RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000334414.10

PTPRB-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 12,316 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-202ENST00000334414 HEATR9A2RTY3 570 aa5.74□□□□□ -1.49
PTPRB-202ENST00000334414 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP5.74□□□□□ -1.49
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PTPRB-202ENST00000334414 MAGEB16A2A368 324 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRB-202ENST00000334414 FAM220BPB1ANY3 271 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRB-202ENST00000334414 MATN2O00339 956 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRB-202ENST00000334414 RAPGEF3O95398 923 aa5.73□□□□□ -1.49
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