN8-202ENST00000341403 MRPL40Q9NQ50 206 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
UBXN8-202ENST00000341403 PARVAQ9NVD7 372 aa9.99□□□□□ -0.81
UBXN8-202ENST00000341403 ARL8BQ9NVJ2 186 aa9.99□□□□□ -0.81
UBXN8-202ENST00000341403 CNTN3Q9P232 1028 aa9.99□□□□□ -0.81
UBXN8-202ENST00000341403 ZNHIT2Q9UHR6 403 aa9.99□□□□□ -0.81
UBXN8-202ENST00000341403 PRPF19Q9UMS4 504 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
UBXN8-202ENST00000341403 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa9.99□□□□□ -0.81
UBXN8-202ENST00000341403 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
UBXN8-202ENST00000341403 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
UBXN8-202ENST00000341403 A0A0G2JND7 137 aa9.98□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.4 ms