RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331789.9

ACTB-201, Transcript of actin beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ACTB, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-201ENST00000331789 RPS6KA5O75582 802 aa18.91■□□□□ 0.62
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ACTB-201ENST00000331789 TAP1Q03518 808 aa18.91■□□□□ 0.62
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ACTB-201ENST00000331789 CD99L2Q8TCZ2 262 aa18.9■□□□□ 0.62
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ACTB-201ENST00000331789 PI4K2BG5E9Z4 385 aa18.88■□□□□ 0.61
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ACTB-201ENST00000331789 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa18.88■□□□□ 0.61
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ACTB-201ENST00000331789 GSCP56915 257 aaPredicted RBP18.88■□□□□ 0.61
ACTB-201ENST00000331789 SNX1Q13596 522 aa18.88■□□□□ 0.61
ACTB-201ENST00000331789 CCDC105Q8IYK2 499 aa18.88■□□□□ 0.61
ACTB-201ENST00000331789 NIPA2Q8N8Q9 360 aa18.88■□□□□ 0.61
ACTB-201ENST00000331789 MCRS1Q96EZ8 462 aa18.88■□□□□ 0.61
ACTB-201ENST00000331789 ZNF560Q96MR9 790 aa18.88■□□□□ 0.61
ACTB-201ENST00000331789 LRRC19Q9H756 370 aa18.88■□□□□ 0.61
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